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The map label for this gene is 116515719

Identifier: 116515719

GI number: 116515719

Start: 1226626

End: 1228059

Strand: Reverse

Name: 116515719

Synonym: SPD_1198

Alternate gene names: NA

Gene position: 1228059-1226626 (Counterclockwise)

Preceding gene: 116516760

Following gene: 116516014

Centisome position: 60.02

GC content: 36.26

Gene sequence:

>1434_bases
GTGATTGATGGGAAACGATTATTATTTAGTTTGACCATAGTCAGTTATGCCTTGACGCTAGTAAGTGGAATTGTGTATCT
GTTTAATAATAATAATGTTAGCTTACTTTCTACTTTATTGTTCTTGTTGGTTAGTAGCTTGATTGCTTGTTGGAATGATA
TCAAGTATTACTTAATCCATTTTATTTTCTATTTAACCATTTTTGTATTTCTGGTATCAAGACCGACCATTGATTATTTT
AGGGATGGTGCTTTGGATACCTATCATCCAATAGCCTATCGTTTTGCCTTTATAGTTGTCATGGTTTCGATTCTGGGCTT
GACAACAGGAGGCGTCCTGGCTCGTTACTTCATAGCTAGGAAGAAAATAAAAGTAGCAAATATAGGAAATTCTCTAAAAG
AGGTTTATATCAAGCGGTTACGCTTTGTATCACTAGGAGTTTTTCTTCTAACTTATCCTTTCTATTTCATTCGGTTATTT
GAACGGCTCTTGTATCGTTTGCAGACTTCCTACTATGCCTACTATGCAAATTTTGAAAGTAAACTGCCTTATTTTACCTA
CATTTTGTCTACCTTTACGGTCTATGCAATGTGTATGTATCTGGCAACCAAGCCAAAGAAATTGCAGGCCACAGCAGTGC
TTGTCTCCTTTATTGCAGCTAACACTATTCATTTGGCAATTGGGACACGAAATCCCTTTATTTTAAGTATTTTATTTGCT
TTTGTTTATTACTTTATGCGGGAGCAAGCTGAAAAAGGAAAATGGATTGGGTTTAAAGAAAAGTTAGCGATTTTTGTAGG
TTCTCCTATTCTCATGTTAGCGATGGGAGTACTCAATTATGTACGGGATAATGTCCAAGTTTCCCATACAGGTTTCTGGG
ATATCTTACTTGACTTTATCTATAAACAAGGGACTAGTTTTGGTGTTCTGGCTCGAGGTTTTCTATTTAACAGTAGCCTC
CCTTACCGAGATTTCCGTAATTTTACTTTTGGTCCTGTTCTTGATTATTTTGCAAGGGGGAGTTTGGGAGCCATTTTCGG
AGGAAAAGCCTTTGAACATACAACCAATAGTGTGGAACTAGCTATTGATAGTAATAGTTATGCCCACAATCTATCCTATC
TTGTCTTGAACAAGGAATACCTGAAAGGGCATGGTATCGGAAGTAGTTATATCATGGAGTTGTATACCGACTATGGTATG
ATTGGAGTCTTTCTGCTTAGTTTCTTACTCGGCGTATTATTTATAGCCATGCTGCAAGTAGCCTATCGCTCAAGGACAAT
CCTATTTGCTTTATCCCTACTCATCTTGAATAATCTATTCTTTATGCCAAGAAGCAGCTTTTCAGAAAGTTTCTTCAATT
TATTTACAATGCAATTCTGGGGAATTGTTCTTGTGATTATATTTGTAGCAAAAATGCTTACAAAGGAAAACTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TAGTGCTTTGGCCCTATTCATAAATATTTCCTTATACCGATTCTTATTACTGAAAAATATTGAAAAATCTAAAAAATTAC
ATTAGAACGGGGGTGACCAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TATCTACTAAACAAAGGAGAAAAAAATCATGTTTGAACATTATTCAGTAGCTGATTTGTTTGCAAATCTTTATAAAAAAC
GAAAAGCAAATATTTTAGCT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 477; Mature: 477

Protein sequence:

>477_residues
MIDGKRLLFSLTIVSYALTLVSGIVYLFNNNNVSLLSTLLFLLVSSLIACWNDIKYYLIHFIFYLTIFVFLVSRPTIDYF
RDGALDTYHPIAYRFAFIVVMVSILGLTTGGVLARYFIARKKIKVANIGNSLKEVYIKRLRFVSLGVFLLTYPFYFIRLF
ERLLYRLQTSYYAYYANFESKLPYFTYILSTFTVYAMCMYLATKPKKLQATAVLVSFIAANTIHLAIGTRNPFILSILFA
FVYYFMREQAEKGKWIGFKEKLAIFVGSPILMLAMGVLNYVRDNVQVSHTGFWDILLDFIYKQGTSFGVLARGFLFNSSL
PYRDFRNFTFGPVLDYFARGSLGAIFGGKAFEHTTNSVELAIDSNSYAHNLSYLVLNKEYLKGHGIGSSYIMELYTDYGM
IGVFLLSFLLGVLFIAMLQVAYRSRTILFALSLLILNNLFFMPRSSFSESFFNLFTMQFWGIVLVIIFVAKMLTKEN

Sequences:

>Translated_477_residues
MIDGKRLLFSLTIVSYALTLVSGIVYLFNNNNVSLLSTLLFLLVSSLIACWNDIKYYLIHFIFYLTIFVFLVSRPTIDYF
RDGALDTYHPIAYRFAFIVVMVSILGLTTGGVLARYFIARKKIKVANIGNSLKEVYIKRLRFVSLGVFLLTYPFYFIRLF
ERLLYRLQTSYYAYYANFESKLPYFTYILSTFTVYAMCMYLATKPKKLQATAVLVSFIAANTIHLAIGTRNPFILSILFA
FVYYFMREQAEKGKWIGFKEKLAIFVGSPILMLAMGVLNYVRDNVQVSHTGFWDILLDFIYKQGTSFGVLARGFLFNSSL
PYRDFRNFTFGPVLDYFARGSLGAIFGGKAFEHTTNSVELAIDSNSYAHNLSYLVLNKEYLKGHGIGSSYIMELYTDYGM
IGVFLLSFLLGVLFIAMLQVAYRSRTILFALSLLILNNLFFMPRSSFSESFFNLFTMQFWGIVLVIIFVAKMLTKEN
>Mature_477_residues
MIDGKRLLFSLTIVSYALTLVSGIVYLFNNNNVSLLSTLLFLLVSSLIACWNDIKYYLIHFIFYLTIFVFLVSRPTIDYF
RDGALDTYHPIAYRFAFIVVMVSILGLTTGGVLARYFIARKKIKVANIGNSLKEVYIKRLRFVSLGVFLLTYPFYFIRLF
ERLLYRLQTSYYAYYANFESKLPYFTYILSTFTVYAMCMYLATKPKKLQATAVLVSFIAANTIHLAIGTRNPFILSILFA
FVYYFMREQAEKGKWIGFKEKLAIFVGSPILMLAMGVLNYVRDNVQVSHTGFWDILLDFIYKQGTSFGVLARGFLFNSSL
PYRDFRNFTFGPVLDYFARGSLGAIFGGKAFEHTTNSVELAIDSNSYAHNLSYLVLNKEYLKGHGIGSSYIMELYTDYGM
IGVFLLSFLLGVLFIAMLQVAYRSRTILFALSLLILNNLFFMPRSSFSESFFNLFTMQFWGIVLVIIFVAKMLTKEN

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 54802; Mature: 54802

Theoretical pI: Translated: 9.88; Mature: 9.88

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
2.7 %Met     (Translated Protein)
3.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
2.7 %Met     (Mature Protein)
3.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MIDGKRLLFSLTIVSYALTLVSGIVYLFNNNNVSLLSTLLFLLVSSLIACWNDIKYYLIH
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FIFYLTIFVFLVSRPTIDYFRDGALDTYHPIAYRFAFIVVMVSILGLTTGGVLARYFIAR
HHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH
KKIKVANIGNSLKEVYIKRLRFVSLGVFLLTYPFYFIRLFERLLYRLQTSYYAYYANFES
HHEEHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCC
KLPYFTYILSTFTVYAMCMYLATKPKKLQATAVLVSFIAANTIHLAIGTRNPFILSILFA
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEEECCCHHHHHHHHH
FVYYFMREQAEKGKWIGFKEKLAIFVGSPILMLAMGVLNYVRDNVQVSHTGFWDILLDFI
HHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCHHHHHHHHH
YKQGTSFGVLARGFLFNSSLPYRDFRNFTFGPVLDYFARGSLGAIFGGKAFEHTTNSVEL
HHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCHHHCCCCCEEE
AIDSNSYAHNLSYLVLNKEYLKGHGIGSSYIMELYTDYGMIGVFLLSFLLGVLFIAMLQV
EECCCCCHHCCEEEEEEHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AYRSRTILFALSLLILNNLFFMPRSSFSESFFNLFTMQFWGIVLVIIFVAKMLTKEN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MIDGKRLLFSLTIVSYALTLVSGIVYLFNNNNVSLLSTLLFLLVSSLIACWNDIKYYLIH
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FIFYLTIFVFLVSRPTIDYFRDGALDTYHPIAYRFAFIVVMVSILGLTTGGVLARYFIAR
HHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH
KKIKVANIGNSLKEVYIKRLRFVSLGVFLLTYPFYFIRLFERLLYRLQTSYYAYYANFES
HHEEHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCC
KLPYFTYILSTFTVYAMCMYLATKPKKLQATAVLVSFIAANTIHLAIGTRNPFILSILFA
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEEECCCHHHHHHHHH
FVYYFMREQAEKGKWIGFKEKLAIFVGSPILMLAMGVLNYVRDNVQVSHTGFWDILLDFI
HHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCHHHHHHHHH
YKQGTSFGVLARGFLFNSSLPYRDFRNFTFGPVLDYFARGSLGAIFGGKAFEHTTNSVEL
HHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCHHHCCCCCEEE
AIDSNSYAHNLSYLVLNKEYLKGHGIGSSYIMELYTDYGMIGVFLLSFLLGVLFIAMLQV
EECCCCCHHCCEEEEEEHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AYRSRTILFALSLLILNNLFFMPRSSFSESFFNLFTMQFWGIVLVIIFVAKMLTKEN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA