Definition | Agrobacterium tumefaciens str. C58 chromosome circular, complete sequence. |
---|---|
Accession | NC_003062 |
Length | 2,841,580 |
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The map label for this gene is 159184723
Identifier: 159184723
GI number: 159184723
Start: 1337985
End: 1344332
Strand: Reverse
Name: 159184723
Synonym: Atu1348
Alternate gene names: NA
Gene position: 1344332-1337985 (Counterclockwise)
Preceding gene: 15888677
Following gene: 15888671
Centisome position: 47.31
GC content: 63.64
Gene sequence:
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CAGCCGCAGCCTGCCCCTGCATTGCGTGGCACACTGCCGCTTGAGAACCGTCAGGTCGAAAACCGTCAGGCACCCGCCCC GGCGCAGCCGGTCGCAACCAACCCGGCCGGACGCCGGGAAGAAGGCGGCGGCTGGATCAGCGATCTGCTACGCGGCGCGT CCCAGGAGACGCCAGCAGCATCTACACCGCGCGCCAGCACTGAGCAGCAGCCCACCCGTGCGGCCGACACCCGCAATCCC CGGCACATGGTGGAATCGCTGAATTCACTCTCGGTCGATATCGCCCGCGCCATCGATCACGATGCCTCCGTGGAACTGTG GCGCCGCTATCAGCGCGGCGAGCGCGACGTCTTCACACGTCGCCTCTACACGCTGAAGGGCCAGACGACGTTTGACGAGA TCAAGCGCAAATACGAACGCGAAGCGGAATTCCGCACCGCCGTGGACCGCTACATCACCGATTTCGAGAAGCTGCTCGCC GACGTGGCCCGCACCGACCGCGACCGGAGCGTCACCCAGTCCTACCTCACCTCCGATACCGGCAAGGTCTATACGATGCT TGCCCATGCGGCGGGCCGGTTTAATTGA
Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases CAGAAAGGTAACGCGGAGGGGAATCTCCTCCGCGTCACCCGTCTAACCTGAAATGAAAAATGACCGTCGTGTAGCATTCG TCTACCCGGTGGTCATTCTG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: Chemotaxis Sensory Transducer; Transmembrane Protein; Methyl-Accepting Chemotaxis Protein; Kinesin-Like Protein; ATPase
Number of amino acids: Translated: 2115; Mature: 2114
Protein sequence:
>2115_residues MANNKISDSVDETAFQALEDALQLGAFEEKPETRKTAKPKQPEARVKEASRQTPAPEATRAPVEQTPRSPNLEAANDGSK RSPAMILKSLEGGSIGGALRNATIMSVIWALGGLGIAHLLYGNALWSIGSLADLTAIPGLMAIVVGILVPVMLFFAFAIM MARARDLRNAARSMAEVALRLAEPETVASDRIMSVGQAVRREVSAMNDGIERTIARATELETLVHSEVNALERSYADNEL RVRSLVQELTAERDAIVNHAERIRSSIVGAQEQIKEELSIVGEELSMRIATTGEAFASMIDTRSAALLEKSRASTEAMGS LIAAKTENLLQALNSSGSTISNEFDMRLHNLTSTLDERGEVLLERFAIHASTLDSGVESLNSALEERTRQLNETLSARSL ELNRNIERGQQVIGGSLDTVLDKLSTTLEEKGLSFRQSLQSTADDAIMDLDLRSGLYEERMQATVGQVNSAFDEHVAQFA SAFDQRAGSLDSKLMESLARINETVAGGSEALDTILTSGLERIGSTMTDQSLALATALGTGQEMLENALESRTQAFSDAI GQRTAEITDAFTNSHAKIDTVLAERSNALFGALSASQDRFDEALASRSLAITGSVSGTAEHLAAMLDERAAAINSVVADV ERRLTETLETRAAAITGAVSGIEDRISDTLESRTAALHDVVSGAESRIADTLDGRTAALSSAISGVEERIADTMDSRTLS LDMTFANVEERLSETLDNRTSALTGIVASAEEKIAGALDSRTATFGDVVAGAETRIAETLDGRTAALNAVVSGAEERIAD ALDSRTMALDMTFSGAEEKIAEALDTRTAALGELVASAETRIAGALDSRTDSLKTVVSGAEERITDVLDSRTMALDMSFS GVEEKITDILDGRTAALKSAVAGVEDRIAGALDSRTAALSGIVSGAEERIAEALDSRTLALDMTISGVEERIAEAMDARA SSLSLAAAGVGQRLEATAFTLENALASGHERLETMLGSQAERIAGSLERNSGLIEQSVSGAANRIENVVEDGSSRFAQTV EEGVSRLENNLSQSHEEIRTALDQRQADLAATLSSATTQMGDMLSEQAMMIGTTVASSASMLELSLETQQDTLQKAIDGS AATLEARLRNSAGDIAVKIGEAAREIGGATDALSTRIETSIGNVTTRLDETGARIETSLDALQTRVGGDLANVNNSIEDA GRRFADALEDKTAVFARTSDEAAERITGILDEQTTRVADTFENRTSRLAETFDAGTARIDERLGTMDRALTIGLENVNRT IEGKASDLAVSLRGAVVSATQNIGDEAARSSALLAKSGSEFAEQVQAQNEAFTKAIEERSGEIVTRISDAQTRLSGQAAA VAQTFSEAGNIIVNKVAEAEAVVRSQVGVISETLTSVESALDARGESIRSALDNRTRELNSMLASRSAELSRLIEEKAKP VVEEYATIGREAAEKIVSAAQQSAELLSQSNSGMVGMVEQAISDYAAAGTDAASKLVAATRQSTDMLSETHTAMADAVEQ GIDKYARSGSDAANKLVAATRQSTDMLSQTHNSMAEIVEQSATNFNAAVERAAQGFGAADEALNASATRFSESASQAADM VSSSSRLLEGKIDRLSNISGQTLAQVAGIVGRFEEHSKVLSQASELLNAAQSSLVGTLEERQDALRSLSVGLVKRSEEIE TAMRNVVGVVENTLNEAEERSQNVAGNLRDNLQASFSDIGRSLDETEQRARSAAQTMRGALLSAGQDASRSIESTLSDAQ KYSDELVNRLRGGVESSLSEVDNLLGSASEKSNAAAANLKETLRQAVEEAVSRFAGATDEIRRSSHDIRRELDATRAELK RGAFDLPEEAKESAAAMRRAVSEQIKALQDISQLVGRSTHQMEVSEPVARAIAATQPAAERRVEPRPQPAAAAPVQQRPA QPQPAPALRGTLPLENRQVENRQAPAPAQPVATNPAGRREEGGGWISDLLRGASQETPAASTPRASTEQQPTRAADTRNP RHMVESLNSLSVDIARAIDHDASVELWRRYQRGERDVFTRRLYTLKGQTTFDEIKRKYEREAEFRTAVDRYITDFEKLLA DVARTDRDRSVTQSYLTSDTGKVYTMLAHAAGRFN
Sequences:
>Translated_2115_residues MANNKISDSVDETAFQALEDALQLGAFEEKPETRKTAKPKQPEARVKEASRQTPAPEATRAPVEQTPRSPNLEAANDGSK RSPAMILKSLEGGSIGGALRNATIMSVIWALGGLGIAHLLYGNALWSIGSLADLTAIPGLMAIVVGILVPVMLFFAFAIM MARARDLRNAARSMAEVALRLAEPETVASDRIMSVGQAVRREVSAMNDGIERTIARATELETLVHSEVNALERSYADNEL RVRSLVQELTAERDAIVNHAERIRSSIVGAQEQIKEELSIVGEELSMRIATTGEAFASMIDTRSAALLEKSRASTEAMGS LIAAKTENLLQALNSSGSTISNEFDMRLHNLTSTLDERGEVLLERFAIHASTLDSGVESLNSALEERTRQLNETLSARSL ELNRNIERGQQVIGGSLDTVLDKLSTTLEEKGLSFRQSLQSTADDAIMDLDLRSGLYEERMQATVGQVNSAFDEHVAQFA SAFDQRAGSLDSKLMESLARINETVAGGSEALDTILTSGLERIGSTMTDQSLALATALGTGQEMLENALESRTQAFSDAI GQRTAEITDAFTNSHAKIDTVLAERSNALFGALSASQDRFDEALASRSLAITGSVSGTAEHLAAMLDERAAAINSVVADV ERRLTETLETRAAAITGAVSGIEDRISDTLESRTAALHDVVSGAESRIADTLDGRTAALSSAISGVEERIADTMDSRTLS LDMTFANVEERLSETLDNRTSALTGIVASAEEKIAGALDSRTATFGDVVAGAETRIAETLDGRTAALNAVVSGAEERIAD ALDSRTMALDMTFSGAEEKIAEALDTRTAALGELVASAETRIAGALDSRTDSLKTVVSGAEERITDVLDSRTMALDMSFS GVEEKITDILDGRTAALKSAVAGVEDRIAGALDSRTAALSGIVSGAEERIAEALDSRTLALDMTISGVEERIAEAMDARA SSLSLAAAGVGQRLEATAFTLENALASGHERLETMLGSQAERIAGSLERNSGLIEQSVSGAANRIENVVEDGSSRFAQTV EEGVSRLENNLSQSHEEIRTALDQRQADLAATLSSATTQMGDMLSEQAMMIGTTVASSASMLELSLETQQDTLQKAIDGS AATLEARLRNSAGDIAVKIGEAAREIGGATDALSTRIETSIGNVTTRLDETGARIETSLDALQTRVGGDLANVNNSIEDA GRRFADALEDKTAVFARTSDEAAERITGILDEQTTRVADTFENRTSRLAETFDAGTARIDERLGTMDRALTIGLENVNRT IEGKASDLAVSLRGAVVSATQNIGDEAARSSALLAKSGSEFAEQVQAQNEAFTKAIEERSGEIVTRISDAQTRLSGQAAA VAQTFSEAGNIIVNKVAEAEAVVRSQVGVISETLTSVESALDARGESIRSALDNRTRELNSMLASRSAELSRLIEEKAKP VVEEYATIGREAAEKIVSAAQQSAELLSQSNSGMVGMVEQAISDYAAAGTDAASKLVAATRQSTDMLSETHTAMADAVEQ GIDKYARSGSDAANKLVAATRQSTDMLSQTHNSMAEIVEQSATNFNAAVERAAQGFGAADEALNASATRFSESASQAADM VSSSSRLLEGKIDRLSNISGQTLAQVAGIVGRFEEHSKVLSQASELLNAAQSSLVGTLEERQDALRSLSVGLVKRSEEIE TAMRNVVGVVENTLNEAEERSQNVAGNLRDNLQASFSDIGRSLDETEQRARSAAQTMRGALLSAGQDASRSIESTLSDAQ KYSDELVNRLRGGVESSLSEVDNLLGSASEKSNAAAANLKETLRQAVEEAVSRFAGATDEIRRSSHDIRRELDATRAELK RGAFDLPEEAKESAAAMRRAVSEQIKALQDISQLVGRSTHQMEVSEPVARAIAATQPAAERRVEPRPQPAAAAPVQQRPA QPQPAPALRGTLPLENRQVENRQAPAPAQPVATNPAGRREEGGGWISDLLRGASQETPAASTPRASTEQQPTRAADTRNP RHMVESLNSLSVDIARAIDHDASVELWRRYQRGERDVFTRRLYTLKGQTTFDEIKRKYEREAEFRTAVDRYITDFEKLLA DVARTDRDRSVTQSYLTSDTGKVYTMLAHAAGRFN >Mature_2114_residues ANNKISDSVDETAFQALEDALQLGAFEEKPETRKTAKPKQPEARVKEASRQTPAPEATRAPVEQTPRSPNLEAANDGSKR SPAMILKSLEGGSIGGALRNATIMSVIWALGGLGIAHLLYGNALWSIGSLADLTAIPGLMAIVVGILVPVMLFFAFAIMM ARARDLRNAARSMAEVALRLAEPETVASDRIMSVGQAVRREVSAMNDGIERTIARATELETLVHSEVNALERSYADNELR VRSLVQELTAERDAIVNHAERIRSSIVGAQEQIKEELSIVGEELSMRIATTGEAFASMIDTRSAALLEKSRASTEAMGSL IAAKTENLLQALNSSGSTISNEFDMRLHNLTSTLDERGEVLLERFAIHASTLDSGVESLNSALEERTRQLNETLSARSLE LNRNIERGQQVIGGSLDTVLDKLSTTLEEKGLSFRQSLQSTADDAIMDLDLRSGLYEERMQATVGQVNSAFDEHVAQFAS AFDQRAGSLDSKLMESLARINETVAGGSEALDTILTSGLERIGSTMTDQSLALATALGTGQEMLENALESRTQAFSDAIG QRTAEITDAFTNSHAKIDTVLAERSNALFGALSASQDRFDEALASRSLAITGSVSGTAEHLAAMLDERAAAINSVVADVE RRLTETLETRAAAITGAVSGIEDRISDTLESRTAALHDVVSGAESRIADTLDGRTAALSSAISGVEERIADTMDSRTLSL DMTFANVEERLSETLDNRTSALTGIVASAEEKIAGALDSRTATFGDVVAGAETRIAETLDGRTAALNAVVSGAEERIADA LDSRTMALDMTFSGAEEKIAEALDTRTAALGELVASAETRIAGALDSRTDSLKTVVSGAEERITDVLDSRTMALDMSFSG VEEKITDILDGRTAALKSAVAGVEDRIAGALDSRTAALSGIVSGAEERIAEALDSRTLALDMTISGVEERIAEAMDARAS SLSLAAAGVGQRLEATAFTLENALASGHERLETMLGSQAERIAGSLERNSGLIEQSVSGAANRIENVVEDGSSRFAQTVE EGVSRLENNLSQSHEEIRTALDQRQADLAATLSSATTQMGDMLSEQAMMIGTTVASSASMLELSLETQQDTLQKAIDGSA ATLEARLRNSAGDIAVKIGEAAREIGGATDALSTRIETSIGNVTTRLDETGARIETSLDALQTRVGGDLANVNNSIEDAG RRFADALEDKTAVFARTSDEAAERITGILDEQTTRVADTFENRTSRLAETFDAGTARIDERLGTMDRALTIGLENVNRTI EGKASDLAVSLRGAVVSATQNIGDEAARSSALLAKSGSEFAEQVQAQNEAFTKAIEERSGEIVTRISDAQTRLSGQAAAV AQTFSEAGNIIVNKVAEAEAVVRSQVGVISETLTSVESALDARGESIRSALDNRTRELNSMLASRSAELSRLIEEKAKPV VEEYATIGREAAEKIVSAAQQSAELLSQSNSGMVGMVEQAISDYAAAGTDAASKLVAATRQSTDMLSETHTAMADAVEQG IDKYARSGSDAANKLVAATRQSTDMLSQTHNSMAEIVEQSATNFNAAVERAAQGFGAADEALNASATRFSESASQAADMV SSSSRLLEGKIDRLSNISGQTLAQVAGIVGRFEEHSKVLSQASELLNAAQSSLVGTLEERQDALRSLSVGLVKRSEEIET AMRNVVGVVENTLNEAEERSQNVAGNLRDNLQASFSDIGRSLDETEQRARSAAQTMRGALLSAGQDASRSIESTLSDAQK YSDELVNRLRGGVESSLSEVDNLLGSASEKSNAAAANLKETLRQAVEEAVSRFAGATDEIRRSSHDIRRELDATRAELKR GAFDLPEEAKESAAAMRRAVSEQIKALQDISQLVGRSTHQMEVSEPVARAIAATQPAAERRVEPRPQPAAAAPVQQRPAQ PQPAPALRGTLPLENRQVENRQAPAPAQPVATNPAGRREEGGGWISDLLRGASQETPAASTPRASTEQQPTRAADTRNPR HMVESLNSLSVDIARAIDHDASVELWRRYQRGERDVFTRRLYTLKGQTTFDEIKRKYEREAEFRTAVDRYITDFEKLLAD VARTDRDRSVTQSYLTSDTGKVYTMLAHAAGRFN
Specific function: Unknown
COG id: NA
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Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
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Similarity: NA
Homologues:
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Paralogues:
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Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
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EC number: NA
Molecular weight: Translated: 225595; Mature: 225464
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Signals:
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Secondary structure:
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