| Definition | Sulfolobus islandicus M.14.25 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_012588 |
| Length | 2,608,832 |
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The map label for this gene is 227828049
Identifier: 227828049
GI number: 227828049
Start: 1656315
End: 1658222
Strand: Direct
Name: 227828049
Synonym: M1425_1786
Alternate gene names: NA
Gene position: 1656315-1658222 (Clockwise)
Preceding gene: 227828045
Following gene: 227828054
Centisome position: 63.49
GC content: 27.31
Gene sequence:
>1908_bases TTGAGAGATAATATTATCTTAAGCATGTTTATAAAGAACCCGGAGCCAAATAGTGAAACTATATATGATTACATAAATAG AGTAATAGTCGCAGTAATTAACGCAATTCTATCATACAAAATCTTTATTTCGTTTTTGCCTAGCGATTATATATATTTTG CCATAGCGATTATCTCGGTAATTTCGTTTTTCTTTCATAAACCTCTTTCTATAATACTTTTATCAATATATATTATAGAC AGTGCTGCGATTTATAAAGTACTATATAATGTCGCACTATATCCTCTGATTCAAAGCTACTCAATTAAATATCTAATAGA AATACTGCTGATGTTAATTTTTATATTTATAATACCTCTATTTTCCATTTTAAGATATAGTTCTGTAGGAGGTATAATAG TATCTAGTTCAATACTTTTATCAATCTACAATCCCTTCTTTTTATTGTTTTTACCTTTTGGAATTGCTGAAAAAAATAGT AAAATCATAGTAAATATTTTATCTGCATTACCTTTACTAATAATACCTATTACTCTACATTATACCCTAATATTGTATAG TTATTTACCCTTGGTATCTATTATATTAGTTCTGGTTACTGGTATATTGTTTAGTATAAGAGAGTTATTTAGCTTAACTG GATTTTTACCACTTTCTATCTTTCTTTATCTAAATAATCAGAGTTTAGAAGTAATAACCTTAGTTTCAGTATTAACTTTG ATTTTAAATATAATTCCTTCTATATTATCACTGATTAAAGCTAATTTCTACGTTAAAAAAGAAGTAGTTGAGATGAGAAA TAGAATCGATGAAAATATAGACGACCTTAAAGGAATATTAGAAAAGATAAAATTACTCGCAAAGGATACTAATGATATAG AGCTAACTCCTTTGATTCAGAAGTATAATAAGTTCTTTGCTGACATTTCAAATAACTTGGAAAATATATCTGATATAAAG ACTTTGCAAAATATTGAGCTAGAATTAAACGCCAAAAGATTAGAGCTAGAAAGAAGTATTAACGATTATCTATTTGATCA AATATCACGATATAACGAAATTGTAGATGAAATTAAAAATTATGGTATTGTGTTAGATAAAATAGAACAGTTATCTGAGC CTATAAAAATTAATGATGAGGGAGTTATTAGGATAAATAAATTAATGATGAGAATGAATGAAAATGTGAACTTGTTATAT AAATATATTGAAAGTATAAGTAGTTCATTGGAACTGTTGTTAGGCAAGAACTACGAGAACGAAATAATTGATGTAAGACT TAATATAGAAATGTCAATTAAGTATCTAAAGATACTACTTAGTAAAGAAAATTTAGAAAGTTGCAAGACATGTACAGAAC TGATGCTAAGGTTTTTACAATTATCTAATTCTCTTAATTTACATATGAATCAAGAATTATTGAAGAACATAATAAAGCTC AATGACGAGAAACTTGCTGTCTTCATAATAAAAAGTAGGGAAATCTTAGAGCAAGGTTTAAAGACAGCTTCTAGTGTGTT AGCTAAAGTTAAAGAGGATTACGAACACATCAAGAACGAGATACCTTCATTAAGTAGATATAAAGAATTCGAGCTTATTA ACTTGCTTGAAAAAGAAATAAATGACTCCACTAAGCCGATATGTAAGAGAATAGAAACGTTATCTTCTTCGCTTCAAGTA ATTCAAGATTTGTCCAGTATAATAACTCATAAGAATGAAATTGCTGATGTTATTAACTTGATTAATGATAATTATGATCT CATCTTGCAAAAAGTGATAGAGGAAGGATGCATAAAACTTAGTGAGTTGGGAATAGCATTAGATTATGGTAAGTTCATAG ATCTTGTACTACAAGAAAAGGGTACAAATTTAAGAGTTGTTAATGATTCAATCTGTTACATGAGATAG
Upstream 100 bases:
>100_bases CAATTCGTACTTTTTAAACTGAATTTGGAGAGTCATAGGTATAGATATGAAGAACCGTTTATATCTTTAACTTACTAAAG CTAGTAAACCATATATATCT
Downstream 100 bases:
>100_bases TTTCCTATCTTAGTCTTTTTATAGTAATCTCAGCATAGTCGTCAACTACATCCGCTTTAAAAAGGTACCTAGGAGCATTT CTCAGAAGTTGATGAGTACA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 635; Mature: 635
Protein sequence:
>635_residues MRDNIILSMFIKNPEPNSETIYDYINRVIVAVINAILSYKIFISFLPSDYIYFAIAIISVISFFFHKPLSIILLSIYIID SAAIYKVLYNVALYPLIQSYSIKYLIEILLMLIFIFIIPLFSILRYSSVGGIIVSSSILLSIYNPFFLLFLPFGIAEKNS KIIVNILSALPLLIIPITLHYTLILYSYLPLVSIILVLVTGILFSIRELFSLTGFLPLSIFLYLNNQSLEVITLVSVLTL ILNIIPSILSLIKANFYVKKEVVEMRNRIDENIDDLKGILEKIKLLAKDTNDIELTPLIQKYNKFFADISNNLENISDIK TLQNIELELNAKRLELERSINDYLFDQISRYNEIVDEIKNYGIVLDKIEQLSEPIKINDEGVIRINKLMMRMNENVNLLY KYIESISSSLELLLGKNYENEIIDVRLNIEMSIKYLKILLSKENLESCKTCTELMLRFLQLSNSLNLHMNQELLKNIIKL NDEKLAVFIIKSREILEQGLKTASSVLAKVKEDYEHIKNEIPSLSRYKEFELINLLEKEINDSTKPICKRIETLSSSLQV IQDLSSIITHKNEIADVINLINDNYDLILQKVIEEGCIKLSELGIALDYGKFIDLVLQEKGTNLRVVNDSICYMR
Sequences:
>Translated_635_residues MRDNIILSMFIKNPEPNSETIYDYINRVIVAVINAILSYKIFISFLPSDYIYFAIAIISVISFFFHKPLSIILLSIYIID SAAIYKVLYNVALYPLIQSYSIKYLIEILLMLIFIFIIPLFSILRYSSVGGIIVSSSILLSIYNPFFLLFLPFGIAEKNS KIIVNILSALPLLIIPITLHYTLILYSYLPLVSIILVLVTGILFSIRELFSLTGFLPLSIFLYLNNQSLEVITLVSVLTL ILNIIPSILSLIKANFYVKKEVVEMRNRIDENIDDLKGILEKIKLLAKDTNDIELTPLIQKYNKFFADISNNLENISDIK TLQNIELELNAKRLELERSINDYLFDQISRYNEIVDEIKNYGIVLDKIEQLSEPIKINDEGVIRINKLMMRMNENVNLLY KYIESISSSLELLLGKNYENEIIDVRLNIEMSIKYLKILLSKENLESCKTCTELMLRFLQLSNSLNLHMNQELLKNIIKL NDEKLAVFIIKSREILEQGLKTASSVLAKVKEDYEHIKNEIPSLSRYKEFELINLLEKEINDSTKPICKRIETLSSSLQV IQDLSSIITHKNEIADVINLINDNYDLILQKVIEEGCIKLSELGIALDYGKFIDLVLQEKGTNLRVVNDSICYMR >Mature_635_residues MRDNIILSMFIKNPEPNSETIYDYINRVIVAVINAILSYKIFISFLPSDYIYFAIAIISVISFFFHKPLSIILLSIYIID SAAIYKVLYNVALYPLIQSYSIKYLIEILLMLIFIFIIPLFSILRYSSVGGIIVSSSILLSIYNPFFLLFLPFGIAEKNS KIIVNILSALPLLIIPITLHYTLILYSYLPLVSIILVLVTGILFSIRELFSLTGFLPLSIFLYLNNQSLEVITLVSVLTL ILNIIPSILSLIKANFYVKKEVVEMRNRIDENIDDLKGILEKIKLLAKDTNDIELTPLIQKYNKFFADISNNLENISDIK TLQNIELELNAKRLELERSINDYLFDQISRYNEIVDEIKNYGIVLDKIEQLSEPIKINDEGVIRINKLMMRMNENVNLLY KYIESISSSLELLLGKNYENEIIDVRLNIEMSIKYLKILLSKENLESCKTCTELMLRFLQLSNSLNLHMNQELLKNIIKL NDEKLAVFIIKSREILEQGLKTASSVLAKVKEDYEHIKNEIPSLSRYKEFELINLLEKEINDSTKPICKRIETLSSSLQV IQDLSSIITHKNEIADVINLINDNYDLILQKVIEEGCIKLSELGIALDYGKFIDLVLQEKGTNLRVVNDSICYMR
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 73115; Mature: 73115
Theoretical pI: Translated: 5.08; Mature: 5.08
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.8 %Cys (Translated Protein) 1.7 %Met (Translated Protein) 2.5 %Cys+Met (Translated Protein) 0.8 %Cys (Mature Protein) 1.7 %Met (Mature Protein) 2.5 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MRDNIILSMFIKNPEPNSETIYDYINRVIVAVINAILSYKIFISFLPSDYIYFAIAIISV CCCCEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH ISFFFHKPLSIILLSIYIIDSAAIYKVLYNVALYPLIQSYSIKYLIEILLMLIFIFIIPL HHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FSILRYSSVGGIIVSSSILLSIYNPFFLLFLPFGIAEKNSKIIVNILSALPLLIIPITLH HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YTLILYSYLPLVSIILVLVTGILFSIRELFSLTGFLPLSIFLYLNNQSLEVITLVSVLTL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHEEEEECCCCHHHHHHHHHHHH ILNIIPSILSLIKANFYVKKEVVEMRNRIDENIDDLKGILEKIKLLAKDTNDIELTPLIQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHH KYNKFFADISNNLENISDIKTLQNIELELNAKRLELERSINDYLFDQISRYNEIVDEIKN HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YGIVLDKIEQLSEPIKINDEGVIRINKLMMRMNENVNLLYKYIESISSSLELLLGKNYEN CCHHHHHHHHHCCCCEECCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC EIIDVRLNIEMSIKYLKILLSKENLESCKTCTELMLRFLQLSNSLNLHMNQELLKNIIKL CEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHC NDEKLAVFIIKSREILEQGLKTASSVLAKVKEDYEHIKNEIPSLSRYKEFELINLLEKEI CCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH NDSTKPICKRIETLSSSLQVIQDLSSIITHKNEIADVINLINDNYDLILQKVIEEGCIKL CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHH SELGIALDYGKFIDLVLQEKGTNLRVVNDSICYMR HHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCC >Mature Secondary Structure MRDNIILSMFIKNPEPNSETIYDYINRVIVAVINAILSYKIFISFLPSDYIYFAIAIISV CCCCEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH ISFFFHKPLSIILLSIYIIDSAAIYKVLYNVALYPLIQSYSIKYLIEILLMLIFIFIIPL HHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FSILRYSSVGGIIVSSSILLSIYNPFFLLFLPFGIAEKNSKIIVNILSALPLLIIPITLH HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YTLILYSYLPLVSIILVLVTGILFSIRELFSLTGFLPLSIFLYLNNQSLEVITLVSVLTL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHEEEEECCCCHHHHHHHHHHHH ILNIIPSILSLIKANFYVKKEVVEMRNRIDENIDDLKGILEKIKLLAKDTNDIELTPLIQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHH KYNKFFADISNNLENISDIKTLQNIELELNAKRLELERSINDYLFDQISRYNEIVDEIKN HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YGIVLDKIEQLSEPIKINDEGVIRINKLMMRMNENVNLLYKYIESISSSLELLLGKNYEN CCHHHHHHHHHCCCCEECCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC EIIDVRLNIEMSIKYLKILLSKENLESCKTCTELMLRFLQLSNSLNLHMNQELLKNIIKL CEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHC NDEKLAVFIIKSREILEQGLKTASSVLAKVKEDYEHIKNEIPSLSRYKEFELINLLEKEI CCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH NDSTKPICKRIETLSSSLQVIQDLSSIITHKNEIADVINLINDNYDLILQKVIEEGCIKL CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHH SELGIALDYGKFIDLVLQEKGTNLRVVNDSICYMR HHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA