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The map label for this gene is 116516720

Identifier: 116516720

GI number: 116516720

Start: 1687191

End: 1688384

Strand: Reverse

Name: 116516720

Synonym: SPD_1672

Alternate gene names: NA

Gene position: 1688384-1687191 (Counterclockwise)

Preceding gene: 116515647

Following gene: 116515355

Centisome position: 82.52

GC content: 37.86

Gene sequence:

>1194_bases
TTGAAATCAATAGGCTTTATTGAAAAGCTGAAGGGGTTGTCTAGTAAAGAGCTGATTTTATTGGGAATTATCCTAAGTAT
CTTTTTACCCTTTTATCTTTTTGTAGTTGTACTCTGTTTATATATTATCAGTTTGATTTTTACAGGAGACATGAAAAGTA
TTCTTCAGAAAATGGGGGAGCATCCGATGCTGCTTCTTTTTCTTAGCTATAGTACTGTTATATCCATTCTTGCACAAAAT
TGGATGGGTCTTGTGGCTTCAGTAGGAATGTTTCTATTTACTATTTTCTTTTTGCACTATCAGTCGATTTTATCCCATAA
ATTCTTTCGATTGATTTTGCAGTTCGTCTTGTTTGGTAGTGTCTTGTCAGCTGCTTTTGCCAGTTTAGAACATTTCCAAA
TTGTGAAGAAATTTAACTATGCTTTTCTTTCACCCAATATGCAGGTGTGGCATCAGAACCGGGCAGAAGTGACCTTCTTT
AATCCTAATTATTATGGAATTATTTGTTGTTTCTGTATTATGATTGCTTTCTATCTGTTTACAACGACCAAGTTGAATTG
GTTGAAAGTATTCTGTGTGATTGCAGGCTTTGTTAATCTCTTTGGTTTGAACTTTACTCAAAATCGAACTGCCTTTCCTG
CTATTATCGCTGGAGCAATTATCTATCTCTTTACGACTATTAAAAACTGGAAGGCCTTTTGGCTTAGTATTGGGGTCTTC
GCGATTGGTTTGAGTTTCCTCTTTTCTAGTGATTTGGGAGTTCGAATGGGTACTTTAGACTCTTCTATGGAAGAACGCAT
TTCTATCTGGGATGCTGGGATGGCCTTGTTTAAGCAAAATCCTTTTTGGGGTGAAGGGCCATTGACCTATATGCACTCTT
ATCCTCGGATACATGCTCCTTATCATGAACATGCCCACAGTCTTTATATTGATACGATTCTGAGTTACGGAATTGTGGGT
ACCATTTTATTAGTTTTGTCTTCTGTTGCTCCTGTTCGCTTGATGATGGATATGAGTCAGGAGTCGGGGAAACGTCCGAT
TATCGGCCTTTATCTATCTTTCCTTACAGTGGTTGCTGTGCACGGAATTTTTGACTTGGCTCTCTTCTGGATTCAGTCAG
GCTTTATTTTCTTGCTAGTTATGTGCAGTATTCCATTGGAGCATCGAATGTTGGTATCGGACATGACGGATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GGAAAACGTTTCCTTTGTTTTCAAATTGCTAAAAAAGTGGTACAATATAGGATAGCTTACTATTATCTGAATCAGCAGAT
TTGGAGAGAAAGGATTCATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
GTTTTATAAGTTTGAAATCTTCTACCTTGGGTAGGAGATTTTTTTATACGATGGGCATGTCGTGCATCTGAGGTGTAAGT
CCTCTGTAGGGATCCACTAC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: O-Antigen Polymerase Superfamily

Number of amino acids: Translated: 397; Mature: 397

Protein sequence:

>397_residues
MKSIGFIEKLKGLSSKELILLGIILSIFLPFYLFVVVLCLYIISLIFTGDMKSILQKMGEHPMLLLFLSYSTVISILAQN
WMGLVASVGMFLFTIFFLHYQSILSHKFFRLILQFVLFGSVLSAAFASLEHFQIVKKFNYAFLSPNMQVWHQNRAEVTFF
NPNYYGIICCFCIMIAFYLFTTTKLNWLKVFCVIAGFVNLFGLNFTQNRTAFPAIIAGAIIYLFTTIKNWKAFWLSIGVF
AIGLSFLFSSDLGVRMGTLDSSMEERISIWDAGMALFKQNPFWGEGPLTYMHSYPRIHAPYHEHAHSLYIDTILSYGIVG
TILLVLSSVAPVRLMMDMSQESGKRPIIGLYLSFLTVVAVHGIFDLALFWIQSGFIFLLVMCSIPLEHRMLVSDMTD

Sequences:

>Translated_397_residues
MKSIGFIEKLKGLSSKELILLGIILSIFLPFYLFVVVLCLYIISLIFTGDMKSILQKMGEHPMLLLFLSYSTVISILAQN
WMGLVASVGMFLFTIFFLHYQSILSHKFFRLILQFVLFGSVLSAAFASLEHFQIVKKFNYAFLSPNMQVWHQNRAEVTFF
NPNYYGIICCFCIMIAFYLFTTTKLNWLKVFCVIAGFVNLFGLNFTQNRTAFPAIIAGAIIYLFTTIKNWKAFWLSIGVF
AIGLSFLFSSDLGVRMGTLDSSMEERISIWDAGMALFKQNPFWGEGPLTYMHSYPRIHAPYHEHAHSLYIDTILSYGIVG
TILLVLSSVAPVRLMMDMSQESGKRPIIGLYLSFLTVVAVHGIFDLALFWIQSGFIFLLVMCSIPLEHRMLVSDMTD
>Mature_397_residues
MKSIGFIEKLKGLSSKELILLGIILSIFLPFYLFVVVLCLYIISLIFTGDMKSILQKMGEHPMLLLFLSYSTVISILAQN
WMGLVASVGMFLFTIFFLHYQSILSHKFFRLILQFVLFGSVLSAAFASLEHFQIVKKFNYAFLSPNMQVWHQNRAEVTFF
NPNYYGIICCFCIMIAFYLFTTTKLNWLKVFCVIAGFVNLFGLNFTQNRTAFPAIIAGAIIYLFTTIKNWKAFWLSIGVF
AIGLSFLFSSDLGVRMGTLDSSMEERISIWDAGMALFKQNPFWGEGPLTYMHSYPRIHAPYHEHAHSLYIDTILSYGIVG
TILLVLSSVAPVRLMMDMSQESGKRPIIGLYLSFLTVVAVHGIFDLALFWIQSGFIFLLVMCSIPLEHRMLVSDMTD

Specific function: Unknown

COG id: COG3307

COG function: function code M; Lipid A core - O-antigen ligase and related enzymes

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 45209; Mature: 45209

Theoretical pI: Translated: 8.54; Mature: 8.54

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.5 %Cys     (Translated Protein)
4.5 %Met     (Translated Protein)
6.0 %Cys+Met (Translated Protein)
1.5 %Cys     (Mature Protein)
4.5 %Met     (Mature Protein)
6.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA