| Definition | Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo-bovis L550 chromosome 1, complete sequence. |
|---|---|
| Accession | NC_008508 |
| Length | 3,614,446 |
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The map label for this gene is 116327467
Identifier: 116327467
GI number: 116327467
Start: 772038
End: 774371
Strand: Direct
Name: 116327467
Synonym: LBL_0689
Alternate gene names: NA
Gene position: 772038-774371 (Clockwise)
Preceding gene: 116327466
Following gene: 116327468
Centisome position: 21.36
GC content: 45.5
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases ACGCGACCGATATGCCCGCTCTTCAAACGGAACTAAACGCCGCTAAAACCGCTTACGAAACGCAATAATCCGCATATTTG GCCCTTCTTCAACAATTGAA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 777; Mature: 777
Protein sequence:
>777_residues MLNTDPSSRASQSPKSASFLNSFREKLFTPKKTVLEIDLDSSVCEEFSQKEEGPKSDSNFSSHTFRKRNELTASSTLFLR LESLTQKLKRQTTETERLVRMDLRLETRNLKEKDSRGTIVKKIPQKNCKNSSFQFGSDSKVFPDQKIRQKIGRKTETTNF RAQDGRDNRPRDERRVEKRPSIWETTTLLDGLELLRGRICVSYNVSEGEGLKTDELRFTSKRWTKIVALPLIFVFLFEFA FLPVFESESLFADSFDQNFENKNKAKGRLESYYNAAEKTSDVLEWQSIIDSGKRILKAQWEANASLEIEKELKGFSGTSS AKEEFRIQLENQKQTIAVDWEAELSEEILEKRGAWKANFNKQNFESYFTVAKKKEIREALENLVKAADAAKNAATGDGTA RLAAWDGAINSGIAGVRALWENNIVSIKNGILTSSTSTALTGVEKVEFEKKLDEIESYYKNYFHWEENGVKLPARQGLIQ SLNRDMDIAIAQEEDPTRLTELLIEKTKQQLDPATGQLLNSLDDLGTIPTSYDDVSGSNAQEKILQALQDGQALWDQAIE RLVVKKLEYDRVAEDKRVRNEDKWSKAYYVLLDAKAKWNEEINKQIEEGLKKWDESEVRLKENKQKALQELNQYLSISQE QYVSHLNGLQGTILSSADTIGSIVSNIAWYQDQIDKENRKSSPNTGLIGTYQQEINKWTTLRNQFRQYVAAVQNKIHDED ILGNNGGSGVLDDSGNSSDPYLYSSAEFEYRLAKAELDELEKKKTGHRRSGTTRKQT
Sequences:
>Translated_777_residues MLNTDPSSRASQSPKSASFLNSFREKLFTPKKTVLEIDLDSSVCEEFSQKEEGPKSDSNFSSHTFRKRNELTASSTLFLR LESLTQKLKRQTTETERLVRMDLRLETRNLKEKDSRGTIVKKIPQKNCKNSSFQFGSDSKVFPDQKIRQKIGRKTETTNF RAQDGRDNRPRDERRVEKRPSIWETTTLLDGLELLRGRICVSYNVSEGEGLKTDELRFTSKRWTKIVALPLIFVFLFEFA FLPVFESESLFADSFDQNFENKNKAKGRLESYYNAAEKTSDVLEWQSIIDSGKRILKAQWEANASLEIEKELKGFSGTSS AKEEFRIQLENQKQTIAVDWEAELSEEILEKRGAWKANFNKQNFESYFTVAKKKEIREALENLVKAADAAKNAATGDGTA RLAAWDGAINSGIAGVRALWENNIVSIKNGILTSSTSTALTGVEKVEFEKKLDEIESYYKNYFHWEENGVKLPARQGLIQ SLNRDMDIAIAQEEDPTRLTELLIEKTKQQLDPATGQLLNSLDDLGTIPTSYDDVSGSNAQEKILQALQDGQALWDQAIE RLVVKKLEYDRVAEDKRVRNEDKWSKAYYVLLDAKAKWNEEINKQIEEGLKKWDESEVRLKENKQKALQELNQYLSISQE QYVSHLNGLQGTILSSADTIGSIVSNIAWYQDQIDKENRKSSPNTGLIGTYQQEINKWTTLRNQFRQYVAAVQNKIHDED ILGNNGGSGVLDDSGNSSDPYLYSSAEFEYRLAKAELDELEKKKTGHRRSGTTRKQT >Mature_777_residues MLNTDPSSRASQSPKSASFLNSFREKLFTPKKTVLEIDLDSSVCEEFSQKEEGPKSDSNFSSHTFRKRNELTASSTLFLR LESLTQKLKRQTTETERLVRMDLRLETRNLKEKDSRGTIVKKIPQKNCKNSSFQFGSDSKVFPDQKIRQKIGRKTETTNF RAQDGRDNRPRDERRVEKRPSIWETTTLLDGLELLRGRICVSYNVSEGEGLKTDELRFTSKRWTKIVALPLIFVFLFEFA FLPVFESESLFADSFDQNFENKNKAKGRLESYYNAAEKTSDVLEWQSIIDSGKRILKAQWEANASLEIEKELKGFSGTSS AKEEFRIQLENQKQTIAVDWEAELSEEILEKRGAWKANFNKQNFESYFTVAKKKEIREALENLVKAADAAKNAATGDGTA RLAAWDGAINSGIAGVRALWENNIVSIKNGILTSSTSTALTGVEKVEFEKKLDEIESYYKNYFHWEENGVKLPARQGLIQ SLNRDMDIAIAQEEDPTRLTELLIEKTKQQLDPATGQLLNSLDDLGTIPTSYDDVSGSNAQEKILQALQDGQALWDQAIE RLVVKKLEYDRVAEDKRVRNEDKWSKAYYVLLDAKAKWNEEINKQIEEGLKKWDESEVRLKENKQKALQELNQYLSISQE QYVSHLNGLQGTILSSADTIGSIVSNIAWYQDQIDKENRKSSPNTGLIGTYQQEINKWTTLRNQFRQYVAAVQNKIHDED ILGNNGGSGVLDDSGNSSDPYLYSSAEFEYRLAKAELDELEKKKTGHRRSGTTRKQT
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 88683; Mature: 88683
Theoretical pI: Translated: 6.02; Mature: 6.02
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
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Transmembrane regions:
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Cys/Met content:
0.4 %Cys (Translated Protein) 0.4 %Met (Translated Protein) 0.8 %Cys+Met (Translated Protein) 0.4 %Cys (Mature Protein) 0.4 %Met (Mature Protein) 0.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MLNTDPSSRASQSPKSASFLNSFREKLFTPKKTVLEIDLDSSVCEEFSQKEEGPKSDSNF CCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC SSHTFRKRNELTASSTLFLRLESLTQKLKRQTTETERLVRMDLRLETRNLKEKDSRGTIV CHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHH KKIPQKNCKNSSFQFGSDSKVFPDQKIRQKIGRKTETTNFRAQDGRDNRPRDERRVEKRP HHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCC SIWETTTLLDGLELLRGRICVSYNVSEGEGLKTDELRFTSKRWTKIVALPLIFVFLFEFA CHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FLPVFESESLFADSFDQNFENKNKAKGRLESYYNAAEKTSDVLEWQSIIDSGKRILKAQW HCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EANASLEIEKELKGFSGTSSAKEEFRIQLENQKQTIAVDWEAELSEEILEKRGAWKANFN CCCCCEEEHHHHCCCCCCCCCHHHHEEEEECCCCEEEECCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC KQNFESYFTVAKKKEIREALENLVKAADAAKNAATGDGTARLAAWDGAINSGIAGVRALW HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEECCHHHCCHHHHHHHH ENNIVSIKNGILTSSTSTALTGVEKVEFEKKLDEIESYYKNYFHWEENGVKLPARQGLIQ CCCCEEECCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEECCCCEECCHHHHHHH SLNRDMDIAIAQEEDPTRLTELLIEKTKQQLDPATGQLLNSLDDLGTIPTSYDDVSGSNA HCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCH QEKILQALQDGQALWDQAIERLVVKKLEYDRVAEDKRVRNEDKWSKAYYVLLDAKAKWNE HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEECCHHHHH EINKQIEEGLKKWDESEVRLKENKQKALQELNQYLSISQEQYVSHLNGLQGTILSSADTI HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHH GSIVSNIAWYQDQIDKENRKSSPNTGLIGTYQQEINKWTTLRNQFRQYVAAVQNKIHDED HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH ILGNNGGSGVLDDSGNSSDPYLYSSAEFEYRLAKAELDELEKKKTGHRRSGTTRKQT CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCC >Mature Secondary Structure MLNTDPSSRASQSPKSASFLNSFREKLFTPKKTVLEIDLDSSVCEEFSQKEEGPKSDSNF CCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC SSHTFRKRNELTASSTLFLRLESLTQKLKRQTTETERLVRMDLRLETRNLKEKDSRGTIV CHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHH KKIPQKNCKNSSFQFGSDSKVFPDQKIRQKIGRKTETTNFRAQDGRDNRPRDERRVEKRP HHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCC SIWETTTLLDGLELLRGRICVSYNVSEGEGLKTDELRFTSKRWTKIVALPLIFVFLFEFA CHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FLPVFESESLFADSFDQNFENKNKAKGRLESYYNAAEKTSDVLEWQSIIDSGKRILKAQW HCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EANASLEIEKELKGFSGTSSAKEEFRIQLENQKQTIAVDWEAELSEEILEKRGAWKANFN CCCCCEEEHHHHCCCCCCCCCHHHHEEEEECCCCEEEECCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC KQNFESYFTVAKKKEIREALENLVKAADAAKNAATGDGTARLAAWDGAINSGIAGVRALW HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEECCHHHCCHHHHHHHH ENNIVSIKNGILTSSTSTALTGVEKVEFEKKLDEIESYYKNYFHWEENGVKLPARQGLIQ CCCCEEECCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEECCCCEECCHHHHHHH SLNRDMDIAIAQEEDPTRLTELLIEKTKQQLDPATGQLLNSLDDLGTIPTSYDDVSGSNA HCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCH QEKILQALQDGQALWDQAIERLVVKKLEYDRVAEDKRVRNEDKWSKAYYVLLDAKAKWNE HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEECCHHHHH EINKQIEEGLKKWDESEVRLKENKQKALQELNQYLSISQEQYVSHLNGLQGTILSSADTI HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHH GSIVSNIAWYQDQIDKENRKSSPNTGLIGTYQQEINKWTTLRNQFRQYVAAVQNKIHDED HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH ILGNNGGSGVLDDSGNSSDPYLYSSAEFEYRLAKAELDELEKKKTGHRRSGTTRKQT CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA