| Definition | Edwardsiella ictaluri 93-146 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_012779 |
| Length | 3,812,315 |
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The map label for this gene is 238919935
Identifier: 238919935
GI number: 238919935
Start: 1962099
End: 1964957
Strand: Reverse
Name: 238919935
Synonym: NT01EI_2039
Alternate gene names: NA
Gene position: 1964957-1962099 (Counterclockwise)
Preceding gene: 238919944
Following gene: 238919934
Centisome position: 51.54
GC content: 41.24
Gene sequence:
>2859_bases ATGACAGATAGCGTACAGACTGAAACAACCGAGGGAAAAATCATCATCAACTTGTTTGCTCCCAATCTTCCCGGAAGTAC CAAAGAAGATGATCTCATTCAAAAATCTCTGCGTGATCAGTTGGTCGAGACTATCCGAAACTCGGTTACCCTTCCTGACA CCGATAAGTCTGCTGGGCTAACACGGTTTATTGATGAGTCCGGTCGTAATGTATTTTTTGTGGATGGTACTCGCGGTGCG GGTAAAACCACTTTTATCAATAGCGTGGTCAAATCTCTAAACAGTGACCAAGGTGATGTAAAAGTCAGCATCAAGTGTTT GCCGACCATCGACCCTACCAAGTTGCCGCGTCATGAACCAATTTTGGTCACTGTGACTGCCCGTCTGAATAAAATGGTGT CCGACAAGTTAAAAGGATGCTGGGCGTCGAATGACTATAAAAAACAAAAAGAACAATGGCAGAATCACCTTGCGCAGCTC CAGCGTGGTTTACATCTGCTCACAGACAAGGAATATAAGCCGGAATATTTCAGTGATGCTTTGAAGCTGGATACTCAGCT TGATTACTCCATTGGTGGCCAGGATTTGTCAGAAATCTTTGAGGAGCTGGTTAAACGTGCGTGTGAAATTCTCGGCTGCA AGGCCATTTTGATCACCTTTGATGATATTGATACTCAGTTTGACGCTGGTTGGGATGTGCTTGAATCTATTCGTAAATTC TTTAACAGCGGGAAGTTGGTGGTGGTGGCTACAGGTGACTTGCGCCTATACTCCCAATTGATTCGCGGTAAACAATACGA AAATTACAGCAAAACTTTGCTCGATCAGGAAAAAGAGAGCGCCCGCTTAGCAGAGCGAGGCTATATGGTTGAACACCTTG AACAGCAATATTTATTAAAACTTTTTCCGGTACAAAAGCGTATTCAACTGAAAACCATGTTGCAACTGGTCGGCGAAAAG GGAAAAGTCGGTAAAGAGAAGATCAAGGTTAAGACCGAGCCTGGCATGCAGGATATTGATGCCATAGATGTTCGGCAAGC GATTGGCGATGCTGTTAGGGAAGGCCTTAATTTGAGAGAGGGCTCTGATGCTGACATGTATGTGAATGAACTGCTGAAGC AGCCAGTGCGGTTGTTGATGCAGGTGCTTCAGGATTTTTATACTAAAAAATATCATGCTACATCGGTAAAGCTTGATAGT AAAAAAAGAAGAAATGAAAGGCCTGATGAGTTATCAGTTCCGAATTTACTTAGAAATGCCTTATATGGTTCGATGCTAAG CAGCATTTATCGTGCGGGGTTAAATTATGAACAGCATCGGTTTGGTATGGATTCACTCTGTAAGGACATTTTTACCTATG TAAAGCAGGATCGTGATTTTAATACCGGATTTTATTTGCGGCCTCAGTCTGAAAGTGAAGCATTAAGAAATTGCTCTATT TACTTAGCGTCTCAGGTAAGTGAAAACTGTCAGGGCAGTCTGTCAAAGTTCCTACAGATGCTTTTGGTTGGTTGTGGTTC TGTCAGCATATTCAACCAATTTGTAACCGAGTTAGCACAGGCTGAAAATGATAGAGAAAAATTCGAACAGCTTGTTAGTG AATATGTATCTTATATGTCTGTTGGCAGAATTGAAAGCGCCTCACATTGGGCTAATCGATGTTGTGCGGTGGTTGCAAAC AACCCTAATGATGAAAATGTTGGCGTTTTTCTTGGTATGGTGCAGTTAAATCGTAAATCACGCCAAAAGATGCCAGAGGG TTACAAAAAATTTAACATTAATACTGAGAATGGTTTGGCAAAAGCCGCAATGGCTGCTTCTTTGAGTACGGTAGCTTCAA ATAACCTTATGGATTTCAGTAGTGTTTTTAATCTGATTGGTGCTATTGCAGATATCTCTGCATGTCGTTGTGAAAGACCT GCCATTACTAATGCTTTTAATAAAGTTGTAGCTCAGACAACATGTATTGTTCCCCCATGGAGCGAGGCTGCTGCTCGTGC AGAAATGAAAGGCTCAAGTAAAAGGGCGGATAAAGATGCTGCTGTTTTGGATATTGACCTTGATCCCATGGATGATGACG TAACTGCTGATAGTCAACAGGATGACCATCAGCAGGATGGCACAACGGAATTTTCTGATGCCATTACAAAAGTTGAGCAA TGGCTTAATAAAGTAAAAGAAATTGAGATTGAAATTCGTCCGTCGGCACTTTTGATTGGTAAAGTATGGACTCGGTTCTA TTTTAACCTTAATAATGTGGCTGATCAGCATAAAACCAGGCTCTATAAAGATGCAGCGCATGGACTAATGGCCAGTCAAT CAAATGCTGCAAAAATTATGCGTTTTAATGTTTTGGCTTTTCTTCATGCGGTATTGGTTGAAGAGAGCTTATATCATTCG GTTAGTGATAGGGAATATATCGGTGAGGGGTTAAGACTAAACCCAGTTACTTCGGTTGATGAGTTTGAGAAAAAGATAAA AGTAATTAGTGAAGAATTGACAGCGGATAAGAAAACATGGAGCGATACCCACCCATTGTTTTTCTTATTAATTAGCTGTC CAATTCTACATCCGTTCATTTTTCCTGTTGGAGGGGTTAATTGTTCAGCCAAAGCACTGAGCAAGGAAGCAAGTTTCAAT GAACTGATTGATAAAATTGTTGGCGGAAAATTACTTTCTGATAAAGAATGGGACTGTTTTTCTAAAAATGGTGATCGAGA AATAAACATTAAACAACAGGTGTCTCAAAACACTATAACATCGCTGAACTCCTCCACAATCGTCGGAGCGTCATACGATA AGGTTACGCCAGCTAGGAAAACCAAGTCGCCTTCATTAAGTAACGGCGAAGAAAAATGA
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Downstream 100 bases:
>100_bases TAATGATCTTCGTATAAGGATTGGGTATGGAAAGGTTTCTTCTTAACTCAACAGTACTGTTGCATAGGCTGAGCACAGTC TCTTTGGATGAGGTATCACT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 952; Mature: 951
Protein sequence:
>952_residues MTDSVQTETTEGKIIINLFAPNLPGSTKEDDLIQKSLRDQLVETIRNSVTLPDTDKSAGLTRFIDESGRNVFFVDGTRGA GKTTFINSVVKSLNSDQGDVKVSIKCLPTIDPTKLPRHEPILVTVTARLNKMVSDKLKGCWASNDYKKQKEQWQNHLAQL QRGLHLLTDKEYKPEYFSDALKLDTQLDYSIGGQDLSEIFEELVKRACEILGCKAILITFDDIDTQFDAGWDVLESIRKF FNSGKLVVVATGDLRLYSQLIRGKQYENYSKTLLDQEKESARLAERGYMVEHLEQQYLLKLFPVQKRIQLKTMLQLVGEK GKVGKEKIKVKTEPGMQDIDAIDVRQAIGDAVREGLNLREGSDADMYVNELLKQPVRLLMQVLQDFYTKKYHATSVKLDS KKRRNERPDELSVPNLLRNALYGSMLSSIYRAGLNYEQHRFGMDSLCKDIFTYVKQDRDFNTGFYLRPQSESEALRNCSI YLASQVSENCQGSLSKFLQMLLVGCGSVSIFNQFVTELAQAENDREKFEQLVSEYVSYMSVGRIESASHWANRCCAVVAN NPNDENVGVFLGMVQLNRKSRQKMPEGYKKFNINTENGLAKAAMAASLSTVASNNLMDFSSVFNLIGAIADISACRCERP AITNAFNKVVAQTTCIVPPWSEAAARAEMKGSSKRADKDAAVLDIDLDPMDDDVTADSQQDDHQQDGTTEFSDAITKVEQ WLNKVKEIEIEIRPSALLIGKVWTRFYFNLNNVADQHKTRLYKDAAHGLMASQSNAAKIMRFNVLAFLHAVLVEESLYHS VSDREYIGEGLRLNPVTSVDEFEKKIKVISEELTADKKTWSDTHPLFFLLISCPILHPFIFPVGGVNCSAKALSKEASFN ELIDKIVGGKLLSDKEWDCFSKNGDREINIKQQVSQNTITSLNSSTIVGASYDKVTPARKTKSPSLSNGEEK
Sequences:
>Translated_952_residues MTDSVQTETTEGKIIINLFAPNLPGSTKEDDLIQKSLRDQLVETIRNSVTLPDTDKSAGLTRFIDESGRNVFFVDGTRGA GKTTFINSVVKSLNSDQGDVKVSIKCLPTIDPTKLPRHEPILVTVTARLNKMVSDKLKGCWASNDYKKQKEQWQNHLAQL QRGLHLLTDKEYKPEYFSDALKLDTQLDYSIGGQDLSEIFEELVKRACEILGCKAILITFDDIDTQFDAGWDVLESIRKF FNSGKLVVVATGDLRLYSQLIRGKQYENYSKTLLDQEKESARLAERGYMVEHLEQQYLLKLFPVQKRIQLKTMLQLVGEK GKVGKEKIKVKTEPGMQDIDAIDVRQAIGDAVREGLNLREGSDADMYVNELLKQPVRLLMQVLQDFYTKKYHATSVKLDS KKRRNERPDELSVPNLLRNALYGSMLSSIYRAGLNYEQHRFGMDSLCKDIFTYVKQDRDFNTGFYLRPQSESEALRNCSI YLASQVSENCQGSLSKFLQMLLVGCGSVSIFNQFVTELAQAENDREKFEQLVSEYVSYMSVGRIESASHWANRCCAVVAN NPNDENVGVFLGMVQLNRKSRQKMPEGYKKFNINTENGLAKAAMAASLSTVASNNLMDFSSVFNLIGAIADISACRCERP AITNAFNKVVAQTTCIVPPWSEAAARAEMKGSSKRADKDAAVLDIDLDPMDDDVTADSQQDDHQQDGTTEFSDAITKVEQ WLNKVKEIEIEIRPSALLIGKVWTRFYFNLNNVADQHKTRLYKDAAHGLMASQSNAAKIMRFNVLAFLHAVLVEESLYHS VSDREYIGEGLRLNPVTSVDEFEKKIKVISEELTADKKTWSDTHPLFFLLISCPILHPFIFPVGGVNCSAKALSKEASFN ELIDKIVGGKLLSDKEWDCFSKNGDREINIKQQVSQNTITSLNSSTIVGASYDKVTPARKTKSPSLSNGEEK >Mature_951_residues TDSVQTETTEGKIIINLFAPNLPGSTKEDDLIQKSLRDQLVETIRNSVTLPDTDKSAGLTRFIDESGRNVFFVDGTRGAG KTTFINSVVKSLNSDQGDVKVSIKCLPTIDPTKLPRHEPILVTVTARLNKMVSDKLKGCWASNDYKKQKEQWQNHLAQLQ RGLHLLTDKEYKPEYFSDALKLDTQLDYSIGGQDLSEIFEELVKRACEILGCKAILITFDDIDTQFDAGWDVLESIRKFF NSGKLVVVATGDLRLYSQLIRGKQYENYSKTLLDQEKESARLAERGYMVEHLEQQYLLKLFPVQKRIQLKTMLQLVGEKG KVGKEKIKVKTEPGMQDIDAIDVRQAIGDAVREGLNLREGSDADMYVNELLKQPVRLLMQVLQDFYTKKYHATSVKLDSK KRRNERPDELSVPNLLRNALYGSMLSSIYRAGLNYEQHRFGMDSLCKDIFTYVKQDRDFNTGFYLRPQSESEALRNCSIY LASQVSENCQGSLSKFLQMLLVGCGSVSIFNQFVTELAQAENDREKFEQLVSEYVSYMSVGRIESASHWANRCCAVVANN PNDENVGVFLGMVQLNRKSRQKMPEGYKKFNINTENGLAKAAMAASLSTVASNNLMDFSSVFNLIGAIADISACRCERPA ITNAFNKVVAQTTCIVPPWSEAAARAEMKGSSKRADKDAAVLDIDLDPMDDDVTADSQQDDHQQDGTTEFSDAITKVEQW LNKVKEIEIEIRPSALLIGKVWTRFYFNLNNVADQHKTRLYKDAAHGLMASQSNAAKIMRFNVLAFLHAVLVEESLYHSV SDREYIGEGLRLNPVTSVDEFEKKIKVISEELTADKKTWSDTHPLFFLLISCPILHPFIFPVGGVNCSAKALSKEASFNE LIDKIVGGKLLSDKEWDCFSKNGDREINIKQQVSQNTITSLNSSTIVGASYDKVTPARKTKSPSLSNGEEK
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 106948; Mature: 106817
Theoretical pI: Translated: 6.42; Mature: 6.42
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.7 %Cys (Translated Protein) 2.0 %Met (Translated Protein) 3.7 %Cys+Met (Translated Protein) 1.7 %Cys (Mature Protein) 1.9 %Met (Mature Protein) 3.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MTDSVQTETTEGKIIINLFAPNLPGSTKEDDLIQKSLRDQLVETIRNSVTLPDTDKSAGL CCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCH TRFIDESGRNVFFVDGTRGAGKTTFINSVVKSLNSDQGDVKVSIKCLPTIDPTKLPRHEP HHHHHCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCCC ILVTVTARLNKMVSDKLKGCWASNDYKKQKEQWQNHLAQLQRGLHLLTDKEYKPEYFSDA EEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHCCCCCCCHHHHHH LKLDTQLDYSIGGQDLSEIFEELVKRACEILGCKAILITFDDIDTQFDAGWDVLESIRKF HHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHH FNSGKLVVVATGDLRLYSQLIRGKQYENYSKTLLDQEKESARLAERGYMVEHLEQQYLLK HCCCCEEEEECCCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHH LFPVQKRIQLKTMLQLVGEKGKVGKEKIKVKTEPGMQDIDAIDVRQAIGDAVREGLNLRE HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC GSDADMYVNELLKQPVRLLMQVLQDFYTKKYHATSVKLDSKKRRNERPDELSVPNLLRNA CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCEEEECCHHHCCCCCCCCCHHHHHHHH LYGSMLSSIYRAGLNYEQHRFGMDSLCKDIFTYVKQDRDFNTGFYLRPQSESEALRNCSI HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHH YLASQVSENCQGSLSKFLQMLLVGCGSVSIFNQFVTELAQAENDREKFEQLVSEYVSYMS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH VGRIESASHWANRCCAVVANNPNDENVGVFLGMVQLNRKSRQKMPEGYKKFNINTENGLA HCCCCHHHHHHHCEEEEEECCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHCCCCCHHEECCCCCCCHH KAAMAASLSTVASNNLMDFSSVFNLIGAIADISACRCERPAITNAFNKVVAQTTCIVPPW HHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHEECCCCC SEAAARAEMKGSSKRADKDAAVLDIDLDPMDDDVTADSQQDDHQQDGTTEFSDAITKVEQ HHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH WLNKVKEIEIEIRPSALLIGKVWTRFYFNLNNVADQHKTRLYKDAAHGLMASQSNAAKIM HHHHHHHEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHH RFNVLAFLHAVLVEESLYHSVSDREYIGEGLRLNPVTSVDEFEKKIKVISEELTADKKTW HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC SDTHPLFFLLISCPILHPFIFPVGGVNCSAKALSKEASFNELIDKIVGGKLLSDKEWDCF CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCC SKNGDREINIKQQVSQNTITSLNSSTIVGASYDKVTPARKTKSPSLSNGEEK CCCCCCEECHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC >Mature Secondary Structure TDSVQTETTEGKIIINLFAPNLPGSTKEDDLIQKSLRDQLVETIRNSVTLPDTDKSAGL CCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCH TRFIDESGRNVFFVDGTRGAGKTTFINSVVKSLNSDQGDVKVSIKCLPTIDPTKLPRHEP HHHHHCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCCC ILVTVTARLNKMVSDKLKGCWASNDYKKQKEQWQNHLAQLQRGLHLLTDKEYKPEYFSDA EEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHCCCCCCCHHHHHH LKLDTQLDYSIGGQDLSEIFEELVKRACEILGCKAILITFDDIDTQFDAGWDVLESIRKF HHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHH FNSGKLVVVATGDLRLYSQLIRGKQYENYSKTLLDQEKESARLAERGYMVEHLEQQYLLK HCCCCEEEEECCCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHH LFPVQKRIQLKTMLQLVGEKGKVGKEKIKVKTEPGMQDIDAIDVRQAIGDAVREGLNLRE HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC GSDADMYVNELLKQPVRLLMQVLQDFYTKKYHATSVKLDSKKRRNERPDELSVPNLLRNA CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCEEEECCHHHCCCCCCCCCHHHHHHHH LYGSMLSSIYRAGLNYEQHRFGMDSLCKDIFTYVKQDRDFNTGFYLRPQSESEALRNCSI HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHH YLASQVSENCQGSLSKFLQMLLVGCGSVSIFNQFVTELAQAENDREKFEQLVSEYVSYMS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH VGRIESASHWANRCCAVVANNPNDENVGVFLGMVQLNRKSRQKMPEGYKKFNINTENGLA HCCCCHHHHHHHCEEEEEECCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHCCCCCHHEECCCCCCCHH KAAMAASLSTVASNNLMDFSSVFNLIGAIADISACRCERPAITNAFNKVVAQTTCIVPPW HHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHEECCCCC SEAAARAEMKGSSKRADKDAAVLDIDLDPMDDDVTADSQQDDHQQDGTTEFSDAITKVEQ HHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH WLNKVKEIEIEIRPSALLIGKVWTRFYFNLNNVADQHKTRLYKDAAHGLMASQSNAAKIM HHHHHHHEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHH RFNVLAFLHAVLVEESLYHSVSDREYIGEGLRLNPVTSVDEFEKKIKVISEELTADKKTW HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC SDTHPLFFLLISCPILHPFIFPVGGVNCSAKALSKEASFNELIDKIVGGKLLSDKEWDCF CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCC SKNGDREINIKQQVSQNTITSLNSSTIVGASYDKVTPARKTKSPSLSNGEEK CCCCCCEECHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
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Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA