| Definition | Bacillus thuringiensis str. Al Hakam chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_008600 |
| Length | 5,257,091 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is yhjX [H]
Identifier: 118478060
GI number: 118478060
Start: 2585575
End: 2586783
Strand: Direct
Name: yhjX [H]
Synonym: BALH_2415
Alternate gene names: 118478060
Gene position: 2585575-2586783 (Clockwise)
Preceding gene: 118478059
Following gene: 118478061
Centisome position: 49.18
GC content: 35.24
Gene sequence:
>1209_bases ATGAAACAAACTTCTATAAATCCGTTACTAATTGTTCTAGGTACAATCATTGTTCAAATTGGGCTTGGAACAATTTATAC ATGGAGTTTATTTAATCAGCCCCTTGTAAGTAAGTTTGGATGGAACCTTAATTCAGTTGCGATAACTTTCTCCATTACAA GCTTTTCTTTATCATTTTCAACCTTATTTGCAGGAAAGTTACAGCAAAAATTAGGACTTCGTAAACTTATCGCTACTGCA GGGATTGTTCTGGGACTCGGTTTAATACTTAGTTCACAAGTTTCTTCCTTACCATTACTATATTTATTAGCTGGAGTCGT AGTTGGTTATGCAGATGGAACTGCTTATATTACATCACTATCTAATTTAATTAAATGGTTTCCGAATCGGAAAGGGCTTA TTTCAGGTATATCTGTATCAGCATATGGAATGGGTAGCTTAATCTTTAGATATATAAACGGAAGTCTTATCGATAGCCTT GGTGTATCACAAGCATTTTTATATTGGGGTATCATTGTTTTACTTTTAGTATTAATCGGATCGTTCTTCTTACGTGAAGC AATAGTAAGTAACACTGTAACTGAAACATTACACAATGATTATACGCCTCGTGAAATGATGCGAACGAAACAAGTATATC TTTTGTTTTTTATGTTATTTACATCGTGTATGGGCGGTTTGTATTTAATCGGTATGGTAAAAGATATTGGGGTCCAACTA GTTGGACTTAGCGCAGCAACCGCTGCTAATGCCGTCGCCATGATTGCGATTTTTAACACTGTAGGTAGAATCGTTCTTGG AACGTTATCAGATAAAATTGGTCGAATGAAAATTGTCTCTGCAACGTTTATAATTATAGGCTTATCAGTATTCACTCTAA GTTACATCCCTCTAAATTACGGAATTTATTTTGCTTGTGTAGCAAGTGTCGCCTTTTGCTTTGGCGGTAATATTACAATA TTCCCAGCTATTGTTGGAGATTACTTCGGGTTAAAAAATCATAGTACAAATTACGGGATTGTATATCAAGGTTTCGGATT CGGTGCGCTTGCAGGATCATTCATTGGAGCACTACTTGGTGGATTTCAACCGACCTTTATTACAATCGGCGTTTTAAGCG TTATTTCCTTTATTATTTCGTTAGTAATTCGTCCACCAAAAACAGAGAAGAAAAAGGAATTAAAACATTTACATCGGAAA GTAGCTTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases CATGAACTTAATTACCATTTTCCGCACAGTATCTTGCAATTTATGATGGATATACTAACTGTGAAAATCTATGTCAAAAT AAAAGAAGGGGACAGTTAGT
Downstream 100 bases:
>100_bases TACTAAAAAGAGTCCTCATATAGGGCTCTTTTTTATATAGTAATGAAAGGTTAACGATTATTAACTTTGCTAAGAGCAGA TAAATGAAATACTTAATTAA
Product: oxalate:formate antiporter
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 402; Mature: 402
Protein sequence:
>402_residues MKQTSINPLLIVLGTIIVQIGLGTIYTWSLFNQPLVSKFGWNLNSVAITFSITSFSLSFSTLFAGKLQQKLGLRKLIATA GIVLGLGLILSSQVSSLPLLYLLAGVVVGYADGTAYITSLSNLIKWFPNRKGLISGISVSAYGMGSLIFRYINGSLIDSL GVSQAFLYWGIIVLLLVLIGSFFLREAIVSNTVTETLHNDYTPREMMRTKQVYLLFFMLFTSCMGGLYLIGMVKDIGVQL VGLSAATAANAVAMIAIFNTVGRIVLGTLSDKIGRMKIVSATFIIIGLSVFTLSYIPLNYGIYFACVASVAFCFGGNITI FPAIVGDYFGLKNHSTNYGIVYQGFGFGALAGSFIGALLGGFQPTFITIGVLSVISFIISLVIRPPKTEKKKELKHLHRK VA
Sequences:
>Translated_402_residues MKQTSINPLLIVLGTIIVQIGLGTIYTWSLFNQPLVSKFGWNLNSVAITFSITSFSLSFSTLFAGKLQQKLGLRKLIATA GIVLGLGLILSSQVSSLPLLYLLAGVVVGYADGTAYITSLSNLIKWFPNRKGLISGISVSAYGMGSLIFRYINGSLIDSL GVSQAFLYWGIIVLLLVLIGSFFLREAIVSNTVTETLHNDYTPREMMRTKQVYLLFFMLFTSCMGGLYLIGMVKDIGVQL VGLSAATAANAVAMIAIFNTVGRIVLGTLSDKIGRMKIVSATFIIIGLSVFTLSYIPLNYGIYFACVASVAFCFGGNITI FPAIVGDYFGLKNHSTNYGIVYQGFGFGALAGSFIGALLGGFQPTFITIGVLSVISFIISLVIRPPKTEKKKELKHLHRK VA >Mature_402_residues MKQTSINPLLIVLGTIIVQIGLGTIYTWSLFNQPLVSKFGWNLNSVAITFSITSFSLSFSTLFAGKLQQKLGLRKLIATA GIVLGLGLILSSQVSSLPLLYLLAGVVVGYADGTAYITSLSNLIKWFPNRKGLISGISVSAYGMGSLIFRYINGSLIDSL GVSQAFLYWGIIVLLLVLIGSFFLREAIVSNTVTETLHNDYTPREMMRTKQVYLLFFMLFTSCMGGLYLIGMVKDIGVQL VGLSAATAANAVAMIAIFNTVGRIVLGTLSDKIGRMKIVSATFIIIGLSVFTLSYIPLNYGIYFACVASVAFCFGGNITI FPAIVGDYFGLKNHSTNYGIVYQGFGFGALAGSFIGALLGGFQPTFITIGVLSVISFIISLVIRPPKTEKKKELKHLHRK VA
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]
Metaboloic importance: Unknown [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1789969, Length=391, Percent_Identity=43.4782608695652, Blast_Score=326, Evalue=2e-90,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR020846 - InterPro: IPR011701 - InterPro: IPR016196 - InterPro: IPR004741 [H]
Pfam domain/function: PF07690 MFS_1 [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 43384; Mature: 43384
Theoretical pI: Translated: 10.23; Mature: 10.23
Prosite motif: PS50850 MFS
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.7 %Cys (Translated Protein) 2.2 %Met (Translated Protein) 3.0 %Cys+Met (Translated Protein) 0.7 %Cys (Mature Protein) 2.2 %Met (Mature Protein) 3.0 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKQTSINPLLIVLGTIIVQIGLGTIYTWSLFNQPLVSKFGWNLNSVAITFSITSFSLSFS CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHEEHHHHCCHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEEEHHHHH TLFAGKLQQKLGLRKLIATAGIVLGLGLILSSQVSSLPLLYLLAGVVVGYADGTAYITSL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH SNLIKWFPNRKGLISGISVSAYGMGSLIFRYINGSLIDSLGVSQAFLYWGIIVLLLVLIG HHHHHHCCCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SFFLREAIVSNTVTETLHNDYTPREMMRTKQVYLLFFMLFTSCMGGLYLIGMVKDIGVQL HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEE VGLSAATAANAVAMIAIFNTVGRIVLGTLSDKIGRMKIVSATFIIIGLSVFTLSYIPLNY EECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GIYFACVASVAFCFGGNITIFPAIVGDYFGLKNHSTNYGIVYQGFGFGALAGSFIGALLG HHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHC GFQPTFITIGVLSVISFIISLVIRPPKTEKKKELKHLHRKVA CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure MKQTSINPLLIVLGTIIVQIGLGTIYTWSLFNQPLVSKFGWNLNSVAITFSITSFSLSFS CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHEEHHHHCCHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEEEHHHHH TLFAGKLQQKLGLRKLIATAGIVLGLGLILSSQVSSLPLLYLLAGVVVGYADGTAYITSL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH SNLIKWFPNRKGLISGISVSAYGMGSLIFRYINGSLIDSLGVSQAFLYWGIIVLLLVLIG HHHHHHCCCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SFFLREAIVSNTVTETLHNDYTPREMMRTKQVYLLFFMLFTSCMGGLYLIGMVKDIGVQL HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEE VGLSAATAANAVAMIAIFNTVGRIVLGTLSDKIGRMKIVSATFIIIGLSVFTLSYIPLNY EECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GIYFACVASVAFCFGGNITIFPAIVGDYFGLKNHSTNYGIVYQGFGFGALAGSFIGALLG HHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHC GFQPTFITIGVLSVISFIISLVIRPPKTEKKKELKHLHRKVA CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 8041620; 9278503 [H]