Definition | Borrelia afzelii PKo plasmid lp60-2, complete sequence. |
---|---|
Accession | NC_008565 |
Length | 59,804 |
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The map label for this gene is 117621655
Identifier: 117621655
GI number: 117621655
Start: 7447
End: 11277
Strand: Reverse
Name: 117621655
Synonym: BAPKO_2508
Alternate gene names: NA
Gene position: 11277-7447 (Counterclockwise)
Preceding gene: 117621656
Following gene: 117621649
Centisome position: 18.86
GC content: 25.37
Gene sequence:
>3831_bases ATGAAAACTAAAAACATTGTAAAAACAAATGATCCAAATATATCTCTTTATAAAGAACTATCAGAAGATTTTATTAAAAA AGAGAATATTAATAAACTAAAAGACTTTTTTATTCTTATAAAGAAAAAACTTTCTTCAATAGATGATAATTCAACAGAAG CAAATATAGAGTCTTTACTAAGATTTATATTTGAAGAACTAAATTATTCAGTAGAACAACAAAAAGGTGGGCAAATAGAA GGGGTGGATTCTAGAGTAGATATACTACTTTTTGAAAATGATAAAGACAAAGTAGATTTTAATAATAAATTAGAAGAAGC TAAAAAGAACAATGAGCCTATTCCAGCTGAAGATATCTTACTTATAGTAGAAGTTAAGCGTCCATCATTTAGTTTTAATA CTAAAGATAAAGTAAAAGAAGCAGAAGATCAGCTATATAGATATCTAAATCAATATCAAAAACATTATGGGATGCTTTCA AATGGAAAAGTGTGGAGATTATATGACAAATCTAAAGTCCTTTATGGAGAAAAAAGATATATTGAATTTGATTTTTCTAA AGTTGAAGAAAAAGAAGAATACAAAGAACAAGAATGGTTTGTTTTATTCATCTACCTTATAAGAAAAGAAAGATACCTAA AGACAAGCAATGTAATAGAGATTGAAAAAGAACAAATATCTAAAGAAAAAGAGATAATTCAAAAAACTCTTAGAGAGATA CTTTATGAGAAGCCTGACGACTCTGTAATATTTAAAATTGCAAAAAATATATATGACAAAGAATTTAAAGTATCAGACAA GGAAATTACCCAACATATTTTAGCTAGCATTCTTGAAGAATCAATTATTTTTATTTTAAGAATATTTTTTATTGCATATA TTGAAGATAACGAAATTTTTAAGAAAATATTAGAAGAAAATAAGCTATACAGGTCTTCTATATCTTTTAGATATTTTTTT TATGATGAAAATACAAAAAATAAATTAGGATATAAAAAAATAATAACAATTTTTAATTTACTTGATAAAGGAAGTGATGC AATAAAGTTTCCTATATTTAATGGAGGATTATTTGCAGAAGACAAGGTTAAATATTTAAATAATGAAAGTTTACTAAGTA TTAGTGAGCTTGAAGAAATACTGGTTAAAATACTTTTCTTTGAAGAAAAAAATATTAAAGATGAAAAATTTGTAGAGTAT TCAAAGCTAGATCCTAAAAGTTTTGGAGAATTGTACGAGACTCTACTTGAATATGACCTAAGAATTGCAGATACTACTGT TCATCGTATTGTTGAAGACGGGGTTTATCTCATTCGTACTGAAGAAGAGCTTGAAAATAAGCAAGTAAACAAAGTTGCTA CATACTATAAAGGCAATATTTATCTTACATCTAGATCGCTTGATAGAAAGAAAAGCGGAGCATATTATACCCCGGATGAC TTAACTGACTTTATGGTCATATCATCAATTGAAGAACAGCTTAAAACTAAGTCCCCTTTAGATATAAAAATCATTGATAA TTCTTGTGGATCAGGGCATTTTTTAATTTCTTGTTTAGATTACTTAACAGAAAAAGTATGGTACGAGCTAGATAAATTTG AAGATGTAAAAAAAGAGCTTGATAAAGAATATAGAGCTATTTTTAAAGAAAGTGAAGAATATGATGTTCAGGATAGTATA AGTAAAGAATTGGTACTTAAAAGGATGCTATTAAAGAAGTGTATTTATGGTGTTGATATTAATCCTATTTCGGTTGAAAT TACTATGCTAAGCTTATGGATTAATACCTTTATTTTTGGAACACCACTAAGCTTTATTGAACATCACATAAAAGTAGGAA ATGCCCTGCTAGGATATACCAAGGATGAATTTTTTGATATTACAAAAAAGAAATTTGAAAGTGGATTTTCGTTATTTAAA GAAAGAATTAAAGAAATTACAACTATTTTAGAAGATAGCTATCAAAAAATTAAAAGTATTAACGATACTACTAAAGAAGA TATAGAAAAATCCAAAAAGATATACAAAGAATATGAGGAAAGTGAAGATACAGAGTATTTAAGAATAATATTTTCTTTAA TCAAACTTTATTCATTGTCTTTTGACAAATCTTTAAAAATAGAATTTAGTGATATTACAGCTATAATTAGTTTAATTGAA AATATTTTGGGCAATAAAACTTCTAGCGAAAATAAAGAAAAAATAGAAAAAATTAGAAAATTAAGTAGCTACTATAAACT TTTCCACTATGGAATTGAGTTCCCAGATATTGAGGAAGGATTTGATATTGTAATTGGAAATCCTCCATGGGAAAAAACCA AGTTTAATGAATCTGAATTTTTTTCAAAACATATTCCTAATTACAGAAAACTAAACATAAAAGAACAAAATAAGATAAAG CAAGAAATACTTAGTAAAGATAATCATCCTTTGAATATTGAATACAATGGAGAAAAAAATAGTATAACTGCCATTAACAA TATTTATAAATTTGATTTTAAAGACTTTTCTAGTGGTGGAGACCCCAATCTTTTTAGATATTTTGTTGCATTTAATTTAA AATTAATAAAACCGGGGGGCAATTTAACTTATCTAACCCCCTCTAGTCTTTGGAGTGAATATAGTTCTAGAGAACTAAGA AAGCATATTTTTAATAACTATAAACTTAGCTATATTTACCAATTTGAAAACAAAAAAAGATTTAAAGATGTACATTCAAG TTTTAAATTTGCTATATTTCAACTTAGTAATATCAAAGCTTCTACATCAAGTTTTAAAGCAAAATTTATGATTCAGAGTA GTGATAATATTTTAAAAGAAATAACTAGAGACTTGAAAGACAATAAAGACAATGCTTACCAAGGAATTGAATTAAAAATA GACCAAATTAAAAAACTATCTCCTATTCAAGAGTCAATAATAGAAATTAAAAATAATGAGGAATTTAATTTAATTAGAAA AATGTTTAATTCATTTAGTGTTCTTCGTGAGGAATATATTGATTTCGGAGTAGGACTCAATTTAACAATTCATAAAGCAT TGTATAAAGAATATAATAATAAAAACTTTGTATTTCTTTATTCTGGAGCTAATATTCATCAGTTTAATTCAAGATTTTTT GAAAATAAGGATGCAAAAGAAAGTTCTAAGTTTTTCTGGATAGATAAAGAAGATTTAGAAAAAATATTAGCTAAAGACGA TCGACATCAAACTAAAAGAGTATTCTATAGAGCAATTGCAAGAAACACAGATGAAAGAACTATGATTAGTACTTTGTCTC CTAAAAATTGTTATTGTGTAAATTCAATGTATATAAATTATGAGAAAACACCAATATCTATTTATAAGAAATTATTTATT ATATCTATTTTTAATTCATTAGCATTTGATTTTTTGCTAAGAAGATTTGTTGATTCAAATGTGCTAAAGTCATGCCTTTA TCAATGTCCAATGCCCCAGCCCGAAAAAGATGAAATTCTAGCTAATCCGCTATACTTAACTTTAATAAAAAATACTTCCT TGCTAATAGCTAAAAATGATCTGGGGAACTTTAAATATTTACTTTACTTGGAACATTTTAAGTTTAGTAAAGAAGAAGTT GATAAAATCTTAAATCTAGATACCAAAGATGAATTTTTTAAAGAAAAAGAAAATGAAAACAATTTTATTGTAGCCAGTCT TTATTCACTTACCAAAGAAGATTTTATGGTTTTGCTTAATGATTTTAAGGTATTGAAAAATAAAAAAGGAGAAGACTATA TTTTGTCTTTAATAAAAGGATATGAGAATTATTTAAGAATAAATAAACTTAACTCAACAATTCAATCTTAG
Upstream 100 bases:
>100_bases CAATCTTAGAACATATTATGAGTATTAAGAATAGCTAAAAAAGATTTATAAATAACATAAATGGGTTTTATAGGCATTGT AGTTATTGTAGGCATAAATA
Downstream 100 bases:
>100_bases TTAATTCTTTTAAAGAGATTATTATTAATTTAATAAAATATATGTTTTTGCGAAAAATTTTACTATAAAATGATGAAAAA GTTCTTTTTAAGAAAATGAT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: Type I Restriction R Protein; Type II Restriction Methylase Subunit; Restriction/; Transcriptional Regulator; Type IIS Restriction- Protein; ATP Phosphoribosyltransferase; Type II Restriction Methylase Subunits; Type II Restriction; Type II Restriction Methylase; Type IV Site-Specific Deoxyribonuclease; Eco57I Restriction Endonuclease; Restriction /; Plasmid-Related Protein; Type II Restriction/; Divergent AAA Domain Family; Fused Endonuclease-Methyltransferase; Type I Restriction Restriction /
Number of amino acids: Translated: 1276; Mature: 1276
Protein sequence:
>1276_residues MKTKNIVKTNDPNISLYKELSEDFIKKENINKLKDFFILIKKKLSSIDDNSTEANIESLLRFIFEELNYSVEQQKGGQIE GVDSRVDILLFENDKDKVDFNNKLEEAKKNNEPIPAEDILLIVEVKRPSFSFNTKDKVKEAEDQLYRYLNQYQKHYGMLS NGKVWRLYDKSKVLYGEKRYIEFDFSKVEEKEEYKEQEWFVLFIYLIRKERYLKTSNVIEIEKEQISKEKEIIQKTLREI LYEKPDDSVIFKIAKNIYDKEFKVSDKEITQHILASILEESIIFILRIFFIAYIEDNEIFKKILEENKLYRSSISFRYFF YDENTKNKLGYKKIITIFNLLDKGSDAIKFPIFNGGLFAEDKVKYLNNESLLSISELEEILVKILFFEEKNIKDEKFVEY SKLDPKSFGELYETLLEYDLRIADTTVHRIVEDGVYLIRTEEELENKQVNKVATYYKGNIYLTSRSLDRKKSGAYYTPDD LTDFMVISSIEEQLKTKSPLDIKIIDNSCGSGHFLISCLDYLTEKVWYELDKFEDVKKELDKEYRAIFKESEEYDVQDSI SKELVLKRMLLKKCIYGVDINPISVEITMLSLWINTFIFGTPLSFIEHHIKVGNALLGYTKDEFFDITKKKFESGFSLFK ERIKEITTILEDSYQKIKSINDTTKEDIEKSKKIYKEYEESEDTEYLRIIFSLIKLYSLSFDKSLKIEFSDITAIISLIE NILGNKTSSENKEKIEKIRKLSSYYKLFHYGIEFPDIEEGFDIVIGNPPWEKTKFNESEFFSKHIPNYRKLNIKEQNKIK QEILSKDNHPLNIEYNGEKNSITAINNIYKFDFKDFSSGGDPNLFRYFVAFNLKLIKPGGNLTYLTPSSLWSEYSSRELR KHIFNNYKLSYIYQFENKKRFKDVHSSFKFAIFQLSNIKASTSSFKAKFMIQSSDNILKEITRDLKDNKDNAYQGIELKI DQIKKLSPIQESIIEIKNNEEFNLIRKMFNSFSVLREEYIDFGVGLNLTIHKALYKEYNNKNFVFLYSGANIHQFNSRFF ENKDAKESSKFFWIDKEDLEKILAKDDRHQTKRVFYRAIARNTDERTMISTLSPKNCYCVNSMYINYEKTPISIYKKLFI ISIFNSLAFDFLLRRFVDSNVLKSCLYQCPMPQPEKDEILANPLYLTLIKNTSLLIAKNDLGNFKYLLYLEHFKFSKEEV DKILNLDTKDEFFKEKENENNFIVASLYSLTKEDFMVLLNDFKVLKNKKGEDYILSLIKGYENYLRINKLNSTIQS
Sequences:
>Translated_1276_residues MKTKNIVKTNDPNISLYKELSEDFIKKENINKLKDFFILIKKKLSSIDDNSTEANIESLLRFIFEELNYSVEQQKGGQIE GVDSRVDILLFENDKDKVDFNNKLEEAKKNNEPIPAEDILLIVEVKRPSFSFNTKDKVKEAEDQLYRYLNQYQKHYGMLS NGKVWRLYDKSKVLYGEKRYIEFDFSKVEEKEEYKEQEWFVLFIYLIRKERYLKTSNVIEIEKEQISKEKEIIQKTLREI LYEKPDDSVIFKIAKNIYDKEFKVSDKEITQHILASILEESIIFILRIFFIAYIEDNEIFKKILEENKLYRSSISFRYFF YDENTKNKLGYKKIITIFNLLDKGSDAIKFPIFNGGLFAEDKVKYLNNESLLSISELEEILVKILFFEEKNIKDEKFVEY SKLDPKSFGELYETLLEYDLRIADTTVHRIVEDGVYLIRTEEELENKQVNKVATYYKGNIYLTSRSLDRKKSGAYYTPDD LTDFMVISSIEEQLKTKSPLDIKIIDNSCGSGHFLISCLDYLTEKVWYELDKFEDVKKELDKEYRAIFKESEEYDVQDSI SKELVLKRMLLKKCIYGVDINPISVEITMLSLWINTFIFGTPLSFIEHHIKVGNALLGYTKDEFFDITKKKFESGFSLFK ERIKEITTILEDSYQKIKSINDTTKEDIEKSKKIYKEYEESEDTEYLRIIFSLIKLYSLSFDKSLKIEFSDITAIISLIE NILGNKTSSENKEKIEKIRKLSSYYKLFHYGIEFPDIEEGFDIVIGNPPWEKTKFNESEFFSKHIPNYRKLNIKEQNKIK QEILSKDNHPLNIEYNGEKNSITAINNIYKFDFKDFSSGGDPNLFRYFVAFNLKLIKPGGNLTYLTPSSLWSEYSSRELR KHIFNNYKLSYIYQFENKKRFKDVHSSFKFAIFQLSNIKASTSSFKAKFMIQSSDNILKEITRDLKDNKDNAYQGIELKI DQIKKLSPIQESIIEIKNNEEFNLIRKMFNSFSVLREEYIDFGVGLNLTIHKALYKEYNNKNFVFLYSGANIHQFNSRFF ENKDAKESSKFFWIDKEDLEKILAKDDRHQTKRVFYRAIARNTDERTMISTLSPKNCYCVNSMYINYEKTPISIYKKLFI ISIFNSLAFDFLLRRFVDSNVLKSCLYQCPMPQPEKDEILANPLYLTLIKNTSLLIAKNDLGNFKYLLYLEHFKFSKEEV DKILNLDTKDEFFKEKENENNFIVASLYSLTKEDFMVLLNDFKVLKNKKGEDYILSLIKGYENYLRINKLNSTIQS >Mature_1276_residues MKTKNIVKTNDPNISLYKELSEDFIKKENINKLKDFFILIKKKLSSIDDNSTEANIESLLRFIFEELNYSVEQQKGGQIE GVDSRVDILLFENDKDKVDFNNKLEEAKKNNEPIPAEDILLIVEVKRPSFSFNTKDKVKEAEDQLYRYLNQYQKHYGMLS NGKVWRLYDKSKVLYGEKRYIEFDFSKVEEKEEYKEQEWFVLFIYLIRKERYLKTSNVIEIEKEQISKEKEIIQKTLREI LYEKPDDSVIFKIAKNIYDKEFKVSDKEITQHILASILEESIIFILRIFFIAYIEDNEIFKKILEENKLYRSSISFRYFF YDENTKNKLGYKKIITIFNLLDKGSDAIKFPIFNGGLFAEDKVKYLNNESLLSISELEEILVKILFFEEKNIKDEKFVEY SKLDPKSFGELYETLLEYDLRIADTTVHRIVEDGVYLIRTEEELENKQVNKVATYYKGNIYLTSRSLDRKKSGAYYTPDD LTDFMVISSIEEQLKTKSPLDIKIIDNSCGSGHFLISCLDYLTEKVWYELDKFEDVKKELDKEYRAIFKESEEYDVQDSI SKELVLKRMLLKKCIYGVDINPISVEITMLSLWINTFIFGTPLSFIEHHIKVGNALLGYTKDEFFDITKKKFESGFSLFK ERIKEITTILEDSYQKIKSINDTTKEDIEKSKKIYKEYEESEDTEYLRIIFSLIKLYSLSFDKSLKIEFSDITAIISLIE NILGNKTSSENKEKIEKIRKLSSYYKLFHYGIEFPDIEEGFDIVIGNPPWEKTKFNESEFFSKHIPNYRKLNIKEQNKIK QEILSKDNHPLNIEYNGEKNSITAINNIYKFDFKDFSSGGDPNLFRYFVAFNLKLIKPGGNLTYLTPSSLWSEYSSRELR KHIFNNYKLSYIYQFENKKRFKDVHSSFKFAIFQLSNIKASTSSFKAKFMIQSSDNILKEITRDLKDNKDNAYQGIELKI DQIKKLSPIQESIIEIKNNEEFNLIRKMFNSFSVLREEYIDFGVGLNLTIHKALYKEYNNKNFVFLYSGANIHQFNSRFF ENKDAKESSKFFWIDKEDLEKILAKDDRHQTKRVFYRAIARNTDERTMISTLSPKNCYCVNSMYINYEKTPISIYKKLFI ISIFNSLAFDFLLRRFVDSNVLKSCLYQCPMPQPEKDEILANPLYLTLIKNTSLLIAKNDLGNFKYLLYLEHFKFSKEEV DKILNLDTKDEFFKEKENENNFIVASLYSLTKEDFMVLLNDFKVLKNKKGEDYILSLIKGYENYLRINKLNSTIQS
Specific function: Unknown
COG id: COG1002
COG function: function code V; Type II restriction enzyme, methylase subunits
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 151100; Mature: 151100
Theoretical pI: Translated: 6.51; Mature: 6.51
Prosite motif: PS00092 N6_MTASE
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.5 %Cys (Translated Protein) 0.9 %Met (Translated Protein) 1.4 %Cys+Met (Translated Protein) 0.5 %Cys (Mature Protein) 0.9 %Met (Mature Protein) 1.4 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKTKNIVKTNDPNISLYKELSEDFIKKENINKLKDFFILIKKKLSSIDDNSTEANIESLL CCCCCCEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHH RFIFEELNYSVEQQKGGQIEGVDSRVDILLFENDKDKVDFNNKLEEAKKNNEPIPAEDIL HHHHHHHCCCHHHCCCCCEECCCCCEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCEE LIVEVKRPSFSFNTKDKVKEAEDQLYRYLNQYQKHYGMLSNGKVWRLYDKSKVLYGEKRY EEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCEEEECCCEE IEFDFSKVEEKEEYKEQEWFVLFIYLIRKERYLKTSNVIEIEKEQISKEKEIIQKTLREI EEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHH LYEKPDDSVIFKIAKNIYDKEFKVSDKEITQHILASILEESIIFILRIFFIAYIEDNEIF HHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH KKILEENKLYRSSISFRYFFYDENTKNKLGYKKIITIFNLLDKGSDAIKFPIFNGGLFAE HHHHHHCHHHHHCCEEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCC DKVKYLNNESLLSISELEEILVKILFFEEKNIKDEKFVEYSKLDPKSFGELYETLLEYDL CHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCC RIADTTVHRIVEDGVYLIRTEEELENKQVNKVATYYKGNIYLTSRSLDRKKSGAYYTPDD 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RNTDERTMISTLSPKNCYCVNSMYINYEKTPISIYKKLFIISIFNSLAFDFLLRRFVDSN CCCCCHHHEEECCCCCEEEEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VLKSCLYQCPMPQPEKDEILANPLYLTLIKNTSLLIAKNDLGNFKYLLYLEHFKFSKEEV HHHHHHHHCCCCCCCCCHHHCCCEEEEEECCCEEEEEECCCCCEEEEEEEEHHCCCHHHH DKILNLDTKDEFFKEKENENNFIVASLYSLTKEDFMVLLNDFKVLKNKKGEDYILSLIKG HHHHCCCCHHHHHHHCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHH YENYLRINKLNSTIQS HHHHEEHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA