Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 117918538

Identifier: 117918538

GI number: 117918538

Start: 91041

End: 92351

Strand: Direct

Name: 117918538

Synonym: Shewana3_0079

Alternate gene names: NA

Gene position: 91041-92351 (Clockwise)

Preceding gene: 117918537

Following gene: 117918539

Centisome position: 1.83

GC content: 52.17

Gene sequence:

>1311_bases
ATGAGTGCCGCGAAACCCATAGCAGAATCAACGACCCGCATCGGTACTAGCCATTCGCTCAATCCTTTTAACGGTATGTT
GCGCCTATGGTTTTTTGATGTGGGCAGCGTGAGTTTTATAGGCACTGGCATATTTGGCTTGGCCCTGAGCGTGTTAGCGG
GATGGGCGGGGCAAAAGGCGAGTTTCGATATTTTTGTCACTATGGGCCTAGTGTCTACCTCGGCAGCGGTGGCATGGCAG
CTGATCCGCCTGATGGCGAGTGAGTGCTCCATCTTAATCCCCCGTTATCGGCAGAATATTTTTATCCAGTGTGAAGTGAT
GCTGATAGGCGCCTTTAGCCTTGCGGTGTTGCAATGCGTGCTGTTTGACCTGACCGATACTCTGTCGTTACTGGTCTTTG
CCCAAGGGATAAGCCTAGGGTTTATCTTGCTGTGCCTGCGGCAAACCCAATGGTTTTACAGCTCATTTTTACTGTTTATC
TTAGTGCCGTTTTCCAACGAGTTGGCGGAGCAAGTGCCGCTGTGGCTAAGCATCATAGTGCTGTTTGTGTTAGCGGCCTT
AATTTGGCGCCGATGCTTAGTGTTACCTTGGCGGGTAGAGGCACGAAGTGTGTATCTTAACGGCTTGGAAATGGGCTGGT
TTTGGCTGCCTAGCCTGCAATCCATACGGATATTGACTCGGTTAGAGCGTTATCTGCATCCGGTTAACTTCTTTATCGGT
CCTATGCTGACCGTGTTGCTGCTGTTGCTCCCCGTGCTAACCATCGGGCTTGGGATCGTCTCCCACGAGCTGCATTGGAA
CTTCCCGGTATTACTGCTACTGGCACAATTTAGTGTGATTAGTTGCTCGTTGGTGCATTGGAGCCGTGTACAACGCTCTC
GGGCGACTGAAATGCTGCTGTTGATGCCAAGCTTCGACGGCCGTGCTGGCTTAGTTAAGGCCTTTGGTCGTGGTCAACAA
CGCTTGCTGCTTCTGCTCAGTTTGAGCGTGTTAATCTGCAGTCTGTTTGTCACTTGGCTCGATGGTGATTTGAGCTTGCC
TCTGCTGGCGCACATAGTGATGAGCACGTATTGGGCCTGCGCCTTAGTGTTAGGGCTAGGTTGTTTGTGTCGCCGCGTAT
TGCAGGTGAGCCTGACCATGCTGGTGGTGCTCGGGCATTCGCTCTGGGTGTCTATTAGCCTCGCGGCGCTGCAACACGAT
GGAAGTCTGCTCTATTGGTCGCTGGGTAATCTGGTGCTGCTGATCCTTGGGCAAATCGCACTGATTTGGGGCAGTAAAAA
GCTCTGGCAGGGCGACATTACCGGGCTCTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATTCTGTTCTGGTGGATAGGGGCGATGTGGAGCTTAATTTGCCCGGCGTGCAGCGCAGCGAAGCGCTGAATTTGGAACAA
CTCTTTGTGGAGCTGCACAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTGCCCTGAAATGGCGTGATTTGGGCGACATTTGCACAAGATTAGAGCAAAAACTCTTAGTTTTTAGCTTGCCTTCAGGT
AGAATGCCGCAAAAGCGGTA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 436; Mature: 435

Protein sequence:

>436_residues
MSAAKPIAESTTRIGTSHSLNPFNGMLRLWFFDVGSVSFIGTGIFGLALSVLAGWAGQKASFDIFVTMGLVSTSAAVAWQ
LIRLMASECSILIPRYRQNIFIQCEVMLIGAFSLAVLQCVLFDLTDTLSLLVFAQGISLGFILLCLRQTQWFYSSFLLFI
LVPFSNELAEQVPLWLSIIVLFVLAALIWRRCLVLPWRVEARSVYLNGLEMGWFWLPSLQSIRILTRLERYLHPVNFFIG
PMLTVLLLLLPVLTIGLGIVSHELHWNFPVLLLLAQFSVISCSLVHWSRVQRSRATEMLLLMPSFDGRAGLVKAFGRGQQ
RLLLLLSLSVLICSLFVTWLDGDLSLPLLAHIVMSTYWACALVLGLGCLCRRVLQVSLTMLVVLGHSLWVSISLAALQHD
GSLLYWSLGNLVLLILGQIALIWGSKKLWQGDITGL

Sequences:

>Translated_436_residues
MSAAKPIAESTTRIGTSHSLNPFNGMLRLWFFDVGSVSFIGTGIFGLALSVLAGWAGQKASFDIFVTMGLVSTSAAVAWQ
LIRLMASECSILIPRYRQNIFIQCEVMLIGAFSLAVLQCVLFDLTDTLSLLVFAQGISLGFILLCLRQTQWFYSSFLLFI
LVPFSNELAEQVPLWLSIIVLFVLAALIWRRCLVLPWRVEARSVYLNGLEMGWFWLPSLQSIRILTRLERYLHPVNFFIG
PMLTVLLLLLPVLTIGLGIVSHELHWNFPVLLLLAQFSVISCSLVHWSRVQRSRATEMLLLMPSFDGRAGLVKAFGRGQQ
RLLLLLSLSVLICSLFVTWLDGDLSLPLLAHIVMSTYWACALVLGLGCLCRRVLQVSLTMLVVLGHSLWVSISLAALQHD
GSLLYWSLGNLVLLILGQIALIWGSKKLWQGDITGL
>Mature_435_residues
SAAKPIAESTTRIGTSHSLNPFNGMLRLWFFDVGSVSFIGTGIFGLALSVLAGWAGQKASFDIFVTMGLVSTSAAVAWQL
IRLMASECSILIPRYRQNIFIQCEVMLIGAFSLAVLQCVLFDLTDTLSLLVFAQGISLGFILLCLRQTQWFYSSFLLFIL
VPFSNELAEQVPLWLSIIVLFVLAALIWRRCLVLPWRVEARSVYLNGLEMGWFWLPSLQSIRILTRLERYLHPVNFFIGP
MLTVLLLLLPVLTIGLGIVSHELHWNFPVLLLLAQFSVISCSLVHWSRVQRSRATEMLLLMPSFDGRAGLVKAFGRGQQR
LLLLLSLSVLICSLFVTWLDGDLSLPLLAHIVMSTYWACALVLGLGCLCRRVLQVSLTMLVVLGHSLWVSISLAALQHDG
SLLYWSLGNLVLLILGQIALIWGSKKLWQGDITGL

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 48566; Mature: 48435

Theoretical pI: Translated: 8.71; Mature: 8.71

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

2.3 %Cys     (Translated Protein)
2.5 %Met     (Translated Protein)
4.8 %Cys+Met (Translated Protein)
2.3 %Cys     (Mature Protein)
2.3 %Met     (Mature Protein)
4.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSAAKPIAESTTRIGTSHSLNPFNGMLRLWFFDVGSVSFIGTGIFGLALSVLAGWAGQKA
CCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
SFDIFVTMGLVSTSAAVAWQLIRLMASECSILIPRYRQNIFIQCEVMLIGAFSLAVLQCV
CEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEECCCCCCEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHH
LFDLTDTLSLLVFAQGISLGFILLCLRQTQWFYSSFLLFILVPFSNELAEQVPLWLSIIV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCHHHHHHHHHHHHHHH
LFVLAALIWRRCLVLPWRVEARSVYLNGLEMGWFWLPSLQSIRILTRLERYLHPVNFFIG
HHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHEEEECEEECEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
PMLTVLLLLLPVLTIGLGIVSHELHWNFPVLLLLAQFSVISCSLVHWSRVQRSRATEMLL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEE
LMPSFDGRAGLVKAFGRGQQRLLLLLSLSVLICSLFVTWLDGDLSLPLLAHIVMSTYWAC
EEECCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
ALVLGLGCLCRRVLQVSLTMLVVLGHSLWVSISLAALQHDGSLLYWSLGNLVLLILGQIA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHH
LIWGSKKLWQGDITGL
HHCCCCHHCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure 
SAAKPIAESTTRIGTSHSLNPFNGMLRLWFFDVGSVSFIGTGIFGLALSVLAGWAGQKA
CCCCCCHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
SFDIFVTMGLVSTSAAVAWQLIRLMASECSILIPRYRQNIFIQCEVMLIGAFSLAVLQCV
CEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEECCCCCCEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHH
LFDLTDTLSLLVFAQGISLGFILLCLRQTQWFYSSFLLFILVPFSNELAEQVPLWLSIIV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCHHHHHHHHHHHHHHH
LFVLAALIWRRCLVLPWRVEARSVYLNGLEMGWFWLPSLQSIRILTRLERYLHPVNFFIG
HHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHEEEECEEECEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
PMLTVLLLLLPVLTIGLGIVSHELHWNFPVLLLLAQFSVISCSLVHWSRVQRSRATEMLL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEE
LMPSFDGRAGLVKAFGRGQQRLLLLLSLSVLICSLFVTWLDGDLSLPLLAHIVMSTYWAC
EEECCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
ALVLGLGCLCRRVLQVSLTMLVVLGHSLWVSISLAALQHDGSLLYWSLGNLVLLILGQIA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHH
LIWGSKKLWQGDITGL
HHCCCCHHCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA