| Definition | Rickettsia africae ESF-5 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_012633 |
| Length | 1,278,540 |
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The map label for this gene is tlc4 [H]
Identifier: 229586757
GI number: 229586757
Start: 645916
End: 647451
Strand: Direct
Name: tlc4 [H]
Synonym: RAF_ORF0611
Alternate gene names: 229586757
Gene position: 645916-647451 (Clockwise)
Preceding gene: 229586747
Following gene: 229586758
Centisome position: 50.52
GC content: 29.62
Gene sequence:
>1536_bases ATGACGATTAACCCCAGTAACATAGAAAATTCTTCCTCTAAAATCAATAGCTATTTTTCTAAACTTACCGATTATATCTG GCCTATAAAACGCCATGAAGTTTCTAAATTTTTATTCATCACTTTATTAATGTTCTGTATTTTATTTATCCAAAATCTAA TCAGAGCTTTAAAAGATAGTATTGTTACTACTATGATCGGTGCCGAGATTATCTCGTTTTTGAAGTTTTGGGGAGTGATG CCGTCAGCTTTTTTAATGACTGCTATATATGTAAAGCTTGTTAATAAGATGAAAGCAGAAAATATATTTTATCTTATTAT ATCAATATTTTTAACATTCTTTGCTCTTTTTGCTTACGTTATTTTTCCAAATCATGAAGTGCTGCATTTTAGTCCTGTAA CCGTTCAAAATTTAACGGCAAGTTTACCTAATTTAAAATGGTTTATATGGCTTTTATCAAAATGGAGTTTTTCATTATTT TATATAATAGCCGAATTATGGCCAAACGTAGTTTTCGCATTACTTTTTTGGCAGTTTGTTAATAATATTACTACAGTAGA AGAATCTAAAAGATTTTATCCGTTATTCGGTTTACTTAGTCAAACAGGTATTTATTTAGCAGGGCAGTTTTTAGAAAATC TAAGTAATATTAATGATTACGTAACTAATAAATTTGCATTGCAATCGTCTTTTCATACACTTTCTATACAAATTATACTA ACTATAGTATTAATTTTAGGAATAATAACTATTAAAACTTTTTGGTTGCTTAATCATAAAGTACTAGACAAAGAGCATAT GGCGTTACTCAGGTTTAAAGCAAAGAAAAAATCTATGACTATTGCCGAAAGTTTTCAGATGCTTCTATCGTCAAGACATA TTAGATTAATTGCAACTTTGCTTATCTGCTATGGCATTGCCATTAATTTAGTAGAAGGTCCTTGGAAAGCAGCAGCTACT AAAATTTATAAAACTCCAACCGAATATGCAGCTTTTATAGGAAGTTATTTGAGCTATACCGGAGTATTTACTATTTTATT TGTCGTACTTGGTTCAAATATAGTTAGAAGAATTGGCTGGTTTACGGCGGCTGTTATCACCCCTTTAATAGTTTTTATTA CCGGTATATTATTTTTTGCCGTTAATAATTTTGAAAGATTTGCCGGCTTAATAATAGCAAATTTTATTCTAACCGATCCT GCTTTAATTGCTATAACAATAGGTGCTATTCAAAATGTGCTTAGTAAATCAAGCAAATATACCTTATTTGATTCAACAAA AGAAATGGCCTATGTTCCTTTAGATCCGGAAATAAAAATAAAAGGCAAAGCTGCTGCCGACGTGATAGGTACAAAACTCG GTAAATCTGGTAGTGCATTTTTACAATCATTGGTATTTATAATATTACCTTCCGCTAGTTATCAATCTATTTCCACCTGT TTAATGATTATATTTATAATTACTTGCTTAATCTGGTTTTGGGCAACTAAAGCACTCAATAAAGAATATAAAAATTCTAT TAAATTTTCTCAATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases CAATAATTACTCATTTTAATGTGATTTTAACTTGACTTAAATTTAGACAATCTTTAATATATAACTCTAGCCAATAGCAA GATAGCTTAGACCAAATAAA
Downstream 100 bases:
>100_bases TATTAGTTTTTTCTTGATATTACTAAAATCTCTATATACTATCTTTGACAGTATAACTCAAACTGTGAAAAAAGGATGTG TTATGTCATTCCCGCGTAGG
Product: ATP/ADP translocase
Products: NA
Alternate protein names: ADP/ATP translocase 4 [H]
Number of amino acids: Translated: 511; Mature: 510
Protein sequence:
>511_residues MTINPSNIENSSSKINSYFSKLTDYIWPIKRHEVSKFLFITLLMFCILFIQNLIRALKDSIVTTMIGAEIISFLKFWGVM PSAFLMTAIYVKLVNKMKAENIFYLIISIFLTFFALFAYVIFPNHEVLHFSPVTVQNLTASLPNLKWFIWLLSKWSFSLF YIIAELWPNVVFALLFWQFVNNITTVEESKRFYPLFGLLSQTGIYLAGQFLENLSNINDYVTNKFALQSSFHTLSIQIIL TIVLILGIITIKTFWLLNHKVLDKEHMALLRFKAKKKSMTIAESFQMLLSSRHIRLIATLLICYGIAINLVEGPWKAAAT KIYKTPTEYAAFIGSYLSYTGVFTILFVVLGSNIVRRIGWFTAAVITPLIVFITGILFFAVNNFERFAGLIIANFILTDP ALIAITIGAIQNVLSKSSKYTLFDSTKEMAYVPLDPEIKIKGKAAADVIGTKLGKSGSAFLQSLVFIILPSASYQSISTC LMIIFIITCLIWFWATKALNKEYKNSIKFSQ
Sequences:
>Translated_511_residues MTINPSNIENSSSKINSYFSKLTDYIWPIKRHEVSKFLFITLLMFCILFIQNLIRALKDSIVTTMIGAEIISFLKFWGVM PSAFLMTAIYVKLVNKMKAENIFYLIISIFLTFFALFAYVIFPNHEVLHFSPVTVQNLTASLPNLKWFIWLLSKWSFSLF YIIAELWPNVVFALLFWQFVNNITTVEESKRFYPLFGLLSQTGIYLAGQFLENLSNINDYVTNKFALQSSFHTLSIQIIL TIVLILGIITIKTFWLLNHKVLDKEHMALLRFKAKKKSMTIAESFQMLLSSRHIRLIATLLICYGIAINLVEGPWKAAAT KIYKTPTEYAAFIGSYLSYTGVFTILFVVLGSNIVRRIGWFTAAVITPLIVFITGILFFAVNNFERFAGLIIANFILTDP ALIAITIGAIQNVLSKSSKYTLFDSTKEMAYVPLDPEIKIKGKAAADVIGTKLGKSGSAFLQSLVFIILPSASYQSISTC LMIIFIITCLIWFWATKALNKEYKNSIKFSQ >Mature_510_residues TINPSNIENSSSKINSYFSKLTDYIWPIKRHEVSKFLFITLLMFCILFIQNLIRALKDSIVTTMIGAEIISFLKFWGVMP SAFLMTAIYVKLVNKMKAENIFYLIISIFLTFFALFAYVIFPNHEVLHFSPVTVQNLTASLPNLKWFIWLLSKWSFSLFY IIAELWPNVVFALLFWQFVNNITTVEESKRFYPLFGLLSQTGIYLAGQFLENLSNINDYVTNKFALQSSFHTLSIQIILT IVLILGIITIKTFWLLNHKVLDKEHMALLRFKAKKKSMTIAESFQMLLSSRHIRLIATLLICYGIAINLVEGPWKAAATK IYKTPTEYAAFIGSYLSYTGVFTILFVVLGSNIVRRIGWFTAAVITPLIVFITGILFFAVNNFERFAGLIIANFILTDPA LIAITIGAIQNVLSKSSKYTLFDSTKEMAYVPLDPEIKIKGKAAADVIGTKLGKSGSAFLQSLVFIILPSASYQSISTCL MIIFIITCLIWFWATKALNKEYKNSIKFSQ
Specific function: Provides the rickettsial cell with host ATP in exchange for rickettsial ADP. This is an obligate exchange system. This energy acquiring activity is an important component of rickettsial parasitism [H]
COG id: COG3202
COG function: function code C; ATP/ADP translocase
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the ADP/ATP translocase tlc family [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR004667 [H]
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 58065; Mature: 57934
Theoretical pI: Translated: 10.07; Mature: 10.07
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.8 %Cys (Translated Protein) 2.2 %Met (Translated Protein) 2.9 %Cys+Met (Translated Protein) 0.8 %Cys (Mature Protein) 2.0 %Met (Mature Protein) 2.7 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MTINPSNIENSSSKINSYFSKLTDYIWPIKRHEVSKFLFITLLMFCILFIQNLIRALKDS CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IVTTMIGAEIISFLKFWGVMPSAFLMTAIYVKLVNKMKAENIFYLIISIFLTFFALFAYV HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IFPNHEVLHFSPVTVQNLTASLPNLKWFIWLLSKWSFSLFYIIAELWPNVVFALLFWQFV HCCCCCEEEECCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NNITTVEESKRFYPLFGLLSQTGIYLAGQFLENLSNINDYVTNKFALQSSFHTLSIQIIL CCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHH TIVLILGIITIKTFWLLNHKVLDKEHMALLRFKAKKKSMTIAESFQMLLSSRHIRLIATL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH LICYGIAINLVEGPWKAAATKIYKTPTEYAAFIGSYLSYTGVFTILFVVLGSNIVRRIGW HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FTAAVITPLIVFITGILFFAVNNFERFAGLIIANFILTDPALIAITIGAIQNVLSKSSKY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCE TLFDSTKEMAYVPLDPEIKIKGKAAADVIGTKLGKSGSAFLQSLVFIILPSASYQSISTC EEEECCCCCEEECCCCCEEECCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHH LMIIFIITCLIWFWATKALNKEYKNSIKFSQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC >Mature Secondary Structure TINPSNIENSSSKINSYFSKLTDYIWPIKRHEVSKFLFITLLMFCILFIQNLIRALKDS CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IVTTMIGAEIISFLKFWGVMPSAFLMTAIYVKLVNKMKAENIFYLIISIFLTFFALFAYV HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IFPNHEVLHFSPVTVQNLTASLPNLKWFIWLLSKWSFSLFYIIAELWPNVVFALLFWQFV HCCCCCEEEECCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NNITTVEESKRFYPLFGLLSQTGIYLAGQFLENLSNINDYVTNKFALQSSFHTLSIQIIL CCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHH TIVLILGIITIKTFWLLNHKVLDKEHMALLRFKAKKKSMTIAESFQMLLSSRHIRLIATL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH LICYGIAINLVEGPWKAAATKIYKTPTEYAAFIGSYLSYTGVFTILFVVLGSNIVRRIGW HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FTAAVITPLIVFITGILFFAVNNFERFAGLIIANFILTDPALIAITIGAIQNVLSKSSKY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCE TLFDSTKEMAYVPLDPEIKIKGKAAADVIGTKLGKSGSAFLQSLVFIILPSASYQSISTC EEEECCCCCEEECCCCCEEECCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHH LMIIFIITCLIWFWATKALNKEYKNSIKFSQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 9823893 [H]