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Definition Sulfolobus islandicus M.14.25 chromosome, complete genome.
Accession NC_012588
Length 2,608,832

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The map label for this gene is 227828394

Identifier: 227828394

GI number: 227828394

Start: 1955099

End: 1956571

Strand: Direct

Name: 227828394

Synonym: M1425_2137

Alternate gene names: NA

Gene position: 1955099-1956571 (Clockwise)

Preceding gene: 227828393

Following gene: 227828395

Centisome position: 74.94

GC content: 32.72

Gene sequence:

>1473_bases
GTGGATAAAAAAGAGAGTGTGAGAGTTACAAGAATAGGTATTATTAACTTACTAACAAGGACTTTAGGGGCACCTATTTC
ATTTATCTTCACGTTATTAGTTGCAAGGTATCTGTCGAATCCTCCCTATGGTATTATTTATTTTGCTACTTGGCAAACCT
TGTATGTTTTCACAATAGGCTATTTTACAATACCCGCAAATCTATTCTCATTAATAACGTCAAGATATTCTGCAGAAAGG
AAGAATGTTGGTGGAATAGTAATAACTAACTTGATAGCAGGAATTATATCAGGTTTAGTTTTTGCCCTTTTAGTCCCATA
CTACATTTCTTTAACTAAGCTCAATGTTCCTATTTATTTCTATTCTGCAATATCGCTAATTATTTTAACCTACTTGCTGA
CTGTAACGAATTCAATAGCTCAAGGAAGAACACCCAAGATAATTGGAATTTCCGCATTAATCTTTCAAGTTCTGAGATTA
GTTTCGGGGATTGTATTCATGTTCCTATTTAATCTTTCGATTCTGGCAGTAATCCTAGCTTATAGCATAGGCTATCTTGC
TCAGATATTATTCAATTTATTCTTCATAAGAGCTAATCTCAAGATTGACTTTAAGGTAGCTTTTTCGGCTGTTAGAAAAG
CAGTGGTGTATATAGCGAATTATATTCAATATATTCTAGAAGCGTCAATAGTATGGATTACTCTGGCTATCGTAAAATCA
GATTTAGTAGTAGCATATTTTGAGTCTGCCATTATAGTTAGTAATGTCCAGATTTGGTCACAAGCAATATATACTGGTCT
AATGGCTAAGTTGGCTGAAGATAAGAATCCATCTATAATTAGTGATGCCATTAAACTTTACTCAATAGTAGGTAGTCTAT
TTTTAATTCTTATTTACATAGATGGCTATGGGCTTTTATACAAACTAAGACCTGAGTATACAGCTGCTATTTTCTCTCTC
TATATACTTACTTTTTCAAATTTCATAAGAGGTTTCTATAATATCTTCTATCAAGGTATAACAATGGCTGATCCTACTCT
ATCAGTAGAATCTAAGAATGAATTCAAAGGTCACCTATTTAAGCTGACTACTTCCAATTTGCTTTTTTCATTGCTAGGTT
TAGGAATTTCCACGTTGCTGATTTACCTCTTCTCCTCTTACTCACCTTATTTATTAGCAGCCTTTATGAGTATCGGGATA
ATAATTAATTCATTCTCAATGCTGTTTACTTCCTATAGAGCTTGTAGACAAATTTACAATTTTAATTTCCCAGTTAAAGA
ATTTCTAGTACCATTAGGCTTAGGTGCACTTAGTTTGCCCTTATCAGTGGTTTATAGGCCAGTAAGTTTTCTTGCGATGG
GTATATATGCTATAATAATAATTTCGATCTTTACACTATATAATTACGCTTTTAACCCATACGGTAGAAGGTTAGTAATA
GCGATTATAAGAGAATTTAAGCAAAGAGTTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TATTTTAGAAGGCTAACAACTTTGTTAATTTGATTTAAGATCGCGTCAAATCTTTTTGACTCGATAGACTATAAATACTT
TATTTTTAATACGTAAAAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TCTACTTTATATGGTTGGTTCAGAAATTCGGATGGCTAGGTTGTTCGAGAAAGGTAGAGCATTTGTCGTGGCACTAGATC
ACGGATTGGTAATGGGACCA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 490; Mature: 490

Protein sequence:

>490_residues
MDKKESVRVTRIGIINLLTRTLGAPISFIFTLLVARYLSNPPYGIIYFATWQTLYVFTIGYFTIPANLFSLITSRYSAER
KNVGGIVITNLIAGIISGLVFALLVPYYISLTKLNVPIYFYSAISLIILTYLLTVTNSIAQGRTPKIIGISALIFQVLRL
VSGIVFMFLFNLSILAVILAYSIGYLAQILFNLFFIRANLKIDFKVAFSAVRKAVVYIANYIQYILEASIVWITLAIVKS
DLVVAYFESAIIVSNVQIWSQAIYTGLMAKLAEDKNPSIISDAIKLYSIVGSLFLILIYIDGYGLLYKLRPEYTAAIFSL
YILTFSNFIRGFYNIFYQGITMADPTLSVESKNEFKGHLFKLTTSNLLFSLLGLGISTLLIYLFSSYSPYLLAAFMSIGI
IINSFSMLFTSYRACRQIYNFNFPVKEFLVPLGLGALSLPLSVVYRPVSFLAMGIYAIIIISIFTLYNYAFNPYGRRLVI
AIIREFKQRV

Sequences:

>Translated_490_residues
MDKKESVRVTRIGIINLLTRTLGAPISFIFTLLVARYLSNPPYGIIYFATWQTLYVFTIGYFTIPANLFSLITSRYSAER
KNVGGIVITNLIAGIISGLVFALLVPYYISLTKLNVPIYFYSAISLIILTYLLTVTNSIAQGRTPKIIGISALIFQVLRL
VSGIVFMFLFNLSILAVILAYSIGYLAQILFNLFFIRANLKIDFKVAFSAVRKAVVYIANYIQYILEASIVWITLAIVKS
DLVVAYFESAIIVSNVQIWSQAIYTGLMAKLAEDKNPSIISDAIKLYSIVGSLFLILIYIDGYGLLYKLRPEYTAAIFSL
YILTFSNFIRGFYNIFYQGITMADPTLSVESKNEFKGHLFKLTTSNLLFSLLGLGISTLLIYLFSSYSPYLLAAFMSIGI
IINSFSMLFTSYRACRQIYNFNFPVKEFLVPLGLGALSLPLSVVYRPVSFLAMGIYAIIIISIFTLYNYAFNPYGRRLVI
AIIREFKQRV
>Mature_490_residues
MDKKESVRVTRIGIINLLTRTLGAPISFIFTLLVARYLSNPPYGIIYFATWQTLYVFTIGYFTIPANLFSLITSRYSAER
KNVGGIVITNLIAGIISGLVFALLVPYYISLTKLNVPIYFYSAISLIILTYLLTVTNSIAQGRTPKIIGISALIFQVLRL
VSGIVFMFLFNLSILAVILAYSIGYLAQILFNLFFIRANLKIDFKVAFSAVRKAVVYIANYIQYILEASIVWITLAIVKS
DLVVAYFESAIIVSNVQIWSQAIYTGLMAKLAEDKNPSIISDAIKLYSIVGSLFLILIYIDGYGLLYKLRPEYTAAIFSL
YILTFSNFIRGFYNIFYQGITMADPTLSVESKNEFKGHLFKLTTSNLLFSLLGLGISTLLIYLFSSYSPYLLAAFMSIGI
IINSFSMLFTSYRACRQIYNFNFPVKEFLVPLGLGALSLPLSVVYRPVSFLAMGIYAIIIISIFTLYNYAFNPYGRRLVI
AIIREFKQRV

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 55181; Mature: 55181

Theoretical pI: Translated: 9.98; Mature: 9.98

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
1.4 %Met     (Translated Protein)
1.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
1.4 %Met     (Mature Protein)
1.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MDKKESVRVTRIGIINLLTRTLGAPISFIFTLLVARYLSNPPYGIIYFATWQTLYVFTIG
CCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHH
YFTIPANLFSLITSRYSAERKNVGGIVITNLIAGIISGLVFALLVPYYISLTKLNVPIYF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH
YSAISLIILTYLLTVTNSIAQGRTPKIIGISALIFQVLRLVSGIVFMFLFNLSILAVILA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YSIGYLAQILFNLFFIRANLKIDFKVAFSAVRKAVVYIANYIQYILEASIVWITLAIVKS
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DLVVAYFESAIIVSNVQIWSQAIYTGLMAKLAEDKNPSIISDAIKLYSIVGSLFLILIYI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
DGYGLLYKLRPEYTAAIFSLYILTFSNFIRGFYNIFYQGITMADPTLSVESKNEFKGHLF
CCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCCCCCCCCCCCCCCHHE
KLTTSNLLFSLLGLGISTLLIYLFSSYSPYLLAAFMSIGIIINSFSMLFTSYRACRQIYN
EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
FNFPVKEFLVPLGLGALSLPLSVVYRPVSFLAMGIYAIIIISIFTLYNYAFNPYGRRLVI
CCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHH
AIIREFKQRV
HHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MDKKESVRVTRIGIINLLTRTLGAPISFIFTLLVARYLSNPPYGIIYFATWQTLYVFTIG
CCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHH
YFTIPANLFSLITSRYSAERKNVGGIVITNLIAGIISGLVFALLVPYYISLTKLNVPIYF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH
YSAISLIILTYLLTVTNSIAQGRTPKIIGISALIFQVLRLVSGIVFMFLFNLSILAVILA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YSIGYLAQILFNLFFIRANLKIDFKVAFSAVRKAVVYIANYIQYILEASIVWITLAIVKS
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DLVVAYFESAIIVSNVQIWSQAIYTGLMAKLAEDKNPSIISDAIKLYSIVGSLFLILIYI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
DGYGLLYKLRPEYTAAIFSLYILTFSNFIRGFYNIFYQGITMADPTLSVESKNEFKGHLF
CCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCCCCCCCCCCCCCCHHE
KLTTSNLLFSLLGLGISTLLIYLFSSYSPYLLAAFMSIGIIINSFSMLFTSYRACRQIYN
EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
FNFPVKEFLVPLGLGALSLPLSVVYRPVSFLAMGIYAIIIISIFTLYNYAFNPYGRRLVI
CCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHH
AIIREFKQRV
HHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA