Definition Sulfolobus islandicus M.14.25 chromosome, complete genome.
Accession NC_012588
Length 2,608,832

Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 227826535

Identifier: 227826535

GI number: 227826535

Start: 110014

End: 111483

Strand: Direct

Name: 227826535

Synonym: M1425_0124

Alternate gene names: NA

Gene position: 110014-111483 (Clockwise)

Preceding gene: 227826534

Following gene: 227826536

Centisome position: 4.22

GC content: 31.9

Gene sequence:

>1470_bases
ATGATAAGGTTAGATAAAAATAACTTCATTCCCTGGATTTCTATAGTTTTTTTATTGTTTGCTTATTCCATAGGTACTGG
CTTGTATATAACCATACAACGTGTTACATACTATCCTATTTTTGAATCTAAAATTGTTTCAGTACTTCTCACGATATTCT
CATCATCATTAATGACTCTTTACAATTACAAGAGATATGTTTTTCTAGTTCCATTATCTCTATTGTCCTTCTTCTCTGTA
TCATTAACTCCCCTTATAATATCTATATTTATTTTACATGAGCTAAGGAAAGTTGATCGAACAGTTAGTATTATATTGCT
AATAATAGATGCGTCTATGTTATCATGGCTCACTCTACGTTTACTATTAGGCATTAATACTTACTTTTCCTTTCCTCTCA
TGATTTTAGAATCGGGAGCACCTACAGTAATTCCATTTATATGGTTTGCTGGAGTAGTATTCTCTGCTTATAAAAGAGAT
TTAAGTAGTAAGAGCCAACTATTCATCAATCCCTTAATTCCATTTATTGTAGCTCTGCTTATTTCTCTAGTCCCTTACTT
TCCTTTTATAAATCCTTATAAATTTCCAGAAACTGTTGATTTTAAGTATTATTACTCATGGCTTCTATCACCCACTTTAA
GTGGGTGGTTCTTTTACTCGAGGCCTCTGTATTTAATGCTTTTATACACATTATCATTTATTTTCAAGCCGTATACAGTA
GCGTACTATGAATTTGCATTTCTTTCTATTCTTTATGTATATTCTGCATATAAACTAGCCTCAGCGCTAGATAAATCTAT
AGCTTCCCTAGCAGCCTTATTAGCTTCGGTATCTCCTATGTTAATAACCTTTCTCTATTCTGGTTTGGAGGCTAACTTAT
TTTCAATTTCATTAATGTTTATCTCAATGTCGTATTTTCTCAAAAAAGAGAAATTAAGTTTAGCAATACTTTTTTCTTTA
CTATCGATGTTCTCTCATATATACGCTTGGGCTCAGTTATCTGCTAGTATAGCTCTATACTACCTTCTTAAATCAATTAG
ACTTAAATCTAGACCAGACAACTATACGCTAACTTATTTGTCCTTTTCAATTCCCTTTATAGCCATTGGATTCTTCCTAA
TTTTAAGTGGTGTTTTCCCCGTACCTATGGGATTATTAAACTATAATCAACTTATATACCAAATAACTGTAGTGAGTTGG
GGATCGAATAATGCTTTGCTTTACTTTTTGGTATCATCCTTTGGAAACAAGTATATTAAGGAAGAAGTTCTAGATTTCGT
GTATTCAATCTCGGTATTTGGTATTATTTTTCTGGCACCAGCTACCAATTTAATAATTGATTTGCCTCTTTTCATTCCTG
CAGCTTATACCATAAGAAATATGGATAGGCAGAGCGTGTCAGTATTATTACTTCTGAGTTTAATACTATGGGGTATTTAT
ATGAGTATTAATAGCGTTCCTATTCTATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GCTAAAATTTCCATTTTTGATACTAATATAAGGGTCCTAGTTTTAGGAGTTTTATTGACTATTTTATCATCCTTCGTTCT
AAAGATCATGGTGGGACGGT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAGTAAGATTTTTATTTTACTTAAGAAGAGATTTATTAACAATGAGGGATATATATCAGATACTATTAGTTGGCATTATC
TCTTTGTTAGTAATTATAAC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 489; Mature: 489

Protein sequence:

>489_residues
MIRLDKNNFIPWISIVFLLFAYSIGTGLYITIQRVTYYPIFESKIVSVLLTIFSSSLMTLYNYKRYVFLVPLSLLSFFSV
SLTPLIISIFILHELRKVDRTVSIILLIIDASMLSWLTLRLLLGINTYFSFPLMILESGAPTVIPFIWFAGVVFSAYKRD
LSSKSQLFINPLIPFIVALLISLVPYFPFINPYKFPETVDFKYYYSWLLSPTLSGWFFYSRPLYLMLLYTLSFIFKPYTV
AYYEFAFLSILYVYSAYKLASALDKSIASLAALLASVSPMLITFLYSGLEANLFSISLMFISMSYFLKKEKLSLAILFSL
LSMFSHIYAWAQLSASIALYYLLKSIRLKSRPDNYTLTYLSFSIPFIAIGFFLILSGVFPVPMGLLNYNQLIYQITVVSW
GSNNALLYFLVSSFGNKYIKEEVLDFVYSISVFGIIFLAPATNLIIDLPLFIPAAYTIRNMDRQSVSVLLLLSLILWGIY
MSINSVPIL

Sequences:

>Translated_489_residues
MIRLDKNNFIPWISIVFLLFAYSIGTGLYITIQRVTYYPIFESKIVSVLLTIFSSSLMTLYNYKRYVFLVPLSLLSFFSV
SLTPLIISIFILHELRKVDRTVSIILLIIDASMLSWLTLRLLLGINTYFSFPLMILESGAPTVIPFIWFAGVVFSAYKRD
LSSKSQLFINPLIPFIVALLISLVPYFPFINPYKFPETVDFKYYYSWLLSPTLSGWFFYSRPLYLMLLYTLSFIFKPYTV
AYYEFAFLSILYVYSAYKLASALDKSIASLAALLASVSPMLITFLYSGLEANLFSISLMFISMSYFLKKEKLSLAILFSL
LSMFSHIYAWAQLSASIALYYLLKSIRLKSRPDNYTLTYLSFSIPFIAIGFFLILSGVFPVPMGLLNYNQLIYQITVVSW
GSNNALLYFLVSSFGNKYIKEEVLDFVYSISVFGIIFLAPATNLIIDLPLFIPAAYTIRNMDRQSVSVLLLLSLILWGIY
MSINSVPIL
>Mature_489_residues
MIRLDKNNFIPWISIVFLLFAYSIGTGLYITIQRVTYYPIFESKIVSVLLTIFSSSLMTLYNYKRYVFLVPLSLLSFFSV
SLTPLIISIFILHELRKVDRTVSIILLIIDASMLSWLTLRLLLGINTYFSFPLMILESGAPTVIPFIWFAGVVFSAYKRD
LSSKSQLFINPLIPFIVALLISLVPYFPFINPYKFPETVDFKYYYSWLLSPTLSGWFFYSRPLYLMLLYTLSFIFKPYTV
AYYEFAFLSILYVYSAYKLASALDKSIASLAALLASVSPMLITFLYSGLEANLFSISLMFISMSYFLKKEKLSLAILFSL
LSMFSHIYAWAQLSASIALYYLLKSIRLKSRPDNYTLTYLSFSIPFIAIGFFLILSGVFPVPMGLLNYNQLIYQITVVSW
GSNNALLYFLVSSFGNKYIKEEVLDFVYSISVFGIIFLAPATNLIIDLPLFIPAAYTIRNMDRQSVSVLLLLSLILWGIY
MSINSVPIL

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 56009; Mature: 56009

Theoretical pI: Translated: 9.61; Mature: 9.61

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
2.5 %Met     (Translated Protein)
2.5 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
2.5 %Met     (Mature Protein)
2.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MIRLDKNNFIPWISIVFLLFAYSIGTGLYITIQRVTYYPIFESKIVSVLLTIFSSSLMTL
CEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YNYKRYVFLVPLSLLSFFSVSLTPLIISIFILHELRKVDRTVSIILLIIDASMLSWLTLR
HCCCHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLLGINTYFSFPLMILESGAPTVIPFIWFAGVVFSAYKRDLSSKSQLFINPLIPFIVALL
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHH
ISLVPYFPFINPYKFPETVDFKYYYSWLLSPTLSGWFFYSRPLYLMLLYTLSFIFKPYTV
HHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHH
AYYEFAFLSILYVYSAYKLASALDKSIASLAALLASVSPMLITFLYSGLEANLFSISLMF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH
ISMSYFLKKEKLSLAILFSLLSMFSHIYAWAQLSASIALYYLLKSIRLKSRPDNYTLTYL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEE
SFSIPFIAIGFFLILSGVFPVPMGLLNYNQLIYQITVVSWGSNNALLYFLVSSFGNKYIK
EHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEEECCCCEEEEEEHHHHCCHHHH
EEVLDFVYSISVFGIIFLAPATNLIIDLPLFIPAAYTIRNMDRQSVSVLLLLSLILWGIY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHEEECHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MSINSVPIL
HHCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MIRLDKNNFIPWISIVFLLFAYSIGTGLYITIQRVTYYPIFESKIVSVLLTIFSSSLMTL
CEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YNYKRYVFLVPLSLLSFFSVSLTPLIISIFILHELRKVDRTVSIILLIIDASMLSWLTLR
HCCCHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLLGINTYFSFPLMILESGAPTVIPFIWFAGVVFSAYKRDLSSKSQLFINPLIPFIVALL
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHH
ISLVPYFPFINPYKFPETVDFKYYYSWLLSPTLSGWFFYSRPLYLMLLYTLSFIFKPYTV
HHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHH
AYYEFAFLSILYVYSAYKLASALDKSIASLAALLASVSPMLITFLYSGLEANLFSISLMF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH
ISMSYFLKKEKLSLAILFSLLSMFSHIYAWAQLSASIALYYLLKSIRLKSRPDNYTLTYL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEE
SFSIPFIAIGFFLILSGVFPVPMGLLNYNQLIYQITVVSWGSNNALLYFLVSSFGNKYIK
EHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEEECCCCEEEEEEHHHHCCHHHH
EEVLDFVYSISVFGIIFLAPATNLIIDLPLFIPAAYTIRNMDRQSVSVLLLLSLILWGIY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHEEECHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MSINSVPIL
HHCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA