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Definition Edwardsiella ictaluri 93-146 chromosome, complete genome.
Accession NC_012779
Length 3,812,315

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The map label for this gene is 238919935

Identifier: 238919935

GI number: 238919935

Start: 1962099

End: 1964957

Strand: Reverse

Name: 238919935

Synonym: NT01EI_2039

Alternate gene names: NA

Gene position: 1964957-1962099 (Counterclockwise)

Preceding gene: 238919944

Following gene: 238919934

Centisome position: 51.54

GC content: 41.24

Gene sequence:

>2859_bases
ATGACAGATAGCGTACAGACTGAAACAACCGAGGGAAAAATCATCATCAACTTGTTTGCTCCCAATCTTCCCGGAAGTAC
CAAAGAAGATGATCTCATTCAAAAATCTCTGCGTGATCAGTTGGTCGAGACTATCCGAAACTCGGTTACCCTTCCTGACA
CCGATAAGTCTGCTGGGCTAACACGGTTTATTGATGAGTCCGGTCGTAATGTATTTTTTGTGGATGGTACTCGCGGTGCG
GGTAAAACCACTTTTATCAATAGCGTGGTCAAATCTCTAAACAGTGACCAAGGTGATGTAAAAGTCAGCATCAAGTGTTT
GCCGACCATCGACCCTACCAAGTTGCCGCGTCATGAACCAATTTTGGTCACTGTGACTGCCCGTCTGAATAAAATGGTGT
CCGACAAGTTAAAAGGATGCTGGGCGTCGAATGACTATAAAAAACAAAAAGAACAATGGCAGAATCACCTTGCGCAGCTC
CAGCGTGGTTTACATCTGCTCACAGACAAGGAATATAAGCCGGAATATTTCAGTGATGCTTTGAAGCTGGATACTCAGCT
TGATTACTCCATTGGTGGCCAGGATTTGTCAGAAATCTTTGAGGAGCTGGTTAAACGTGCGTGTGAAATTCTCGGCTGCA
AGGCCATTTTGATCACCTTTGATGATATTGATACTCAGTTTGACGCTGGTTGGGATGTGCTTGAATCTATTCGTAAATTC
TTTAACAGCGGGAAGTTGGTGGTGGTGGCTACAGGTGACTTGCGCCTATACTCCCAATTGATTCGCGGTAAACAATACGA
AAATTACAGCAAAACTTTGCTCGATCAGGAAAAAGAGAGCGCCCGCTTAGCAGAGCGAGGCTATATGGTTGAACACCTTG
AACAGCAATATTTATTAAAACTTTTTCCGGTACAAAAGCGTATTCAACTGAAAACCATGTTGCAACTGGTCGGCGAAAAG
GGAAAAGTCGGTAAAGAGAAGATCAAGGTTAAGACCGAGCCTGGCATGCAGGATATTGATGCCATAGATGTTCGGCAAGC
GATTGGCGATGCTGTTAGGGAAGGCCTTAATTTGAGAGAGGGCTCTGATGCTGACATGTATGTGAATGAACTGCTGAAGC
AGCCAGTGCGGTTGTTGATGCAGGTGCTTCAGGATTTTTATACTAAAAAATATCATGCTACATCGGTAAAGCTTGATAGT
AAAAAAAGAAGAAATGAAAGGCCTGATGAGTTATCAGTTCCGAATTTACTTAGAAATGCCTTATATGGTTCGATGCTAAG
CAGCATTTATCGTGCGGGGTTAAATTATGAACAGCATCGGTTTGGTATGGATTCACTCTGTAAGGACATTTTTACCTATG
TAAAGCAGGATCGTGATTTTAATACCGGATTTTATTTGCGGCCTCAGTCTGAAAGTGAAGCATTAAGAAATTGCTCTATT
TACTTAGCGTCTCAGGTAAGTGAAAACTGTCAGGGCAGTCTGTCAAAGTTCCTACAGATGCTTTTGGTTGGTTGTGGTTC
TGTCAGCATATTCAACCAATTTGTAACCGAGTTAGCACAGGCTGAAAATGATAGAGAAAAATTCGAACAGCTTGTTAGTG
AATATGTATCTTATATGTCTGTTGGCAGAATTGAAAGCGCCTCACATTGGGCTAATCGATGTTGTGCGGTGGTTGCAAAC
AACCCTAATGATGAAAATGTTGGCGTTTTTCTTGGTATGGTGCAGTTAAATCGTAAATCACGCCAAAAGATGCCAGAGGG
TTACAAAAAATTTAACATTAATACTGAGAATGGTTTGGCAAAAGCCGCAATGGCTGCTTCTTTGAGTACGGTAGCTTCAA
ATAACCTTATGGATTTCAGTAGTGTTTTTAATCTGATTGGTGCTATTGCAGATATCTCTGCATGTCGTTGTGAAAGACCT
GCCATTACTAATGCTTTTAATAAAGTTGTAGCTCAGACAACATGTATTGTTCCCCCATGGAGCGAGGCTGCTGCTCGTGC
AGAAATGAAAGGCTCAAGTAAAAGGGCGGATAAAGATGCTGCTGTTTTGGATATTGACCTTGATCCCATGGATGATGACG
TAACTGCTGATAGTCAACAGGATGACCATCAGCAGGATGGCACAACGGAATTTTCTGATGCCATTACAAAAGTTGAGCAA
TGGCTTAATAAAGTAAAAGAAATTGAGATTGAAATTCGTCCGTCGGCACTTTTGATTGGTAAAGTATGGACTCGGTTCTA
TTTTAACCTTAATAATGTGGCTGATCAGCATAAAACCAGGCTCTATAAAGATGCAGCGCATGGACTAATGGCCAGTCAAT
CAAATGCTGCAAAAATTATGCGTTTTAATGTTTTGGCTTTTCTTCATGCGGTATTGGTTGAAGAGAGCTTATATCATTCG
GTTAGTGATAGGGAATATATCGGTGAGGGGTTAAGACTAAACCCAGTTACTTCGGTTGATGAGTTTGAGAAAAAGATAAA
AGTAATTAGTGAAGAATTGACAGCGGATAAGAAAACATGGAGCGATACCCACCCATTGTTTTTCTTATTAATTAGCTGTC
CAATTCTACATCCGTTCATTTTTCCTGTTGGAGGGGTTAATTGTTCAGCCAAAGCACTGAGCAAGGAAGCAAGTTTCAAT
GAACTGATTGATAAAATTGTTGGCGGAAAATTACTTTCTGATAAAGAATGGGACTGTTTTTCTAAAAATGGTGATCGAGA
AATAAACATTAAACAACAGGTGTCTCAAAACACTATAACATCGCTGAACTCCTCCACAATCGTCGGAGCGTCATACGATA
AGGTTACGCCAGCTAGGAAAACCAAGTCGCCTTCATTAAGTAACGGCGAAGAAAAATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAGGGCACTGAGCATTGCATGAATCAACTCAGTGGAAATTTAAAGCACCAGTCTGATACTAAGGCTGGCAAAAAATCAAA
ATAAATGGATTGATACGGAC

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAATGATCTTCGTATAAGGATTGGGTATGGAAAGGTTTCTTCTTAACTCAACAGTACTGTTGCATAGGCTGAGCACAGTC
TCTTTGGATGAGGTATCACT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 952; Mature: 951

Protein sequence:

>952_residues
MTDSVQTETTEGKIIINLFAPNLPGSTKEDDLIQKSLRDQLVETIRNSVTLPDTDKSAGLTRFIDESGRNVFFVDGTRGA
GKTTFINSVVKSLNSDQGDVKVSIKCLPTIDPTKLPRHEPILVTVTARLNKMVSDKLKGCWASNDYKKQKEQWQNHLAQL
QRGLHLLTDKEYKPEYFSDALKLDTQLDYSIGGQDLSEIFEELVKRACEILGCKAILITFDDIDTQFDAGWDVLESIRKF
FNSGKLVVVATGDLRLYSQLIRGKQYENYSKTLLDQEKESARLAERGYMVEHLEQQYLLKLFPVQKRIQLKTMLQLVGEK
GKVGKEKIKVKTEPGMQDIDAIDVRQAIGDAVREGLNLREGSDADMYVNELLKQPVRLLMQVLQDFYTKKYHATSVKLDS
KKRRNERPDELSVPNLLRNALYGSMLSSIYRAGLNYEQHRFGMDSLCKDIFTYVKQDRDFNTGFYLRPQSESEALRNCSI
YLASQVSENCQGSLSKFLQMLLVGCGSVSIFNQFVTELAQAENDREKFEQLVSEYVSYMSVGRIESASHWANRCCAVVAN
NPNDENVGVFLGMVQLNRKSRQKMPEGYKKFNINTENGLAKAAMAASLSTVASNNLMDFSSVFNLIGAIADISACRCERP
AITNAFNKVVAQTTCIVPPWSEAAARAEMKGSSKRADKDAAVLDIDLDPMDDDVTADSQQDDHQQDGTTEFSDAITKVEQ
WLNKVKEIEIEIRPSALLIGKVWTRFYFNLNNVADQHKTRLYKDAAHGLMASQSNAAKIMRFNVLAFLHAVLVEESLYHS
VSDREYIGEGLRLNPVTSVDEFEKKIKVISEELTADKKTWSDTHPLFFLLISCPILHPFIFPVGGVNCSAKALSKEASFN
ELIDKIVGGKLLSDKEWDCFSKNGDREINIKQQVSQNTITSLNSSTIVGASYDKVTPARKTKSPSLSNGEEK

Sequences:

>Translated_952_residues
MTDSVQTETTEGKIIINLFAPNLPGSTKEDDLIQKSLRDQLVETIRNSVTLPDTDKSAGLTRFIDESGRNVFFVDGTRGA
GKTTFINSVVKSLNSDQGDVKVSIKCLPTIDPTKLPRHEPILVTVTARLNKMVSDKLKGCWASNDYKKQKEQWQNHLAQL
QRGLHLLTDKEYKPEYFSDALKLDTQLDYSIGGQDLSEIFEELVKRACEILGCKAILITFDDIDTQFDAGWDVLESIRKF
FNSGKLVVVATGDLRLYSQLIRGKQYENYSKTLLDQEKESARLAERGYMVEHLEQQYLLKLFPVQKRIQLKTMLQLVGEK
GKVGKEKIKVKTEPGMQDIDAIDVRQAIGDAVREGLNLREGSDADMYVNELLKQPVRLLMQVLQDFYTKKYHATSVKLDS
KKRRNERPDELSVPNLLRNALYGSMLSSIYRAGLNYEQHRFGMDSLCKDIFTYVKQDRDFNTGFYLRPQSESEALRNCSI
YLASQVSENCQGSLSKFLQMLLVGCGSVSIFNQFVTELAQAENDREKFEQLVSEYVSYMSVGRIESASHWANRCCAVVAN
NPNDENVGVFLGMVQLNRKSRQKMPEGYKKFNINTENGLAKAAMAASLSTVASNNLMDFSSVFNLIGAIADISACRCERP
AITNAFNKVVAQTTCIVPPWSEAAARAEMKGSSKRADKDAAVLDIDLDPMDDDVTADSQQDDHQQDGTTEFSDAITKVEQ
WLNKVKEIEIEIRPSALLIGKVWTRFYFNLNNVADQHKTRLYKDAAHGLMASQSNAAKIMRFNVLAFLHAVLVEESLYHS
VSDREYIGEGLRLNPVTSVDEFEKKIKVISEELTADKKTWSDTHPLFFLLISCPILHPFIFPVGGVNCSAKALSKEASFN
ELIDKIVGGKLLSDKEWDCFSKNGDREINIKQQVSQNTITSLNSSTIVGASYDKVTPARKTKSPSLSNGEEK
>Mature_951_residues
TDSVQTETTEGKIIINLFAPNLPGSTKEDDLIQKSLRDQLVETIRNSVTLPDTDKSAGLTRFIDESGRNVFFVDGTRGAG
KTTFINSVVKSLNSDQGDVKVSIKCLPTIDPTKLPRHEPILVTVTARLNKMVSDKLKGCWASNDYKKQKEQWQNHLAQLQ
RGLHLLTDKEYKPEYFSDALKLDTQLDYSIGGQDLSEIFEELVKRACEILGCKAILITFDDIDTQFDAGWDVLESIRKFF
NSGKLVVVATGDLRLYSQLIRGKQYENYSKTLLDQEKESARLAERGYMVEHLEQQYLLKLFPVQKRIQLKTMLQLVGEKG
KVGKEKIKVKTEPGMQDIDAIDVRQAIGDAVREGLNLREGSDADMYVNELLKQPVRLLMQVLQDFYTKKYHATSVKLDSK
KRRNERPDELSVPNLLRNALYGSMLSSIYRAGLNYEQHRFGMDSLCKDIFTYVKQDRDFNTGFYLRPQSESEALRNCSIY
LASQVSENCQGSLSKFLQMLLVGCGSVSIFNQFVTELAQAENDREKFEQLVSEYVSYMSVGRIESASHWANRCCAVVANN
PNDENVGVFLGMVQLNRKSRQKMPEGYKKFNINTENGLAKAAMAASLSTVASNNLMDFSSVFNLIGAIADISACRCERPA
ITNAFNKVVAQTTCIVPPWSEAAARAEMKGSSKRADKDAAVLDIDLDPMDDDVTADSQQDDHQQDGTTEFSDAITKVEQW
LNKVKEIEIEIRPSALLIGKVWTRFYFNLNNVADQHKTRLYKDAAHGLMASQSNAAKIMRFNVLAFLHAVLVEESLYHSV
SDREYIGEGLRLNPVTSVDEFEKKIKVISEELTADKKTWSDTHPLFFLLISCPILHPFIFPVGGVNCSAKALSKEASFNE
LIDKIVGGKLLSDKEWDCFSKNGDREINIKQQVSQNTITSLNSSTIVGASYDKVTPARKTKSPSLSNGEEK

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 106948; Mature: 106817

Theoretical pI: Translated: 6.42; Mature: 6.42

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.7 %Cys     (Translated Protein)
2.0 %Met     (Translated Protein)
3.7 %Cys+Met (Translated Protein)
1.7 %Cys     (Mature Protein)
1.9 %Met     (Mature Protein)
3.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MTDSVQTETTEGKIIINLFAPNLPGSTKEDDLIQKSLRDQLVETIRNSVTLPDTDKSAGL
CCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCH
TRFIDESGRNVFFVDGTRGAGKTTFINSVVKSLNSDQGDVKVSIKCLPTIDPTKLPRHEP
HHHHHCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCCC
ILVTVTARLNKMVSDKLKGCWASNDYKKQKEQWQNHLAQLQRGLHLLTDKEYKPEYFSDA
EEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHCCCCCCCHHHHHH
LKLDTQLDYSIGGQDLSEIFEELVKRACEILGCKAILITFDDIDTQFDAGWDVLESIRKF
HHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHH
FNSGKLVVVATGDLRLYSQLIRGKQYENYSKTLLDQEKESARLAERGYMVEHLEQQYLLK
HCCCCEEEEECCCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHH
LFPVQKRIQLKTMLQLVGEKGKVGKEKIKVKTEPGMQDIDAIDVRQAIGDAVREGLNLRE
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
GSDADMYVNELLKQPVRLLMQVLQDFYTKKYHATSVKLDSKKRRNERPDELSVPNLLRNA
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCEEEECCHHHCCCCCCCCCHHHHHHHH
LYGSMLSSIYRAGLNYEQHRFGMDSLCKDIFTYVKQDRDFNTGFYLRPQSESEALRNCSI
HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHH
YLASQVSENCQGSLSKFLQMLLVGCGSVSIFNQFVTELAQAENDREKFEQLVSEYVSYMS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
VGRIESASHWANRCCAVVANNPNDENVGVFLGMVQLNRKSRQKMPEGYKKFNINTENGLA
HCCCCHHHHHHHCEEEEEECCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHCCCCCHHEECCCCCCCHH
KAAMAASLSTVASNNLMDFSSVFNLIGAIADISACRCERPAITNAFNKVVAQTTCIVPPW
HHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHEECCCCC
SEAAARAEMKGSSKRADKDAAVLDIDLDPMDDDVTADSQQDDHQQDGTTEFSDAITKVEQ
HHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
WLNKVKEIEIEIRPSALLIGKVWTRFYFNLNNVADQHKTRLYKDAAHGLMASQSNAAKIM
HHHHHHHEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHH
RFNVLAFLHAVLVEESLYHSVSDREYIGEGLRLNPVTSVDEFEKKIKVISEELTADKKTW
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
SDTHPLFFLLISCPILHPFIFPVGGVNCSAKALSKEASFNELIDKIVGGKLLSDKEWDCF
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCC
SKNGDREINIKQQVSQNTITSLNSSTIVGASYDKVTPARKTKSPSLSNGEEK
CCCCCCEECHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure 
TDSVQTETTEGKIIINLFAPNLPGSTKEDDLIQKSLRDQLVETIRNSVTLPDTDKSAGL
CCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCH
TRFIDESGRNVFFVDGTRGAGKTTFINSVVKSLNSDQGDVKVSIKCLPTIDPTKLPRHEP
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HCCCCEEEEECCCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHH
LFPVQKRIQLKTMLQLVGEKGKVGKEKIKVKTEPGMQDIDAIDVRQAIGDAVREGLNLRE
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CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCEEEECCHHHCCCCCCCCCHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHH
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VGRIESASHWANRCCAVVANNPNDENVGVFLGMVQLNRKSRQKMPEGYKKFNINTENGLA
HCCCCHHHHHHHCEEEEEECCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHCCCCCHHEECCCCCCCHH
KAAMAASLSTVASNNLMDFSSVFNLIGAIADISACRCERPAITNAFNKVVAQTTCIVPPW
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SEAAARAEMKGSSKRADKDAAVLDIDLDPMDDDVTADSQQDDHQQDGTTEFSDAITKVEQ
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RFNVLAFLHAVLVEESLYHSVSDREYIGEGLRLNPVTSVDEFEKKIKVISEELTADKKTW
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CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCC
SKNGDREINIKQQVSQNTITSLNSSTIVGASYDKVTPARKTKSPSLSNGEEK
CCCCCCEECHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA