Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is ygxB [H]

Identifier: 113474367

GI number: 113474367

Start: 800556

End: 802199

Strand: Reverse

Name: ygxB [H]

Synonym: Tery_0500

Alternate gene names: 113474367

Gene position: 802199-800556 (Counterclockwise)

Preceding gene: 113474369

Following gene: 113474363

Centisome position: 10.35

GC content: 37.83

Gene sequence:

>1644_bases
ATGAATGGCACTTGGCAAAATATTACACAATTAATTCACCTCGACGAGCCAATTCAGGCTAATCTAATCTTAGCCTCACA
TATTTTGGCACAAGCTAATGGAAATCCTTTAAATCAATTGTCCCAAGCTCCAATCCTGAAAATAGCTATAGCTATTGGAA
CTTTATTCATAGGTTGGCTTGTGGCTTTGTTTATTTCTAATGTTATAGTTGGAGGACTCTTAAAAAAGACCAGTGTTGAT
AACAAAATTGCTGGTTGGGTGACAGGTAGTCAGGAAAACGGTCAGGATTTACCTGTGGAGAAATGGATATCCTCTGTGGT
GTTCTGGATCATTATGATCTTTGTTTTGGTGGCCTTCTTTGAAGAGCTTAATCTCACAACAGTTTCTCAACCTCTAAGTG
TCTTCCTCACAGAAATAACTAGCTTCTTACCTAAGATAGCTGGTGCTTTCATTTGGCTGGGTATTGCCTGGTCAGTAGCA
AGTATAGCTAAATTAGCAGCAAGCAGAGGACTGAAAACATTTGGTCTAAATGACCGTCTGAATGAGCAGATCAGTGATGG
ACAAGAAGAAAGTCAATTAGATATTAGCGATACTATTGCTAATGCTATCTATTGGTTGATCTTCCTGCTATTCTTGCCAT
TAATCCTGGAAGCCTTGCAACTACAGATTGCTTTACAACCTGTTCAAAGCATAGTAGATCAAATCTTACAAGCTTTGCCT
AGAATTCTTAAGGCTGTTATTTTAGCTACAGTTGGTTGGTTAGTTGCTACTGTTGTTAAGAAAGTTGTTACTAATCTACT
TGCTGCTACAGGTGTAGACCAAATGGGTAGCAAGTTGGGTATGAATAAAACCAGTAGCAGTCAAAATATTTCTGGGATTA
TTGGTACAATTGTTTATGTATTGATATTAATTCCTGTAGCGATCGCTGCTCTGAGTGCTCTAAATATTGAGGCAATTACC
ATTCCAGCAGTGGCAATGCTTAACAATATTCTGACATTCCTCCCCAAAATCTTTGCGGCTCTTGTAGTACTTGTTATTGC
TTACTTTGTTGGTCAATTTGTTAAAGATTTAATTACTAATCTTCTTACCAGTATTGGGTTTGATGACTTTTTCAATTGGC
TTGGTTTAACTTCGACTCCATCATCTTCCCCATCTAAAGACCCAAATACAACTGTAATTCAGGGTGAACCTGATATTACT
CGGACTCCATCACAAATTGCTGGCTTTGTAGCTTTTGTGGGTATTATCCTTTTTGCTGCAGTTTCAGCTACTCAAATTAT
GGAACTTCAGGCTCTGAGTTTAATTGTTAATCAGTTAATCTATATTGCTGGTCAAGTTCTTTACGGTTTAGTGGTATTGG
CTATAGGTCTTTGTTTAGCTAGCTTTGCTTACAACTTAATTACTAGTTCTGGTAGTTCCCAAGCAAAACTTTTAGGGCAG
CTTGCTCGAATTGGAATTATCGTATTAGTCTCAGCTATGGCTCTGCAACAAATGGGTATTGCTCCTAGTATTGTCAATCT
AGCTTTTGGACTCTTCATGGGAGCAATGGCTGTAGCTATTGCTTTAGCTTTTGGTTTGGGAGGACGAGATATTGCTTCTT
CTCAAATTCAAGAATGGTTAGAACAGTTTAATAAGAAAAAATAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
CGAAAACTTGACTAAATGGCATAGTTACCTTCAAGCTATTAGACATATACAAGCAATCTAAATGATTGCTAATTAACACT
CACATTAACCCAAGAAAACC

Downstream 100 bases:

>100_bases
TCGTTAAAATTTCTGCCAGAGTTTTTGACCAGGGAGAATGGGAAATATCAAAGTTCCATAACCCATTCTCCCTCTTTGAC
TATCAATTACCATCTCTTAT

Product: TM helix protein

Products: NA

Alternate protein names: ORF1 [H]

Number of amino acids: Translated: 547; Mature: 547

Protein sequence:

>547_residues
MNGTWQNITQLIHLDEPIQANLILASHILAQANGNPLNQLSQAPILKIAIAIGTLFIGWLVALFISNVIVGGLLKKTSVD
NKIAGWVTGSQENGQDLPVEKWISSVVFWIIMIFVLVAFFEELNLTTVSQPLSVFLTEITSFLPKIAGAFIWLGIAWSVA
SIAKLAASRGLKTFGLNDRLNEQISDGQEESQLDISDTIANAIYWLIFLLFLPLILEALQLQIALQPVQSIVDQILQALP
RILKAVILATVGWLVATVVKKVVTNLLAATGVDQMGSKLGMNKTSSSQNISGIIGTIVYVLILIPVAIAALSALNIEAIT
IPAVAMLNNILTFLPKIFAALVVLVIAYFVGQFVKDLITNLLTSIGFDDFFNWLGLTSTPSSSPSKDPNTTVIQGEPDIT
RTPSQIAGFVAFVGIILFAAVSATQIMELQALSLIVNQLIYIAGQVLYGLVVLAIGLCLASFAYNLITSSGSSQAKLLGQ
LARIGIIVLVSAMALQQMGIAPSIVNLAFGLFMGAMAVAIALAFGLGGRDIASSQIQEWLEQFNKKK

Sequences:

>Translated_547_residues
MNGTWQNITQLIHLDEPIQANLILASHILAQANGNPLNQLSQAPILKIAIAIGTLFIGWLVALFISNVIVGGLLKKTSVD
NKIAGWVTGSQENGQDLPVEKWISSVVFWIIMIFVLVAFFEELNLTTVSQPLSVFLTEITSFLPKIAGAFIWLGIAWSVA
SIAKLAASRGLKTFGLNDRLNEQISDGQEESQLDISDTIANAIYWLIFLLFLPLILEALQLQIALQPVQSIVDQILQALP
RILKAVILATVGWLVATVVKKVVTNLLAATGVDQMGSKLGMNKTSSSQNISGIIGTIVYVLILIPVAIAALSALNIEAIT
IPAVAMLNNILTFLPKIFAALVVLVIAYFVGQFVKDLITNLLTSIGFDDFFNWLGLTSTPSSSPSKDPNTTVIQGEPDIT
RTPSQIAGFVAFVGIILFAAVSATQIMELQALSLIVNQLIYIAGQVLYGLVVLAIGLCLASFAYNLITSSGSSQAKLLGQ
LARIGIIVLVSAMALQQMGIAPSIVNLAFGLFMGAMAVAIALAFGLGGRDIASSQIQEWLEQFNKKK
>Mature_547_residues
MNGTWQNITQLIHLDEPIQANLILASHILAQANGNPLNQLSQAPILKIAIAIGTLFIGWLVALFISNVIVGGLLKKTSVD
NKIAGWVTGSQENGQDLPVEKWISSVVFWIIMIFVLVAFFEELNLTTVSQPLSVFLTEITSFLPKIAGAFIWLGIAWSVA
SIAKLAASRGLKTFGLNDRLNEQISDGQEESQLDISDTIANAIYWLIFLLFLPLILEALQLQIALQPVQSIVDQILQALP
RILKAVILATVGWLVATVVKKVVTNLLAATGVDQMGSKLGMNKTSSSQNISGIIGTIVYVLILIPVAIAALSALNIEAIT
IPAVAMLNNILTFLPKIFAALVVLVIAYFVGQFVKDLITNLLTSIGFDDFFNWLGLTSTPSSSPSKDPNTTVIQGEPDIT
RTPSQIAGFVAFVGIILFAAVSATQIMELQALSLIVNQLIYIAGQVLYGLVVLAIGLCLASFAYNLITSSGSSQAKLLGQ
LARIGIIVLVSAMALQQMGIAPSIVNLAFGLFMGAMAVAIALAFGLGGRDIASSQIQEWLEQFNKKK

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR008910 [H]

Pfam domain/function: PF05552 TM_helix [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 58578; Mature: 58578

Theoretical pI: Translated: 5.14; Mature: 5.14

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
1.8 %Met     (Translated Protein)
2.0 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
1.8 %Met     (Mature Protein)
2.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNGTWQNITQLIHLDEPIQANLILASHILAQANGNPLNQLSQAPILKIAIAIGTLFIGWL
CCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHH
VALFISNVIVGGLLKKTSVDNKIAGWVTGSQENGQDLPVEKWISSVVFWIIMIFVLVAFF
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHCCEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EELNLTTVSQPLSVFLTEITSFLPKIAGAFIWLGIAWSVASIAKLAASRGLKTFGLNDRL
HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHH
NEQISDGQEESQLDISDTIANAIYWLIFLLFLPLILEALQLQIALQPVQSIVDQILQALP
HHHHCCCCHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RILKAVILATVGWLVATVVKKVVTNLLAATGVDQMGSKLGMNKTSSSQNISGIIGTIVYV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
LILIPVAIAALSALNIEAITIPAVAMLNNILTFLPKIFAALVVLVIAYFVGQFVKDLITN
HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLTSIGFDDFFNWLGLTSTPSSSPSKDPNTTVIQGEPDITRTPSQIAGFVAFVGIILFAA
HHHHCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VSATQIMELQALSLIVNQLIYIAGQVLYGLVVLAIGLCLASFAYNLITSSGSSQAKLLGQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH
LARIGIIVLVSAMALQQMGIAPSIVNLAFGLFMGAMAVAIALAFGLGGRDIASSQIQEWL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHH
EQFNKKK
HHHCCCC
>Mature Secondary Structure
MNGTWQNITQLIHLDEPIQANLILASHILAQANGNPLNQLSQAPILKIAIAIGTLFIGWL
CCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHH
VALFISNVIVGGLLKKTSVDNKIAGWVTGSQENGQDLPVEKWISSVVFWIIMIFVLVAFF
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHCCEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EELNLTTVSQPLSVFLTEITSFLPKIAGAFIWLGIAWSVASIAKLAASRGLKTFGLNDRL
HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHH
NEQISDGQEESQLDISDTIANAIYWLIFLLFLPLILEALQLQIALQPVQSIVDQILQALP
HHHHCCCCHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RILKAVILATVGWLVATVVKKVVTNLLAATGVDQMGSKLGMNKTSSSQNISGIIGTIVYV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
LILIPVAIAALSALNIEAITIPAVAMLNNILTFLPKIFAALVVLVIAYFVGQFVKDLITN
HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLTSIGFDDFFNWLGLTSTPSSSPSKDPNTTVIQGEPDITRTPSQIAGFVAFVGIILFAA
HHHHCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VSATQIMELQALSLIVNQLIYIAGQVLYGLVVLAIGLCLASFAYNLITSSGSSQAKLLGQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH
LARIGIIVLVSAMALQQMGIAPSIVNLAFGLFMGAMAVAIALAFGLGGRDIASSQIQEWL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHH
EQFNKKK
HHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9579061; 9384377; 8144469 [H]