Definition Psychromonas ingrahamii 37, complete genome.
Accession NC_008709
Length 4,559,598

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The map label for this gene is 119947017

Identifier: 119947017

GI number: 119947017

Start: 4216804

End: 4218168

Strand: Reverse

Name: 119947017

Synonym: Ping_3414

Alternate gene names: NA

Gene position: 4218168-4216804 (Counterclockwise)

Preceding gene: 119947018

Following gene: 119947016

Centisome position: 92.51

GC content: 35.09

Gene sequence:

>1365_bases
ATGCTAGAGACAACGATCAATATATTTTCAGACGCAATAAACAATAGATTAACTTTATGCATTGTCGCTCTCATCATATT
ATTATTTATTGGAACTCTATTTCTAGAGTATAAATATTACAAAAAATCAAGTTTAGACTTAAGTAATGTTGTATCAGATT
TTGAATTAGTTGCGGATAAAATAAATAATAACGAGAGTTTAACAGAGAAAGAAAGCGGTATAAAAGCCCAGTATTTCTCT
ACGTTAAAAGCAGAAGATACACGTACTTTATTATCTAATTACCCAGAAAAACTTCTAATAAAACCAGCATCAAGTGGTTA
CAGTTTTATGGCAAGTGTGTTAACAACGATAGGTGTAATAGGAACATTTTTAGGAATAGTTATTGGACTTTCAGGTATTC
AGGAAAAATTAAATGCTAGCTCTACAGAGATGTTCGAAGGCGTAAAAACCTTGCTGGGAGGAATGGATACAGCATTTGTT
ACATCACTAGCTGGCTTATTATTCTCAATTCTTTTGGCGTGGGGATCACGACATTACAATAAAAAAAATGTTGGACATTT
TTTTGGTATTAGAGATGATTTTAATAAATTATTCCGTGCAGAAAGCATTGCTGATTTTTTACAAAAAATGTCTGGAGGCG
CTCAAGACAAAGTCGTTGAAAAACAGCTTCAAGCTGCTGAGAAAAGTGCCCAGGCTTCAGAAGCATTATTGCAGATGGGA
AGCTCATTGGAAAAAGCCGCTGATAATTTTGATGCTGACAAAATTGGTCAACACCTTTCTACAAGCTTAGACAAAATATT
CACTACTGAAATGGTGCCGGTTTTCACTGAGATAAGTTCAGAGTTAAAATCTTTGCGTGAAATAAAAGAAGATAATAGTG
AAAAGATAATACAAGCCATAATGACTGAGTTAAGGGCTGAAGTAATTGAACCATTATCTAATCAAATATCAGAGACGTCA
TCACTTGTAAAAGATTCAACATCAGCTGTTACTAAGTTGCATGATGAATTAGGTGGAATTGCAACAAAGCTTGCGATGGC
TGTGGCAACTATTCAGACTTTCCAGAAAGAGACTCTTGAAGAGTTAAAAGAATTTTCAAGCGATTTGCGTGTTATTTTGG
GCGGATTTCAAAATGATACCAAGGTTATTTTGGAGGGTGTTGCCGAGCAATTAGAGGGGGCAGTTAAATCAAGTGTAGAT
GTAATGAATAAACAGAAAGTTGCATTCAAAGAAAGTGCAGACCAAGCTGCTACTACTTTTAGTGGGATTCGAGAGGAGTT
AGAGCAGTCTTTAGATACTCAGGGTAAAGTGCAAAAAGAGATGTTAGATCAGACTGCTGAGCGTGTACACACTATTATGT
TATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAGGTGCTTATTTTAAGGATGATGCTGAACACATACCGGTACGTGTTGCAGACAAGTTATTTACAGCACAAGAATTAATA
AAATTAATAAAGAGGTAAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AGTCAAAAGTCTAATTCAGAGCAAGCTAGCATCCTTAAGCAAGTTGGAAAAACTGCGACAGAGCTGATGGATAATGCACG
TGAAAATTTAGGCGACACAT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 454; Mature: 454

Protein sequence:

>454_residues
MLETTINIFSDAINNRLTLCIVALIILLFIGTLFLEYKYYKKSSLDLSNVVSDFELVADKINNNESLTEKESGIKAQYFS
TLKAEDTRTLLSNYPEKLLIKPASSGYSFMASVLTTIGVIGTFLGIVIGLSGIQEKLNASSTEMFEGVKTLLGGMDTAFV
TSLAGLLFSILLAWGSRHYNKKNVGHFFGIRDDFNKLFRAESIADFLQKMSGGAQDKVVEKQLQAAEKSAQASEALLQMG
SSLEKAADNFDADKIGQHLSTSLDKIFTTEMVPVFTEISSELKSLREIKEDNSEKIIQAIMTELRAEVIEPLSNQISETS
SLVKDSTSAVTKLHDELGGIATKLAMAVATIQTFQKETLEELKEFSSDLRVILGGFQNDTKVILEGVAEQLEGAVKSSVD
VMNKQKVAFKESADQAATTFSGIREELEQSLDTQGKVQKEMLDQTAERVHTIML

Sequences:

>Translated_454_residues
MLETTINIFSDAINNRLTLCIVALIILLFIGTLFLEYKYYKKSSLDLSNVVSDFELVADKINNNESLTEKESGIKAQYFS
TLKAEDTRTLLSNYPEKLLIKPASSGYSFMASVLTTIGVIGTFLGIVIGLSGIQEKLNASSTEMFEGVKTLLGGMDTAFV
TSLAGLLFSILLAWGSRHYNKKNVGHFFGIRDDFNKLFRAESIADFLQKMSGGAQDKVVEKQLQAAEKSAQASEALLQMG
SSLEKAADNFDADKIGQHLSTSLDKIFTTEMVPVFTEISSELKSLREIKEDNSEKIIQAIMTELRAEVIEPLSNQISETS
SLVKDSTSAVTKLHDELGGIATKLAMAVATIQTFQKETLEELKEFSSDLRVILGGFQNDTKVILEGVAEQLEGAVKSSVD
VMNKQKVAFKESADQAATTFSGIREELEQSLDTQGKVQKEMLDQTAERVHTIML
>Mature_454_residues
MLETTINIFSDAINNRLTLCIVALIILLFIGTLFLEYKYYKKSSLDLSNVVSDFELVADKINNNESLTEKESGIKAQYFS
TLKAEDTRTLLSNYPEKLLIKPASSGYSFMASVLTTIGVIGTFLGIVIGLSGIQEKLNASSTEMFEGVKTLLGGMDTAFV
TSLAGLLFSILLAWGSRHYNKKNVGHFFGIRDDFNKLFRAESIADFLQKMSGGAQDKVVEKQLQAAEKSAQASEALLQMG
SSLEKAADNFDADKIGQHLSTSLDKIFTTEMVPVFTEISSELKSLREIKEDNSEKIIQAIMTELRAEVIEPLSNQISETS
SLVKDSTSAVTKLHDELGGIATKLAMAVATIQTFQKETLEELKEFSSDLRVILGGFQNDTKVILEGVAEQLEGAVKSSVD
VMNKQKVAFKESADQAATTFSGIREELEQSLDTQGKVQKEMLDQTAERVHTIML

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 49891; Mature: 49891

Theoretical pI: Translated: 4.66; Mature: 4.66

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
2.6 %Met     (Translated Protein)
2.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
2.6 %Met     (Mature Protein)
2.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLETTINIFSDAINNRLTLCIVALIILLFIGTLFLEYKYYKKSSLDLSNVVSDFELVADK
CCCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH
INNNESLTEKESGIKAQYFSTLKAEDTRTLLSNYPEKLLIKPASSGYSFMASVLTTIGVI
HCCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
GTFLGIVIGLSGIQEKLNASSTEMFEGVKTLLGGMDTAFVTSLAGLLFSILLAWGSRHYN
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
KKNVGHFFGIRDDFNKLFRAESIADFLQKMSGGAQDKVVEKQLQAAEKSAQASEALLQMG
CCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SSLEKAADNFDADKIGQHLSTSLDKIFTTEMVPVFTEISSELKSLREIKEDNSEKIIQAI
HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH
MTELRAEVIEPLSNQISETSSLVKDSTSAVTKLHDELGGIATKLAMAVATIQTFQKETLE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ELKEFSSDLRVILGGFQNDTKVILEGVAEQLEGAVKSSVDVMNKQKVAFKESADQAATTF
HHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SGIREELEQSLDTQGKVQKEMLDQTAERVHTIML
HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MLETTINIFSDAINNRLTLCIVALIILLFIGTLFLEYKYYKKSSLDLSNVVSDFELVADK
CCCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH
INNNESLTEKESGIKAQYFSTLKAEDTRTLLSNYPEKLLIKPASSGYSFMASVLTTIGVI
HCCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
GTFLGIVIGLSGIQEKLNASSTEMFEGVKTLLGGMDTAFVTSLAGLLFSILLAWGSRHYN
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
KKNVGHFFGIRDDFNKLFRAESIADFLQKMSGGAQDKVVEKQLQAAEKSAQASEALLQMG
CCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SSLEKAADNFDADKIGQHLSTSLDKIFTTEMVPVFTEISSELKSLREIKEDNSEKIIQAI
HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH
MTELRAEVIEPLSNQISETSSLVKDSTSAVTKLHDELGGIATKLAMAVATIQTFQKETLE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ELKEFSSDLRVILGGFQNDTKVILEGVAEQLEGAVKSSVDVMNKQKVAFKESADQAATTF
HHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SGIREELEQSLDTQGKVQKEMLDQTAERVHTIML
HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA