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The map label for this gene is pucC [H]

Identifier: 113474329

GI number: 113474329

Start: 727178

End: 728614

Strand: Direct

Name: pucC [H]

Synonym: Tery_0459

Alternate gene names: 113474329

Gene position: 727178-728614 (Clockwise)

Preceding gene: 113474327

Following gene: 113474336

Centisome position: 9.38

GC content: 35.21

Gene sequence:

>1437_bases
ATGACAAGTAAAGATTTAAAAGGTACAAAAATCGATAATATTGATATGGAAAAAAATTTTCCTAAACTTAATTTATTCAC
TATGTTTAGATTGGGTTTCTATCAAATGGGATTAGGAACAATGTCAGTTTTAACTCTTGGAGTTTTAAACCGAGTTATGA
TTGCTGAATTAAAAATTCCTGCCACAATAGTAGCCATAACTTTATCGTTATATCAATTTATGGCTCCAGCAAGGGTTTGG
TTTGGTCAAATGTCTGATACTAAGCCTTTGCTTGGTAAACATCGCACTGGTTATATGTGGATAGGAGCGGTTTTTTTTAC
GGTAACTGCTTTTTTTGCTGTGCAAGCTATGTGGCAGGTTGGTGATAGTTTAAGGGTTAATGGTTGGTCTAATTCTACTT
ATTTTTGGATTGGTATTTTAGGCTTAATGTTTATATTTTATGGTTTGGCTTTAAGTGCAAGTTCTACACCTTTTGCTGCT
TTATTAGTAGATATTTCTGATGAAGATAATCGTTCTAAGGTTGTCGGTATAGTCTGGTCAATGTTGATGGTGGGAATTAT
TATTGGGGCTATTACTAGTAGTTTTTTATTGAAACAAGTTGGTGTGGATGCTCCGTTAGAAACTGTTCAAGTTTCTATTA
ATAATTTGTTTATTATAATACCGGCAATTGTTTTGGTTTTTGCTTTTATTGGTACTGTGGGAGTTGAGGAAAAATACTCT
CGTTATGGCAGTCGTTCAACTATTGCTAACCGGGAGGATCAAGTTACTATGGGAACAACTTTAAAAATTTTAAAGGCTAA
TAGACAAACTGGTTTGTTTTTTACTTTTGTGTTTGTATTAATTATTAGTTTGTTTATGCAGGATGCTGTTTTGGAGCCTT
ATGCTGGGGAAATATTTCTGATGCCAATTTCTGAAAGTACTAGGTTGAATGCTGTTTCGGGAATAGGAACTTTAATTGGG
TTAGGTACAACGGGTTTTTTAGTAGTACCAAGGTTGGGAAAGAAAAATTCTTTGAAGGTTGGATGTGTGGCAACAACAAT
TAGTTTTATTTTGATAGTTATGTCTGGGTTTACTGGTAAGCTTTCTTTGTTTTTAAGTGCTTTATTTTTGTATGGTTTGG
CTGCAGGTTTAACTACTACTGCTGCTCTTAGTTTAATGTTAGATTTAACGGCGGCGGAAACGGCGGGAACTTTTATTGGG
GCTTGGGGTTTAGCACAGGCAATGGCACGAGGTTTATCTACGGTTATTGGTGGTGTGACTTTGGATGTTGGTCGCCGTTT
ATTTAATGTTTCAATGTTGGCTTATGGGTTGGTTTTTCTATTAGCAGGAGTGGGAATGATACTTTCTATTTTCTTGCTCA
ATAGGGTTAATGTTAGAGAATTTCAAGATAATGCTAGTGTGGCGATCGCTACTATTTTAGAGGGAGAATTAGATTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
AGCTTCTATATTTTTAGCTGATGATTTTAGCTAGAAATGCTTATAAATAATGACTGATAACTGATAACTGATAACTAATA
GCTGATAACTCATAAATGAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAAGTTAGGGTTTTAATTTGCTGGGAGTTTTACTTTTCTCAGACTTATTTTGTTTGTTTATTTCTGACTCTGGATATGGC
AAAGAATGGGTTGAAAATTG

Product: PUCC protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 478; Mature: 477

Protein sequence:

>478_residues
MTSKDLKGTKIDNIDMEKNFPKLNLFTMFRLGFYQMGLGTMSVLTLGVLNRVMIAELKIPATIVAITLSLYQFMAPARVW
FGQMSDTKPLLGKHRTGYMWIGAVFFTVTAFFAVQAMWQVGDSLRVNGWSNSTYFWIGILGLMFIFYGLALSASSTPFAA
LLVDISDEDNRSKVVGIVWSMLMVGIIIGAITSSFLLKQVGVDAPLETVQVSINNLFIIIPAIVLVFAFIGTVGVEEKYS
RYGSRSTIANREDQVTMGTTLKILKANRQTGLFFTFVFVLIISLFMQDAVLEPYAGEIFLMPISESTRLNAVSGIGTLIG
LGTTGFLVVPRLGKKNSLKVGCVATTISFILIVMSGFTGKLSLFLSALFLYGLAAGLTTTAALSLMLDLTAAETAGTFIG
AWGLAQAMARGLSTVIGGVTLDVGRRLFNVSMLAYGLVFLLAGVGMILSIFLLNRVNVREFQDNASVAIATILEGELD

Sequences:

>Translated_478_residues
MTSKDLKGTKIDNIDMEKNFPKLNLFTMFRLGFYQMGLGTMSVLTLGVLNRVMIAELKIPATIVAITLSLYQFMAPARVW
FGQMSDTKPLLGKHRTGYMWIGAVFFTVTAFFAVQAMWQVGDSLRVNGWSNSTYFWIGILGLMFIFYGLALSASSTPFAA
LLVDISDEDNRSKVVGIVWSMLMVGIIIGAITSSFLLKQVGVDAPLETVQVSINNLFIIIPAIVLVFAFIGTVGVEEKYS
RYGSRSTIANREDQVTMGTTLKILKANRQTGLFFTFVFVLIISLFMQDAVLEPYAGEIFLMPISESTRLNAVSGIGTLIG
LGTTGFLVVPRLGKKNSLKVGCVATTISFILIVMSGFTGKLSLFLSALFLYGLAAGLTTTAALSLMLDLTAAETAGTFIG
AWGLAQAMARGLSTVIGGVTLDVGRRLFNVSMLAYGLVFLLAGVGMILSIFLLNRVNVREFQDNASVAIATILEGELD
>Mature_477_residues
TSKDLKGTKIDNIDMEKNFPKLNLFTMFRLGFYQMGLGTMSVLTLGVLNRVMIAELKIPATIVAITLSLYQFMAPARVWF
GQMSDTKPLLGKHRTGYMWIGAVFFTVTAFFAVQAMWQVGDSLRVNGWSNSTYFWIGILGLMFIFYGLALSASSTPFAAL
LVDISDEDNRSKVVGIVWSMLMVGIIIGAITSSFLLKQVGVDAPLETVQVSINNLFIIIPAIVLVFAFIGTVGVEEKYSR
YGSRSTIANREDQVTMGTTLKILKANRQTGLFFTFVFVLIISLFMQDAVLEPYAGEIFLMPISESTRLNAVSGIGTLIGL
GTTGFLVVPRLGKKNSLKVGCVATTISFILIVMSGFTGKLSLFLSALFLYGLAAGLTTTAALSLMLDLTAAETAGTFIGA
WGLAQAMARGLSTVIGGVTLDVGRRLFNVSMLAYGLVFLLAGVGMILSIFLLNRVNVREFQDNASVAIATILEGELD

Specific function: PucC is required for high-level transcription of the puc operon [H]

COG id: COG0477

COG function: function code GEPR; Permeases of the major facilitator superfamily

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the pucC family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR016196
- InterPro:   IPR004896 [H]

Pfam domain/function: PF03209 PUCC [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 51772; Mature: 51641

Theoretical pI: Translated: 9.56; Mature: 9.56

Prosite motif: PS50850 MFS

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
4.4 %Met     (Translated Protein)
4.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
4.2 %Met     (Mature Protein)
4.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MTSKDLKGTKIDNIDMEKNFPKLNLFTMFRLGFYQMGLGTMSVLTLGVLNRVMIAELKIP
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
ATIVAITLSLYQFMAPARVWFGQMSDTKPLLGKHRTGYMWIGAVFFTVTAFFAVQAMWQV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
GDSLRVNGWSNSTYFWIGILGLMFIFYGLALSASSTPFAALLVDISDEDNRSKVVGIVWS
CCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHH
MLMVGIIIGAITSSFLLKQVGVDAPLETVQVSINNLFIIIPAIVLVFAFIGTVGVEEKYS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHEEHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHH
RYGSRSTIANREDQVTMGTTLKILKANRQTGLFFTFVFVLIISLFMQDAVLEPYAGEIFL
HCCCCCCCCCCCCCEEECCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEE
MPISESTRLNAVSGIGTLIGLGTTGFLVVPRLGKKNSLKVGCVATTISFILIVMSGFTGK
EECCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH
LSLFLSALFLYGLAAGLTTTAALSLMLDLTAAETAGTFIGAWGLAQAMARGLSTVIGGVT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH
LDVGRRLFNVSMLAYGLVFLLAGVGMILSIFLLNRVNVREFQDNASVAIATILEGELD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCCCEEEEEECCCCCC
>Mature Secondary Structure 
TSKDLKGTKIDNIDMEKNFPKLNLFTMFRLGFYQMGLGTMSVLTLGVLNRVMIAELKIP
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
ATIVAITLSLYQFMAPARVWFGQMSDTKPLLGKHRTGYMWIGAVFFTVTAFFAVQAMWQV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
GDSLRVNGWSNSTYFWIGILGLMFIFYGLALSASSTPFAALLVDISDEDNRSKVVGIVWS
CCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHH
MLMVGIIIGAITSSFLLKQVGVDAPLETVQVSINNLFIIIPAIVLVFAFIGTVGVEEKYS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHEEHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHH
RYGSRSTIANREDQVTMGTTLKILKANRQTGLFFTFVFVLIISLFMQDAVLEPYAGEIFL
HCCCCCCCCCCCCCEEECCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEE
MPISESTRLNAVSGIGTLIGLGTTGFLVVPRLGKKNSLKVGCVATTISFILIVMSGFTGK
EECCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH
LSLFLSALFLYGLAAGLTTTAALSLMLDLTAAETAGTFIGAWGLAQAMARGLSTVIGGVT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH
LDVGRRLFNVSMLAYGLVFLLAGVGMILSIFLLNRVNVREFQDNASVAIATILEGELD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCCCEEEEEECCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 2549005; 1717257; 8759841 [H]