| Definition | Eubacterium eligens ATCC 27750 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_012778 |
| Length | 2,144,190 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is 238917809
Identifier: 238917809
GI number: 238917809
Start: 1952490
End: 1954388
Strand: Reverse
Name: 238917809
Synonym: EUBELI_01890
Alternate gene names: NA
Gene position: 1954388-1952490 (Counterclockwise)
Preceding gene: 238917811
Following gene: 238917806
Centisome position: 91.15
GC content: 42.6
Gene sequence:
>1899_bases ATGGATATTAGATATATTAAGGCGAAGGAATTATCCGCAAGATGGGGCGTGACGCCGAGAAGAATTAACCAGTTGTGTAC AGAGGGAAAGCTGCCGGGAGCTTATAAGGAAGGCAAGTTCTGGATGATACCTGACGATGTGGACAGACCGGATTGTTTAA GGGAGAATAGGAATCTTTATGTCAGGGAAGACAGCGCTGTATACAACAGGAAGCGTCCCTGCCCGGTTGGAATAACATCT TATAAAGAAGTGTCGAATGAATGTTATTATGTAGACAAAACATTGCTTATTAGGGACATTATAGATAATCACAGTAAGGT GTATTTATTTACAAGACCGAGAAGATTCGGAAAGACACTTACTATGGACATGGTTCGCACATTTTTTGAAAAGACTGATA CGGATACATCAGTGTATTTTAAGAATAAGAAGATATGGCGAGAGGGCGCGCTGTATAAGGAGAAGCAGGGGCAGTACCCG GTGATTTTTCTTACATTTAAAGACGCCCACCAGTCAACATGGCAGGACATGTACGCAAGTCTCTGCTTTACATTAAGGAA TGAATTTTTGCGACATATTGAACTGACGACAAGCGCCAGATTAAGTGACTATGATAAGAAGTATCTTAAGTCAATACTTG ATGATGAGGCAACGATAATAGATTATCAGTTTGCACTGGGGAAGCTGTCGGCAATGCTTTCAAAGCATTATGGCAGGAAT GTAATCGTGATAATTGACGAGTACGATACGCCAATCCAGCAAGGACATATATTTGGATACTATGATGAAGTGATTGGCTT TATGAGAAATCTTTTGTCGGCTGTCTTAAAGGACAATCCAAGTCTGGAACTGGGGATTCTCACGGGAATTCTCCGCATAG CTAAGGAAAGCCTGTTCAGCGGGCTTAACAATCTTGTGGTTAATACAATTCTTGATGATGAATATTCGCAATATTTTGGA TTCACGGAAGAGGAAGTTTCTGCTATGGCGCAGTACTACGGCGTGTCTGACCGGCTGGGTGAGATTAAGGAATGGTATGA CGGCTATATGTTTGGCAGAACCGGAATATATAATCCGTGGTCGGTTATTAATTACTTCAATAACAAATGTGTTCCCAAAG CCTTCTGGTCAAGAACAAGTGGCAATGAGATAATCGGCGAGCTGTTTAATAGTGCTGATACCACATTTGCAGACAACTTA TTAAGATTGCTGCAGGGCAGTACTGTTCAGGCAATTGTTGACACAGATATCATATATCCTGAGATTAATGGAGACATTGA TACAATATACAGCTTCCTTCTGGTTGCCGGATATCTGCGTGTGTCAGAGCATATTGGCTCTCTGTACGACAATCCGATAT GCGCGCTGTCGATACCTAATTATGAGATAAAGAGCGTGTTCCAGAAGGAGATTATTGACAGATATAACGGCATATTTACA GGTGCGCTGCTAAGAAACTTTGCGGAATCAATCCGTACGGGAAATGCACATTTATTAACAGAAACCTTGCAGCAGTATCT TTTGCAGTCTGCAAGCGTGTTTGATACGGCACATGAGGATTTCTATCATGGGGTGGTATTTGGAATGCTTGCGGTATTGT CAGACAATTATTATATCTCGTCTAACAGGGAGTCAGGTGAGGGACGATTTGACATAGAGCTGCAACCGAAGAGCCGTGGC GGACACGGATATATCATAGAATTCAAAGCATGTAAGGAAGCTGAGCTTGAGAAGATGGCTGGCAGTGCAGTCAGACAGAT TCAGCAGAAAAGTTACACAGCCAATCTTGAAAAGCATGGCGTGTCTGGGATTGGTATGTTCGGAGTTGCATTCAGCGGTA AGAAAGTGAGTGTGGCGTATGAGGAGCATGATGTGAAGAAGCGCAAGTCACGCGAATAG
Upstream 100 bases:
>100_bases ATGTATATAAATGTTGTGAATTAAGTAAGAGGCGGTGTGGAATCTGTGTACATGACACGGATTTCAGTATGTGCAGTAAT GCACAGAAAAGAGGGGCTTT
Downstream 100 bases:
>100_bases AAGAATTGCAGAAAAAAGGACGGTAAGAAGTTAATTCTTATCGTCCTTTTTGTCACGGATTATTTATCCTTAATTGTATT ATACAGATTAACAATTTCGC
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 632; Mature: 632
Protein sequence:
>632_residues MDIRYIKAKELSARWGVTPRRINQLCTEGKLPGAYKEGKFWMIPDDVDRPDCLRENRNLYVREDSAVYNRKRPCPVGITS YKEVSNECYYVDKTLLIRDIIDNHSKVYLFTRPRRFGKTLTMDMVRTFFEKTDTDTSVYFKNKKIWREGALYKEKQGQYP VIFLTFKDAHQSTWQDMYASLCFTLRNEFLRHIELTTSARLSDYDKKYLKSILDDEATIIDYQFALGKLSAMLSKHYGRN VIVIIDEYDTPIQQGHIFGYYDEVIGFMRNLLSAVLKDNPSLELGILTGILRIAKESLFSGLNNLVVNTILDDEYSQYFG FTEEEVSAMAQYYGVSDRLGEIKEWYDGYMFGRTGIYNPWSVINYFNNKCVPKAFWSRTSGNEIIGELFNSADTTFADNL LRLLQGSTVQAIVDTDIIYPEINGDIDTIYSFLLVAGYLRVSEHIGSLYDNPICALSIPNYEIKSVFQKEIIDRYNGIFT GALLRNFAESIRTGNAHLLTETLQQYLLQSASVFDTAHEDFYHGVVFGMLAVLSDNYYISSNRESGEGRFDIELQPKSRG GHGYIIEFKACKEAELEKMAGSAVRQIQQKSYTANLEKHGVSGIGMFGVAFSGKKVSVAYEEHDVKKRKSRE
Sequences:
>Translated_632_residues MDIRYIKAKELSARWGVTPRRINQLCTEGKLPGAYKEGKFWMIPDDVDRPDCLRENRNLYVREDSAVYNRKRPCPVGITS YKEVSNECYYVDKTLLIRDIIDNHSKVYLFTRPRRFGKTLTMDMVRTFFEKTDTDTSVYFKNKKIWREGALYKEKQGQYP VIFLTFKDAHQSTWQDMYASLCFTLRNEFLRHIELTTSARLSDYDKKYLKSILDDEATIIDYQFALGKLSAMLSKHYGRN VIVIIDEYDTPIQQGHIFGYYDEVIGFMRNLLSAVLKDNPSLELGILTGILRIAKESLFSGLNNLVVNTILDDEYSQYFG FTEEEVSAMAQYYGVSDRLGEIKEWYDGYMFGRTGIYNPWSVINYFNNKCVPKAFWSRTSGNEIIGELFNSADTTFADNL LRLLQGSTVQAIVDTDIIYPEINGDIDTIYSFLLVAGYLRVSEHIGSLYDNPICALSIPNYEIKSVFQKEIIDRYNGIFT GALLRNFAESIRTGNAHLLTETLQQYLLQSASVFDTAHEDFYHGVVFGMLAVLSDNYYISSNRESGEGRFDIELQPKSRG GHGYIIEFKACKEAELEKMAGSAVRQIQQKSYTANLEKHGVSGIGMFGVAFSGKKVSVAYEEHDVKKRKSRE >Mature_632_residues MDIRYIKAKELSARWGVTPRRINQLCTEGKLPGAYKEGKFWMIPDDVDRPDCLRENRNLYVREDSAVYNRKRPCPVGITS YKEVSNECYYVDKTLLIRDIIDNHSKVYLFTRPRRFGKTLTMDMVRTFFEKTDTDTSVYFKNKKIWREGALYKEKQGQYP VIFLTFKDAHQSTWQDMYASLCFTLRNEFLRHIELTTSARLSDYDKKYLKSILDDEATIIDYQFALGKLSAMLSKHYGRN VIVIIDEYDTPIQQGHIFGYYDEVIGFMRNLLSAVLKDNPSLELGILTGILRIAKESLFSGLNNLVVNTILDDEYSQYFG FTEEEVSAMAQYYGVSDRLGEIKEWYDGYMFGRTGIYNPWSVINYFNNKCVPKAFWSRTSGNEIIGELFNSADTTFADNL LRLLQGSTVQAIVDTDIIYPEINGDIDTIYSFLLVAGYLRVSEHIGSLYDNPICALSIPNYEIKSVFQKEIIDRYNGIFT GALLRNFAESIRTGNAHLLTETLQQYLLQSASVFDTAHEDFYHGVVFGMLAVLSDNYYISSNRESGEGRFDIELQPKSRG GHGYIIEFKACKEAELEKMAGSAVRQIQQKSYTANLEKHGVSGIGMFGVAFSGKKVSVAYEEHDVKKRKSRE
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR018631 - InterPro: IPR012547 [H]
Pfam domain/function: PF09820 AAA-ATPase_like; PF08011 DUF1703 [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 72582; Mature: 72582
Theoretical pI: Translated: 6.39; Mature: 6.39
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.3 %Cys (Translated Protein) 1.9 %Met (Translated Protein) 3.2 %Cys+Met (Translated Protein) 1.3 %Cys (Mature Protein) 1.9 %Met (Mature Protein) 3.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MDIRYIKAKELSARWGVTPRRINQLCTEGKLPGAYKEGKFWMIPDDVDRPDCLRENRNLY CCCEEEEHHHCCHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCHHHHCCCCEE VREDSAVYNRKRPCPVGITSYKEVSNECYYVDKTLLIRDIIDNHSKVYLFTRPRRFGKTL EEECCHHHCCCCCCCCCCCHHHHHCCCEEEEHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCHHHCCHH TMDMVRTFFEKTDTDTSVYFKNKKIWREGALYKEKQGQYPVIFLTFKDAHQSTWQDMYAS HHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCHHHHHCCCCHHCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHH LCFTLRNEFLRHIELTTSARLSDYDKKYLKSILDDEATIIDYQFALGKLSAMLSKHYGRN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCE VIVIIDEYDTPIQQGHIFGYYDEVIGFMRNLLSAVLKDNPSLELGILTGILRIAKESLFS EEEEEECCCCCHHCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHH GLNNLVVNTILDDEYSQYFGFTEEEVSAMAQYYGVSDRLGEIKEWYDGYMFGRTGIYNPW HHHHHHHHHHHCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCEEECCCCCCCCH SVINYFNNKCVPKAFWSRTSGNEIIGELFNSADTTFADNLLRLLQGSTVQAIVDTDIIYP HHHHHHCCCCCCHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCEEEE EINGDIDTIYSFLLVAGYLRVSEHIGSLYDNPICALSIPNYEIKSVFQKEIIDRYNGIFT CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHH GALLRNFAESIRTGNAHLLTETLQQYLLQSASVFDTAHEDFYHGVVFGMLAVLSDNYYIS HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEE SNRESGEGRFDIELQPKSRGGHGYIIEFKACKEAELEKMAGSAVRQIQQKSYTANLEKHG CCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCC VSGIGMFGVAFSGKKVSVAYEEHDVKKRKSRE CCCEEEEEEEECCCEEEEEEHHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure MDIRYIKAKELSARWGVTPRRINQLCTEGKLPGAYKEGKFWMIPDDVDRPDCLRENRNLY CCCEEEEHHHCCHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCHHHHCCCCEE VREDSAVYNRKRPCPVGITSYKEVSNECYYVDKTLLIRDIIDNHSKVYLFTRPRRFGKTL EEECCHHHCCCCCCCCCCCHHHHHCCCEEEEHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCHHHCCHH TMDMVRTFFEKTDTDTSVYFKNKKIWREGALYKEKQGQYPVIFLTFKDAHQSTWQDMYAS HHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCHHHHHCCCCHHCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHH LCFTLRNEFLRHIELTTSARLSDYDKKYLKSILDDEATIIDYQFALGKLSAMLSKHYGRN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCE VIVIIDEYDTPIQQGHIFGYYDEVIGFMRNLLSAVLKDNPSLELGILTGILRIAKESLFS EEEEEECCCCCHHCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHH GLNNLVVNTILDDEYSQYFGFTEEEVSAMAQYYGVSDRLGEIKEWYDGYMFGRTGIYNPW HHHHHHHHHHHCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCEEECCCCCCCCH SVINYFNNKCVPKAFWSRTSGNEIIGELFNSADTTFADNLLRLLQGSTVQAIVDTDIIYP HHHHHHCCCCCCHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCEEEE EINGDIDTIYSFLLVAGYLRVSEHIGSLYDNPICALSIPNYEIKSVFQKEIIDRYNGIFT CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHH GALLRNFAESIRTGNAHLLTETLQQYLLQSASVFDTAHEDFYHGVVFGMLAVLSDNYYIS HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEE SNRESGEGRFDIELQPKSRGGHGYIIEFKACKEAELEKMAGSAVRQIQQKSYTANLEKHG CCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCC VSGIGMFGVAFSGKKVSVAYEEHDVKKRKSRE CCCEEEEEEEECCCEEEEEEHHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha Beta
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 2388847 [H]