| Definition | Bacillus anthracis str. CDC 684, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_012581 |
| Length | 5,230,115 |
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The map label for this gene is 227813818
Identifier: 227813818
GI number: 227813818
Start: 1107356
End: 1109845
Strand: Direct
Name: 227813818
Synonym: BAMEG_1223
Alternate gene names: NA
Gene position: 1107356-1109845 (Clockwise)
Preceding gene: 227813817
Following gene: 227813819
Centisome position: 21.17
GC content: 29.48
Gene sequence:
>2490_bases ATGATAAAATCAGTACGAGGATTAAGTTTACGCTTTTTTAAGACGAATAAATTCACTGCTATTTCCTCTATAGTTAGCGT TATGTTGGCTGTTTCTCTAATTGTTACGATGATTGTATTTTCGAGTCATGCGAAACAGTCTGTTATAAATGAAGTGAAAA ATGTATACGGAGATATGGATTTATCTGTCGGATATAACCCTGATCAAAATAAGTTGATGGATAAATCTTTACTGCAAAAT ATTAAGGAACAAGAAAATGTTGAATACATGTCAAAAGTATTAGTAAATCATTTGCAAGTAAATAAATTGAATACAGCTAT TTATACAGTAGGTGTTCAAAACGATTCATTATCTAAAAGTCGATATCATTTTTCTAAAAATATATCAAATGAGGAAGTAA CATTAAATGATGGATTAGCAGAAACTTTACAAGTAAAAGTTGGGGAAAAGATTAAAATCGAAAATAAATCATATGTAGTA AAAGAAGTGTTGCCTGATATAGAAGCTGGAGGTTCAGCTCCAGATATACTTATTTTATCTGAAGGTGCGGTGAAACAGCA CATATATGAAAAAACGGGTAAACACAATGAAGCTACTTATTTGTTAATAAAAGCAAAAGAGAATGCAGATGTACTAGCAT TGTCTAGTGAAATTCATAAAATAGACAAAGAATTAAGAATCGATATTGCGGAGGAAGACGAGTTTTTAAAAAGTAATTTA GCATCATTACATATTTTTATAATCGTTTTATCTACATTAATACTTATTGTTACTGCGTTATTGTTGGTGTCTAATTTTGA AGTGTTTTTATATAAATATAAAAGTCAATTTGCTATTATGCGATCAATGGGAGCAACAACGAAACAAATGTTTAAAGTTA TATTTATTCAATGTAGTGTAATCAATTTCTTTGGTGGAATATCAGATTTGTTACTAGCTGTAATAAGTAAACGTTTTTTA CAAAGTTGCCTAGAGCATTTATTTGCTTTTCAAATTAATTCAATGAATTTTGACTATAAAATAGCAATTGTAACAGTGAT TTTTAGTATCTTTTTTATTGAACTGTTTATGTTATATCCGTCATACAGAAGTTCGAAAATATTGCCAGTAAAGCTTATGC GGGAGAATGAAGAATCCGATTTTTCTAATAAAAAAATACGCAGTATTATGGGGAAATTCCTTTTAATGAGTAGCTTATTT TTAACTGTTTTAGGTGGGTTTGTAGCAAATAAGGGAGATACGCAGGCAATAGTGATATTAATAGGAGCTATATTTCTCGT TTTAGGAGTATATATTTTATTTCCGACTTATCTCTCTTCGATATTAATAGCATGTCTACCTATAATGAAAAAAATATTTG GAAGGAATACATTTGTTGCTATTAAAAATGTAATTCCGCAAGTAAGAAAAAATACATTTGTTATCTTAATGATAAGTACA ATGATGGTGATAGTTGTCTTCGGATCCACTATATTTAAAACGATGCAAAAAAATAATGAAAGATATTTACAACGAGAATT TCCAACACATATTGTTGTGGAAAATCGTTTGAATAATGATTCAACCATTTCCTCACCTCATACACAAAATATATTTAAAG AAATAAGTAGTGTAAAAGGAGCTAGTACGATTAGTACGAACTCACTCGCAGAATTAAAGCAAGGTGAAAAATATATTACT TTTGACTATAATTTAGGTGATGTAAAGGAAATGGAAAAGCAAGGATTACTGCCAAAACTACCTGCAAACTTCGAGAATAG TATAATTGTTACAGAAGAGTTAGCGGGGCGATATAAACTTCATGTAGGCGATATCATTCAATTGGGTCTATTTTCAGAAC AGGAACAAAAAGTTAGACCGATTGGTAAGGTAGAAGTTGGATTAATTGTTAACGAACTACCAAATTCGCCTTCGGTACTC ATGGATTGGAGTAATGTAACATATAAACAAGATTATACAGTTTTTGAGCGTGCATTTATTAGTTCAAATAATGAGAGAGA GACGTTGAAGCAATTAAAGAAAGTGAAAGATCAATATCCACAATTAAAAATAAGTAGTTATAATCAATCATTAAAACAAT CTAATTTAATGTTTCAGCAAAGGTGGTCCATTTTCATCGTTGTTATTGTAGTGATTTTGTTTAGTGTGACATTAGGGGTA TGTAATACACTTATAAATAATATTCAATCTAAAAGAAAAGAGTTTGCTATTTTACGAGCAATAACAGTTAAGAAAAAAGG GGTTGTACAAATTATTTTGACGCAAGTTAATTTATATGTACTTATTGGAATCGTACTAGGGGCTGTTATAGGAGCATTAT TAACCTATATGGTAAGTATAATAGATCGTACACCTTTATTTTTTGATTTCAAACTTATCTTAAGGGTAATAGCGGGGATG TTTGGAATAGTCTTTATTATTTTTATACCTTTTGCTAATAGAATAGGAAAAAGGGACATTGTAGAAGAGTTAAATAAGGA TAATAAATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TTCATAATGGAGAAGTTGTTGATGATTATACGTGTTCTCATGGAGTAAATGATATGAATATTATTTTAGATAAATTTAAA AAATTAATGGAGAAATCAAA
Downstream 100 bases:
>100_bases AAGAGGTTAACCCAAGTTGCTATTCAGCTACTTTTGGGTCAATCTCTCTTTTTATTAAAAGTTGATTTTCATATTGGTGT GCTCATTCATAAATGTATAG
Product: ABC transporter, permease protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 829; Mature: 829
Protein sequence:
>829_residues MIKSVRGLSLRFFKTNKFTAISSIVSVMLAVSLIVTMIVFSSHAKQSVINEVKNVYGDMDLSVGYNPDQNKLMDKSLLQN IKEQENVEYMSKVLVNHLQVNKLNTAIYTVGVQNDSLSKSRYHFSKNISNEEVTLNDGLAETLQVKVGEKIKIENKSYVV KEVLPDIEAGGSAPDILILSEGAVKQHIYEKTGKHNEATYLLIKAKENADVLALSSEIHKIDKELRIDIAEEDEFLKSNL ASLHIFIIVLSTLILIVTALLLVSNFEVFLYKYKSQFAIMRSMGATTKQMFKVIFIQCSVINFFGGISDLLLAVISKRFL QSCLEHLFAFQINSMNFDYKIAIVTVIFSIFFIELFMLYPSYRSSKILPVKLMRENEESDFSNKKIRSIMGKFLLMSSLF LTVLGGFVANKGDTQAIVILIGAIFLVLGVYILFPTYLSSILIACLPIMKKIFGRNTFVAIKNVIPQVRKNTFVILMIST MMVIVVFGSTIFKTMQKNNERYLQREFPTHIVVENRLNNDSTISSPHTQNIFKEISSVKGASTISTNSLAELKQGEKYIT FDYNLGDVKEMEKQGLLPKLPANFENSIIVTEELAGRYKLHVGDIIQLGLFSEQEQKVRPIGKVEVGLIVNELPNSPSVL MDWSNVTYKQDYTVFERAFISSNNERETLKQLKKVKDQYPQLKISSYNQSLKQSNLMFQQRWSIFIVVIVVILFSVTLGV CNTLINNIQSKRKEFAILRAITVKKKGVVQIILTQVNLYVLIGIVLGAVIGALLTYMVSIIDRTPLFFDFKLILRVIAGM FGIVFIIFIPFANRIGKRDIVEELNKDNK
Sequences:
>Translated_829_residues MIKSVRGLSLRFFKTNKFTAISSIVSVMLAVSLIVTMIVFSSHAKQSVINEVKNVYGDMDLSVGYNPDQNKLMDKSLLQN IKEQENVEYMSKVLVNHLQVNKLNTAIYTVGVQNDSLSKSRYHFSKNISNEEVTLNDGLAETLQVKVGEKIKIENKSYVV KEVLPDIEAGGSAPDILILSEGAVKQHIYEKTGKHNEATYLLIKAKENADVLALSSEIHKIDKELRIDIAEEDEFLKSNL ASLHIFIIVLSTLILIVTALLLVSNFEVFLYKYKSQFAIMRSMGATTKQMFKVIFIQCSVINFFGGISDLLLAVISKRFL QSCLEHLFAFQINSMNFDYKIAIVTVIFSIFFIELFMLYPSYRSSKILPVKLMRENEESDFSNKKIRSIMGKFLLMSSLF LTVLGGFVANKGDTQAIVILIGAIFLVLGVYILFPTYLSSILIACLPIMKKIFGRNTFVAIKNVIPQVRKNTFVILMIST MMVIVVFGSTIFKTMQKNNERYLQREFPTHIVVENRLNNDSTISSPHTQNIFKEISSVKGASTISTNSLAELKQGEKYIT FDYNLGDVKEMEKQGLLPKLPANFENSIIVTEELAGRYKLHVGDIIQLGLFSEQEQKVRPIGKVEVGLIVNELPNSPSVL MDWSNVTYKQDYTVFERAFISSNNERETLKQLKKVKDQYPQLKISSYNQSLKQSNLMFQQRWSIFIVVIVVILFSVTLGV CNTLINNIQSKRKEFAILRAITVKKKGVVQIILTQVNLYVLIGIVLGAVIGALLTYMVSIIDRTPLFFDFKLILRVIAGM FGIVFIIFIPFANRIGKRDIVEELNKDNK >Mature_829_residues MIKSVRGLSLRFFKTNKFTAISSIVSVMLAVSLIVTMIVFSSHAKQSVINEVKNVYGDMDLSVGYNPDQNKLMDKSLLQN IKEQENVEYMSKVLVNHLQVNKLNTAIYTVGVQNDSLSKSRYHFSKNISNEEVTLNDGLAETLQVKVGEKIKIENKSYVV KEVLPDIEAGGSAPDILILSEGAVKQHIYEKTGKHNEATYLLIKAKENADVLALSSEIHKIDKELRIDIAEEDEFLKSNL ASLHIFIIVLSTLILIVTALLLVSNFEVFLYKYKSQFAIMRSMGATTKQMFKVIFIQCSVINFFGGISDLLLAVISKRFL QSCLEHLFAFQINSMNFDYKIAIVTVIFSIFFIELFMLYPSYRSSKILPVKLMRENEESDFSNKKIRSIMGKFLLMSSLF LTVLGGFVANKGDTQAIVILIGAIFLVLGVYILFPTYLSSILIACLPIMKKIFGRNTFVAIKNVIPQVRKNTFVILMIST MMVIVVFGSTIFKTMQKNNERYLQREFPTHIVVENRLNNDSTISSPHTQNIFKEISSVKGASTISTNSLAELKQGEKYIT FDYNLGDVKEMEKQGLLPKLPANFENSIIVTEELAGRYKLHVGDIIQLGLFSEQEQKVRPIGKVEVGLIVNELPNSPSVL MDWSNVTYKQDYTVFERAFISSNNERETLKQLKKVKDQYPQLKISSYNQSLKQSNLMFQQRWSIFIVVIVVILFSVTLGV CNTLINNIQSKRKEFAILRAITVKKKGVVQIILTQVNLYVLIGIVLGAVIGALLTYMVSIIDRTPLFFDFKLILRVIAGM FGIVFIIFIPFANRIGKRDIVEELNKDNK
Specific function: Unknown
COG id: COG0577
COG function: function code V; ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the ABC-4 integral membrane protein family [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR003838 [H]
Pfam domain/function: PF02687 FtsX [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 93815; Mature: 93815
Theoretical pI: Translated: 9.82; Mature: 9.82
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.5 %Cys (Translated Protein) 2.9 %Met (Translated Protein) 3.4 %Cys+Met (Translated Protein) 0.5 %Cys (Mature Protein) 2.9 %Met (Mature Protein) 3.4 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MIKSVRGLSLRFFKTNKFTAISSIVSVMLAVSLIVTMIVFSSHAKQSVINEVKNVYGDMD CCCCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC LSVGYNPDQNKLMDKSLLQNIKEQENVEYMSKVLVNHLQVNKLNTAIYTVGVQNDSLSKS EECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEECEEEEEEEECCCCCCHH RYHFSKNISNEEVTLNDGLAETLQVKVGEKIKIENKSYVVKEVLPDIEAGGSAPDILILS HHHHHCCCCCCEEEECCCHHHHHHHCCCCEEEECCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEC EGAVKQHIYEKTGKHNEATYLLIKAKENADVLALSSEIHKIDKELRIDIAEEDEFLKSNL CCHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEECCCCCEEEEHHHHHHHHHHHEEEECCHHHHHHHHH ASLHIFIIVLSTLILIVTALLLVSNFEVFLYKYKSQFAIMRSMGATTKQMFKVIFIQCSV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHH INFFGGISDLLLAVISKRFLQSCLEHLFAFQINSMNFDYKIAIVTVIFSIFFIELFMLYP HHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC SYRSSKILPVKLMRENEESDFSNKKIRSIMGKFLLMSSLFLTVLGGFVANKGDTQAIVIL CCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHH IGAIFLVLGVYILFPTYLSSILIACLPIMKKIFGRNTFVAIKNVIPQVRKNTFVILMIST HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHH MMVIVVFGSTIFKTMQKNNERYLQREFPTHIVVENRLNNDSTISSPHTQNIFKEISSVKG HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCC ASTISTNSLAELKQGEKYITFDYNLGDVKEMEKQGLLPKLPANFENSIIVTEELAGRYKL CCCCCHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEEHHHCCCEEE HVGDIIQLGLFSEQEQKVRPIGKVEVGLIVNELPNSPSVLMDWSNVTYKQDYTVFERAFI EHHHHHHHCCCCCHHHHCCCCCCEEEHHHEECCCCCCCEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHH SSNNERETLKQLKKVKDQYPQLKISSYNQSLKQSNLMFQQRWSIFIVVIVVILFSVTLGV CCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH CNTLINNIQSKRKEFAILRAITVKKKGVVQIILTQVNLYVLIGIVLGAVIGALLTYMVSI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IDRTPLFFDFKLILRVIAGMFGIVFIIFIPFANRIGKRDIVEELNKDNK HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCC >Mature Secondary Structure MIKSVRGLSLRFFKTNKFTAISSIVSVMLAVSLIVTMIVFSSHAKQSVINEVKNVYGDMD CCCCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC LSVGYNPDQNKLMDKSLLQNIKEQENVEYMSKVLVNHLQVNKLNTAIYTVGVQNDSLSKS EECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEECEEEEEEEECCCCCCHH RYHFSKNISNEEVTLNDGLAETLQVKVGEKIKIENKSYVVKEVLPDIEAGGSAPDILILS HHHHHCCCCCCEEEECCCHHHHHHHCCCCEEEECCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEC EGAVKQHIYEKTGKHNEATYLLIKAKENADVLALSSEIHKIDKELRIDIAEEDEFLKSNL CCHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEECCCCCEEEEHHHHHHHHHHHEEEECCHHHHHHHHH ASLHIFIIVLSTLILIVTALLLVSNFEVFLYKYKSQFAIMRSMGATTKQMFKVIFIQCSV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHH INFFGGISDLLLAVISKRFLQSCLEHLFAFQINSMNFDYKIAIVTVIFSIFFIELFMLYP HHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC SYRSSKILPVKLMRENEESDFSNKKIRSIMGKFLLMSSLFLTVLGGFVANKGDTQAIVIL CCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHH IGAIFLVLGVYILFPTYLSSILIACLPIMKKIFGRNTFVAIKNVIPQVRKNTFVILMIST HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHH MMVIVVFGSTIFKTMQKNNERYLQREFPTHIVVENRLNNDSTISSPHTQNIFKEISSVKG HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCC ASTISTNSLAELKQGEKYITFDYNLGDVKEMEKQGLLPKLPANFENSIIVTEELAGRYKL CCCCCHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEEHHHCCCEEE HVGDIIQLGLFSEQEQKVRPIGKVEVGLIVNELPNSPSVLMDWSNVTYKQDYTVFERAFI EHHHHHHHCCCCCHHHHCCCCCCEEEHHHEECCCCCCCEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHH SSNNERETLKQLKKVKDQYPQLKISSYNQSLKQSNLMFQQRWSIFIVVIVVILFSVTLGV CCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH CNTLINNIQSKRKEFAILRAITVKKKGVVQIILTQVNLYVLIGIVLGAVIGALLTYMVSI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IDRTPLFFDFKLILRVIAGMFGIVFIIFIPFANRIGKRDIVEELNKDNK HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 8688087 [H]