| Definition | Sulfolobus islandicus M.14.25 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_012588 |
| Length | 2,608,832 |
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The map label for this gene is 227828804
Identifier: 227828804
GI number: 227828804
Start: 2397726
End: 2398979
Strand: Direct
Name: 227828804
Synonym: M1425_2578
Alternate gene names: NA
Gene position: 2397726-2398979 (Clockwise)
Preceding gene: 227828801
Following gene: 227828805
Centisome position: 91.91
GC content: 35.09
Gene sequence:
>1254_bases ATGATTAAGTATAAGGATACCAGATGGATGTATCTAGTGATACCTTATAATGCTTCAATAGGTCCTTTATCCACGTTAGT AACATTACAGATTCTTTCGCTTGGAGGGAATGCAATTGACGTAGCATACGCTATCTCCTTAAGTAACGCTGTTCTAATTC CAGCTTCAATAATATGGGGATTCCTAGCTGACAAGATGGATAGAAAGAAACAAATATTGCTAAGCTTAGCTGGAGTTTCA ATTCCCCTTATTGTAATGCCCTTCATGAAAAGTATCTCATTAATTACCTTAAATTACGCTTTAATTACATTTATGAGCAC TGCGTCAACAACACCATTCAATTTACTAATAATGGAGTCCGCTGAGAAAAAACACTGGGGCTCTCTCTTCTCAAGATTCT CTTTATTCTCCTCTATAGGTGTCTTGCTAGGATTGGTTGTTTCGACTTTTCTAGTAATTCTCTTAAGAATTGACCAAATA GAGGAAATACTGGGATTTTCAGTACTGGCTACGTTAATTGCAAGCGTAAAAATACTACCTAAACCCATAATTACATTTGA AAGGGCAGCTATTATACACAATAAGGAATCGTTTTTGACTAGAATGAGACACTTGCCAATGATGTTCCTTCATCTACCTA ATATTCATCACTTTAAAATGTTTTCCGTGAGTAGATTATTTAGGAAACCCATTAATTACATTCCTCTACTTTACTTAGGA ATAGTGTTATTTTACATAAGCAGCGGAATATTCAATACTGTATATCCAGCAGGTTTGTACGTGAAGGGATTAAATAAATC TGAAGTGTTGGCTGTAATAAGCGTTGGTATGATATTTCAAATTTTAGGATTTAGGATATCCTCAACGTTACTGGAGAATA AAGATGAGAAAGGATTAGCATACATTTCACTTATCCTGAGAGGTGTGTCATACGTTTTACTTGGTATATTTGCCCAACTA TTTTTAGGTATTCCAATATTAATCTCTGGGTTAATATTCTATCCATTGGCAGCCGGAATTGCCTATGCAGTATTTTACTC CTCATCTACTACCTTAATATTCAAAATTGTTGGGGAGAGAAGGCAAGGAACTGGACTTGGAGTTTATAGTACAGTAGTAG GGATATCATTATTTGTGGGGTCACTTTTATCTGGTTATATCACGCACTATATTAGTTACGGTATAGATTTTATAGTTGCA GGGATTATACTCTTAATTGCTTCATGGATATTTAGATATCTGGAGGAAGGATGA
Upstream 100 bases:
>100_bases TGTTTTTCATATTTAAAAAATTTAAACTTATACAAGGATCTACTTTTCGTTAAACTTTACAATAAAACTTTTAAACATTA CATTGTGGCTAAAACAAGTA
Downstream 100 bases:
>100_bases TTTTATCTTAATTTTTATTAAAAATAGACTAATATTTAAACTTTATGACATTTTATCGACGTAAACTTTAGGACGATTTT ATATGTTATTTTGTTAAACT
Product: major facilitator superfamily MFS_1
Products: NA
Alternate protein names: Permease Facilitator Superfamily; Facilitator Superfamily Permease; Facilitator Superfamily Protein; Transporter Facilitator Family
Number of amino acids: Translated: 417; Mature: 417
Protein sequence:
>417_residues MIKYKDTRWMYLVIPYNASIGPLSTLVTLQILSLGGNAIDVAYAISLSNAVLIPASIIWGFLADKMDRKKQILLSLAGVS IPLIVMPFMKSISLITLNYALITFMSTASTTPFNLLIMESAEKKHWGSLFSRFSLFSSIGVLLGLVVSTFLVILLRIDQI EEILGFSVLATLIASVKILPKPIITFERAAIIHNKESFLTRMRHLPMMFLHLPNIHHFKMFSVSRLFRKPINYIPLLYLG IVLFYISSGIFNTVYPAGLYVKGLNKSEVLAVISVGMIFQILGFRISSTLLENKDEKGLAYISLILRGVSYVLLGIFAQL FLGIPILISGLIFYPLAAGIAYAVFYSSSTTLIFKIVGERRQGTGLGVYSTVVGISLFVGSLLSGYITHYISYGIDFIVA GIILLIASWIFRYLEEG
Sequences:
>Translated_417_residues MIKYKDTRWMYLVIPYNASIGPLSTLVTLQILSLGGNAIDVAYAISLSNAVLIPASIIWGFLADKMDRKKQILLSLAGVS IPLIVMPFMKSISLITLNYALITFMSTASTTPFNLLIMESAEKKHWGSLFSRFSLFSSIGVLLGLVVSTFLVILLRIDQI EEILGFSVLATLIASVKILPKPIITFERAAIIHNKESFLTRMRHLPMMFLHLPNIHHFKMFSVSRLFRKPINYIPLLYLG IVLFYISSGIFNTVYPAGLYVKGLNKSEVLAVISVGMIFQILGFRISSTLLENKDEKGLAYISLILRGVSYVLLGIFAQL FLGIPILISGLIFYPLAAGIAYAVFYSSSTTLIFKIVGERRQGTGLGVYSTVVGISLFVGSLLSGYITHYISYGIDFIVA GIILLIASWIFRYLEEG >Mature_417_residues MIKYKDTRWMYLVIPYNASIGPLSTLVTLQILSLGGNAIDVAYAISLSNAVLIPASIIWGFLADKMDRKKQILLSLAGVS IPLIVMPFMKSISLITLNYALITFMSTASTTPFNLLIMESAEKKHWGSLFSRFSLFSSIGVLLGLVVSTFLVILLRIDQI EEILGFSVLATLIASVKILPKPIITFERAAIIHNKESFLTRMRHLPMMFLHLPNIHHFKMFSVSRLFRKPINYIPLLYLG IVLFYISSGIFNTVYPAGLYVKGLNKSEVLAVISVGMIFQILGFRISSTLLENKDEKGLAYISLILRGVSYVLLGIFAQL FLGIPILISGLIFYPLAAGIAYAVFYSSSTTLIFKIVGERRQGTGLGVYSTVVGISLFVGSLLSGYITHYISYGIDFIVA GIILLIASWIFRYLEEG
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
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Paralogues:
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Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 46230; Mature: 46230
Theoretical pI: Translated: 10.04; Mature: 10.04
Prosite motif: PS50850 MFS
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
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Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 2.9 %Met (Translated Protein) 2.9 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 2.9 %Met (Mature Protein) 2.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MIKYKDTRWMYLVIPYNASIGPLSTLVTLQILSLGGNAIDVAYAISLSNAVLIPASIIWG CCCCCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHEEEEECCCCEEHHHHHHHH FLADKMDRKKQILLSLAGVSIPLIVMPFMKSISLITLNYALITFMSTASTTPFNLLIMES HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEC AEKKHWGSLFSRFSLFSSIGVLLGLVVSTFLVILLRIDQIEEILGFSVLATLIASVKILP CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC KPIITFERAAIIHNKESFLTRMRHLPMMFLHLPNIHHFKMFSVSRLFRKPINYIPLLYLG CCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHH IVLFYISSGIFNTVYPAGLYVKGLNKSEVLAVISVGMIFQILGFRISSTLLENKDEKGLA HHHHHHHCCHHHHHCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHH YISLILRGVSYVLLGIFAQLFLGIPILISGLIFYPLAAGIAYAVFYSSSTTLIFKIVGER HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCC RQGTGLGVYSTVVGISLFVGSLLSGYITHYISYGIDFIVAGIILLIASWIFRYLEEG CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure MIKYKDTRWMYLVIPYNASIGPLSTLVTLQILSLGGNAIDVAYAISLSNAVLIPASIIWG CCCCCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHEEEEECCCCEEHHHHHHHH FLADKMDRKKQILLSLAGVSIPLIVMPFMKSISLITLNYALITFMSTASTTPFNLLIMES HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEC AEKKHWGSLFSRFSLFSSIGVLLGLVVSTFLVILLRIDQIEEILGFSVLATLIASVKILP CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC KPIITFERAAIIHNKESFLTRMRHLPMMFLHLPNIHHFKMFSVSRLFRKPINYIPLLYLG CCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHH IVLFYISSGIFNTVYPAGLYVKGLNKSEVLAVISVGMIFQILGFRISSTLLENKDEKGLA HHHHHHHCCHHHHHCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHH YISLILRGVSYVLLGIFAQLFLGIPILISGLIFYPLAAGIAYAVFYSSSTTLIFKIVGER HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCC RQGTGLGVYSTVVGISLFVGSLLSGYITHYISYGIDFIVAGIILLIASWIFRYLEEG CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA