Definition Streptococcus pneumoniae D39, complete genome.
Accession NC_008533
Length 2,046,115

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The map label for this gene is ppc

Identifier: 116516040

GI number: 116516040

Start: 965156

End: 967852

Strand: Direct

Name: ppc

Synonym: SPD_0953

Alternate gene names: 116516040

Gene position: 965156-967852 (Clockwise)

Preceding gene: 116517219

Following gene: 116517122

Centisome position: 47.17

GC content: 38.34

Gene sequence:

>2697_bases
ATGTCTCTTCAAAAATTAGAAAATTCTAGTAATAAAAGTGTTGTGCAAGAAGAAGTCTTGATTCTAACAGAATTACTGGA
AGATATTACTAAAAATATGCTTGCCCCAGAGACCTTTGAAAAAATAATACAGTTGAAAGAATTATCAACGCAGGAAGATT
ATCAAGGTCTAAACCGTCTAGTGACTAGCTTATCAAATGATGAAATGGTCTATATTTCACGCTATTTCTCTATCTTGCCT
CTTTTGATTAATATTTCAGAGGATGTGGATTTAGCTTATGAAATCAATCATCAAAATAATATTGATCAGGACTATTTAGG
TAAATTATCTACAACGATTAAATTGGTAGCAGAAAAGGAAAATGCCGTTGAGATCCTAGAACACTTGAATGTTGTTCCGG
TTTTGACAGCCCATCCAACACAAGTGCAACGCAAAAGTATGTTGGATTTAACAAATCATATTCATAGTCTTTTGCGTAAA
TACCGTGATGTTAAGTTGGGGTTGATCAATAAAGATAAATGGTACAATGATTTGCGTCGTTACATCGAAATTATCATGCA
GACAGACATGATTCGTGAGAAAAAATTAAAAGTGACTAACGAAATCACGAATGCTATGGAATATTATAACAGCTCCTTTT
TGAAAGCTGTACCTCATTTGACGACGGAGTATAAGCGCTTAGCGCAAGCACATGGTCTGAATTTAAAACAGGCTAAACCA
ATCACCATGGGTATGTGGATAGGTGGTGACCGTGATGGAAATCCATTTGTTACAGCAAAGACCTTGAAGCAGTCTGCACT
CACTCAGTGTGAAGTCATCATGAACTACTATGATAAAAAGATTTACCAACTTTATCGTGAATTTTCTCTTTCAACTAGCA
TTGTCAACGTCAGCAAGCAAGTCAGAGAAATGGCTCGTCAATCCAAGGATAACTCGATTTACCGCGAAAAAGAGCTTTAC
CGTCGTGCCTTGTTTGATATTCAATCAAAAATTCAGGCAACTAAAACCTATCTGATTGAGGATGAAGAAGTTGGGACTCG
TTATGAAACCGCCAATGATTTCTACAAGGATTTGATTGCCATTCGAGATTCTCTACTAGAAAATAAGGGCGAGTCCTTGA
TTTCAGGTGATTTTGTGGAATTATTGCAGGCAGTAGAGATATTTGGTTTTTACTTAGCATCAATTGATATGCGACAAGAC
TCTAGCGTCTATGAAGCCTGTGTGGCAGAACTCTTGAAATCAGCAGGAATTCATTCTCGTTATAGCGAGTTGAGCGAAGA
AGAAAAGTGTGACCTTCTCTTGAAAGAATTAGAAGAAGATCCCCGAATTCTTTCTGCGACTCACGCAGAAAAATCAGAAT
TATTAGCAAAAGAACTAGCTATTTTTAAGACGGCTCGTGTTTTGAAAGATAAGTTGGGAGATGATGTCATCCGTCAGACC
ATCATTTCACATGCAACCAGCCTTTCTGATATGCTAGAATTAGCTATTCTGTTAAAAGAAGTAGGACTGGTGGATACGGA
AAGGGCGCGTGTTCAGATTGTTCCCCTTTTTGAAACAATTGAAGACTTGGATCATTCAGAGGAAACAATGAGAAAATATC
TTTCTCTTAGCCTTGCCAAAAAATGGATTGACTCACGAAATAACTACCAAGAAATCATGCTTGGCTACTCTGACAGTAAT
AAAGATGGCGGTTACTTGTCATCATGTTGGACCCTCTACAAGGCTCAACAACAATTGACTGCTATTGGAGATGAATTTGG
CGTTAAGGTTACCTTCTTCCATGGTCGTGGTGGTACTGTCGGTCGTGGTGGTGGGCCAACCTATGAAGCCATTACATCTC
AACCGCTCAAGTCTATCAAGGATCGTATCCGCTTGACGGAGCAGGGTGAAGTAATTGGGAATAAATACGGTAACAAAGAC
GCCGCTTACTATAACCTTGAAATGCTAGTATCGGCAGCTATTAACCGTATGATTACTCAGAAGAAGAGCGATACCAATAC
CCCAAATCGTTATGAAGCCATTATGGATCAAGTAGTGGACCGTAGTTACGATATCTACCGTGATTTGGTCTTTGGTAATG
AGCATTTCTATGATTATTTCTTCGAGTCAAGTCCAATCAAGGCTATTTCAAGTTTTAATATTGGTTCTCGTCCAGCCGCT
CGTAAGACTATTACTGAAATCGGTGGATTGCGTGCTATCCCTTGGGTATTCTCATGGTCACAGAGTCGTGTTATGTTCCC
TGGATGGTACGGGGTTGGTTCAAGCTTCAAGGAATTTATCAATAAAAATCCAGAGAATATTGCTATCTTACGAGATATGT
ACCAAAATTGGCCTTTCTTCCAATCGCTTCTTTCAAATGTTGATATGGTTTTGTCAAAATCAAATATGAATATTGCTTTT
GAATATGCTAAACTTTGTGAAGACGAGCAAGTTAAGGCCATCTATGAGACTATTTTAAATGAATGGCAAGTTACTAAGAA
CGTTATCTTGGCTATTGAAGGACATGACGAACTCTTAGCTGACAATCCATATCTAAAAGCTAGTCTGGATTACCGTATGC
CTTACTTTAATATTCTCAACTATATTCAGTTAGAGTTGATTAAACGCCAACGTCGTGGAGAATTGTCCAGTGATCAAGAA
CGATTGATTCATATCACCATCAACGGAATTGCGACAGGATTGCGTAATTCAGGTTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTAAATATTGATGCCAGTGAAAAACGCGCTAAGTTGTACCGAGAATTGGAAAATCAACCAATGAACCTTCTGTTGAAGTA
GGATAAAGAAAGGATAGTTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAATTTTCAAGAGTGAATGCTAAAAGTGAATATCAAAAAAATTCTAATAGACTATTGACAAGTAGTTTAAAAATGATATA
ATTTAACCATTCAGAAAAGT

Product: phosphoenolpyruvate carboxylase

Products: NA

Alternate protein names: PEPC; PEPCase

Number of amino acids: Translated: 898; Mature: 897

Protein sequence:

>898_residues
MSLQKLENSSNKSVVQEEVLILTELLEDITKNMLAPETFEKIIQLKELSTQEDYQGLNRLVTSLSNDEMVYISRYFSILP
LLINISEDVDLAYEINHQNNIDQDYLGKLSTTIKLVAEKENAVEILEHLNVVPVLTAHPTQVQRKSMLDLTNHIHSLLRK
YRDVKLGLINKDKWYNDLRRYIEIIMQTDMIREKKLKVTNEITNAMEYYNSSFLKAVPHLTTEYKRLAQAHGLNLKQAKP
ITMGMWIGGDRDGNPFVTAKTLKQSALTQCEVIMNYYDKKIYQLYREFSLSTSIVNVSKQVREMARQSKDNSIYREKELY
RRALFDIQSKIQATKTYLIEDEEVGTRYETANDFYKDLIAIRDSLLENKGESLISGDFVELLQAVEIFGFYLASIDMRQD
SSVYEACVAELLKSAGIHSRYSELSEEEKCDLLLKELEEDPRILSATHAEKSELLAKELAIFKTARVLKDKLGDDVIRQT
IISHATSLSDMLELAILLKEVGLVDTERARVQIVPLFETIEDLDHSEETMRKYLSLSLAKKWIDSRNNYQEIMLGYSDSN
KDGGYLSSCWTLYKAQQQLTAIGDEFGVKVTFFHGRGGTVGRGGGPTYEAITSQPLKSIKDRIRLTEQGEVIGNKYGNKD
AAYYNLEMLVSAAINRMITQKKSDTNTPNRYEAIMDQVVDRSYDIYRDLVFGNEHFYDYFFESSPIKAISSFNIGSRPAA
RKTITEIGGLRAIPWVFSWSQSRVMFPGWYGVGSSFKEFINKNPENIAILRDMYQNWPFFQSLLSNVDMVLSKSNMNIAF
EYAKLCEDEQVKAIYETILNEWQVTKNVILAIEGHDELLADNPYLKASLDYRMPYFNILNYIQLELIKRQRRGELSSDQE
RLIHITINGIATGLRNSG

Sequences:

>Translated_898_residues
MSLQKLENSSNKSVVQEEVLILTELLEDITKNMLAPETFEKIIQLKELSTQEDYQGLNRLVTSLSNDEMVYISRYFSILP
LLINISEDVDLAYEINHQNNIDQDYLGKLSTTIKLVAEKENAVEILEHLNVVPVLTAHPTQVQRKSMLDLTNHIHSLLRK
YRDVKLGLINKDKWYNDLRRYIEIIMQTDMIREKKLKVTNEITNAMEYYNSSFLKAVPHLTTEYKRLAQAHGLNLKQAKP
ITMGMWIGGDRDGNPFVTAKTLKQSALTQCEVIMNYYDKKIYQLYREFSLSTSIVNVSKQVREMARQSKDNSIYREKELY
RRALFDIQSKIQATKTYLIEDEEVGTRYETANDFYKDLIAIRDSLLENKGESLISGDFVELLQAVEIFGFYLASIDMRQD
SSVYEACVAELLKSAGIHSRYSELSEEEKCDLLLKELEEDPRILSATHAEKSELLAKELAIFKTARVLKDKLGDDVIRQT
IISHATSLSDMLELAILLKEVGLVDTERARVQIVPLFETIEDLDHSEETMRKYLSLSLAKKWIDSRNNYQEIMLGYSDSN
KDGGYLSSCWTLYKAQQQLTAIGDEFGVKVTFFHGRGGTVGRGGGPTYEAITSQPLKSIKDRIRLTEQGEVIGNKYGNKD
AAYYNLEMLVSAAINRMITQKKSDTNTPNRYEAIMDQVVDRSYDIYRDLVFGNEHFYDYFFESSPIKAISSFNIGSRPAA
RKTITEIGGLRAIPWVFSWSQSRVMFPGWYGVGSSFKEFINKNPENIAILRDMYQNWPFFQSLLSNVDMVLSKSNMNIAF
EYAKLCEDEQVKAIYETILNEWQVTKNVILAIEGHDELLADNPYLKASLDYRMPYFNILNYIQLELIKRQRRGELSSDQE
RLIHITINGIATGLRNSG
>Mature_897_residues
SLQKLENSSNKSVVQEEVLILTELLEDITKNMLAPETFEKIIQLKELSTQEDYQGLNRLVTSLSNDEMVYISRYFSILPL
LINISEDVDLAYEINHQNNIDQDYLGKLSTTIKLVAEKENAVEILEHLNVVPVLTAHPTQVQRKSMLDLTNHIHSLLRKY
RDVKLGLINKDKWYNDLRRYIEIIMQTDMIREKKLKVTNEITNAMEYYNSSFLKAVPHLTTEYKRLAQAHGLNLKQAKPI
TMGMWIGGDRDGNPFVTAKTLKQSALTQCEVIMNYYDKKIYQLYREFSLSTSIVNVSKQVREMARQSKDNSIYREKELYR
RALFDIQSKIQATKTYLIEDEEVGTRYETANDFYKDLIAIRDSLLENKGESLISGDFVELLQAVEIFGFYLASIDMRQDS
SVYEACVAELLKSAGIHSRYSELSEEEKCDLLLKELEEDPRILSATHAEKSELLAKELAIFKTARVLKDKLGDDVIRQTI
ISHATSLSDMLELAILLKEVGLVDTERARVQIVPLFETIEDLDHSEETMRKYLSLSLAKKWIDSRNNYQEIMLGYSDSNK
DGGYLSSCWTLYKAQQQLTAIGDEFGVKVTFFHGRGGTVGRGGGPTYEAITSQPLKSIKDRIRLTEQGEVIGNKYGNKDA
AYYNLEMLVSAAINRMITQKKSDTNTPNRYEAIMDQVVDRSYDIYRDLVFGNEHFYDYFFESSPIKAISSFNIGSRPAAR
KTITEIGGLRAIPWVFSWSQSRVMFPGWYGVGSSFKEFINKNPENIAILRDMYQNWPFFQSLLSNVDMVLSKSNMNIAFE
YAKLCEDEQVKAIYETILNEWQVTKNVILAIEGHDELLADNPYLKASLDYRMPYFNILNYIQLELIKRQRRGELSSDQER
LIHITINGIATGLRNSG

Specific function: Forms oxaloacetate, a four-carbon dicarboxylic acid source for the tricarboxylic acid cycle

COG id: COG2352

COG function: function code C; Phosphoenolpyruvate carboxylase

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasm [C]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the PEPCase type 1 family

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1790393, Length=908, Percent_Identity=28.8546255506608, Blast_Score=349, Evalue=6e-97,

Paralogues:

None

Copy number: 3,500 Molecules/Cell In: Glucose minimal media [C]

Swissprot (AC and ID): CAPP_STRP2 (Q04KL8)

Other databases:

- EMBL:   CP000410
- RefSeq:   YP_816430.1
- ProteinModelPortal:   Q04KL8
- STRING:   Q04KL8
- PhosSite:   Q04KL8
- EnsemblBacteria:   EBSTRT00000020363
- GeneID:   4441700
- GenomeReviews:   CP000410_GR
- KEGG:   spd:SPD_0953
- eggNOG:   COG2352
- GeneTree:   EBGT00050000028190
- HOGENOM:   HBG351035
- OMA:   AIPWVFG
- ProtClustDB:   PRK00009
- HAMAP:   MF_00595
- InterPro:   IPR021135
- InterPro:   IPR018129
- InterPro:   IPR022805
- InterPro:   IPR015813
- PRINTS:   PR00150

Pfam domain/function: PF00311 PEPcase; SSF51621 Pyrv/PenolPyrv_Kinase_cat

EC number: =4.1.1.31

Molecular weight: Translated: 103210; Mature: 103079

Theoretical pI: Translated: 5.41; Mature: 5.41

Prosite motif: PS00781 PEPCASE_1; PS00393 PEPCASE_2

Important sites: ACT_SITE 138-138 ACT_SITE 561-561

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.6 %Cys     (Translated Protein)
2.6 %Met     (Translated Protein)
3.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.6 %Cys     (Mature Protein)
2.5 %Met     (Mature Protein)
3.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSLQKLENSSNKSVVQEEVLILTELLEDITKNMLAPETFEKIIQLKELSTQEDYQGLNRL
CCCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
VTSLSNDEMVYISRYFSILPLLINISEDVDLAYEINHQNNIDQDYLGKLSTTIKLVAEKE
HHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCH
NAVEILEHLNVVPVLTAHPTQVQRKSMLDLTNHIHSLLRKYRDVKLGLINKDKWYNDLRR
HHHHHHHHCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEECCCHHHHHHHHH
YIEIIMQTDMIREKKLKVTNEITNAMEYYNSSFLKAVPHLTTEYKRLAQAHGLNLKQAKP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC
ITMGMWIGGDRDGNPFVTAKTLKQSALTQCEVIMNYYDKKIYQLYREFSLSTSIVNVSKQ
CEEEEEECCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VREMARQSKDNSIYREKELYRRALFDIQSKIQATKTYLIEDEEVGTRYETANDFYKDLIA
HHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
IRDSLLENKGESLISGDFVELLQAVEIFGFYLASIDMRQDSSVYEACVAELLKSAGIHSR
HHHHHHHCCCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHH
YSELSEEEKCDLLLKELEEDPRILSATHAEKSELLAKELAIFKTARVLKDKLGDDVIRQT
HHHHCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHH
IISHATSLSDMLELAILLKEVGLVDTERARVQIVPLFETIEDLDHSEETMRKYLSLSLAK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH
KWIDSRNNYQEIMLGYSDSNKDGGYLSSCWTLYKAQQQLTAIGDEFGVKVTFFHGRGGTV
HHHHCCCCHHHHEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEEECCCCCC
GRGGGPTYEAITSQPLKSIKDRIRLTEQGEVIGNKYGNKDAAYYNLEMLVSAAINRMITQ
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KKSDTNTPNRYEAIMDQVVDRSYDIYRDLVFGNEHFYDYFFESSPIKAISSFNIGSRPAA
CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCHHHHHCCCCCCCCHH
RKTITEIGGLRAIPWVFSWSQSRVMFPGWYGVGSSFKEFINKNPENIAILRDMYQNWPFF
HHHHHHHCCCEECCHHEECCCCCEECCCCCCCCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCHHH
QSLLSNVDMVLSKSNMNIAFEYAKLCEDEQVKAIYETILNEWQVTKNVILAIEGHDELLA
HHHHHHHHHHEECCCCCEEEHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCHHHC
DNPYLKASLDYRMPYFNILNYIQLELIKRQRRGELSSDQERLIHITINGIATGLRNSG
CCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEEEHHHHHHCCCCC
>Mature Secondary Structure 
SLQKLENSSNKSVVQEEVLILTELLEDITKNMLAPETFEKIIQLKELSTQEDYQGLNRL
CCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
VTSLSNDEMVYISRYFSILPLLINISEDVDLAYEINHQNNIDQDYLGKLSTTIKLVAEKE
HHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCH
NAVEILEHLNVVPVLTAHPTQVQRKSMLDLTNHIHSLLRKYRDVKLGLINKDKWYNDLRR
HHHHHHHHCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEECCCHHHHHHHHH
YIEIIMQTDMIREKKLKVTNEITNAMEYYNSSFLKAVPHLTTEYKRLAQAHGLNLKQAKP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC
ITMGMWIGGDRDGNPFVTAKTLKQSALTQCEVIMNYYDKKIYQLYREFSLSTSIVNVSKQ
CEEEEEECCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VREMARQSKDNSIYREKELYRRALFDIQSKIQATKTYLIEDEEVGTRYETANDFYKDLIA
HHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
IRDSLLENKGESLISGDFVELLQAVEIFGFYLASIDMRQDSSVYEACVAELLKSAGIHSR
HHHHHHHCCCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHH
YSELSEEEKCDLLLKELEEDPRILSATHAEKSELLAKELAIFKTARVLKDKLGDDVIRQT
HHHHCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHH
IISHATSLSDMLELAILLKEVGLVDTERARVQIVPLFETIEDLDHSEETMRKYLSLSLAK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH
KWIDSRNNYQEIMLGYSDSNKDGGYLSSCWTLYKAQQQLTAIGDEFGVKVTFFHGRGGTV
HHHHCCCCHHHHEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEEECCCCCC
GRGGGPTYEAITSQPLKSIKDRIRLTEQGEVIGNKYGNKDAAYYNLEMLVSAAINRMITQ
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KKSDTNTPNRYEAIMDQVVDRSYDIYRDLVFGNEHFYDYFFESSPIKAISSFNIGSRPAA
CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCHHHHHCCCCCCCCHH
RKTITEIGGLRAIPWVFSWSQSRVMFPGWYGVGSSFKEFINKNPENIAILRDMYQNWPFF
HHHHHHHCCCEECCHHEECCCCCEECCCCCCCCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCHHH
QSLLSNVDMVLSKSNMNIAFEYAKLCEDEQVKAIYETILNEWQVTKNVILAIEGHDELLA
HHHHHHHHHHEECCCCCEEEHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCHHHC
DNPYLKASLDYRMPYFNILNYIQLELIKRQRRGELSSDQERLIHITINGIATGLRNSG
CCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEEEHHHHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA