Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is yxdM [H]

Identifier: 118479959

GI number: 118479959

Start: 4623739

End: 4625694

Strand: Direct

Name: yxdM [H]

Synonym: BALH_4404

Alternate gene names: 118479959

Gene position: 4623739-4625694 (Clockwise)

Preceding gene: 118479958

Following gene: 118479960

Centisome position: 87.95

GC content: 33.33

Gene sequence:

>1956_bases
ATGACATTTTGGCAGTTTGCATTTAAAAACGTCTCGCGGAACGCCAGAGCTTATTTCGCCTATTTTGTAAGCAGTGCGTT
TTCCATTGCTATTTTTTTCTCGTTTGCAGTTTACTTATTTCATCCTAAATTGCATATGACAGACGTAAATTATGCTCTGA
ACATATTAATGACAATTTCAGAAGTTGTCATTGTATTCTTTTCATTTTTCTTTTTACTGTATTCAATCGGTACTTTCTTA
AAAGTGCGAAAAAAGCAATTTGGGATTTTAACAGTACTTGGCATCTCTCAAAAACAATTAAAACGACTCATATTTATAGA
AAATATGTTAATTGGTGTTCTTTCTATATTTTTTGGCATTCAACTTGGACTTGTCTTTTCACAGTTCTTTTTATTAGTTA
CCGCCAAGATTACACATGTACCTGGCTTATATTTATATTGGCCTACAAGCGCCATTGTTTTAACTATCATCATCTTTCTC
GGACTCTTTATTCTCGTATCATCTTTTACCCCGATGCTCATTCGTACGAGAAAAGCTGTACGTCTTTTAAAAGAAGGAAC
AAAACAAAAAGAAAGAAAAGCATCTGTGCTCATCTCTCTATTTGGGGCGATATGTTTAATATCCGGATATGTGTTAGCTG
CAAATCCATTATATTTTCTGTCGCTAGGTGATATCATTGGGCTTTTATATGCCGTCTCTAGTATATTTGTCATCCCATCG
CTTATTGCAGCTGGGACATATTTTTTCTTCTCACAAATTAGCTTTTTACTCATTCGTATATTAAAAGCGCGAAGAACGTT
TTATATGAAACGCATTAATATGCTTTGGATTTCTGATTTAGCATCACGCATTCGAACGAATATTAATATGCTTTTTATTG
TAGCGATGCTATCAACACTCGCTTTTACAATGATTACATTCTTATACGGTTTTGGGAAATTTACAAAGTTTGATGCGATA
AGGGAAAACCCTTTTCCTTTTACATATTTATCACATACTGAAAATACGTTAGCGGATGAGCATTTAAACTGGTTAGAGCA
GAAGTTTAATGAAGAACACTTTACTTATACAAAATTTAAAACGGATATATATGAAGTATCTTCAGCTGAAAATAATACGC
AACTCTATTACGCAATTAAACAAAGTGACTATAATGTACTTGCTAAGGCTTTAAATTGGGAAAAACTCACGGTGAATAAG
AATGAATCTTATATTCTTATGAAAGACTTAGATGATCAAGTTATTGGAACACTTCACAATAAAGAACAGAAAAGTACTCT
TACACTTACTCAAAACAATTTACAACTACAAGTGAAAGAATATAAAAGTTATAGCCCATTCCCAAACAGCTTAATATACC
AATTACTCATACTATCTGATGAAAATGTAGCAGCCTTATCGACCGTTTCCAAGCAAATGAGTGTATATAACTTCAAAGTT
ACAGATTGGGAAAAAGCACATAATATCGGTTCATCGTTTATAACAAAAATCCATAACGACAATGCAGCAATTCAAGCAGA
GCACCCGCCTTTCCATGCAAGTGAAGCGAGCGATTCTCTATATAAAACAAAACTAAATGTCGCTTCATTTTTCTTAATTG
GTACTTTCTTAGGTGTTATTTTCTTTATCGGAGCTGGCAGTGTTCTTTACTTCCGGATGTATACAGATTTAACAAATGAG
CAAGAAAAATATATAACGATTACGAAAATTGGCTTAACGGAAACTGAAATGAAACGTTCAGCGACAATTCAGCTTGCGAT
TCTTTTCTTCGTGCCTTACATTATGGCATCCATCCATACGATGTTCGCGACGAAGATGTTACAAGAAGTTTTACATCTCT
CGTTCTTCGCTGAGATTACAGTCGTACTTATGATTTTTGGAACAGTTGAAATTTTATTTTTCCTTTTAATTCGTTCCTTT
TATATGCAAAAATTATCACAACACATTAAGTTTTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TATCACAATATACTAATACACATTAAAAAGGTTATTACATGAAAAAGGTGGGATCTCTTCCCTCCTTTTTCATGCTCATT
ATATTAGGAGGTTTAGGTGA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAAATAGAAAGGTGATTACTATGGAAGAAGTATTACACATAAAAAACGTCTCAAAAGTGTATGAGGGAAAAGTTCCTCAT
ACCGCTTTAAAAAATATAAA

Product: ABC transporter permease

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 651; Mature: 650

Protein sequence:

>651_residues
MTFWQFAFKNVSRNARAYFAYFVSSAFSIAIFFSFAVYLFHPKLHMTDVNYALNILMTISEVVIVFFSFFFLLYSIGTFL
KVRKKQFGILTVLGISQKQLKRLIFIENMLIGVLSIFFGIQLGLVFSQFFLLVTAKITHVPGLYLYWPTSAIVLTIIIFL
GLFILVSSFTPMLIRTRKAVRLLKEGTKQKERKASVLISLFGAICLISGYVLAANPLYFLSLGDIIGLLYAVSSIFVIPS
LIAAGTYFFFSQISFLLIRILKARRTFYMKRINMLWISDLASRIRTNINMLFIVAMLSTLAFTMITFLYGFGKFTKFDAI
RENPFPFTYLSHTENTLADEHLNWLEQKFNEEHFTYTKFKTDIYEVSSAENNTQLYYAIKQSDYNVLAKALNWEKLTVNK
NESYILMKDLDDQVIGTLHNKEQKSTLTLTQNNLQLQVKEYKSYSPFPNSLIYQLLILSDENVAALSTVSKQMSVYNFKV
TDWEKAHNIGSSFITKIHNDNAAIQAEHPPFHASEASDSLYKTKLNVASFFLIGTFLGVIFFIGAGSVLYFRMYTDLTNE
QEKYITITKIGLTETEMKRSATIQLAILFFVPYIMASIHTMFATKMLQEVLHLSFFAEITVVLMIFGTVEILFFLLIRSF
YMQKLSQHIKF

Sequences:

>Translated_651_residues
MTFWQFAFKNVSRNARAYFAYFVSSAFSIAIFFSFAVYLFHPKLHMTDVNYALNILMTISEVVIVFFSFFFLLYSIGTFL
KVRKKQFGILTVLGISQKQLKRLIFIENMLIGVLSIFFGIQLGLVFSQFFLLVTAKITHVPGLYLYWPTSAIVLTIIIFL
GLFILVSSFTPMLIRTRKAVRLLKEGTKQKERKASVLISLFGAICLISGYVLAANPLYFLSLGDIIGLLYAVSSIFVIPS
LIAAGTYFFFSQISFLLIRILKARRTFYMKRINMLWISDLASRIRTNINMLFIVAMLSTLAFTMITFLYGFGKFTKFDAI
RENPFPFTYLSHTENTLADEHLNWLEQKFNEEHFTYTKFKTDIYEVSSAENNTQLYYAIKQSDYNVLAKALNWEKLTVNK
NESYILMKDLDDQVIGTLHNKEQKSTLTLTQNNLQLQVKEYKSYSPFPNSLIYQLLILSDENVAALSTVSKQMSVYNFKV
TDWEKAHNIGSSFITKIHNDNAAIQAEHPPFHASEASDSLYKTKLNVASFFLIGTFLGVIFFIGAGSVLYFRMYTDLTNE
QEKYITITKIGLTETEMKRSATIQLAILFFVPYIMASIHTMFATKMLQEVLHLSFFAEITVVLMIFGTVEILFFLLIRSF
YMQKLSQHIKF
>Mature_650_residues
TFWQFAFKNVSRNARAYFAYFVSSAFSIAIFFSFAVYLFHPKLHMTDVNYALNILMTISEVVIVFFSFFFLLYSIGTFLK
VRKKQFGILTVLGISQKQLKRLIFIENMLIGVLSIFFGIQLGLVFSQFFLLVTAKITHVPGLYLYWPTSAIVLTIIIFLG
LFILVSSFTPMLIRTRKAVRLLKEGTKQKERKASVLISLFGAICLISGYVLAANPLYFLSLGDIIGLLYAVSSIFVIPSL
IAAGTYFFFSQISFLLIRILKARRTFYMKRINMLWISDLASRIRTNINMLFIVAMLSTLAFTMITFLYGFGKFTKFDAIR
ENPFPFTYLSHTENTLADEHLNWLEQKFNEEHFTYTKFKTDIYEVSSAENNTQLYYAIKQSDYNVLAKALNWEKLTVNKN
ESYILMKDLDDQVIGTLHNKEQKSTLTLTQNNLQLQVKEYKSYSPFPNSLIYQLLILSDENVAALSTVSKQMSVYNFKVT
DWEKAHNIGSSFITKIHNDNAAIQAEHPPFHASEASDSLYKTKLNVASFFLIGTFLGVIFFIGAGSVLYFRMYTDLTNEQ
EKYITITKIGLTETEMKRSATIQLAILFFVPYIMASIHTMFATKMLQEVLHLSFFAEITVVLMIFGTVEILFFLLIRSFY
MQKLSQHIKF

Specific function: Part of the ABC transporter complex yxdLM which could be involved in peptide resistance [H]

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the ABC-4 integral membrane protein family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003838 [H]

Pfam domain/function: PF02687 FtsX [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 74947; Mature: 74816

Theoretical pI: Translated: 9.86; Mature: 9.86

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
2.9 %Met     (Translated Protein)
3.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
2.8 %Met     (Mature Protein)
2.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MTFWQFAFKNVSRNARAYFAYFVSSAFSIAIFFSFAVYLFHPKLHMTDVNYALNILMTIS
CCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHHHHHHHHH
EVVIVFFSFFFLLYSIGTFLKVRKKQFGILTVLGISQKQLKRLIFIENMLIGVLSIFFGI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QLGLVFSQFFLLVTAKITHVPGLYLYWPTSAIVLTIIIFLGLFILVSSFTPMLIRTRKAV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
RLLKEGTKQKERKASVLISLFGAICLISGYVLAANPLYFLSLGDIIGLLYAVSSIFVIPS
HHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LIAAGTYFFFSQISFLLIRILKARRTFYMKRINMLWISDLASRIRTNINMLFIVAMLSTL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH
AFTMITFLYGFGKFTKFDAIRENPFPFTYLSHTENTLADEHLNWLEQKFNEEHFTYTKFK
HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEH
TDIYEVSSAENNTQLYYAIKQSDYNVLAKALNWEKLTVNKNESYILMKDLDDQVIGTLHN
HHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHCCCEEEEECCCCCEEEEECCCHHHHHHHCC
KEQKSTLTLTQNNLQLQVKEYKSYSPFPNSLIYQLLILSDENVAALSTVSKQMSVYNFKV
CCCCCEEEEEECCCEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHEECCCCHHHHHHHHHHHHHEEEEE
TDWEKAHNIGSSFITKIHNDNAAIQAEHPPFHASEASDSLYKTKLNVASFFLIGTFLGVI
CCHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FFIGAGSVLYFRMYTDLTNEQEKYITITKIGLTETEMKRSATIQLAILFFVPYIMASIHT
HHHCCCHHEEEEEHHHCCCCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MFATKMLQEVLHLSFFAEITVVLMIFGTVEILFFLLIRSFYMQKLSQHIKF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure 
TFWQFAFKNVSRNARAYFAYFVSSAFSIAIFFSFAVYLFHPKLHMTDVNYALNILMTIS
CHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHHHHHHHHH
EVVIVFFSFFFLLYSIGTFLKVRKKQFGILTVLGISQKQLKRLIFIENMLIGVLSIFFGI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QLGLVFSQFFLLVTAKITHVPGLYLYWPTSAIVLTIIIFLGLFILVSSFTPMLIRTRKAV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
RLLKEGTKQKERKASVLISLFGAICLISGYVLAANPLYFLSLGDIIGLLYAVSSIFVIPS
HHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LIAAGTYFFFSQISFLLIRILKARRTFYMKRINMLWISDLASRIRTNINMLFIVAMLSTL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH
AFTMITFLYGFGKFTKFDAIRENPFPFTYLSHTENTLADEHLNWLEQKFNEEHFTYTKFK
HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEH
TDIYEVSSAENNTQLYYAIKQSDYNVLAKALNWEKLTVNKNESYILMKDLDDQVIGTLHN
HHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHCCCEEEEECCCCCEEEEECCCHHHHHHHCC
KEQKSTLTLTQNNLQLQVKEYKSYSPFPNSLIYQLLILSDENVAALSTVSKQMSVYNFKV
CCCCCEEEEEECCCEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHEECCCCHHHHHHHHHHHHHEEEEE
TDWEKAHNIGSSFITKIHNDNAAIQAEHPPFHASEASDSLYKTKLNVASFFLIGTFLGVI
CCHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FFIGAGSVLYFRMYTDLTNEQEKYITITKIGLTETEMKRSATIQLAILFFVPYIMASIHT
HHHCCCHHEEEEEHHHCCCCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MFATKMLQEVLHLSFFAEITVVLMIFGTVEILFFLLIRSFYMQKLSQHIKF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8867804; 9384377; 7952181 [H]