The gene/protein map for NC_012588 is currently unavailable.
Definition Sulfolobus islandicus M.14.25 chromosome, complete genome.
Accession NC_012588
Length 2,608,832

Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 227827390

Identifier: 227827390

GI number: 227827390

Start: 1054920

End: 1056179

Strand: Direct

Name: 227827390

Synonym: M1425_1109

Alternate gene names: NA

Gene position: 1054920-1056179 (Clockwise)

Preceding gene: 227827388

Following gene: 227827396

Centisome position: 40.44

GC content: 34.68

Gene sequence:

>1260_bases
ATGAGCATTTCAACAGTAGATCCACTTGAGGAAATATTAAAACCAGAAAACTTAAGTAGATTGTCCAAGATAGTCGACGC
GTTACCCACAATAGAGAAATTAACTGATAAGATAACGGAGATGGATAAGAAAGGGCAAGTGGACTTCTTACTTTCATTAT
TTGATCAAACAGTTTCCATACTTGATGCAGTACAAAAGGCAGACCTAATAAACACACTCATATCCTTCGGAATGGACCAA
CTACCAAAAATACAAGCAATATGGCCAATACTAGAAAAACTAACAAGCGAAAGAGCTTTACAGTTATTATCACAGATAGA
CTTAGACTCTACACTTACAGCGTTAGAGAAATTATCTCCCGTAATAAAGAAGTTAACAGATGAAAAAGCGTTAAAGATAC
TTGATCAAATAGACTATGACTCTTTAATAGATAGTACTTCGAAATTAGTACCAATTCTTACGAAACTTGCAAATGAGAAG
ACTGTTAAGACTATTGAAGCCTTAGATATCGATATGTTGCTTAACCTAGCGTCGAAGATGGCTCCTACACTAAATAAACT
TGCATCATTAATGGATCAGATGTCTAGCAAAGGTCAAATTGACATGTTAGTTAACTTAATGGAACAAGGAATATCACTAC
TTGATGCAGTACAAAAGGCAGACCTAATAAACACACTCATATCCTTCGGAATGGACCAACTACCAAAAATACAAGCAATA
TGGCCAATACTAGAAAAACTAACAAGCGAAAGAACTCTAAATTTAATACAAAGTTTAGATCTGGATGCTATGTTTAACGC
ATTAGAAGCCTTAACACCGATCATGAAACAACTAACAAGCGATAAGGCAATAAAGATCATTCAGCAATTTGATATTGCGT
CTTCACTTAGTGCCCTAGAAGCAGCAATGCCACTATTAAAGAAACTAACAGATGAAAAGACTGTTAAAATAATATCGCAA
GTAGACGTTAATTCATTACTTATGTTAACAAATAAGTTGGTTGAAATGCAGAAGTCTGGTAGTTTAGATAGACTAATGCA
ACTATTAGAGATAATGTCTGATCCACAATTCGTTAACGGACTAGTTATGGTCATGGATAAGTTCTCTAAGGCGTTCAAAG
CTTGGGTTAATGATGTGCCAAACGTAAGGCCAGTTGGAACTATGGGATTATTGAGAATTACAAGCGATAAAGACGTTAGC
TATACTTTAGGATTAATGCTTGAATTAGCTAAAGAAATCGGAAAGAATTTTAAATCTTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CAGTATTTCTTTTAATTTTCCAAATGCACTTGGTGAGATAACTGCAAACATATTAAATATATATAAACATGCCGGATTAA
TTAATTTAGGGTATAGTAGT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AATAATTTTTTCTATTCTTTTTATCTCTCCTATATCCTTAGAAAATGTAAGTGGTTCATAAGAAGTTCTTCTACCTACTA
ATCCTTCTAAAAATGAAACC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 419; Mature: 418

Protein sequence:

>419_residues
MSISTVDPLEEILKPENLSRLSKIVDALPTIEKLTDKITEMDKKGQVDFLLSLFDQTVSILDAVQKADLINTLISFGMDQ
LPKIQAIWPILEKLTSERALQLLSQIDLDSTLTALEKLSPVIKKLTDEKALKILDQIDYDSLIDSTSKLVPILTKLANEK
TVKTIEALDIDMLLNLASKMAPTLNKLASLMDQMSSKGQIDMLVNLMEQGISLLDAVQKADLINTLISFGMDQLPKIQAI
WPILEKLTSERTLNLIQSLDLDAMFNALEALTPIMKQLTSDKAIKIIQQFDIASSLSALEAAMPLLKKLTDEKTVKIISQ
VDVNSLLMLTNKLVEMQKSGSLDRLMQLLEIMSDPQFVNGLVMVMDKFSKAFKAWVNDVPNVRPVGTMGLLRITSDKDVS
YTLGLMLELAKEIGKNFKS

Sequences:

>Translated_419_residues
MSISTVDPLEEILKPENLSRLSKIVDALPTIEKLTDKITEMDKKGQVDFLLSLFDQTVSILDAVQKADLINTLISFGMDQ
LPKIQAIWPILEKLTSERALQLLSQIDLDSTLTALEKLSPVIKKLTDEKALKILDQIDYDSLIDSTSKLVPILTKLANEK
TVKTIEALDIDMLLNLASKMAPTLNKLASLMDQMSSKGQIDMLVNLMEQGISLLDAVQKADLINTLISFGMDQLPKIQAI
WPILEKLTSERTLNLIQSLDLDAMFNALEALTPIMKQLTSDKAIKIIQQFDIASSLSALEAAMPLLKKLTDEKTVKIISQ
VDVNSLLMLTNKLVEMQKSGSLDRLMQLLEIMSDPQFVNGLVMVMDKFSKAFKAWVNDVPNVRPVGTMGLLRITSDKDVS
YTLGLMLELAKEIGKNFKS
>Mature_418_residues
SISTVDPLEEILKPENLSRLSKIVDALPTIEKLTDKITEMDKKGQVDFLLSLFDQTVSILDAVQKADLINTLISFGMDQL
PKIQAIWPILEKLTSERALQLLSQIDLDSTLTALEKLSPVIKKLTDEKALKILDQIDYDSLIDSTSKLVPILTKLANEKT
VKTIEALDIDMLLNLASKMAPTLNKLASLMDQMSSKGQIDMLVNLMEQGISLLDAVQKADLINTLISFGMDQLPKIQAIW
PILEKLTSERTLNLIQSLDLDAMFNALEALTPIMKQLTSDKAIKIIQQFDIASSLSALEAAMPLLKKLTDEKTVKIISQV
DVNSLLMLTNKLVEMQKSGSLDRLMQLLEIMSDPQFVNGLVMVMDKFSKAFKAWVNDVPNVRPVGTMGLLRITSDKDVSY
TLGLMLELAKEIGKNFKS

Specific function: Unknown

COG id: COG2427

COG function: function code S; Uncharacterized conserved protein

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 46589; Mature: 46458

Theoretical pI: Translated: 4.65; Mature: 4.65

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
5.0 %Met     (Translated Protein)
5.0 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
4.8 %Met     (Mature Protein)
4.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSISTVDPLEEILKPENLSRLSKIVDALPTIEKLTDKITEMDKKGQVDFLLSLFDQTVSI
CCCCCCCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
LDAVQKADLINTLISFGMDQLPKIQAIWPILEKLTSERALQLLSQIDLDSTLTALEKLSP
HHHHHHHHHHHHHHHHCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHH
VIKKLTDEKALKILDQIDYDSLIDSTSKLVPILTKLANEKTVKTIEALDIDMLLNLASKM
HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
APTLNKLASLMDQMSSKGQIDMLVNLMEQGISLLDAVQKADLINTLISFGMDQLPKIQAI
HHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHCCCHHHHH
WPILEKLTSERTLNLIQSLDLDAMFNALEALTPIMKQLTSDKAIKIIQQFDIASSLSALE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AAMPLLKKLTDEKTVKIISQVDVNSLLMLTNKLVEMQKSGSLDRLMQLLEIMSDPQFVNG
HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHH
LVMVMDKFSKAFKAWVNDVPNVRPVGTMGLLRITSDKDVSYTLGLMLELAKEIGKNFKS
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure 
SISTVDPLEEILKPENLSRLSKIVDALPTIEKLTDKITEMDKKGQVDFLLSLFDQTVSI
CCCCCCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
LDAVQKADLINTLISFGMDQLPKIQAIWPILEKLTSERALQLLSQIDLDSTLTALEKLSP
HHHHHHHHHHHHHHHHCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHH
VIKKLTDEKALKILDQIDYDSLIDSTSKLVPILTKLANEKTVKTIEALDIDMLLNLASKM
HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
APTLNKLASLMDQMSSKGQIDMLVNLMEQGISLLDAVQKADLINTLISFGMDQLPKIQAI
HHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHCCCHHHHH
WPILEKLTSERTLNLIQSLDLDAMFNALEALTPIMKQLTSDKAIKIIQQFDIASSLSALE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AAMPLLKKLTDEKTVKIISQVDVNSLLMLTNKLVEMQKSGSLDRLMQLLEIMSDPQFVNG
HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHH
LVMVMDKFSKAFKAWVNDVPNVRPVGTMGLLRITSDKDVSYTLGLMLELAKEIGKNFKS
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA