Definition Kosmotoga olearia TBF 19.5.1, complete genome.
Accession NC_012785
Length 2,302,126

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The map label for this gene is fbpB [H]

Identifier: 239618346

GI number: 239618346

Start: 2104765

End: 2106960

Strand: Reverse

Name: fbpB [H]

Synonym: Kole_1984

Alternate gene names: 239618346

Gene position: 2106960-2104765 (Counterclockwise)

Preceding gene: 239618347

Following gene: 239618345

Centisome position: 91.52

GC content: 42.58

Gene sequence:

>2196_bases
ATGAAGGCCAAAATTCTAAAACTGATAGTCACAGTTGGGCTTTTTGCGGTTTTGATTTTTTGGGTATTCAATAGCATAGA
AAGAGAGTTTGTTGATGCAGCAAAGGAAAGAATTCTAGAAATATCCAACCTCATTTCCTCTTCGATTCCAGAAGACGATA
TACAGAGTTGGCTGGAAGAAATAGACGCTAATTATCCCGATATACAAGCGATTTATATTAAAGGGCTTGAAGAATATGGT
GAAATACCCGAATATTTTTACCAGAATCCTGAAAGCGCTGATTTGTTCGCAAAATTGAAAACGATGGATTTTTTTGATTA
TGGCATAGAAAGTACCGTTTACGAGGAAATTTATTTCCATGAAAACATACTTAAACTCGGTAACAATCAGTATTTTGTTA
CTTTTGTTCCGGTTCTCGAGCCGGAATATGGCATGGTGACAGGTTCGTTGGTTCTGTTACACAACGCTTCGAAAATCCTT
GGCACAATACGAACTATTTGGGGTTTTGCCTTGCTCTTGATAGGAGTCGTCTTTGCGGTATCTTTCATCACAAGCTTCAT
GAGAGACCCCACGCTGGGTTTTACCATACTCATTGTATTCATTATTGTAGGAACCTTCATAGCTTATCCGCTCTATGAAG
CCTTTAAGCTGACGATTTTCCAAAACGGAGAATTCAGTCTAGACGTCTGGAAAAAAGTTCTAACCACAAGGAATTATTCC
CGGGCACTCTGGGGAAGCATAAAGTTGGGGATGCTTACCGCCACAACATCAACGTTGGTAGGCTTTCTCTTTGCCTTCTC
CCTCACGAGAATGAAGTTAAAGGGAAAGAAATTCTTCGCAACCATGGCCACTCTTCCAGTGATCTCCCCACCTTTCTCGC
TTACGTTGTCTATCATTTTGCTTTTCGGAAACAACGGCCTAATCACGCGGAGACTGCTGGGGTTGACATCCTTTGACATA
TACGGACTCGATGGTCTAGTGATTGTTCAAACAATGGGTATGTTTCCGATAGCTTTTCTTGTTTTAAGTGGAGTTTTGGA
AGCCATTGACTCCACGCTTGAAGAGGCAGCGATGAACATGAGGGCGAATCGGTGGAAGGTATTTACCACTGTAACTTTAC
CCCTTTCTATCCCGGGAATTGCCAGTTCCTGGTTGCTGGTTTTTTCAAACTCCATGGCGGATTTTGCAAATCCTTTAATC
CTTTCTGGAAAGTACAAAGTGTTATCCGTTGAGGCATATCTTGAAGTTACGGGTATGCACAGATTACAAAATGGTGCCGC
CCTTTCCATTCTTCTGCTCATACCAACTCTTACAGCCTTTTTGATTCAGAGGTACTGGGTAAACAGAAAGACCTATGTAA
CAGTCACCGGTAAGCCGAGTGCCAGGATTATTGAAATAGTCAACAGGCCGGTGAAGATCTTCCTGACAACCATGATGGGT
CTTATCTCAGCTTTTCTAATTGGTCTGTACTCCACAATAGTGGCGGGATGCTTTGTCAAAAACTGGGGAATAGATTATTC
CTTCACCCTGGAGAATATCACAGAAGCCTTGTCCAGGGCCAGAGATGCCCTTATAGATACCACCACGCTGGCAGCAATTG
CCACACCTATTGCTGGAATTCTAGCCATGATAGTAGCAATGATAATTGTCAGGAAAAAATTCCCTGGGAAAAAGCTTTTA
CAAATGTTTGTTTTGATGCCCTTTGCTATTCCGGGAACACTGGTGGGTATCAGTTATATCATTGCTTTTAACAGGCCACC
ACTGCTGCTGGTCGGAACCGGAGCGATAATAGTAATAAATTACGTTATAAGGGAGCTGCCAGTGGGGGTGGAAAGCGGAG
TGGCAACCTTGAAACAGATCGATCCGGCTATCGAAGAAGCTGCTCAAAGTCTGGGCGCGGATTCGCCAACGGTTTTCAGG
ACAATTGTGCTACCTTTGATAAGACCTGCATTTATCTCAAGCCTTTCATATACTTTTGTCAGATCCATGACCGCCGTGAG
CGCTGTGATTTTCCTTATTTCTGCAAAATGGTATCACATCACCATTCTCATATACAACTTCTCAGAGAATTTGCGATTTG
GTCTTGCAAGTGTGCTTGCAACGACTCTTATCATAATTATCCTTGCGGTGTTTGGATTGATGAGATTGCTGGTCAAAAAG
AGTTCTTACATGGAAAAAACCATAATTTCGGGGTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GATTTCCTTTAGGTTATAAACCTCCCCTGCACCGCAAAGCGGTGCAGGGATTTGTATTATTAGCTTACTTACCGGCCAAT
CTCCGGAGGTGTAATCAGTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TATGAATGAAGTCGGTTTCGGTTACGTTAAAGAATATTTCAAAGGTTTTTAAAGGTTTTGAAGGGAACGATATAAGGGCT
GTGGACGATGTATCCTTTAA

Product: binding-protein-dependent transport systems inner membrane component

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 731; Mature: 731

Protein sequence:

>731_residues
MKAKILKLIVTVGLFAVLIFWVFNSIEREFVDAAKERILEISNLISSSIPEDDIQSWLEEIDANYPDIQAIYIKGLEEYG
EIPEYFYQNPESADLFAKLKTMDFFDYGIESTVYEEIYFHENILKLGNNQYFVTFVPVLEPEYGMVTGSLVLLHNASKIL
GTIRTIWGFALLLIGVVFAVSFITSFMRDPTLGFTILIVFIIVGTFIAYPLYEAFKLTIFQNGEFSLDVWKKVLTTRNYS
RALWGSIKLGMLTATTSTLVGFLFAFSLTRMKLKGKKFFATMATLPVISPPFSLTLSIILLFGNNGLITRRLLGLTSFDI
YGLDGLVIVQTMGMFPIAFLVLSGVLEAIDSTLEEAAMNMRANRWKVFTTVTLPLSIPGIASSWLLVFSNSMADFANPLI
LSGKYKVLSVEAYLEVTGMHRLQNGAALSILLLIPTLTAFLIQRYWVNRKTYVTVTGKPSARIIEIVNRPVKIFLTTMMG
LISAFLIGLYSTIVAGCFVKNWGIDYSFTLENITEALSRARDALIDTTTLAAIATPIAGILAMIVAMIIVRKKFPGKKLL
QMFVLMPFAIPGTLVGISYIIAFNRPPLLLVGTGAIIVINYVIRELPVGVESGVATLKQIDPAIEEAAQSLGADSPTVFR
TIVLPLIRPAFISSLSYTFVRSMTAVSAVIFLISAKWYHITILIYNFSENLRFGLASVLATTLIIIILAVFGLMRLLVKK
SSYMEKTIISG

Sequences:

>Translated_731_residues
MKAKILKLIVTVGLFAVLIFWVFNSIEREFVDAAKERILEISNLISSSIPEDDIQSWLEEIDANYPDIQAIYIKGLEEYG
EIPEYFYQNPESADLFAKLKTMDFFDYGIESTVYEEIYFHENILKLGNNQYFVTFVPVLEPEYGMVTGSLVLLHNASKIL
GTIRTIWGFALLLIGVVFAVSFITSFMRDPTLGFTILIVFIIVGTFIAYPLYEAFKLTIFQNGEFSLDVWKKVLTTRNYS
RALWGSIKLGMLTATTSTLVGFLFAFSLTRMKLKGKKFFATMATLPVISPPFSLTLSIILLFGNNGLITRRLLGLTSFDI
YGLDGLVIVQTMGMFPIAFLVLSGVLEAIDSTLEEAAMNMRANRWKVFTTVTLPLSIPGIASSWLLVFSNSMADFANPLI
LSGKYKVLSVEAYLEVTGMHRLQNGAALSILLLIPTLTAFLIQRYWVNRKTYVTVTGKPSARIIEIVNRPVKIFLTTMMG
LISAFLIGLYSTIVAGCFVKNWGIDYSFTLENITEALSRARDALIDTTTLAAIATPIAGILAMIVAMIIVRKKFPGKKLL
QMFVLMPFAIPGTLVGISYIIAFNRPPLLLVGTGAIIVINYVIRELPVGVESGVATLKQIDPAIEEAAQSLGADSPTVFR
TIVLPLIRPAFISSLSYTFVRSMTAVSAVIFLISAKWYHITILIYNFSENLRFGLASVLATTLIIIILAVFGLMRLLVKK
SSYMEKTIISG
>Mature_731_residues
MKAKILKLIVTVGLFAVLIFWVFNSIEREFVDAAKERILEISNLISSSIPEDDIQSWLEEIDANYPDIQAIYIKGLEEYG
EIPEYFYQNPESADLFAKLKTMDFFDYGIESTVYEEIYFHENILKLGNNQYFVTFVPVLEPEYGMVTGSLVLLHNASKIL
GTIRTIWGFALLLIGVVFAVSFITSFMRDPTLGFTILIVFIIVGTFIAYPLYEAFKLTIFQNGEFSLDVWKKVLTTRNYS
RALWGSIKLGMLTATTSTLVGFLFAFSLTRMKLKGKKFFATMATLPVISPPFSLTLSIILLFGNNGLITRRLLGLTSFDI
YGLDGLVIVQTMGMFPIAFLVLSGVLEAIDSTLEEAAMNMRANRWKVFTTVTLPLSIPGIASSWLLVFSNSMADFANPLI
LSGKYKVLSVEAYLEVTGMHRLQNGAALSILLLIPTLTAFLIQRYWVNRKTYVTVTGKPSARIIEIVNRPVKIFLTTMMG
LISAFLIGLYSTIVAGCFVKNWGIDYSFTLENITEALSRARDALIDTTTLAAIATPIAGILAMIVAMIIVRKKFPGKKLL
QMFVLMPFAIPGTLVGISYIIAFNRPPLLLVGTGAIIVINYVIRELPVGVESGVATLKQIDPAIEEAAQSLGADSPTVFR
TIVLPLIRPAFISSLSYTFVRSMTAVSAVIFLISAKWYHITILIYNFSENLRFGLASVLATTLIIIILAVFGLMRLLVKK
SSYMEKTIISG

Specific function: Part of the ABC transporter complex fbpABC (TC 3.A.1.10.1) involved in Fe(3+) ions import. Probably responsible for the translocation of the substrate across the membrane [H]

COG id: COG1178

COG function: function code P; ABC-type Fe3+ transport system, permease component

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein (Probable) [H]

Metaboloic importance: Non Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 2 ABC transmembrane type-1 domains [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1788764, Length=186, Percent_Identity=26.3440860215054, Blast_Score=70, Evalue=4e-13,
Organism=Escherichia coli, GI1786980, Length=157, Percent_Identity=31.8471337579618, Blast_Score=67, Evalue=3e-12,
Organism=Escherichia coli, GI1787368, Length=204, Percent_Identity=26.4705882352941, Blast_Score=67, Evalue=4e-12,
Organism=Escherichia coli, GI1787570, Length=229, Percent_Identity=27.0742358078603, Blast_Score=65, Evalue=1e-11,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR000515 [H]

Pfam domain/function: PF00528 BPD_transp_1 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 81182; Mature: 81182

Theoretical pI: Translated: 9.27; Mature: 9.27

Prosite motif: PS50928 ABC_TM1

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.1 %Cys     (Translated Protein)
3.0 %Met     (Translated Protein)
3.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.1 %Cys     (Mature Protein)
3.0 %Met     (Mature Protein)
3.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKAKILKLIVTVGLFAVLIFWVFNSIEREFVDAAKERILEISNLISSSIPEDDIQSWLEE
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHH
IDANYPDIQAIYIKGLEEYGEIPEYFYQNPESADLFAKLKTMDFFDYGIESTVYEEIYFH
HCCCCCCEEHHHEECHHHHCCCCHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH
ENILKLGNNQYFVTFVPVLEPEYGMVTGSLVLLHNASKILGTIRTIWGFALLLIGVVFAV
HHHHHCCCCCEEEEEEEEECCCCCEEECCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SFITSFMRDPTLGFTILIVFIIVGTFIAYPLYEAFKLTIFQNGEFSLDVWKKVLTTRNYS
HHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCHHHHHHHHHCCCCH
RALWGSIKLGMLTATTSTLVGFLFAFSLTRMKLKGKKFFATMATLPVISPPFSLTLSIIL
HHHHCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHEEE
LFGNNGLITRRLLGLTSFDIYGLDGLVIVQTMGMFPIAFLVLSGVLEAIDSTLEEAAMNM
EECCCCHHHHHHHCCCCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
RANRWKVFTTVTLPLSIPGIASSWLLVFSNSMADFANPLILSGKYKVLSVEAYLEVTGMH
CCCCEEEEEEEEEEEECCCHHHHHHHHHCCCHHHHCCCEEECCCEEEEEEEHHHHHHHHH
RLQNGAALSILLLIPTLTAFLIQRYWVNRKTYVTVTGKPSARIIEIVNRPVKIFLTTMMG
HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH
LISAFLIGLYSTIVAGCFVKNWGIDYSFTLENITEALSRARDALIDTTTLAAIATPIAGI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LAMIVAMIIVRKKFPGKKLLQMFVLMPFAIPGTLVGISYIIAFNRPPLLLVGTGAIIVIN
HHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHEEECCCCEEEEECCHHHHHH
YVIRELPVGVESGVATLKQIDPAIEEAAQSLGADSPTVFRTIVLPLIRPAFISSLSYTFV
HHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RSMTAVSAVIFLISAKWYHITILIYNFSENLRFGLASVLATTLIIIILAVFGLMRLLVKK
HHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SSYMEKTIISG
HHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MKAKILKLIVTVGLFAVLIFWVFNSIEREFVDAAKERILEISNLISSSIPEDDIQSWLEE
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHH
IDANYPDIQAIYIKGLEEYGEIPEYFYQNPESADLFAKLKTMDFFDYGIESTVYEEIYFH
HCCCCCCEEHHHEECHHHHCCCCHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH
ENILKLGNNQYFVTFVPVLEPEYGMVTGSLVLLHNASKILGTIRTIWGFALLLIGVVFAV
HHHHHCCCCCEEEEEEEEECCCCCEEECCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SFITSFMRDPTLGFTILIVFIIVGTFIAYPLYEAFKLTIFQNGEFSLDVWKKVLTTRNYS
HHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCHHHHHHHHHCCCCH
RALWGSIKLGMLTATTSTLVGFLFAFSLTRMKLKGKKFFATMATLPVISPPFSLTLSIIL
HHHHCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHEEE
LFGNNGLITRRLLGLTSFDIYGLDGLVIVQTMGMFPIAFLVLSGVLEAIDSTLEEAAMNM
EECCCCHHHHHHHCCCCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
RANRWKVFTTVTLPLSIPGIASSWLLVFSNSMADFANPLILSGKYKVLSVEAYLEVTGMH
CCCCEEEEEEEEEEEECCCHHHHHHHHHCCCHHHHCCCEEECCCEEEEEEEHHHHHHHHH
RLQNGAALSILLLIPTLTAFLIQRYWVNRKTYVTVTGKPSARIIEIVNRPVKIFLTTMMG
HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH
LISAFLIGLYSTIVAGCFVKNWGIDYSFTLENITEALSRARDALIDTTTLAAIATPIAGI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LAMIVAMIIVRKKFPGKKLLQMFVLMPFAIPGTLVGISYIIAFNRPPLLLVGTGAIIVIN
HHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHEEECCCCEEEEECCHHHHHH
YVIRELPVGVESGVATLKQIDPAIEEAAQSLGADSPTVFRTIVLPLIRPAFISSLSYTFV
HHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RSMTAVSAVIFLISAKWYHITILIYNFSENLRFGLASVLATTLIIIILAVFGLMRLLVKK
HHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SSYMEKTIISG
HHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8807793 [H]