| Definition | Eubacterium eligens ATCC 27750 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_012778 |
| Length | 2,144,190 |
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The map label for this gene is 238917677
Identifier: 238917677
GI number: 238917677
Start: 1819559
End: 1821973
Strand: Reverse
Name: 238917677
Synonym: EUBELI_01757
Alternate gene names: NA
Gene position: 1821973-1819559 (Counterclockwise)
Preceding gene: 238917679
Following gene: 238917674
Centisome position: 84.97
GC content: 27.45
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
>100_bases TTTTTTATATAAATTTGTAATTTACACCATTATATGGACTTTATCAAAGGAACCCAATGATTGGGGGATTTTTATATCTA TAAGTGATTTAACATCCGAT
Downstream 100 bases:
>100_bases TGGCTCCATTTTGGCTCTAAAAATTTTAGATTAGGTACACAAAAATGCAAAATAAGATGAATGTGAAGAATAAAACACAC AAATGTGTACCAAGAAACAG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: Pathogenesis-Related Transcriptional Factor And ERF Protein
Number of amino acids: Translated: 804; Mature: 804
Protein sequence:
>804_residues MKQQVDDLVDAGYHIRYIVGDSIIDALVSQKNYLSVKQIRDISQNNINLCSGDVYFLVSDRGYYYIQLLIEDGKTLPSYF VCYDMFGNSIEDEDFILRVSSKIELLKELKYYKHGEKTKYSESEVDNSYLGVMHGEGWFDYQFPANPDRFIGRTSLINAF NDSVNDVKNGITSTKVIEILSRSGVGKSSISLKLQRLYKEKGFSTAIVDSRNIRSDIDILQIFQMLVKDFNFHCNLNCEV PKEKEQINIISKSIDEFNTENGKMSLIFLDQFESVFARPSVYNTLIDIILEFNVKFKSFIFVIARKNDQPTTYDESSLID LNRLKSISKPIVLQDFKTEEAIELISHINDEIGTSLIKPLKEQVLEISNGFPWLLKKYCAHIIKLVRSGEKQKNIVQSGM QLEDLFNEDILALDEAIREFFYRLIAYLPSTYAELSEIFTDEDLSIKLKILQNDYRLIRLTGRTYDTYNDILKEFVKTGH VNLSRRYLIRYTPNTVLNLYKIIVSKNLCNVDQIVENSRVKKTSIINILGELKKLKFIEGSNNNFSLNPYAYQYYTENNI VKYLANILMDNTLIKKILLELEKNKKLTLKQVKNILISEMPFIDATDKIWEQYSKVMCKWLSAATMVNMDKNNTISTNNL GREIGDFLSDEIFFPTTMLAQIIKVVELLADNKEGMTIQELKKSMKRSSLNGHLIDACFLGLVRPISRSEYEITQNGLEF LGKEPNEKRAYIREKLLGLEYVCQYLEQIKTTNKEPLEVFTNILDEMKVDKWNEVSIKWKHKLLRNWLIYSKLVVGKTHK KQVD
Sequences:
>Translated_804_residues MKQQVDDLVDAGYHIRYIVGDSIIDALVSQKNYLSVKQIRDISQNNINLCSGDVYFLVSDRGYYYIQLLIEDGKTLPSYF VCYDMFGNSIEDEDFILRVSSKIELLKELKYYKHGEKTKYSESEVDNSYLGVMHGEGWFDYQFPANPDRFIGRTSLINAF NDSVNDVKNGITSTKVIEILSRSGVGKSSISLKLQRLYKEKGFSTAIVDSRNIRSDIDILQIFQMLVKDFNFHCNLNCEV PKEKEQINIISKSIDEFNTENGKMSLIFLDQFESVFARPSVYNTLIDIILEFNVKFKSFIFVIARKNDQPTTYDESSLID LNRLKSISKPIVLQDFKTEEAIELISHINDEIGTSLIKPLKEQVLEISNGFPWLLKKYCAHIIKLVRSGEKQKNIVQSGM QLEDLFNEDILALDEAIREFFYRLIAYLPSTYAELSEIFTDEDLSIKLKILQNDYRLIRLTGRTYDTYNDILKEFVKTGH VNLSRRYLIRYTPNTVLNLYKIIVSKNLCNVDQIVENSRVKKTSIINILGELKKLKFIEGSNNNFSLNPYAYQYYTENNI VKYLANILMDNTLIKKILLELEKNKKLTLKQVKNILISEMPFIDATDKIWEQYSKVMCKWLSAATMVNMDKNNTISTNNL GREIGDFLSDEIFFPTTMLAQIIKVVELLADNKEGMTIQELKKSMKRSSLNGHLIDACFLGLVRPISRSEYEITQNGLEF LGKEPNEKRAYIREKLLGLEYVCQYLEQIKTTNKEPLEVFTNILDEMKVDKWNEVSIKWKHKLLRNWLIYSKLVVGKTHK KQVD >Mature_804_residues MKQQVDDLVDAGYHIRYIVGDSIIDALVSQKNYLSVKQIRDISQNNINLCSGDVYFLVSDRGYYYIQLLIEDGKTLPSYF VCYDMFGNSIEDEDFILRVSSKIELLKELKYYKHGEKTKYSESEVDNSYLGVMHGEGWFDYQFPANPDRFIGRTSLINAF NDSVNDVKNGITSTKVIEILSRSGVGKSSISLKLQRLYKEKGFSTAIVDSRNIRSDIDILQIFQMLVKDFNFHCNLNCEV PKEKEQINIISKSIDEFNTENGKMSLIFLDQFESVFARPSVYNTLIDIILEFNVKFKSFIFVIARKNDQPTTYDESSLID LNRLKSISKPIVLQDFKTEEAIELISHINDEIGTSLIKPLKEQVLEISNGFPWLLKKYCAHIIKLVRSGEKQKNIVQSGM QLEDLFNEDILALDEAIREFFYRLIAYLPSTYAELSEIFTDEDLSIKLKILQNDYRLIRLTGRTYDTYNDILKEFVKTGH VNLSRRYLIRYTPNTVLNLYKIIVSKNLCNVDQIVENSRVKKTSIINILGELKKLKFIEGSNNNFSLNPYAYQYYTENNI VKYLANILMDNTLIKKILLELEKNKKLTLKQVKNILISEMPFIDATDKIWEQYSKVMCKWLSAATMVNMDKNNTISTNNL GREIGDFLSDEIFFPTTMLAQIIKVVELLADNKEGMTIQELKKSMKRSSLNGHLIDACFLGLVRPISRSEYEITQNGLEF LGKEPNEKRAYIREKLLGLEYVCQYLEQIKTTNKEPLEVFTNILDEMKVDKWNEVSIKWKHKLLRNWLIYSKLVVGKTHK KQVD
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 93305; Mature: 93305
Theoretical pI: Translated: 7.03; Mature: 7.03
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.1 %Cys (Translated Protein) 1.9 %Met (Translated Protein) 3.0 %Cys+Met (Translated Protein) 1.1 %Cys (Mature Protein) 1.9 %Met (Mature Protein) 3.0 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKQQVDDLVDAGYHIRYIVGDSIIDALVSQKNYLSVKQIRDISQNNINLCSGDVYFLVSD CCCHHHHHHCCCCEEEEEECHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCCCEEECCCEEEEEEC RGYYYIQLLIEDGKTLPSYFVCYDMFGNSIEDEDFILRVSSKIELLKELKYYKHGEKTKY CCEEEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC SESEVDNSYLGVMHGEGWFDYQFPANPDRFIGRTSLINAFNDSVNDVKNGITSTKVIEIL CHHHCCCCEEEEEECCCEEECCCCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH SRSGVGKSSISLKLQRLYKEKGFSTAIVDSRNIRSDIDILQIFQMLVKDFNFHCNLNCEV HHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCC PKEKEQINIISKSIDEFNTENGKMSLIFLDQFESVFARPSVYNTLIDIILEFNVKFKSFI CCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEE FVIARKNDQPTTYDESSLIDLNRLKSISKPIVLQDFKTEEAIELISHINDEIGTSLIKPL EEEEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KEQVLEISNGFPWLLKKYCAHIIKLVRSGEKQKNIVQSGMQLEDLFNEDILALDEAIREF HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH FYRLIAYLPSTYAELSEIFTDEDLSIKLKILQNDYRLIRLTGRTYDTYNDILKEFVKTGH HHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEECCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHCCC VNLSRRYLIRYTPNTVLNLYKIIVSKNLCNVDQIVENSRVKKTSIINILGELKKLKFIEG CCEEEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHEEEEC SNNNFSLNPYAYQYYTENNIVKYLANILMDNTLIKKILLELEKNKKLTLKQVKNILISEM CCCCEEECCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCC PFIDATDKIWEQYSKVMCKWLSAATMVNMDKNNTISTNNLGREIGDFLSDEIFFPTTMLA CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHH QIIKVVELLADNKEGMTIQELKKSMKRSSLNGHLIDACFLGLVRPISRSEYEITQNGLEF HHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH LGKEPNEKRAYIREKLLGLEYVCQYLEQIKTTNKEPLEVFTNILDEMKVDKWNEVSIKWK HCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHH HKLLRNWLIYSKLVVGKTHKKQVD HHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCCC >Mature Secondary Structure MKQQVDDLVDAGYHIRYIVGDSIIDALVSQKNYLSVKQIRDISQNNINLCSGDVYFLVSD CCCHHHHHHCCCCEEEEEECHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCCCEEECCCEEEEEEC RGYYYIQLLIEDGKTLPSYFVCYDMFGNSIEDEDFILRVSSKIELLKELKYYKHGEKTKY CCEEEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC SESEVDNSYLGVMHGEGWFDYQFPANPDRFIGRTSLINAFNDSVNDVKNGITSTKVIEIL CHHHCCCCEEEEEECCCEEECCCCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH SRSGVGKSSISLKLQRLYKEKGFSTAIVDSRNIRSDIDILQIFQMLVKDFNFHCNLNCEV HHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCC PKEKEQINIISKSIDEFNTENGKMSLIFLDQFESVFARPSVYNTLIDIILEFNVKFKSFI CCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEE FVIARKNDQPTTYDESSLIDLNRLKSISKPIVLQDFKTEEAIELISHINDEIGTSLIKPL EEEEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KEQVLEISNGFPWLLKKYCAHIIKLVRSGEKQKNIVQSGMQLEDLFNEDILALDEAIREF HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH FYRLIAYLPSTYAELSEIFTDEDLSIKLKILQNDYRLIRLTGRTYDTYNDILKEFVKTGH HHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEECCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHCCC VNLSRRYLIRYTPNTVLNLYKIIVSKNLCNVDQIVENSRVKKTSIINILGELKKLKFIEG CCEEEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHEEEEC SNNNFSLNPYAYQYYTENNIVKYLANILMDNTLIKKILLELEKNKKLTLKQVKNILISEM CCCCEEECCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCC PFIDATDKIWEQYSKVMCKWLSAATMVNMDKNNTISTNNLGREIGDFLSDEIFFPTTMLA CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHH QIIKVVELLADNKEGMTIQELKKSMKRSSLNGHLIDACFLGLVRPISRSEYEITQNGLEF HHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH LGKEPNEKRAYIREKLLGLEYVCQYLEQIKTTNKEPLEVFTNILDEMKVDKWNEVSIKWK HCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHH HKLLRNWLIYSKLVVGKTHKKQVD HHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA