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The map label for this gene is ycgO [C]

Identifier: 118479691

GI number: 118479691

Start: 4340397

End: 4342256

Strand: Reverse

Name: ycgO [C]

Synonym: BALH_4125

Alternate gene names: 118479691

Gene position: 4342256-4340397 (Counterclockwise)

Preceding gene: 118479693

Following gene: 118479690

Centisome position: 82.6

GC content: 36.45

Gene sequence:

>1860_bases
TTGAAAATATATAGAAGTAAAGTATGGTTTATACTTTGCTGTCGCAATACTATGAACAAGGAGGGCATTATGGTTGAATC
ACTTTTACTTAGTATCGTTATTATTATTACGTTAGGTATTGCTTCACAATGGACTGCATGGCGCTTCCAGCTCCCTGCGA
TTGTTGTTATGGCAGTTGCTGGATTATTAATTGGTCCGGTTTTCGGTATTATTAATCCAAAAGAGGTGCTTGGAGATGTT
TTTAGTCCACTCGTATCACTTTCTGTTGCGATTATATTGTTTGAGGGTAGTTTAAGTTTAGATATACGTGAACTGAGGGG
GCTATCAAAACCAGTATTTCGTATCGTTACGTTTGGTGCGTTTATCGCGTGGATTGCTGGCGCACTTGCAGCTCATTACG
TCGCTGGATTAGATTGGGCGGTTGCATTTATTATTGGAGGACTTTTTATTGTGACAGGTCCAACGGTAATTATTCCGTTG
TTACGCCAAGCGCGATTAAAACCAAGAACAGCAGCAATTTTAAAATGGGAAGGGATTATCGTTGATCCATTTGGCGCTTT
GCTTGCTGTATTCGCCTTTCAAATTGTAAATTTCTTAACGAAAGAAAATGTACAATTACATACGTTGCTGTATTTCTTTG
CAGGTTCATTATTTGCAATGGTACTCGGTTATATATTTAGTATTTTTATGAGCTATATGATTTTAAAGGGGAAAGTACCA
GAATATTTAAAAGCACCAATTTTGTTAGTTACGGTACTGTTATGCTTTGGCATTGCGGATGAGGTGATGCATGAAACAGG
TATGCTAGCTGTAACTGTAATGGGGATTACGCTTGCGCGGATGAAAAAATATATTTCTTCTATCGGTGATATTCGTCATT
TTAACGAAAATATTTCTGTGCTACTAACGTCGACTGTTTTTATTATATTAACAGCATCGCTTCCAAGAACAACGATTATG
GAGATTTTCAGCTGGCCTATTATAAGCTTCGTACTTATGATGCTATTTGTTGTACGCCCTTTATCGATTTGGATATCGAC
AATCGGCACAGAGTTAACAAAAGCAGAACGGGCGCTAGTTGGCTGGATTGCGCCGCGAGGTATTGTTGCATTAACGGTTT
CAAGTTACTTTGCGACGGAGTTATTACAAGAAGGTTATAAAGATGCTTCTATATTAACGGCACTTACATTTGCACTCGTT
ATTACGACCGTTTGTGCTCATGGATTTTCAATTGGATTTTTAGCGAAAAGATTAGGATTGGCGAATACGGAGCCACCAGG
AATTTTAATTTCAGGTGCGAGTACATTCTCATCTGCTTTTGCATTGCACTGTAAAGAGATGGGTGTTCCGAGCTTAATTG
TAGATGTATCAGAAGAGCATTTGCAATGTGCAAAGGTGAAAGGGCTTAATACATATAATGGTCAAGTACTTTCTGAACAG
TTACAATTTGAAGTTGATATGAATCAGTATGAATACTTAATTGCAGTTACAGATACGGATTCTTATAATGTATTAGTCGC
AAATACATACGTACCGCAGTTTGGACATCATAATACATTTTTACTTCCAATCCATGATGTAGAAAAGATTGAACAAGAAC
GCATTTCCCTTTCGAAAAAAGCTCATTTACTGTTTGGTCAAAATGAAATTTATGAAGAATTAAATAGAAAAATTGAAGAT
GGTTATACGTTTAAAACGATACAAGTTGCAGAAGAACAAAAGATTAATAAAGAAGAAATCAATTCAGAGGATTTAATATT
ATTTATTCGCCATAGAGATGGTAGTCTTACTTTTTCAACATTGTATAAATATATAGCTGTTATGCCAGGGGATGAGCTAG
TTGTACTAGCAAAGCAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CGATTGGTGAGGGCTAATTAAAGTTTCACTTTATGTAAGTATAGTGTCCTCCTGTTGACTATATATTTAACTTGATTATA
TATTATGTAAATAGAATCAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TATGGTATAGTGAAACGAGGCTGTTTTTCAGTCTCGTTTTTTAAGTGCTTCCTATAAAGAAAGCATGCAAATGGAAAGGA
AGTTTTTATATGCGATCAGA

Product: Na+/H+ antiporter

Products: NA

Alternate protein names: MjNhaP1 [H]

Number of amino acids: Translated: 619; Mature: 619

Protein sequence:

>619_residues
MKIYRSKVWFILCCRNTMNKEGIMVESLLLSIVIIITLGIASQWTAWRFQLPAIVVMAVAGLLIGPVFGIINPKEVLGDV
FSPLVSLSVAIILFEGSLSLDIRELRGLSKPVFRIVTFGAFIAWIAGALAAHYVAGLDWAVAFIIGGLFIVTGPTVIIPL
LRQARLKPRTAAILKWEGIIVDPFGALLAVFAFQIVNFLTKENVQLHTLLYFFAGSLFAMVLGYIFSIFMSYMILKGKVP
EYLKAPILLVTVLLCFGIADEVMHETGMLAVTVMGITLARMKKYISSIGDIRHFNENISVLLTSTVFIILTASLPRTTIM
EIFSWPIISFVLMMLFVVRPLSIWISTIGTELTKAERALVGWIAPRGIVALTVSSYFATELLQEGYKDASILTALTFALV
ITTVCAHGFSIGFLAKRLGLANTEPPGILISGASTFSSAFALHCKEMGVPSLIVDVSEEHLQCAKVKGLNTYNGQVLSEQ
LQFEVDMNQYEYLIAVTDTDSYNVLVANTYVPQFGHHNTFLLPIHDVEKIEQERISLSKKAHLLFGQNEIYEELNRKIED
GYTFKTIQVAEEQKINKEEINSEDLILFIRHRDGSLTFSTLYKYIAVMPGDELVVLAKQ

Sequences:

>Translated_619_residues
MKIYRSKVWFILCCRNTMNKEGIMVESLLLSIVIIITLGIASQWTAWRFQLPAIVVMAVAGLLIGPVFGIINPKEVLGDV
FSPLVSLSVAIILFEGSLSLDIRELRGLSKPVFRIVTFGAFIAWIAGALAAHYVAGLDWAVAFIIGGLFIVTGPTVIIPL
LRQARLKPRTAAILKWEGIIVDPFGALLAVFAFQIVNFLTKENVQLHTLLYFFAGSLFAMVLGYIFSIFMSYMILKGKVP
EYLKAPILLVTVLLCFGIADEVMHETGMLAVTVMGITLARMKKYISSIGDIRHFNENISVLLTSTVFIILTASLPRTTIM
EIFSWPIISFVLMMLFVVRPLSIWISTIGTELTKAERALVGWIAPRGIVALTVSSYFATELLQEGYKDASILTALTFALV
ITTVCAHGFSIGFLAKRLGLANTEPPGILISGASTFSSAFALHCKEMGVPSLIVDVSEEHLQCAKVKGLNTYNGQVLSEQ
LQFEVDMNQYEYLIAVTDTDSYNVLVANTYVPQFGHHNTFLLPIHDVEKIEQERISLSKKAHLLFGQNEIYEELNRKIED
GYTFKTIQVAEEQKINKEEINSEDLILFIRHRDGSLTFSTLYKYIAVMPGDELVVLAKQ
>Mature_619_residues
MKIYRSKVWFILCCRNTMNKEGIMVESLLLSIVIIITLGIASQWTAWRFQLPAIVVMAVAGLLIGPVFGIINPKEVLGDV
FSPLVSLSVAIILFEGSLSLDIRELRGLSKPVFRIVTFGAFIAWIAGALAAHYVAGLDWAVAFIIGGLFIVTGPTVIIPL
LRQARLKPRTAAILKWEGIIVDPFGALLAVFAFQIVNFLTKENVQLHTLLYFFAGSLFAMVLGYIFSIFMSYMILKGKVP
EYLKAPILLVTVLLCFGIADEVMHETGMLAVTVMGITLARMKKYISSIGDIRHFNENISVLLTSTVFIILTASLPRTTIM
EIFSWPIISFVLMMLFVVRPLSIWISTIGTELTKAERALVGWIAPRGIVALTVSSYFATELLQEGYKDASILTALTFALV
ITTVCAHGFSIGFLAKRLGLANTEPPGILISGASTFSSAFALHCKEMGVPSLIVDVSEEHLQCAKVKGLNTYNGQVLSEQ
LQFEVDMNQYEYLIAVTDTDSYNVLVANTYVPQFGHHNTFLLPIHDVEKIEQERISLSKKAHLLFGQNEIYEELNRKIED
GYTFKTIQVAEEQKINKEEINSEDLILFIRHRDGSLTFSTLYKYIAVMPGDELVVLAKQ

Specific function: This is a Na(+)/H(+) antiporter. Can also transport lithium [H]

COG id: COG0025

COG function: function code P; NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporters

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Probable) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the monovalent cation:proton antiporter 1 (CPA1) transporter (TC 2.A.36) family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR006153 [H]

Pfam domain/function: PF00999 Na_H_Exchanger [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 68745; Mature: 68745

Theoretical pI: Translated: 6.79; Mature: 6.79

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.0 %Cys     (Translated Protein)
2.7 %Met     (Translated Protein)
3.7 %Cys+Met (Translated Protein)
1.0 %Cys     (Mature Protein)
2.7 %Met     (Mature Protein)
3.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKIYRSKVWFILCCRNTMNKEGIMVESLLLSIVIIITLGIASQWTAWRFQLPAIVVMAVA
CCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHH
GLLIGPVFGIINPKEVLGDVFSPLVSLSVAIILFEGSLSLDIRELRGLSKPVFRIVTFGA
HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECCCCEEHHHHCCCCHHHHHHHHHHH
FIAWIAGALAAHYVAGLDWAVAFIIGGLFIVTGPTVIIPLLRQARLKPRTAAILKWEGII
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCEE
VDPFGALLAVFAFQIVNFLTKENVQLHTLLYFFAGSLFAMVLGYIFSIFMSYMILKGKVP
ECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
EYLKAPILLVTVLLCFGIADEVMHETGMLAVTVMGITLARMKKYISSIGDIRHFNENISV
HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH
LLTSTVFIILTASLPRTTIMEIFSWPIISFVLMMLFVVRPLSIWISTIGTELTKAERALV
HHHHHEEHHEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GWIAPRGIVALTVSSYFATELLQEGYKDASILTALTFALVITTVCAHGFSIGFLAKRLGL
HHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCC
ANTEPPGILISGASTFSSAFALHCKEMGVPSLIVDVSEEHLQCAKVKGLNTYNGQVLSEQ
CCCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHH
LQFEVDMNQYEYLIAVTDTDSYNVLVANTYVPQFGHHNTFLLPIHDVEKIEQERISLSKK
HHEEECCCCEEEEEEEECCCCCEEEEEECCCCCCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHH
AHLLFGQNEIYEELNRKIEDGYTFKTIQVAEEQKINKEEINSEDLILFIRHRDGSLTFST
HHEEECCHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECHHHCCCHHHCCCCCEEEEEEECCCCEEHHH
LYKYIAVMPGDELVVLAKQ
HHHHHHCCCCCCEEEEECC
>Mature Secondary Structure
MKIYRSKVWFILCCRNTMNKEGIMVESLLLSIVIIITLGIASQWTAWRFQLPAIVVMAVA
CCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHH
GLLIGPVFGIINPKEVLGDVFSPLVSLSVAIILFEGSLSLDIRELRGLSKPVFRIVTFGA
HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECCCCEEHHHHCCCCHHHHHHHHHHH
FIAWIAGALAAHYVAGLDWAVAFIIGGLFIVTGPTVIIPLLRQARLKPRTAAILKWEGII
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCEE
VDPFGALLAVFAFQIVNFLTKENVQLHTLLYFFAGSLFAMVLGYIFSIFMSYMILKGKVP
ECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
EYLKAPILLVTVLLCFGIADEVMHETGMLAVTVMGITLARMKKYISSIGDIRHFNENISV
HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH
LLTSTVFIILTASLPRTTIMEIFSWPIISFVLMMLFVVRPLSIWISTIGTELTKAERALV
HHHHHEEHHEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GWIAPRGIVALTVSSYFATELLQEGYKDASILTALTFALVITTVCAHGFSIGFLAKRLGL
HHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCC
ANTEPPGILISGASTFSSAFALHCKEMGVPSLIVDVSEEHLQCAKVKGLNTYNGQVLSEQ
CCCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHH
LQFEVDMNQYEYLIAVTDTDSYNVLVANTYVPQFGHHNTFLLPIHDVEKIEQERISLSKK
HHEEECCCCEEEEEEEECCCCCEEEEEECCCCCCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHH
AHLLFGQNEIYEELNRKIEDGYTFKTIQVAEEQKINKEEINSEDLILFIRHRDGSLTFST
HHEEECCHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECHHHCCCHHHCCCCCEEEEEEECCCCEEHHH
LYKYIAVMPGDELVVLAKQ
HHHHHHCCCCCCEEEEECC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8688087 [H]