Definition Shewanella frigidimarina NCIMB 400, complete genome.
Accession NC_008345
Length 4,845,257

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Identifier: 114563977

GI number:

Start: 3385774

End: 3390672

Strand: Reverse

Name: Not Available

Synonym: Sfri_2813

Alternate gene names: NA

Gene position: NA

Preceding gene: 114563978

Following gene: 114563976

Centisome position: NA

GC content: NA

Gene sequence:

>4899_bases
ATGATAAAAATGACCAGACTATCTAGCTATAAAAATGCGCTTAAATTGGGTATTGGAGTATTTTCTTGTGGCTTAGTCAT
CAGTTTTATTACTGCTTTAAGTGTTAATAATCAAAATAACACTATCATTACTCAATCTCTTAAAACGGTGACAGAGCAAG
TTGCTAACAATATTATTGATCGTATCGTATTGTATCAATATGGTTTAAGAGGTGCTCGAGGGGTTATTTATACCGTTGGT
GAAGATAATATTTCTCGTGATTTTTTTAAAAAATATAGCTTAACTCGCGATTTTGAAAGTGAGTTCCCCGGTGCGCGAGG
GTTTGGTTATATCCGCCGTGTACCAGCCAACGATGAAGCGAGTTTTGTTGCCAAAGCTAAACTTGATGATTGGCCCGATT
TCAGTGTGCGTCAACTTACTCCCCATGATGATGAACGGTACGTGATTGACTATATCGAACCCGTTGAGCGTAATCTCGCC
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AACCGGTCCAATCACGTTAGTGCAGGCGACTGGTCATCCGTTACAAGCCTTTCTTATTTTAATGCCCATTTACCGTACTG
GACTGACTCCAGCAACCCCGGCGTTAAGGGAGCAACAAGCTTTTGGTTGGAGTTATGCGCCACTCGTTGCCAATGAAGTT
TTTGAACAGATTAATTTATCCCGTAAAACCACTAAACTATTGGTCAATGATGTGACCGATGCTCAAAATAATGTCATGTT
TTATGAAACACATGTTGATGAGGTTAATCCATTAACATCTTTTGTTGTTACATTAGATCGTGAAATATTTGGACGTAAAT
GGCAAGTGTCGCTAGTGGCTTACCCTGAGTTTGTCAGCGGTTTGCATTTAAGCTCACCCAAAATTGTGTTTAGTTATGGT
GCGATTGTGAGCTTGTTATTGGGTGGGCTTATTGGTTTTTATGGCTACGCATTAGGTCGTAAGCGTATCATTATGGAAGA
TAATGAAAGACGTGCCAATATTTTAGAGCATTCGCTTGATGCGATTATTAGTTTTGACTGTGATGGTGTTATTACCAGTT
GGAATGATGGTGCGGTAATGATGTTTGGTTATGAAAAACATGAGGTGATAGGCCTCAAGAAAACAACGTTTATTGTACCA
AACGATGGCTATGATGCTGAAAATGAGAAATTTAATCAGGTACTAAATGGTAAATCGTTACTAAATTTTGTTAGCCAACA
TAAACGAAAAGACAATGAACTACTGTCAACATCGATGACCTCACTGGCTATTTATAATGAGTTTGGCAAAATTATCGGTG
TAAGTCAGACCATTCGAGATATTACGGTACAGCTGAATGCTGAAAAGCAAATTTTAAACATAAATGCCAGCCTTGAACGT
AAGGTTACCGAGCGAACTCAAGCGTTACAACAAGCCCTGTCAGAAAATAAAACCTTACTTGATAATATTAACCAGCAGCT
ACTTTATTCTGAAACCGATAAAAATGGCGTTATCTTGGTGGTAAATGATAATTTCTGTCAAACATCAGGGTTCACTCGCG
AGCAAATGATTGGTAAGAAACATTCGATTTTAAAATCCAATGAACATGATCGTGCCTTTTGGAAACAGATGTGGCAAACC
ATTCACGCAGGCGAGACTTGGCATGAGGAAATTTGTAACCGTGATAAACAGGGCAATATTAAATGGCTTGATACGGTAAT
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AGTTAGAAAAGAATAAACTCGCGTCTTTACTCACTAACGTGCTTGCCGCGGCAACGGAAATTGCGATTATTTCAACCGAT
AATGACGGTATTATTAACATTTTCAATCGTGGTGCTCAGCTATTGCTTGGGTATCAAGCCGAGGAGATTGTGGGTAAGCA
AAGTCCTGCAATATTGCATCTACCATCAGAGATCCGTCAACGCAGTAAAGAGTTAACCGAGGAGTTTGGCGAAGATATTA
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AGTTAGGTATTTGGAATTTAGATTTAGACACCGACAACTTACAATGGAACGATCGTATGTTTGCAATGTACGATTACCCA
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TGCCTTACAGCAAGCCATTGACTTGAATATTCCTTATGAACCGACTTTCAGGATCATTACCAGCTCGAATCAAATTCGCT
ACATTCATGCCGGAGCCCAAATTAGTTATGACAAAACAGGCAAACCTGTGCGGGTGGTTGGGATTAACCGTGACATCACA
GAGCAACGCGAGTTAGAACAAACTTTGCGTTTAGCTAAACAAGCCGCAGATGCTGCGAGTGCGGCTAAATCAGCATTTTT
AGCCAATATGAGTCATGAAATTCGTACTCCAATGAATGCTGTGCTAGGCATGCTACAACTTATTCAGCATTCTGATATGA
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TTTTCTAAAATTGATGCTGGTAAGTTAGAACTTGATTTGCATCCGTTTCAACTCGAAACGTTAATGCGCGAATTAGCGGT
GATGTTAGCGGCCAACGTACACAGTCAACATTTAGAAGTCATTTTTGATTTAGATCCTGCCATTCCATATTTGATTGAAG
GTGATGAACTTCGTTTGCGACAGGTGTTGTTAAATCTTGCGGGTAATGCGATTAAATTCACCTCTGAAGGTCATGTTATT
GTTGGGGTACAGTGTAATGAGTGTACTGCGAATCAAGTGAATTTAACTATTTCGATTACTGATTCTGGTATCGGAATTAG
CCCTGAACAAAGCAGCAAAATTTTCCAAGGTTTTGTTCAAGCAGAGTCTTCAACGTCAAGACGATTCGGCGGTACAGGGT
TGGGATTAGCAATCACTAAAAGTTTAGTTGAGTTGATGGGGGGAGAATTATCATTATCGAGCCATGTCGGTGAGGGAAGT
CGTTTTTGGTTTGAGTTGACGTTTAATATTGTTGAAGTGAAGAATAATGATCTAGATATCGATTTACTGGGTAAGAATAT
TCTGATTGTTGATGACAGTAAAATGAGTCGTAAAATTTTATCTAAAACCTTAATGGCCCATGGTGCTTATGTTAATGAAG
CTCATAATAGTAAACAGGCTATCAATCTTATAGAGCAAAGCTTAAATGCCAGCAGTCACTATGATGTGATTATTATGGAT
TGGCGCATGCCCGATATGAATGGCTTAGAAACTGCCAATCATATTCAAGCGATGTTTCCGGCAGGTAAGGCTCCAGCCAT
TATTATGCTGACAGCATATGGTGCTGAGGTGATGGAACAAACTAAACAATATCGCCAGCAACCTTTTGTGAGTATGTTGA
CCAAACCTGTTACTGCCAACTTAATGCTTGAGGCCGTTTACCGAGCCATAAATGGTTTAGTTCAGCCTGTGCAATCTAGA
AAAATAACTCATTTAGTCTTAAAAGGTGTCAGGGTGTTGGTGGTTGAAGATAATCAGCTTAACCGCCAAGTTATTGATGA
ATTATTACGCCTACAAGGCGCGGTAGTGACATTGGCTAAAGACGGTATTGAGGGGGTTGATTGGGTTACTAAGTCAAATA
ATCAATTTGATATTGTCATTATGGACATGCAAATGCCAGTAATGGATGGACTTGAGGCTACGCACCTTATTCGTGCCGAT
GGCCGATTTAATGATTTACCTATTTTAGCGATGACGGCTAATGCATCACTTGCTGATAAAACATTATGCTTAGAGGCTGG
TATGGATGATCATATTGGTAAGCCGATAGACATGACTCTTTTGTTACCTTGTATGCTTAGTCTGTTGGGCCAAGATAATA
GCGCTTATTATCATTCAACTGTCAATAATTCGCCTATTGCATTACCAGAGGTGATTGATGATGGTGATGATGAAGCGATT
ATCGAAAATTCTGATTCTATTTTGCGTCGTTTTGGTGGAGAGCTTGCATTTTTCATTGATGTGAAACATCATTTTGCATC
AGAAATGGCAGAGCAATTGTCATTACTTACTCAAGCATTTGCACTACAAGATAACAGTGCTATCAGTAGTATTGCTCACA
CAATTAAAGGCACCTCTAGCAATATTGGTGCTAAGCGACTGGCAGCTTTTGCGGCCAAACTAGAGCAAAATATAAAAAAC
GCTGTTAATGTTGATTCAGTTGCTTGTTTAAGCCAAATGCAAGGTCAAATTAATGATAGCCTGCATATGTTAGATACTCT
TTTTCCAGATGAAAGTGCAGTATTAACAACTAACACGCTGGATAATAATGCAATATTGCCGATACAAAGTATAGAACCCG
ATAAAATCAACCGATTAATGGAATTATTGGTTGAACAAAATTTAGATGCCATTGAGTACCTTGATCGCCTGTTAAGCGAC
GTGGTGCCAGATAAGCAGTGGTTAAGATTAAAAAACCAAGTGAGCCAACTTGAGTTCTTGGATGCTGTCGATACATTAAC
ATCGATAATTAAGGAGTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TCTAGATTCGTAATCAATTTCGGAAACACTATATTTTTCAATGTCTAGCTTGTAAAAAAAGCATTTGTCGTCCAAAGTTA
ATGTCTGTGACTCTTAACTA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGCGTGTTCATAGATGAGTATATTTCTGGTGTTGCGCCAATTAGAGGTAAAATACTGTTAGTTGATGATCAAGTTGTGAA
CATCAAAATATTGCATCAAC

Product: multi-sensor hybrid histidine kinase

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: NA

Protein sequence:

>1632_residues
MIKMTRLSSYKNALKLGIGVFSCGLVISFITALSVNNQNNTIITQSLKTVTEQVANNIIDRIVLYQYGLRGARGVIYTVG
EDNISRDFFKKYSLTRDFESEFPGARGFGYIRRVPANDEASFVAKAKLDDWPDFSVRQLTPHDDERYVIDYIEPVERNLA
AVGLDIASEQNRKNAAQQAYLTGETRLTGPITLVQATGHPLQAFLILMPIYRTGLTPATPALREQQAFGWSYAPLVANEV
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FSKIDAGKLELDLHPFQLETLMRELAVMLAANVHSQHLEVIFDLDPAIPYLIEGDELRLRQVLLNLAGNAIKFTSEGHVI
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VVPDKQWLRLKNQVSQLEFLDAVDTLTSIIKE

Sequences:
NA

Specific function: NA

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: NA

Metaboloic importance: NA

Operon status: NA

Operon components: NA

Similarity: NA

Homologues:

NA

Paralogues:

NA

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: NA

Theoretical pI: NA

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

NA

Transmembrane regions:

NA

Cys/Met content:

NA

Secondary structure: NA

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: NA

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: NA

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA