Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is yhjX [H]

Identifier: 227814505

GI number: 227814505

Start: 1741091

End: 1742299

Strand: Reverse

Name: yhjX [H]

Synonym: BAMEG_1913

Alternate gene names: 227814505

Gene position: 1742299-1741091 (Counterclockwise)

Preceding gene: 227814506

Following gene: 227814504

Centisome position: 33.31

GC content: 34.99

Gene sequence:

>1209_bases
ATGAAACAAACTTCTATAAATCCGTTACTAATTGTTCTAGGTACAATCATTGTTCAAATTGGCCTTGGAACAATTTATAC
ATGGAGTTTATTTAATCAGCCCCTTGTAAGTAAGTTTGGATGGAACCTTAATTCAGTTGCTATAACTTTCTCCATTACAA
GCTTCTCTTTATCATTTTCAACATTATTTGCAGGAAAGTTACAGCAAAAATTAGGGCTTCGAAAACTCATCGCTACTGCA
GGGATTGTGCTGGGACTCGGTTTAATACTAAGTTCACAAGTTTCCTCCTTACCATTACTATATTTATTAGCTGGTGTAGT
AGTTGGTTATGCCGATGGAACTGCTTATATCACATCACTATCTAATTTAATTAAATGGTTTCCGAATCGGAAAGGGCTTA
TTTCAGGTATATCTGTATCAGCATATGGAATGGGCAGCTTAATCTTTAGATATATAAACGGAAATCTTATCGATAATCTT
GGTGTATCACAAGCATTCTTATATTGGGGTATTATCGTATTACTTTTAGTGTTAATTGGATCGTTCTTCTTACGTGAAGC
GATTGTAAGTAATGCTGTAACTGAAACATTACACAATGACTATACTCCGCGTGAAATGATGGGAACGAAACAAGTATATC
TCTTGTTTTTTATGTTATTTACATCGTGTATGGGTGGTCTGTATTTAATCGGTATGGTAAAAGATATTGGGGTACAACTC
GTTGGACTTAGTACAGCAACTGCCGCTAACGCTGTTGCAATGATTGCAATTTTTAATACAGTAGGTCGTATTGTTCTTGG
AACGTTATCAGATAAAATAGGTCGAATGAAAATTGTCTCTGCAACGTTTATTATTATAGGTTTGTCAGTCTTTACTTTAA
GTTTTATTCCGCTAAATTACGGAATCTATTTTGCTTGTGTAGCAAGTGTCGCCTTTTGCTTCGGTGGTAATATAACTATA
TTCCCAGCTATTGTCGGAGATTTTTTCGGATTAAAAAACCATAGTACAAATTACGGGATTGTCTACCAAGGTTTTGGATT
TGGTGCGCTTGCAGGATCATTTATTGGAGCGATACTCGGGGGATTTCAACCAACTTTCATTATAATCGGTGTTTTAAGTG
TTATTTCCTTCATTATTTCAATATTAATCCGTCCACCAAATGCAGAGAAGAAAAATGAACTAAAACATTTACATCGGAAA
GTAGCTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CATGAATTCAATTTCCATTTTTCATGCAGTATCTTGCTTTTTATGATGGTTATACTAACTGTGAAAATTCATGTCACGAT
AAAAGAAGGGGACAGTTAGT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TACAAAAAAGAGTCCTAATATAGGGCTCTTTTTTGTGTAGAGAATAGAGTTATTTAATTTAAAGTGAAATGATTTGAGAA
GCAATAAAGTTGTTTATTTC

Product: putative oxalate:formate antiporter

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 402; Mature: 402

Protein sequence:

>402_residues
MKQTSINPLLIVLGTIIVQIGLGTIYTWSLFNQPLVSKFGWNLNSVAITFSITSFSLSFSTLFAGKLQQKLGLRKLIATA
GIVLGLGLILSSQVSSLPLLYLLAGVVVGYADGTAYITSLSNLIKWFPNRKGLISGISVSAYGMGSLIFRYINGNLIDNL
GVSQAFLYWGIIVLLLVLIGSFFLREAIVSNAVTETLHNDYTPREMMGTKQVYLLFFMLFTSCMGGLYLIGMVKDIGVQL
VGLSTATAANAVAMIAIFNTVGRIVLGTLSDKIGRMKIVSATFIIIGLSVFTLSFIPLNYGIYFACVASVAFCFGGNITI
FPAIVGDFFGLKNHSTNYGIVYQGFGFGALAGSFIGAILGGFQPTFIIIGVLSVISFIISILIRPPNAEKKNELKHLHRK
VA

Sequences:

>Translated_402_residues
MKQTSINPLLIVLGTIIVQIGLGTIYTWSLFNQPLVSKFGWNLNSVAITFSITSFSLSFSTLFAGKLQQKLGLRKLIATA
GIVLGLGLILSSQVSSLPLLYLLAGVVVGYADGTAYITSLSNLIKWFPNRKGLISGISVSAYGMGSLIFRYINGNLIDNL
GVSQAFLYWGIIVLLLVLIGSFFLREAIVSNAVTETLHNDYTPREMMGTKQVYLLFFMLFTSCMGGLYLIGMVKDIGVQL
VGLSTATAANAVAMIAIFNTVGRIVLGTLSDKIGRMKIVSATFIIIGLSVFTLSFIPLNYGIYFACVASVAFCFGGNITI
FPAIVGDFFGLKNHSTNYGIVYQGFGFGALAGSFIGAILGGFQPTFIIIGVLSVISFIISILIRPPNAEKKNELKHLHRK
VA
>Mature_402_residues
MKQTSINPLLIVLGTIIVQIGLGTIYTWSLFNQPLVSKFGWNLNSVAITFSITSFSLSFSTLFAGKLQQKLGLRKLIATA
GIVLGLGLILSSQVSSLPLLYLLAGVVVGYADGTAYITSLSNLIKWFPNRKGLISGISVSAYGMGSLIFRYINGNLIDNL
GVSQAFLYWGIIVLLLVLIGSFFLREAIVSNAVTETLHNDYTPREMMGTKQVYLLFFMLFTSCMGGLYLIGMVKDIGVQL
VGLSTATAANAVAMIAIFNTVGRIVLGTLSDKIGRMKIVSATFIIIGLSVFTLSFIPLNYGIYFACVASVAFCFGGNITI
FPAIVGDFFGLKNHSTNYGIVYQGFGFGALAGSFIGAILGGFQPTFIIIGVLSVISFIISILIRPPNAEKKNELKHLHRK
VA

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1789969, Length=391, Percent_Identity=43.2225063938619, Blast_Score=322, Evalue=2e-89,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR020846
- InterPro:   IPR011701
- InterPro:   IPR016196
- InterPro:   IPR004741 [H]

Pfam domain/function: PF07690 MFS_1 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 43275; Mature: 43275

Theoretical pI: Translated: 10.13; Mature: 10.13

Prosite motif: PS50850 MFS

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
2.2 %Met     (Translated Protein)
3.0 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
2.2 %Met     (Mature Protein)
3.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKQTSINPLLIVLGTIIVQIGLGTIYTWSLFNQPLVSKFGWNLNSVAITFSITSFSLSFS
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHEEHHHHCCHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEEEHHHHH
TLFAGKLQQKLGLRKLIATAGIVLGLGLILSSQVSSLPLLYLLAGVVVGYADGTAYITSL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH
SNLIKWFPNRKGLISGISVSAYGMGSLIFRYINGNLIDNLGVSQAFLYWGIIVLLLVLIG
HHHHHHCCCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHCCCHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SFFLREAIVSNAVTETLHNDYTPREMMGTKQVYLLFFMLFTSCMGGLYLIGMVKDIGVQL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEE
VGLSTATAANAVAMIAIFNTVGRIVLGTLSDKIGRMKIVSATFIIIGLSVFTLSFIPLNY
EECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GIYFACVASVAFCFGGNITIFPAIVGDFFGLKNHSTNYGIVYQGFGFGALAGSFIGAILG
HHHHHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHC
GFQPTFIIIGVLSVISFIISILIRPPNAEKKNELKHLHRKVA
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MKQTSINPLLIVLGTIIVQIGLGTIYTWSLFNQPLVSKFGWNLNSVAITFSITSFSLSFS
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHEEHHHHCCHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEEEHHHHH
TLFAGKLQQKLGLRKLIATAGIVLGLGLILSSQVSSLPLLYLLAGVVVGYADGTAYITSL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH
SNLIKWFPNRKGLISGISVSAYGMGSLIFRYINGNLIDNLGVSQAFLYWGIIVLLLVLIG
HHHHHHCCCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHCCCHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SFFLREAIVSNAVTETLHNDYTPREMMGTKQVYLLFFMLFTSCMGGLYLIGMVKDIGVQL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEE
VGLSTATAANAVAMIAIFNTVGRIVLGTLSDKIGRMKIVSATFIIIGLSVFTLSFIPLNY
EECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GIYFACVASVAFCFGGNITIFPAIVGDFFGLKNHSTNYGIVYQGFGFGALAGSFIGAILG
HHHHHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHC
GFQPTFIIIGVLSVISFIISILIRPPNAEKKNELKHLHRKVA
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8041620; 9278503 [H]