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The map label for this gene is 117918877

Identifier: 117918877

GI number: 117918877

Start: 478842

End: 480278

Strand: Direct

Name: 117918877

Synonym: Shewana3_0420

Alternate gene names: NA

Gene position: 478842-480278 (Clockwise)

Preceding gene: 117918868

Following gene: 117918880

Centisome position: 9.63

GC content: 41.2

Gene sequence:

>1437_bases
ATGCAAATATTGAAATCAATCCCGATTGTTAGTCGGATTATCCTGCTCACTTTCTTCGCGCTATTTTTTCTTGGCTCGGT
ATTATCAGGTTATATCACTGGATATCTGGGGGTGGATAACGCTTACGATCTTAAGCGAATCCTAGTAATTATATTTATCG
TGTGTTCAGCGGTTGGCCTTTTGTGGCGACCGAGTATTCCAATAATCGTCACATCGCCTTTTACACTGTGGGTGGTGGCA
AGCCTATTTATACTCGGTTTGATATCAACCATTTTTAGCCAGCATCCATTTTGGTCATTCGTTGAGTTAGCTAATTTTTT
ATTATTGCTCTGTTTGTTTTACGTCATTGGTGTATTGATTGCGGATATAGGCAGAACTGCTGCGCTGCAATACTTTTTTG
GGTTTGCATTATTTTTCTCGATTTGTATTGCAGTTAAGTTTTTCTTGCTGCTGCTATTTCATGCCCTTGATAACAATCGG
CCCGATGTGCATTCTTTAGTGGCTGACTTTATGAATGTAAGGTTTTTCAACCAGTTGCAAGTTGCGCTGCTGCCGCTGTT
GTGTTTGTCTTTTTATATCGAACCACTTAAAAAATATAAACGAGTAGCCATGGTGACCTTTAGTGTGTTGTGGTTAATCC
TGCTGCAATCGGAGGCTCGCGGAGCATTATTAGCGCTGCTAGTGGCGGCTATTGTGGTGTATCGCTTTTTGCCCGCCAGC
TTTGGTAAAGCATTTATTCGCCCCATTATGAAGGCGGTGGCTTTCGGCACGCTTTTATGGCTGGTGCTGATCATTATCAT
TCCACTGTTTATTTTTGATAGCCCAATTTGGCAATTAAGAACCAATAGCTCTGGCCGGATTGATATGTGGATTTATATTT
TGCATGCGATCCCTGAACATATTGGCTTAGGTTACGGGCCAATGAGTTTTGCATGGGCAGAAGCAAGACCTTTACCTAAT
GCTCACCCACATAATGCCCTCATGCAGTTTTTATATGAGTTTGGTGTGGTTGCGTTTATCTTACTGGCGAGTTGGTCGCT
AATAACATTATGGTCAATATTAAAAAGACTTAAATTATTAGGGGCAAAGTCGAGTGAGCATTTGGCTAAAAACTCACAAT
GTAGCCTCGACACCAGCTCACATATAGTCATAGAGACGGACACTACCGATATAGTGTTGGCATTTGCCCTATGCGCAATA
TGGATTTATGCCATGTTTGATGGGGTGATTGTAATGCCATTATCCCAAGCATTATTGGTGGCATTATTGGCACTTAATTG
CCGTCACTATCAATCGCGAGTAATAACACTGCCATTAAAAGTTGCGTTAGTGGCAATATTAATAACCTGTGGTGCATTGT
TAATCGTTAGCCTCGGTGATACCGCGCTTAATCAGCAACTTTATCCAAGATTATGGTTAACTGGGATAATTAATTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TCGATTTACTTGACTAGAACGTGCAAATAATCGGTCATTTGGCGATAAAATCTAACGCTCACCATCGGGGATAAATGCAT
GATGGTATGCTCAATTAAGG

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAAAAATAAAAAAGCCCCAAAAGGGGCTTTCTATAAAACAATAAGATTAACTACTAGCTTTTAATCCAGCACCTTCTTCA
CATTGTTTTTTGGTTGCTTT

Product: O-antigen polymerase

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 478; Mature: 478

Protein sequence:

>478_residues
MQILKSIPIVSRIILLTFFALFFLGSVLSGYITGYLGVDNAYDLKRILVIIFIVCSAVGLLWRPSIPIIVTSPFTLWVVA
SLFILGLISTIFSQHPFWSFVELANFLLLLCLFYVIGVLIADIGRTAALQYFFGFALFFSICIAVKFFLLLLFHALDNNR
PDVHSLVADFMNVRFFNQLQVALLPLLCLSFYIEPLKKYKRVAMVTFSVLWLILLQSEARGALLALLVAAIVVYRFLPAS
FGKAFIRPIMKAVAFGTLLWLVLIIIIPLFIFDSPIWQLRTNSSGRIDMWIYILHAIPEHIGLGYGPMSFAWAEARPLPN
AHPHNALMQFLYEFGVVAFILLASWSLITLWSILKRLKLLGAKSSEHLAKNSQCSLDTSSHIVIETDTTDIVLAFALCAI
WIYAMFDGVIVMPLSQALLVALLALNCRHYQSRVITLPLKVALVAILITCGALLIVSLGDTALNQQLYPRLWLTGIIN

Sequences:

>Translated_478_residues
MQILKSIPIVSRIILLTFFALFFLGSVLSGYITGYLGVDNAYDLKRILVIIFIVCSAVGLLWRPSIPIIVTSPFTLWVVA
SLFILGLISTIFSQHPFWSFVELANFLLLLCLFYVIGVLIADIGRTAALQYFFGFALFFSICIAVKFFLLLLFHALDNNR
PDVHSLVADFMNVRFFNQLQVALLPLLCLSFYIEPLKKYKRVAMVTFSVLWLILLQSEARGALLALLVAAIVVYRFLPAS
FGKAFIRPIMKAVAFGTLLWLVLIIIIPLFIFDSPIWQLRTNSSGRIDMWIYILHAIPEHIGLGYGPMSFAWAEARPLPN
AHPHNALMQFLYEFGVVAFILLASWSLITLWSILKRLKLLGAKSSEHLAKNSQCSLDTSSHIVIETDTTDIVLAFALCAI
WIYAMFDGVIVMPLSQALLVALLALNCRHYQSRVITLPLKVALVAILITCGALLIVSLGDTALNQQLYPRLWLTGIIN
>Mature_478_residues
MQILKSIPIVSRIILLTFFALFFLGSVLSGYITGYLGVDNAYDLKRILVIIFIVCSAVGLLWRPSIPIIVTSPFTLWVVA
SLFILGLISTIFSQHPFWSFVELANFLLLLCLFYVIGVLIADIGRTAALQYFFGFALFFSICIAVKFFLLLLFHALDNNR
PDVHSLVADFMNVRFFNQLQVALLPLLCLSFYIEPLKKYKRVAMVTFSVLWLILLQSEARGALLALLVAAIVVYRFLPAS
FGKAFIRPIMKAVAFGTLLWLVLIIIIPLFIFDSPIWQLRTNSSGRIDMWIYILHAIPEHIGLGYGPMSFAWAEARPLPN
AHPHNALMQFLYEFGVVAFILLASWSLITLWSILKRLKLLGAKSSEHLAKNSQCSLDTSSHIVIETDTTDIVLAFALCAI
WIYAMFDGVIVMPLSQALLVALLALNCRHYQSRVITLPLKVALVAILITCGALLIVSLGDTALNQQLYPRLWLTGIIN

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 53563; Mature: 53563

Theoretical pI: Translated: 9.15; Mature: 9.15

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.7 %Cys     (Translated Protein)
1.9 %Met     (Translated Protein)
3.6 %Cys+Met (Translated Protein)
1.7 %Cys     (Mature Protein)
1.9 %Met     (Mature Protein)
3.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA