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The map label for this gene is ydgH [H]

Identifier: 116492131

GI number: 116492131

Start: 376153

End: 378810

Strand: Direct

Name: ydgH [H]

Synonym: PEPE_0328

Alternate gene names: 116492131

Gene position: 376153-378810 (Clockwise)

Preceding gene: 116492130

Following gene: 116492132

Centisome position: 20.53

GC content: 37.51

Gene sequence:

>2658_bases
ATGAGTAAGTATATCAAACAAAACATTGCCAAGTTTGTGACTTGGATTATCGTTTTGATTTTAGGAATCGTAATGTTACC
TAATATTTCTAGCTTAGTAGCTGAAAAAGGTCAAACCAAAATTCCGGATACGGCTAAAAGCCAAGTTGCTAAAACCATCC
AAAAAGATTGGGGCCACAAAATTAGCAATACGCGCCAGGTCGTTTTGGTCTTTAATAATGGTGACCAAGCTTTAACCCAT
AAGCAAAAAGATCGTATCAATGACACTATTGATAAAATCAAAGATAATAAATCTAAGTATGATATTAAAGGAGTTACTGC
TCCTAACGATAGTGAGGCAACTAAGAAGCAATTAATTTCAAAAGATAAATCAACCCAGTTGGTGCAACTAGATGTAGGTA
AGCGGGATTCAGTGCGGAAGATGAATCAAAAGCTGGTTAAAGAAGTTAAGACGAGCGGAGTGAAAACTTACGTAACTGGT
AGTGATATCTTAAATGATGATTTCTCGGTAGCTATTGAAGAGGGGCTTAAAAAGACTGAAGTTATTGCCATCGTCTTCAT
TTTGATTGTGCTAATTCTAGTCTTCCGTTCCCCAATTGTTCCTTTAATTTCTTTAGGAACTGTTGGACTATCTTTCATCG
TTGCTTTATCAGCAGTGATGAATTTAGCTAAATATACAGGATTTACGATTTCAAACTTTACCCAAGTTTTCATGGTCGTT
GTTATGTTTGGAATCGGGACAGATTACAATATCTTACTCTATAACCAATTCAAGAATGATTTGATTGAGGGGATGGATAA
AGAAACTGCCACGAAGCATTCACTTAAGGTGGCAGGAAAAACGATTCTTTATTCAGGAAGTACCGTTCTATTAGGATTCT
TGACTTTAGCATTGGCTAAGTTCTCCATTTACCGTTCGGCAACGGGGGTTGGAATTGGGGTTGCTATTTTACTACTAGCA
TTATTGACCGTTAACCCCTTCTTTATGTCACTACTCGGGAATAAGGTATTCTGGCCTAGTCATAATTCAAAAGAATCAAA
CCACAGTAAGTTGTGGGATTGGCTTTCAGGACACTCAGCTAAAAATCCATTGATTGCTTTAGGCATCATCGTAATTTTAG
CAATTCCAATGCTGTTAACTTATAACAATAAACTTAATTATGATACAGTCGTTGAACTACCAGCTAATTATTCTGCTAAG
CAAGGATTTAAAACGGTGCAAAAGCACTTTAGCAAAGGAACGGCGGAACCTACTACCATCTATATCAAGAGCAATCACAA
GCTTGATAATGAAAGTGATTTAAGAGTTATTGATAACTTAACTAACCAAATTAAAGGTATTGATGGAATCAAGACGGTTG
CATCAGTTACTCAACCAGGTGGCGATAAGTTAGATCAGCTTTATGTTAATGATCAATTGAAGACGTTGACTTCCCAAACA
AGCAAGGCCCAAGCGGGCTTAAAAGAACTTCAAAAAGGTTTAACTGGTGGAGATTTTGATGCTAGTCAACTTGAAGATAT
CGGTGCTAAAGCGACCTTAATTGGGCAAGAGTTGAAGAGTATCCAATCAACTAGTGGTAGCTCTGTAAGTGGTCAACAAT
TGATGACGGCCTTACAACAAAAGATGGCAGCGGCTGGTCAACCATTATCACAAACACAAATGACGATTCTTTCTGGAGCA
GCTAGCCAAGAAATGGCTTCAGTAAGTTCAATGCAAACTCGCCTTCAAGCAATTGCCACTTATACCCAAGCAATCGGTAA
TGATGCTCAAACTCTTGGAAATGAACTTAAGGGACAACAACAAAAAATGGCAACCGCTGGTGGCAGTGTTGGTAAACTAA
ATGACGGGCTATCTGAATCCAATGATTACTTGAAAGAACTTCAAGATTCATCTGCATCTAACACATTATTTGTGCCTAAA
GCAGTGTTAGAAAGTGATACATTTAAAGATTCAGAAGATGTCTACTTATCTTCAAATAAAAAGGCCGCTAAGATCACGGT
GGTCTTAGATTCAGATCCATTAACTGCTAAGTCGATTAAAAAAGTTGAAAGTCTGCAAACGATGATTAACAACAATATCA
AGGGAACTTCATTGAAGAAAGCTTCCGTTTCGATTGGTGGTCAAACTTCTGAAACTTCTGATACATCAAGTATTGCTAAT
CAAGATTTCTTACGTAGTGCAGTAATTATGTTAGTTGGCATTACGCTTGCATTGATGTTAGTAACGCGCTCTATCTTACA
ACCATTCTATATCATTGCTTCATTGCTACTAGCATACGTAGGTGGACTAGGAATTACACGCTTTATTAGTAGTACATTCC
TTGGTGAAAATCTATTAGGATGGAATGTACCTTTCTTCACCTTTGTAATGTTGGTTGCCCTTGGAGTAGATTACAGTATC
TTCTTGATGATGAAGTACCGTGAATTTGGTAACGAGGATGCTGGAGATCGAATTGTTAAATCAGCAGGAATTATTGGAAC
GGTGGTAATTTCAGCTGCAATTATCCTAGGGGGAACATTTGCTGCCTTAATTCCAGCAGGAGTTCTGACCTTGACGCAAG
TTGCTGTTGGGGTAATTAGTGGTCTGGTTATACTAGTCTTCTTAATTCCAGCAATGAATAGTAGTTTAATTCGTTTAACT
TATCCAAGAAAAAATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATTGTCTAAGAGAGAAGCGATGGAATATGTTGATGAGTTACTAGGGAAATAAGCATTAAGAGAAGAGTGAATTGATTAAT
TATAGATAGGAGAGAAGAGT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TCATAAAGTCGTAACTCTATTTGGGGTTACGGCTTTTTATTTGCTTACGATTAATAACTCGTTTATTCTGGGGGTATAAA
TAATTAGGTGAGGTGATGTT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 885; Mature: 884

Protein sequence:

>885_residues
MSKYIKQNIAKFVTWIIVLILGIVMLPNISSLVAEKGQTKIPDTAKSQVAKTIQKDWGHKISNTRQVVLVFNNGDQALTH
KQKDRINDTIDKIKDNKSKYDIKGVTAPNDSEATKKQLISKDKSTQLVQLDVGKRDSVRKMNQKLVKEVKTSGVKTYVTG
SDILNDDFSVAIEEGLKKTEVIAIVFILIVLILVFRSPIVPLISLGTVGLSFIVALSAVMNLAKYTGFTISNFTQVFMVV
VMFGIGTDYNILLYNQFKNDLIEGMDKETATKHSLKVAGKTILYSGSTVLLGFLTLALAKFSIYRSATGVGIGVAILLLA
LLTVNPFFMSLLGNKVFWPSHNSKESNHSKLWDWLSGHSAKNPLIALGIIVILAIPMLLTYNNKLNYDTVVELPANYSAK
QGFKTVQKHFSKGTAEPTTIYIKSNHKLDNESDLRVIDNLTNQIKGIDGIKTVASVTQPGGDKLDQLYVNDQLKTLTSQT
SKAQAGLKELQKGLTGGDFDASQLEDIGAKATLIGQELKSIQSTSGSSVSGQQLMTALQQKMAAAGQPLSQTQMTILSGA
ASQEMASVSSMQTRLQAIATYTQAIGNDAQTLGNELKGQQQKMATAGGSVGKLNDGLSESNDYLKELQDSSASNTLFVPK
AVLESDTFKDSEDVYLSSNKKAAKITVVLDSDPLTAKSIKKVESLQTMINNNIKGTSLKKASVSIGGQTSETSDTSSIAN
QDFLRSAVIMLVGITLALMLVTRSILQPFYIIASLLLAYVGGLGITRFISSTFLGENLLGWNVPFFTFVMLVALGVDYSI
FLMMKYREFGNEDAGDRIVKSAGIIGTVVISAAIILGGTFAALIPAGVLTLTQVAVGVISGLVILVFLIPAMNSSLIRLT
YPRKN

Sequences:

>Translated_885_residues
MSKYIKQNIAKFVTWIIVLILGIVMLPNISSLVAEKGQTKIPDTAKSQVAKTIQKDWGHKISNTRQVVLVFNNGDQALTH
KQKDRINDTIDKIKDNKSKYDIKGVTAPNDSEATKKQLISKDKSTQLVQLDVGKRDSVRKMNQKLVKEVKTSGVKTYVTG
SDILNDDFSVAIEEGLKKTEVIAIVFILIVLILVFRSPIVPLISLGTVGLSFIVALSAVMNLAKYTGFTISNFTQVFMVV
VMFGIGTDYNILLYNQFKNDLIEGMDKETATKHSLKVAGKTILYSGSTVLLGFLTLALAKFSIYRSATGVGIGVAILLLA
LLTVNPFFMSLLGNKVFWPSHNSKESNHSKLWDWLSGHSAKNPLIALGIIVILAIPMLLTYNNKLNYDTVVELPANYSAK
QGFKTVQKHFSKGTAEPTTIYIKSNHKLDNESDLRVIDNLTNQIKGIDGIKTVASVTQPGGDKLDQLYVNDQLKTLTSQT
SKAQAGLKELQKGLTGGDFDASQLEDIGAKATLIGQELKSIQSTSGSSVSGQQLMTALQQKMAAAGQPLSQTQMTILSGA
ASQEMASVSSMQTRLQAIATYTQAIGNDAQTLGNELKGQQQKMATAGGSVGKLNDGLSESNDYLKELQDSSASNTLFVPK
AVLESDTFKDSEDVYLSSNKKAAKITVVLDSDPLTAKSIKKVESLQTMINNNIKGTSLKKASVSIGGQTSETSDTSSIAN
QDFLRSAVIMLVGITLALMLVTRSILQPFYIIASLLLAYVGGLGITRFISSTFLGENLLGWNVPFFTFVMLVALGVDYSI
FLMMKYREFGNEDAGDRIVKSAGIIGTVVISAAIILGGTFAALIPAGVLTLTQVAVGVISGLVILVFLIPAMNSSLIRLT
YPRKN
>Mature_884_residues
SKYIKQNIAKFVTWIIVLILGIVMLPNISSLVAEKGQTKIPDTAKSQVAKTIQKDWGHKISNTRQVVLVFNNGDQALTHK
QKDRINDTIDKIKDNKSKYDIKGVTAPNDSEATKKQLISKDKSTQLVQLDVGKRDSVRKMNQKLVKEVKTSGVKTYVTGS
DILNDDFSVAIEEGLKKTEVIAIVFILIVLILVFRSPIVPLISLGTVGLSFIVALSAVMNLAKYTGFTISNFTQVFMVVV
MFGIGTDYNILLYNQFKNDLIEGMDKETATKHSLKVAGKTILYSGSTVLLGFLTLALAKFSIYRSATGVGIGVAILLLAL
LTVNPFFMSLLGNKVFWPSHNSKESNHSKLWDWLSGHSAKNPLIALGIIVILAIPMLLTYNNKLNYDTVVELPANYSAKQ
GFKTVQKHFSKGTAEPTTIYIKSNHKLDNESDLRVIDNLTNQIKGIDGIKTVASVTQPGGDKLDQLYVNDQLKTLTSQTS
KAQAGLKELQKGLTGGDFDASQLEDIGAKATLIGQELKSIQSTSGSSVSGQQLMTALQQKMAAAGQPLSQTQMTILSGAA
SQEMASVSSMQTRLQAIATYTQAIGNDAQTLGNELKGQQQKMATAGGSVGKLNDGLSESNDYLKELQDSSASNTLFVPKA
VLESDTFKDSEDVYLSSNKKAAKITVVLDSDPLTAKSIKKVESLQTMINNNIKGTSLKKASVSIGGQTSETSDTSSIANQ
DFLRSAVIMLVGITLALMLVTRSILQPFYIIASLLLAYVGGLGITRFISSTFLGENLLGWNVPFFTFVMLVALGVDYSIF
LMMKYREFGNEDAGDRIVKSAGIIGTVVISAAIILGGTFAALIPAGVLTLTQVAVGVISGLVILVFLIPAMNSSLIRLTY
PRKN

Specific function: Unknown

COG id: COG2409

COG function: function code R; Predicted drug exporters of the RND superfamily

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the mmpL family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR004869
- InterPro:   IPR000731 [H]

Pfam domain/function: PF03176 MMPL [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 95644; Mature: 95513

Theoretical pI: Translated: 9.95; Mature: 9.95

Prosite motif: PS00307 LECTIN_LEGUME_BETA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
2.5 %Met     (Translated Protein)
2.5 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
2.4 %Met     (Mature Protein)
2.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSKYIKQNIAKFVTWIIVLILGIVMLPNISSLVAEKGQTKIPDTAKSQVAKTIQKDWGHK
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCC
ISNTRQVVLVFNNGDQALTHKQKDRINDTIDKIKDNKSKYDIKGVTAPNDSEATKKQLIS
CCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCCCCHHHHHHHHC
KDKSTQLVQLDVGKRDSVRKMNQKLVKEVKTSGVKTYVTGSDILNDDFSVAIEEGLKKTE
CCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCHHCCCHHHHHHHHCCHHHH
VIAIVFILIVLILVFRSPIVPLISLGTVGLSFIVALSAVMNLAKYTGFTISNFTQVFMVV
HHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH
VMFGIGTDYNILLYNQFKNDLIEGMDKETATKHSLKVAGKTILYSGSTVLLGFLTLALAK
HHHHCCCCCEEEEEHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHH
FSIYRSATGVGIGVAILLLALLTVNPFFMSLLGNKVFWPSHNSKESNHSKLWDWLSGHSA
HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCC
KNPLIALGIIVILAIPMLLTYNNKLNYDTVVELPANYSAKQGFKTVQKHFSKGTAEPTTI
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEE
YIKSNHKLDNESDLRVIDNLTNQIKGIDGIKTVASVTQPGGDKLDQLYVNDQLKTLTSQT
EEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SKAQAGLKELQKGLTGGDFDASQLEDIGAKATLIGQELKSIQSTSGSSVSGQQLMTALQQ
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHH
KMAAAGQPLSQTQMTILSGAASQEMASVSSMQTRLQAIATYTQAIGNDAQTLGNELKGQQ
HHHHCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCHH
QKMATAGGSVGKLNDGLSESNDYLKELQDSSASNTLFVPKAVLESDTFKDSEDVYLSSNK
HHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECHHHHCCCCCCCCCCEEEECCC
KAAKITVVLDSDPLTAKSIKKVESLQTMINNNIKGTSLKKASVSIGGQTSETSDTSSIAN
CEEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEHHHEECCCCCCCCCCHHHHHH
QDFLRSAVIMLVGITLALMLVTRSILQPFYIIASLLLAYVGGLGITRFISSTFLGENLLG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCC
WNVPFFTFVMLVALGVDYSIFLMMKYREFGNEDAGDRIVKSAGIIGTVVISAAIILGGTF
CCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
AALIPAGVLTLTQVAVGVISGLVILVFLIPAMNSSLIRLTYPRKN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCC
>Mature Secondary Structure 
SKYIKQNIAKFVTWIIVLILGIVMLPNISSLVAEKGQTKIPDTAKSQVAKTIQKDWGHK
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCC
ISNTRQVVLVFNNGDQALTHKQKDRINDTIDKIKDNKSKYDIKGVTAPNDSEATKKQLIS
CCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCCCCHHHHHHHHC
KDKSTQLVQLDVGKRDSVRKMNQKLVKEVKTSGVKTYVTGSDILNDDFSVAIEEGLKKTE
CCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCHHCCCHHHHHHHHCCHHHH
VIAIVFILIVLILVFRSPIVPLISLGTVGLSFIVALSAVMNLAKYTGFTISNFTQVFMVV
HHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH
VMFGIGTDYNILLYNQFKNDLIEGMDKETATKHSLKVAGKTILYSGSTVLLGFLTLALAK
HHHHCCCCCEEEEEHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHH
FSIYRSATGVGIGVAILLLALLTVNPFFMSLLGNKVFWPSHNSKESNHSKLWDWLSGHSA
HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCC
KNPLIALGIIVILAIPMLLTYNNKLNYDTVVELPANYSAKQGFKTVQKHFSKGTAEPTTI
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEE
YIKSNHKLDNESDLRVIDNLTNQIKGIDGIKTVASVTQPGGDKLDQLYVNDQLKTLTSQT
EEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHH
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CEEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEHHHEECCCCCCCCCCHHHHHH
QDFLRSAVIMLVGITLALMLVTRSILQPFYIIASLLLAYVGGLGITRFISSTFLGENLLG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCC
WNVPFFTFVMLVALGVDYSIFLMMKYREFGNEDAGDRIVKSAGIIGTVVISAAIILGGTF
CCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
AALIPAGVLTLTQVAVGVISGLVILVFLIPAMNSSLIRLTYPRKN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9384377 [H]