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The map label for this gene is ydeR [H]

Identifier: 227816130

GI number: 227816130

Start: 3232224

End: 3233435

Strand: Reverse

Name: ydeR [H]

Synonym: BAMEG_3556

Alternate gene names: 227816130

Gene position: 3233435-3232224 (Counterclockwise)

Preceding gene: 227816131

Following gene: 227816129

Centisome position: 61.82

GC content: 31.6

Gene sequence:

>1212_bases
TTGACTAAAAAGACAAATTTTCTAATATTCATTTTAGCAATTAGTTGTGGCTCACTTGTTGCGAATATTTATTATGCACA
GCCAATTGTACAATTCATTGCAAAAGACTTGAATATCGCTTCGGATTTATCTGGATTGCTCACTACTTTGACGCAAATTG
GATATGGATTGGGCTTGTTTTTTATCGTACCAATGGCAGATTTATTCAAAAGTAAGAAAATAATAGGTATTCTTATCGGA
CTCACTATTATTTCATTGATTGGTACGCTAATTTCGACAAATGGAATTGTTTTTTTAATACTAACAACTGTAATTGGTAT
TGGAGCCTGTGCAGCTCAAATGTTAGTTCCGCTAACAATGAGGATTGTACCTATTGAAGAGATGGGTAAATATGTGGGTA
AAGTAATGAGTGGTTTATTAATTGGGATTATGATTGCTCGCCCATTATCTATCGGAATAACTGAATGGTTCGGCTGGAGA
ATGGTATTTCTTTTTTCACTAATCATTCTAGTTGCTGTATTACTTTTACTTATAAAATTTTTGCCCAACTATGAAGTAGT
ATCAAATAGTAACATGTCATATTCAAATTTAATAGCTTCTATGGTAAAACTGCTACTACATACTTCTCCGTTACAACAAA
GAGCTTTTTATCACGCATGTTTATTTGCAACATTTAGTCTTTATTGGACAGTTATTCCAATCTTATTACGGTCAGAACCA
TTACATTTCTCAAATAATGAAATTGCATTGTTTGGATTTGCTGCAATAGCTGGAGCTTTATTAACTCCTACTATTGGTAA
AATCGCAGATAAAGGCTATATTTTTACAATGACTAATGTATCAATGGCGCTCGTACTATTATCTATCGTACTATTATTTT
TTGTTCAAGATCATTCACTTTTTAGTGTGATTGTAATACTTATTTCAGGTATTAGCATCGATATTGGTGTAGCAGGAAAT
TTATTATTAGGTCAAAAAGTTATCTTTAGTTTGAATCCTGAGATAAGAAACAGACTGAATGGATTATATATGACCATTTT
CTTTTTGGGAGGAGCCTTTGGTTCATGTATTGGAAGTTATACGTACTATAAATTTAATAGCGAAGTACCGTTACTCATTG
GAGCGGCTTTACCTTTAATCGCCTTATTTGTGCATTTAATAAAAAATAATGCGATACATTTATCAAAAACGAAAAATAAA
TATATGTCTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GCTAGCATATAATTTAGTTGATAAGGCTATTGCAGATCTATAGTCTTTCTTTTTTAATTGTTTTGGAACGAACGTTCCGA
AAGTGGAAGGAATGATAAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
CGTTATACAGTTTAGACAATGAAAGTACTTGAATGAAATAGTAGAACAAAACCATCGTTCTATAATTAAGCTTGTAAATA
GAACGGCCTCATTAAGTGTT

Product: putative transporter

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 403; Mature: 402

Protein sequence:

>403_residues
MTKKTNFLIFILAISCGSLVANIYYAQPIVQFIAKDLNIASDLSGLLTTLTQIGYGLGLFFIVPMADLFKSKKIIGILIG
LTIISLIGTLISTNGIVFLILTTVIGIGACAAQMLVPLTMRIVPIEEMGKYVGKVMSGLLIGIMIARPLSIGITEWFGWR
MVFLFSLIILVAVLLLLIKFLPNYEVVSNSNMSYSNLIASMVKLLLHTSPLQQRAFYHACLFATFSLYWTVIPILLRSEP
LHFSNNEIALFGFAAIAGALLTPTIGKIADKGYIFTMTNVSMALVLLSIVLLFFVQDHSLFSVIVILISGISIDIGVAGN
LLLGQKVIFSLNPEIRNRLNGLYMTIFFLGGAFGSCIGSYTYYKFNSEVPLLIGAALPLIALFVHLIKNNAIHLSKTKNK
YMS

Sequences:

>Translated_403_residues
MTKKTNFLIFILAISCGSLVANIYYAQPIVQFIAKDLNIASDLSGLLTTLTQIGYGLGLFFIVPMADLFKSKKIIGILIG
LTIISLIGTLISTNGIVFLILTTVIGIGACAAQMLVPLTMRIVPIEEMGKYVGKVMSGLLIGIMIARPLSIGITEWFGWR
MVFLFSLIILVAVLLLLIKFLPNYEVVSNSNMSYSNLIASMVKLLLHTSPLQQRAFYHACLFATFSLYWTVIPILLRSEP
LHFSNNEIALFGFAAIAGALLTPTIGKIADKGYIFTMTNVSMALVLLSIVLLFFVQDHSLFSVIVILISGISIDIGVAGN
LLLGQKVIFSLNPEIRNRLNGLYMTIFFLGGAFGSCIGSYTYYKFNSEVPLLIGAALPLIALFVHLIKNNAIHLSKTKNK
YMS
>Mature_402_residues
TKKTNFLIFILAISCGSLVANIYYAQPIVQFIAKDLNIASDLSGLLTTLTQIGYGLGLFFIVPMADLFKSKKIIGILIGL
TIISLIGTLISTNGIVFLILTTVIGIGACAAQMLVPLTMRIVPIEEMGKYVGKVMSGLLIGIMIARPLSIGITEWFGWRM
VFLFSLIILVAVLLLLIKFLPNYEVVSNSNMSYSNLIASMVKLLLHTSPLQQRAFYHACLFATFSLYWTVIPILLRSEPL
HFSNNEIALFGFAAIAGALLTPTIGKIADKGYIFTMTNVSMALVLLSIVLLFFVQDHSLFSVIVILISGISIDIGVAGNL
LLGQKVIFSLNPEIRNRLNGLYMTIFFLGGAFGSCIGSYTYYKFNSEVPLLIGAALPLIALFVHLIKNNAIHLSKTKNKY
MS

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the major facilitator superfamily [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR020846
- InterPro:   IPR011701
- InterPro:   IPR016196 [H]

Pfam domain/function: PF07690 MFS_1 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 44100; Mature: 43969

Theoretical pI: Translated: 9.79; Mature: 9.79

Prosite motif: PS00013 PROKAR_LIPOPROTEIN ; PS50850 MFS

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.0 %Cys     (Translated Protein)
3.5 %Met     (Translated Protein)
4.5 %Cys+Met (Translated Protein)
1.0 %Cys     (Mature Protein)
3.2 %Met     (Mature Protein)
4.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MTKKTNFLIFILAISCGSLVANIYYAQPIVQFIAKDLNIASDLSGLLTTLTQIGYGLGLF
CCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FIVPMADLFKSKKIIGILIGLTIISLIGTLISTNGIVFLILTTVIGIGACAAQMLVPLTM
HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RIVPIEEMGKYVGKVMSGLLIGIMIARPLSIGITEWFGWRMVFLFSLIILVAVLLLLIKF
HEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LPNYEVVSNSNMSYSNLIASMVKLLLHTSPLQQRAFYHACLFATFSLYWTVIPILLRSEP
CCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
LHFSNNEIALFGFAAIAGALLTPTIGKIADKGYIFTMTNVSMALVLLSIVLLFFVQDHSL
CCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH
FSVIVILISGISIDIGVAGNLLLGQKVIFSLNPEIRNRLNGLYMTIFFLGGAFGSCIGSY
HHHHHHHHHCCEEEECCCCCHHHCCHHHEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
TYYKFNSEVPLLIGAALPLIALFVHLIKNNAIHLSKTKNKYMS
EEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCHHHCCC
>Mature Secondary Structure 
TKKTNFLIFILAISCGSLVANIYYAQPIVQFIAKDLNIASDLSGLLTTLTQIGYGLGLF
CCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FIVPMADLFKSKKIIGILIGLTIISLIGTLISTNGIVFLILTTVIGIGACAAQMLVPLTM
HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RIVPIEEMGKYVGKVMSGLLIGIMIARPLSIGITEWFGWRMVFLFSLIILVAVLLLLIKF
HEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LPNYEVVSNSNMSYSNLIASMVKLLLHTSPLQQRAFYHACLFATFSLYWTVIPILLRSEP
CCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
LHFSNNEIALFGFAAIAGALLTPTIGKIADKGYIFTMTNVSMALVLLSIVLLFFVQDHSL
CCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH
FSVIVILISGISIDIGVAGNLLLGQKVIFSLNPEIRNRLNGLYMTIFFLGGAFGSCIGSY
HHHHHHHHHCCEEEECCCCCHHHCCHHHEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
TYYKFNSEVPLLIGAALPLIALFVHLIKNNAIHLSKTKNKYMS
EEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9384377 [H]