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The map label for this gene is yfiS [H]

Identifier: 227814522

GI number: 227814522

Start: 1753903

End: 1755207

Strand: Reverse

Name: yfiS [H]

Synonym: BAMEG_1930

Alternate gene names: 227814522

Gene position: 1755207-1753903 (Counterclockwise)

Preceding gene: 227814523

Following gene: 227814520

Centisome position: 33.56

GC content: 30.88

Gene sequence:

>1305_bases
ATGGCAAGTTTACGGTTACATATAGAAAATAAAAAAAGCAACCAAGAACTAAGAAATATTTGTTTATATGCAATTGCAAA
AACCGTATCAATATTCGGTAGCTCTATTTATAGTTTCGCCTTAGGATTGTATGTATTACAAATAACCGGATCGGCTTTAA
ATTTCGCGATTACGCTTATTTTAGGAACGATTCCAATGATTGTTATGAATCCATTTGCCGGTGTAATTGCTGATAAGGTT
GATAAAAAGAAACTCGTCGTTTGTATGGATGTACTAAGCGGATGCTTATTAATAACTGTTTATATATTAAGCGGCTATTA
TGGGTTAAACTTATTCATCATTTATACTACTACCTTTCTTATGACAGTATTTACAACATTTTTTGGAATAGGTTTAGAGG
CTGCAAAACCAAATATCGTCTCTAAAGAGAGACTAATGAGTCTTAACTCTATAAGTAAAATTATCGACTCTATATCTTTA
ATTCTAGGGCCTATGTTAGGGGGCATTGTTTTTGCAGTCTTTGATATGAAAACTTTTATAATTATTAACGGTATTTCATT
TGTCCTTTCGGCTATATCCATATTGTTTATCAACTTTAAATTGTGCGAGCAATACATAAATAAGGAAAGTTCAATAAGGG
AAATTAATTTTATTAAAGATATAAAGGAGGGATACTCTTACTTAATGGAGCGGGAAAGCTTAAAAAATACGTTTCGTATT
TTAATTTCACTTAATTTTTTCCTAGGATTTGCTGTAACTGTTCCATTGCCATACATTATGAATACAGTTCTCAATCTTAG
TTCTAAACATTTTGGTTTGATCCAAGGGACTTTTCCAATAGGTATGATAGTTGGTGCAATAATAGTAAAAAAGATAACGA
ATCGTTTTTCTTATTCCTATCTATTGAAAAAAATAAGTTTTATGGTGGCAATTTTTATGATAGTTTCAGGTGCACCTGTT
CTATTTAAAAGTATTGAAGTGAATAAAATTGTATTTGTGACTATGTACTGCGCCATTATGTTCTTTTTAGGGTTAATGAT
AGCATTAATTGATATCCCTTTAATTTATTTTATGCAAAGAGAGATTCCAGATGAATATAGGGGCAGAGTACTTAGTATTG
GATTAAGTTTAGGTAAAATGATGCAACCGATAGCACTGGCATTATCAGGTCTATTATTAAATCATATTCCAGCCTACACG
CTTCCAATTGGAGGAGGGATCGTATTTCTTATTTTGAATCAGGCTTATTCAAGTAAATTGAATTTAGAAATTCATTCAAA
AGGGTATAGTGTTGAACGTAATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTTATTTCCCCTTAAAATTATTCAAATCGTCCATATTGCGATTGGGTTGACCCAAGAACTTACAATGTACGTAATACAAA
ATTAGACAGGGGGAAAAGTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATAATATTGAAATAGCGCAGGATCATTATCCTGCACTTATCTATCGTAATTCTACTGTTTTTCTAATAACAATCTTATCA
ATATCATCTTCTTCATCACC

Product: putative permease

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 434; Mature: 433

Protein sequence:

>434_residues
MASLRLHIENKKSNQELRNICLYAIAKTVSIFGSSIYSFALGLYVLQITGSALNFAITLILGTIPMIVMNPFAGVIADKV
DKKKLVVCMDVLSGCLLITVYILSGYYGLNLFIIYTTTFLMTVFTTFFGIGLEAAKPNIVSKERLMSLNSISKIIDSISL
ILGPMLGGIVFAVFDMKTFIIINGISFVLSAISILFINFKLCEQYINKESSIREINFIKDIKEGYSYLMERESLKNTFRI
LISLNFFLGFAVTVPLPYIMNTVLNLSSKHFGLIQGTFPIGMIVGAIIVKKITNRFSYSYLLKKISFMVAIFMIVSGAPV
LFKSIEVNKIVFVTMYCAIMFFLGLMIALIDIPLIYFMQREIPDEYRGRVLSIGLSLGKMMQPIALALSGLLLNHIPAYT
LPIGGGIVFLILNQAYSSKLNLEIHSKGYSVERN

Sequences:

>Translated_434_residues
MASLRLHIENKKSNQELRNICLYAIAKTVSIFGSSIYSFALGLYVLQITGSALNFAITLILGTIPMIVMNPFAGVIADKV
DKKKLVVCMDVLSGCLLITVYILSGYYGLNLFIIYTTTFLMTVFTTFFGIGLEAAKPNIVSKERLMSLNSISKIIDSISL
ILGPMLGGIVFAVFDMKTFIIINGISFVLSAISILFINFKLCEQYINKESSIREINFIKDIKEGYSYLMERESLKNTFRI
LISLNFFLGFAVTVPLPYIMNTVLNLSSKHFGLIQGTFPIGMIVGAIIVKKITNRFSYSYLLKKISFMVAIFMIVSGAPV
LFKSIEVNKIVFVTMYCAIMFFLGLMIALIDIPLIYFMQREIPDEYRGRVLSIGLSLGKMMQPIALALSGLLLNHIPAYT
LPIGGGIVFLILNQAYSSKLNLEIHSKGYSVERN
>Mature_433_residues
ASLRLHIENKKSNQELRNICLYAIAKTVSIFGSSIYSFALGLYVLQITGSALNFAITLILGTIPMIVMNPFAGVIADKVD
KKKLVVCMDVLSGCLLITVYILSGYYGLNLFIIYTTTFLMTVFTTFFGIGLEAAKPNIVSKERLMSLNSISKIIDSISLI
LGPMLGGIVFAVFDMKTFIIINGISFVLSAISILFINFKLCEQYINKESSIREINFIKDIKEGYSYLMERESLKNTFRIL
ISLNFFLGFAVTVPLPYIMNTVLNLSSKHFGLIQGTFPIGMIVGAIIVKKITNRFSYSYLLKKISFMVAIFMIVSGAPVL
FKSIEVNKIVFVTMYCAIMFFLGLMIALIDIPLIYFMQREIPDEYRGRVLSIGLSLGKMMQPIALALSGLLLNHIPAYTL
PIGGGIVFLILNQAYSSKLNLEIHSKGYSVERN

Specific function: Unknown

COG id: COG0477

COG function: function code GEPR; Permeases of the major facilitator superfamily

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the major facilitator superfamily. TCR/tet family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR020846
- InterPro:   IPR011701
- InterPro:   IPR016196 [H]

Pfam domain/function: PF07690 MFS_1 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 48363; Mature: 48232

Theoretical pI: Translated: 9.77; Mature: 9.77

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.2 %Cys     (Translated Protein)
4.4 %Met     (Translated Protein)
5.5 %Cys+Met (Translated Protein)
1.2 %Cys     (Mature Protein)
4.2 %Met     (Mature Protein)
5.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MASLRLHIENKKSNQELRNICLYAIAKTVSIFGSSIYSFALGLYVLQITGSALNFAITLI
CCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHH
LGTIPMIVMNPFAGVIADKVDKKKLVVCMDVLSGCLLITVYILSGYYGLNLFIIYTTTFL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHH
MTVFTTFFGIGLEAAKPNIVSKERLMSLNSISKIIDSISLILGPMLGGIVFAVFDMKTFI
HHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IINGISFVLSAISILFINFKLCEQYINKESSIREINFIKDIKEGYSYLMERESLKNTFRI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LISLNFFLGFAVTVPLPYIMNTVLNLSSKHFGLIQGTFPIGMIVGAIIVKKITNRFSYSY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLKKISFMVAIFMIVSGAPVLFKSIEVNKIVFVTMYCAIMFFLGLMIALIDIPLIYFMQR
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EIPDEYRGRVLSIGLSLGKMMQPIALALSGLLLNHIPAYTLPIGGGIVFLILNQAYSSKL
HCCHHHCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCEEEEEEHHHHCCEE
NLEIHSKGYSVERN
EEEEECCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure 
ASLRLHIENKKSNQELRNICLYAIAKTVSIFGSSIYSFALGLYVLQITGSALNFAITLI
CCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHH
LGTIPMIVMNPFAGVIADKVDKKKLVVCMDVLSGCLLITVYILSGYYGLNLFIIYTTTFL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHH
MTVFTTFFGIGLEAAKPNIVSKERLMSLNSISKIIDSISLILGPMLGGIVFAVFDMKTFI
HHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IINGISFVLSAISILFINFKLCEQYINKESSIREINFIKDIKEGYSYLMERESLKNTFRI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LISLNFFLGFAVTVPLPYIMNTVLNLSSKHFGLIQGTFPIGMIVGAIIVKKITNRFSYSY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLKKISFMVAIFMIVSGAPVLFKSIEVNKIVFVTMYCAIMFFLGLMIALIDIPLIYFMQR
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EIPDEYRGRVLSIGLSLGKMMQPIALALSGLLLNHIPAYTLPIGGGIVFLILNQAYSSKL
HCCHHHCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCEEEEEEHHHHCCEE
NLEIHSKGYSVERN
EEEEECCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8946165; 9384377 [H]