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The map label for this gene is opuE [H]

Identifier: 113474425

GI number: 113474425

Start: 884921

End: 886705

Strand: Direct

Name: opuE [H]

Synonym: Tery_0565

Alternate gene names: 113474425

Gene position: 884921-886705 (Clockwise)

Preceding gene: 113474423

Following gene: 113474426

Centisome position: 11.42

GC content: 42.3

Gene sequence:

>1785_bases
ATGCATTTAATTGATTATATTATCGTCGGGTTATACCTGTTCGCAATTGTTCTGTTTGGCATATTTCTCCAGCGAAAAGC
CTCCGCTGGTATAGACTCTTATTTTCTGGGTGATCGGAATATGCCTTGGTGGGTATTGGGAGCTTCCGGAATGGCTTCCA
ATACAGACATTGCCGGAACAATGTTGATAACGGCTTTAGTCTACGCCTTGGGAACAAAGGGATTTTTTTTGGAACTCCGG
GGTGGCATTGCCTTAATTCTAGCAATGTTCATGATTTTTATGGGCAAATGGAATCGTCGAGCCCAAGTTATGACCTTAGC
AGAGTGGATGCATTTACGTTTTGGAGTCGGACGAGAAGGAAATATCGCCCGCATAGTTAGTGCCATTGCTGCTATTATCT
TGACCATTGGTAGAATTAGTTATTTTGCCATAGGTGGGGGCAAATTCTTAGGAGAATTTATCGCGGTCGATGCGCGCCTC
GCCTCAATTATCATTATCTTCCTGGCATTGATCTACACTGTTATCAGTGGTTTTTATGGGGTAGTCTTAACAGACCTATT
TCAGGGAGTATTGATTTTTTTTGCCATCATCTATATCTGCGCGATCGCCATCCAACTGCCCCCTCTCCCCGAAACATTTG
CTATCTCTATTCCAGGCACTAATCAATTGCAGGAGTGGAATTTTAGGGAGTGGAGTAGTATATTCCCCTCCATGAAAGTA
GACTTGCCAGGAGACTATGGCCGTTTCAACTTATTCGGCGCTATCCTTTGCTTCTATCTACTGAAGGTATTAATGGAAGG
GTTTGGGGGTATCGGTGGTTATATGATGCAGCGATACTTTGCTGCCAAAAGCGATCGGGAAGTGGGGTTAATGTCCCTGT
GGTGGATCTTTTTGCTTTCCTTTCGCTGGCCTTTAGTAACAGCTTTTGCAATCCTGGGCATTAATTACGGCATTACTAAC
CAAGTAATTTCTGACCCAGAACTGGTCTTACCAACAGTCATTGCTACTTACCTACCAGTAGGAATTAAAGGATTGATATT
AGCTTGTTTTATTGCCGCCGGAATGTCTACTTTTGACTCCCTAATTAATGGTGGTGCTGCTTACTGGGTGAAAGATATTT
ATCAAGCTTACCTTGATCCCCTAGCTGATAACCGCAAACTGATGTTTCAAAGTCGTTGGGCATCGGTAATCATAGCTATG
GTAGGATTACTATTTAGCTTCAGTATCTCCAATATCAATGAAATTTGGGGATGGTTGACTTTGGGACTGGGCACAGGTCT
GGCGGTTCCTCTGCTGTTAAGATGGTATTGGTGGCGGTTTAATGGCTATGGATTCGCTACGGGTATTGCCGCTGGCATGA
TAGCCGCAATTATTACTAAGGCCATCGTCTTACCTTCTTTACTGGATCTGCAAATTGCCGAATTTATCCAATTTCTAATT
CCTAGTAGTTGTTCTTTAGCAGGATGCATTGTTGGAACTCTGTTAACTCCAGCAACAGAAAGGTTAGTCCTGGAGAATTT
CTATACTATCACTCGCCCCTTTGGTTTCTGGAAGCAGATCGCCACTAATGTGCCCCATTATCTCAGGGAAAAAATCACAC
TAGAGAACCAACAGGATTTGCTGGCAACTGCGATCGCAATTCCTTGGCAAATAGTTTTGTGCCTTACCGGAATTATGTTT
GTGATGAAACGTTGGGATAATTTCAAAATTCTATGTTTTTTATTGATTATACTTTCTATCTGTTTATACTTTGCCTGGTA
CAGATATCTAAAAGTTAAAAATTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AGATGACTAGCCATAGACCGTATAAGGTTCAACAGGAAGTCAACATCAGATTGTCAAGAGCTATACGACCCTTTGTCTCA
GTTTTAGAGAGCAGTAGTTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
GAATTGTCCCATTTTGAATTTGCCAGGCGATCGCTTTCACTAGATCAGGACTTACCTACACAGATCAAAATATACACTAT
CTATAGTGGGTTGACAGCGG

Product: Na+/solute symporter

Products: Na (I) [Cytoplasm]; pantothenate [Cytoplasm] [C]

Alternate protein names: Sodium/proline symporter [H]

Number of amino acids: Translated: 594; Mature: 594

Protein sequence:

>594_residues
MHLIDYIIVGLYLFAIVLFGIFLQRKASAGIDSYFLGDRNMPWWVLGASGMASNTDIAGTMLITALVYALGTKGFFLELR
GGIALILAMFMIFMGKWNRRAQVMTLAEWMHLRFGVGREGNIARIVSAIAAIILTIGRISYFAIGGGKFLGEFIAVDARL
ASIIIIFLALIYTVISGFYGVVLTDLFQGVLIFFAIIYICAIAIQLPPLPETFAISIPGTNQLQEWNFREWSSIFPSMKV
DLPGDYGRFNLFGAILCFYLLKVLMEGFGGIGGYMMQRYFAAKSDREVGLMSLWWIFLLSFRWPLVTAFAILGINYGITN
QVISDPELVLPTVIATYLPVGIKGLILACFIAAGMSTFDSLINGGAAYWVKDIYQAYLDPLADNRKLMFQSRWASVIIAM
VGLLFSFSISNINEIWGWLTLGLGTGLAVPLLLRWYWWRFNGYGFATGIAAGMIAAIITKAIVLPSLLDLQIAEFIQFLI
PSSCSLAGCIVGTLLTPATERLVLENFYTITRPFGFWKQIATNVPHYLREKITLENQQDLLATAIAIPWQIVLCLTGIMF
VMKRWDNFKILCFLLIILSICLYFAWYRYLKVKN

Sequences:

>Translated_594_residues
MHLIDYIIVGLYLFAIVLFGIFLQRKASAGIDSYFLGDRNMPWWVLGASGMASNTDIAGTMLITALVYALGTKGFFLELR
GGIALILAMFMIFMGKWNRRAQVMTLAEWMHLRFGVGREGNIARIVSAIAAIILTIGRISYFAIGGGKFLGEFIAVDARL
ASIIIIFLALIYTVISGFYGVVLTDLFQGVLIFFAIIYICAIAIQLPPLPETFAISIPGTNQLQEWNFREWSSIFPSMKV
DLPGDYGRFNLFGAILCFYLLKVLMEGFGGIGGYMMQRYFAAKSDREVGLMSLWWIFLLSFRWPLVTAFAILGINYGITN
QVISDPELVLPTVIATYLPVGIKGLILACFIAAGMSTFDSLINGGAAYWVKDIYQAYLDPLADNRKLMFQSRWASVIIAM
VGLLFSFSISNINEIWGWLTLGLGTGLAVPLLLRWYWWRFNGYGFATGIAAGMIAAIITKAIVLPSLLDLQIAEFIQFLI
PSSCSLAGCIVGTLLTPATERLVLENFYTITRPFGFWKQIATNVPHYLREKITLENQQDLLATAIAIPWQIVLCLTGIMF
VMKRWDNFKILCFLLIILSICLYFAWYRYLKVKN
>Mature_594_residues
MHLIDYIIVGLYLFAIVLFGIFLQRKASAGIDSYFLGDRNMPWWVLGASGMASNTDIAGTMLITALVYALGTKGFFLELR
GGIALILAMFMIFMGKWNRRAQVMTLAEWMHLRFGVGREGNIARIVSAIAAIILTIGRISYFAIGGGKFLGEFIAVDARL
ASIIIIFLALIYTVISGFYGVVLTDLFQGVLIFFAIIYICAIAIQLPPLPETFAISIPGTNQLQEWNFREWSSIFPSMKV
DLPGDYGRFNLFGAILCFYLLKVLMEGFGGIGGYMMQRYFAAKSDREVGLMSLWWIFLLSFRWPLVTAFAILGINYGITN
QVISDPELVLPTVIATYLPVGIKGLILACFIAAGMSTFDSLINGGAAYWVKDIYQAYLDPLADNRKLMFQSRWASVIIAM
VGLLFSFSISNINEIWGWLTLGLGTGLAVPLLLRWYWWRFNGYGFATGIAAGMIAAIITKAIVLPSLLDLQIAEFIQFLI
PSSCSLAGCIVGTLLTPATERLVLENFYTITRPFGFWKQIATNVPHYLREKITLENQQDLLATAIAIPWQIVLCLTGIMF
VMKRWDNFKILCFLLIILSICLYFAWYRYLKVKN

Specific function: Catalyzes the sodium-dependent uptake of extracellular proline [H]

COG id: COG0591

COG function: function code ER; Na+/proline symporter

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the sodium:solute symporter (SSF) (TC 2.A.21) family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR011851
- InterPro:   IPR001734
- InterPro:   IPR018212
- InterPro:   IPR019900 [H]

Pfam domain/function: PF00474 SSF [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 66484; Mature: 66484

Theoretical pI: Translated: 8.90; Mature: 8.90

Prosite motif: PS50283 NA_SOLUT_SYMP_3

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.3 %Cys     (Translated Protein)
3.4 %Met     (Translated Protein)
4.7 %Cys+Met (Translated Protein)
1.3 %Cys     (Mature Protein)
3.4 %Met     (Mature Protein)
4.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MHLIDYIIVGLYLFAIVLFGIFLQRKASAGIDSYFLGDRNMPWWVLGASGMASNTDIAGT
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCCCEEEEECCCCCCCCCHHHH
MLITALVYALGTKGFFLELRGGIALILAMFMIFMGKWNRRAQVMTLAEWMHLRFGVGREG
HHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
NIARIVSAIAAIILTIGRISYFAIGGGKFLGEFIAVDARLASIIIIFLALIYTVISGFYG
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VVLTDLFQGVLIFFAIIYICAIAIQLPPLPETFAISIPGTNQLQEWNFREWSSIFPSMKV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCEE
DLPGDYGRFNLFGAILCFYLLKVLMEGFGGIGGYMMQRYFAAKSDREVGLMSLWWIFLLS
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
FRWPLVTAFAILGINYGITNQVISDPELVLPTVIATYLPVGIKGLILACFIAAGMSTFDS
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LINGGAAYWVKDIYQAYLDPLADNRKLMFQSRWASVIIAMVGLLFSFSISNINEIWGWLT
HHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LGLGTGLAVPLLLRWYWWRFNGYGFATGIAAGMIAAIITKAIVLPSLLDLQIAEFIQFLI
HHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
PSSCSLAGCIVGTLLTPATERLVLENFYTITRPFGFWKQIATNVPHYLREKITLENQQDL
CCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCHHHH
LATAIAIPWQIVLCLTGIMFVMKRWDNFKILCFLLIILSICLYFAWYRYLKVKN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MHLIDYIIVGLYLFAIVLFGIFLQRKASAGIDSYFLGDRNMPWWVLGASGMASNTDIAGT
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCCCEEEEECCCCCCCCCHHHH
MLITALVYALGTKGFFLELRGGIALILAMFMIFMGKWNRRAQVMTLAEWMHLRFGVGREG
HHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
NIARIVSAIAAIILTIGRISYFAIGGGKFLGEFIAVDARLASIIIIFLALIYTVISGFYG
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VVLTDLFQGVLIFFAIIYICAIAIQLPPLPETFAISIPGTNQLQEWNFREWSSIFPSMKV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCEE
DLPGDYGRFNLFGAILCFYLLKVLMEGFGGIGGYMMQRYFAAKSDREVGLMSLWWIFLLS
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
FRWPLVTAFAILGINYGITNQVISDPELVLPTVIATYLPVGIKGLILACFIAAGMSTFDS
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LINGGAAYWVKDIYQAYLDPLADNRKLMFQSRWASVIIAMVGLLFSFSISNINEIWGWLT
HHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LGLGTGLAVPLLLRWYWWRFNGYGFATGIAAGMIAAIITKAIVLPSLLDLQIAEFIQFLI
HHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
PSSCSLAGCIVGTLLTPATERLVLENFYTITRPFGFWKQIATNVPHYLREKITLENQQDL
CCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCHHHH
LATAIAIPWQIVLCLTGIMFVMKRWDNFKILCFLLIILSICLYFAWYRYLKVKN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: Na (I) [Periplasm]; pantothenate [Periplasm] [C]

Specific reaction: Na (I) [Periplasm] + pantothenate [Periplasm] = Na (I) [Cytoplasm] + pantothenate [Cytoplasm] [C]

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8969499; 9384377 [H]