Definition | Psychromonas ingrahamii 37, complete genome. |
---|---|
Accession | NC_008709 |
Length | 4,559,598 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is 119947017
Identifier: 119947017
GI number: 119947017
Start: 4216804
End: 4218168
Strand: Reverse
Name: 119947017
Synonym: Ping_3414
Alternate gene names: NA
Gene position: 4218168-4216804 (Counterclockwise)
Preceding gene: 119947018
Following gene: 119947016
Centisome position: 92.51
GC content: 35.09
Gene sequence:
>1365_bases ATGCTAGAGACAACGATCAATATATTTTCAGACGCAATAAACAATAGATTAACTTTATGCATTGTCGCTCTCATCATATT ATTATTTATTGGAACTCTATTTCTAGAGTATAAATATTACAAAAAATCAAGTTTAGACTTAAGTAATGTTGTATCAGATT TTGAATTAGTTGCGGATAAAATAAATAATAACGAGAGTTTAACAGAGAAAGAAAGCGGTATAAAAGCCCAGTATTTCTCT ACGTTAAAAGCAGAAGATACACGTACTTTATTATCTAATTACCCAGAAAAACTTCTAATAAAACCAGCATCAAGTGGTTA CAGTTTTATGGCAAGTGTGTTAACAACGATAGGTGTAATAGGAACATTTTTAGGAATAGTTATTGGACTTTCAGGTATTC AGGAAAAATTAAATGCTAGCTCTACAGAGATGTTCGAAGGCGTAAAAACCTTGCTGGGAGGAATGGATACAGCATTTGTT ACATCACTAGCTGGCTTATTATTCTCAATTCTTTTGGCGTGGGGATCACGACATTACAATAAAAAAAATGTTGGACATTT TTTTGGTATTAGAGATGATTTTAATAAATTATTCCGTGCAGAAAGCATTGCTGATTTTTTACAAAAAATGTCTGGAGGCG CTCAAGACAAAGTCGTTGAAAAACAGCTTCAAGCTGCTGAGAAAAGTGCCCAGGCTTCAGAAGCATTATTGCAGATGGGA AGCTCATTGGAAAAAGCCGCTGATAATTTTGATGCTGACAAAATTGGTCAACACCTTTCTACAAGCTTAGACAAAATATT CACTACTGAAATGGTGCCGGTTTTCACTGAGATAAGTTCAGAGTTAAAATCTTTGCGTGAAATAAAAGAAGATAATAGTG AAAAGATAATACAAGCCATAATGACTGAGTTAAGGGCTGAAGTAATTGAACCATTATCTAATCAAATATCAGAGACGTCA TCACTTGTAAAAGATTCAACATCAGCTGTTACTAAGTTGCATGATGAATTAGGTGGAATTGCAACAAAGCTTGCGATGGC TGTGGCAACTATTCAGACTTTCCAGAAAGAGACTCTTGAAGAGTTAAAAGAATTTTCAAGCGATTTGCGTGTTATTTTGG GCGGATTTCAAAATGATACCAAGGTTATTTTGGAGGGTGTTGCCGAGCAATTAGAGGGGGCAGTTAAATCAAGTGTAGAT GTAATGAATAAACAGAAAGTTGCATTCAAAGAAAGTGCAGACCAAGCTGCTACTACTTTTAGTGGGATTCGAGAGGAGTT AGAGCAGTCTTTAGATACTCAGGGTAAAGTGCAAAAAGAGATGTTAGATCAGACTGCTGAGCGTGTACACACTATTATGT TATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases AAGGTGCTTATTTTAAGGATGATGCTGAACACATACCGGTACGTGTTGCAGACAAGTTATTTACAGCACAAGAATTAATA AAATTAATAAAGAGGTAAAA
Downstream 100 bases:
>100_bases AGTCAAAAGTCTAATTCAGAGCAAGCTAGCATCCTTAAGCAAGTTGGAAAAACTGCGACAGAGCTGATGGATAATGCACG TGAAAATTTAGGCGACACAT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 454; Mature: 454
Protein sequence:
>454_residues MLETTINIFSDAINNRLTLCIVALIILLFIGTLFLEYKYYKKSSLDLSNVVSDFELVADKINNNESLTEKESGIKAQYFS TLKAEDTRTLLSNYPEKLLIKPASSGYSFMASVLTTIGVIGTFLGIVIGLSGIQEKLNASSTEMFEGVKTLLGGMDTAFV TSLAGLLFSILLAWGSRHYNKKNVGHFFGIRDDFNKLFRAESIADFLQKMSGGAQDKVVEKQLQAAEKSAQASEALLQMG SSLEKAADNFDADKIGQHLSTSLDKIFTTEMVPVFTEISSELKSLREIKEDNSEKIIQAIMTELRAEVIEPLSNQISETS SLVKDSTSAVTKLHDELGGIATKLAMAVATIQTFQKETLEELKEFSSDLRVILGGFQNDTKVILEGVAEQLEGAVKSSVD VMNKQKVAFKESADQAATTFSGIREELEQSLDTQGKVQKEMLDQTAERVHTIML
Sequences:
>Translated_454_residues MLETTINIFSDAINNRLTLCIVALIILLFIGTLFLEYKYYKKSSLDLSNVVSDFELVADKINNNESLTEKESGIKAQYFS TLKAEDTRTLLSNYPEKLLIKPASSGYSFMASVLTTIGVIGTFLGIVIGLSGIQEKLNASSTEMFEGVKTLLGGMDTAFV TSLAGLLFSILLAWGSRHYNKKNVGHFFGIRDDFNKLFRAESIADFLQKMSGGAQDKVVEKQLQAAEKSAQASEALLQMG SSLEKAADNFDADKIGQHLSTSLDKIFTTEMVPVFTEISSELKSLREIKEDNSEKIIQAIMTELRAEVIEPLSNQISETS SLVKDSTSAVTKLHDELGGIATKLAMAVATIQTFQKETLEELKEFSSDLRVILGGFQNDTKVILEGVAEQLEGAVKSSVD VMNKQKVAFKESADQAATTFSGIREELEQSLDTQGKVQKEMLDQTAERVHTIML >Mature_454_residues MLETTINIFSDAINNRLTLCIVALIILLFIGTLFLEYKYYKKSSLDLSNVVSDFELVADKINNNESLTEKESGIKAQYFS TLKAEDTRTLLSNYPEKLLIKPASSGYSFMASVLTTIGVIGTFLGIVIGLSGIQEKLNASSTEMFEGVKTLLGGMDTAFV TSLAGLLFSILLAWGSRHYNKKNVGHFFGIRDDFNKLFRAESIADFLQKMSGGAQDKVVEKQLQAAEKSAQASEALLQMG SSLEKAADNFDADKIGQHLSTSLDKIFTTEMVPVFTEISSELKSLREIKEDNSEKIIQAIMTELRAEVIEPLSNQISETS SLVKDSTSAVTKLHDELGGIATKLAMAVATIQTFQKETLEELKEFSSDLRVILGGFQNDTKVILEGVAEQLEGAVKSSVD VMNKQKVAFKESADQAATTFSGIREELEQSLDTQGKVQKEMLDQTAERVHTIML
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 49891; Mature: 49891
Theoretical pI: Translated: 4.66; Mature: 4.66
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.2 %Cys (Translated Protein) 2.6 %Met (Translated Protein) 2.9 %Cys+Met (Translated Protein) 0.2 %Cys (Mature Protein) 2.6 %Met (Mature Protein) 2.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MLETTINIFSDAINNRLTLCIVALIILLFIGTLFLEYKYYKKSSLDLSNVVSDFELVADK CCCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH INNNESLTEKESGIKAQYFSTLKAEDTRTLLSNYPEKLLIKPASSGYSFMASVLTTIGVI HCCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHH GTFLGIVIGLSGIQEKLNASSTEMFEGVKTLLGGMDTAFVTSLAGLLFSILLAWGSRHYN HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC KKNVGHFFGIRDDFNKLFRAESIADFLQKMSGGAQDKVVEKQLQAAEKSAQASEALLQMG CCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SSLEKAADNFDADKIGQHLSTSLDKIFTTEMVPVFTEISSELKSLREIKEDNSEKIIQAI HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH MTELRAEVIEPLSNQISETSSLVKDSTSAVTKLHDELGGIATKLAMAVATIQTFQKETLE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ELKEFSSDLRVILGGFQNDTKVILEGVAEQLEGAVKSSVDVMNKQKVAFKESADQAATTF HHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SGIREELEQSLDTQGKVQKEMLDQTAERVHTIML HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure MLETTINIFSDAINNRLTLCIVALIILLFIGTLFLEYKYYKKSSLDLSNVVSDFELVADK CCCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH INNNESLTEKESGIKAQYFSTLKAEDTRTLLSNYPEKLLIKPASSGYSFMASVLTTIGVI HCCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHH GTFLGIVIGLSGIQEKLNASSTEMFEGVKTLLGGMDTAFVTSLAGLLFSILLAWGSRHYN HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC KKNVGHFFGIRDDFNKLFRAESIADFLQKMSGGAQDKVVEKQLQAAEKSAQASEALLQMG CCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SSLEKAADNFDADKIGQHLSTSLDKIFTTEMVPVFTEISSELKSLREIKEDNSEKIIQAI HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH MTELRAEVIEPLSNQISETSSLVKDSTSAVTKLHDELGGIATKLAMAVATIQTFQKETLE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ELKEFSSDLRVILGGFQNDTKVILEGVAEQLEGAVKSSVDVMNKQKVAFKESADQAATTF HHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SGIREELEQSLDTQGKVQKEMLDQTAERVHTIML HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA