| Definition | Vibrio cholerae M66-2 chromosome I, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_012578 |
| Length | 2,892,523 |
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The map label for this gene is vibF [H]
Identifier: 227082333
GI number: 227082333
Start: 2290418
End: 2297659
Strand: Reverse
Name: vibF [H]
Synonym: VCM66_2132
Alternate gene names: 227082333
Gene position: 2297659-2290418 (Counterclockwise)
Preceding gene: 227082334
Following gene: 227082331
Centisome position: 79.43
GC content: 49.59
Gene sequence:
>7242_bases ATGAAAGAAATGACAGCAATGCAAGCGGCTTATTGGCTAGGGCGTCAACACGACTGCTTGCTCGATGGTGTGGCCGCGCA TCTCTACGCCGAATTTGATGGTCAAGCATTAAATCGACAGGCGCTAACGGAAGCGGTACGTGCGCTGTACGCGAAACATC CCATGTTACGTTTAGCGATCACCAAGGATGGACAGCAGAAGATCTTGCCGCTCTCAACTTTCCATCAGCTTAAAGTGGAT GACCTATCACAATGGAAGCCAGATGAGGTGGAGTCTTTTGTGCATACTAAGCGCCAGCGAATGACCCACCAGATGCTCGA TTTAACTCAGGGAAACCCGATTGAGATCAGCTTGACTCTGTTGCCTGAGGGCAAACACCGATTACACATTGATGCGGATA TGATTGCGTGTGATGCACAAAGTTTTCGGCTGTTGGTGGACGATCTCACCTCACTCTATTTAGAGGCCATAGAGCATCGA TTAGAGATCATTGAGTCTGATGTGGTGACTTTTTTCCAATATCTTGATGCTCAGCAAGCCGATCGTGCTTTGGCAAAACG CAAAGAGGTGGATAAGAAATGGTGGCAAGAGCGTCTTGCGACGATTCCCGCCGAGCCAAGTTTGCCTTATCAACCCGTAC CAACCGACGCCGTTAGCGCAAACAGCCAAAGGTTTGCACACTGGTTCACTCCAGTGGAGCGCAAAGGGTTGGCGGAGGTT GCGCGGCAACATCATCTCACACTGACCCAACTGACATTGGCACTCTTTTCACAAGTGATTGCCAATGCTTGCCAAGAGAG ACAATTTCGACTCAATGTACCTACATTCCATCGCGGCAATCGCTCTTTGGATATTGAACACACGATCGGCGATTTTTCCA ATTTGCTGATTTTTAGCGCCGATGTGGGAACGACTCAGACCCTGTTAAGCCTGTGTCAGCAAACGGCTAACCAACTGCAT CAATTACTTCGCCATGAAAGCTATTCAGGGGTTAGCGTGATGCGCGATTTATCGCGGAAACAGGGTGGGGTGCAGCGTTC ACCGATAGTCTTTACCTCAGGCATGGAAATGCGAGACGAGGAGATCTTTTCCGATCATGTCACTCAGCATTTAGGGCGTA TGAATTGGGTGATTTCGCAGGGAGCGCAGGTGACTCTCGATGCGCAAATTGCTCCGGCTTATGAAGGGATTTTGCTCAAT TGGGATGTGCGAATGGAAAACTTCGCTGATAAGGACATCACAGCGCTTTTCGCGCATTACGTTGATTTGATCCGCTGTGT GGCGCTGCATCCTGAGATGATGCAGCAAAGCGTACAACAGATTGACGCGCAACTCGGTTATGCTCGCCGCGAGTCGATTC AGGAGATGCCACTGACCCCTTTACAACAAGCTTACTTGCTAGGTCGCTCAACCCAAATTGCCTTAGGCGGCGTCGCGATG CATGAGTTTCGTGAGTATCGAGGTCACATCGACACTCAGTCACTGCATAGCCGTCTGCTCTATCTCGTTGAGCATATTCC TGCCTTGAGAACTCGCATTGATCAAGAGAAATGGATTCAGTGGGTCTCTCCTTGCATAGCGTTAAATTGGCAAGCCATCG ATTTACAGCATCTTTCCCGCGAACAAGCCTTATTAGCGGTTGAGCCAGTCAGGCAGCAATATCAGCAGCGGATGCATGAT TTAACGCGCTCGCCCTGGCAAATCTGTGTGGTGCAACTGCCAATAGAAGAGCAAGAGGAGTTCAGCTCCATCGTATTGAC CAGCTTTGATGCTTTGATTGTCGATGGTCGCACCCATGCACTCATTCTTGCTGCACTACTAGGAAGCGAAGAACCCGATA TAACTCAGGTGGTGCAAAATGCTCGTGATACTCAGTCCATCTCGCCGCAATTCGCCTCCAAAAAAGCGCAAGATGAAGCG 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ACTACCATGGGCGTTCAGTTGGTGGATTTCACGAAAGTACAAACGGTGTGGCAACTCATCGAGCAAGTGAAAAACAGCAT TAACCAGTCGATGCCATACACAGATATTCCGATTGACCTGATTGAAGAAGGGCTCAAAGGTGTTGAGCATGAGACGGAAG GTCACATGTTTGAGGTCTTTATACAACTGCATGCAAAAAATAAGCTGCATGGAGAGCTACTGTTGACAGAAGGGCATGCG ATCCGCTTCCAACAAGTCGATCCCGATAAAAGTGAATCCGGCTTAGGTTTACAGTTTGAAATTTTAGAAGAGAGGATCGA GCAAAAGCAGACGTTGAGAGTCATGATGAGTTATATGTCGAAACACTATAGCCCAGCTCAAGTCGCTCTGTTGACCAAGG TAACCAGTGGCATGTTTGAGCGGTTTTCCGATTGTATTGCACAAGATATTGCACTGCCGACGCTGAAAAAGCAGGTGAGG CAGCTTGAAGATGAAGCTTGTCGCTCTCCGTCCATGGGGTAG
Upstream 100 bases:
>100_bases TACATGTAATTGATAATGATTATTATTAACTAAAATTTACACATTAATGCGTTGCAAGACGATGTGTACCGAGTAAAGGG ATGAATCTGTGGGTTTAAAG
Downstream 100 bases:
>100_bases TGTTTTTGTGTCGTGACTCGATATCGTAGTGGTAGGGAATAGGGGGCGAAGGGCGATATTGGCTCCCCCTTTATGACAAG CCCTGAAGTGCCAGTCGTGG
Product: nonribosomal peptide synthetase VibF
Products: NA
Alternate protein names: BA1; ATP-dependent isoleucine adenylase; IleA; Isoleucine activase; ATP-dependent cysteine adenylase; CysA; Cysteine activase; ATP-dependent leucine adenylase; LeuA; Leucine activase; ATP-dependent glutamate adenylase; GluA; Glutamate activase; ATP-dependent isoleucine adenylase; IleA; Isoleucine activase; Glutamate racemase [H]
Number of amino acids: Translated: 2413; Mature: 2413
Protein sequence:
>2413_residues MKEMTAMQAAYWLGRQHDCLLDGVAAHLYAEFDGQALNRQALTEAVRALYAKHPMLRLAITKDGQQKILPLSTFHQLKVD DLSQWKPDEVESFVHTKRQRMTHQMLDLTQGNPIEISLTLLPEGKHRLHIDADMIACDAQSFRLLVDDLTSLYLEAIEHR LEIIESDVVTFFQYLDAQQADRALAKRKEVDKKWWQERLATIPAEPSLPYQPVPTDAVSANSQRFAHWFTPVERKGLAEV ARQHHLTLTQLTLALFSQVIANACQERQFRLNVPTFHRGNRSLDIEHTIGDFSNLLIFSADVGTTQTLLSLCQQTANQLH QLLRHESYSGVSVMRDLSRKQGGVQRSPIVFTSGMEMRDEEIFSDHVTQHLGRMNWVISQGAQVTLDAQIAPAYEGILLN WDVRMENFADKDITALFAHYVDLIRCVALHPEMMQQSVQQIDAQLGYARRESIQEMPLTPLQQAYLLGRSTQIALGGVAM HEFREYRGHIDTQSLHSRLLYLVEHIPALRTRIDQEKWIQWVSPCIALNWQAIDLQHLSREQALLAVEPVRQQYQQRMHD LTRSPWQICVVQLPIEEQEEFSSIVLTSFDALIVDGRTHALILAALLGSEEPDITQVVQNARDTQSISPQFASKKAQDEA YWKSKLHPDCPPPALPWKQALETITTSRYARESLQIPKESVGKLNRCGIENGLFLNSLLTATILDVLSYWTTEIGMRVGF PVLIPSSNAIDGNESSFVILEHEKSTLSLLSQASKLQREMLEALEHLAFSGVDLNRLLMNQAPQALVLPVVLTNGLSWKT LNPEDAVTLFDGVTQTPQVALDIRLTYDEQKNLIISFDYALAVLETELIREMLSALHHRLSQITSSASLAAPLEPCIDLS HYRFNSDESASHDCDFLAKLAQQLFVRTEDKTAVICGEQTLSYAQLGEQVQRVMWQLKARGLTTGNVLAICLPRSVEHIV ISLASALSGIIWVPIDAASPKERLNYLLENCHADLVVMDKPCEFGNVIAFDALIEPVLFADGVPDVTPLDQLSRLSQSQQ TAYYLYTSGTTGKPKCVVVNNQATSNVIGQTGQAWHLTSEDVVMSVTPLHHDMSVFDLFATLSFGATLVLPAGHEEKDAL QWNRLIERHQVTIWVSVPAILEMLLSCTQAGQLHSLRLIAQGGDYIKPATIAQLRAGSNPPRLISLGGPTETTIWSIWHE LTADDVSVIPYGRPLAGNRYFIMDEIQRHVPQGVVGRIFTSGVNLAQGYLEDGELKQTDFVTVLDEHGHPVRAFRTGDQG YYRADGNIIFASRINGYVKVRGVRVSLPDIEKQLQTHPALASVVVVDYADTNGDTALAALFSVKPQQSASSQALREFAKQ SLPSSHIPSRFIALEALPLSANGKVDRKQCQAHVQRQSISVEPVGQPNQSQPLSPPTLSSASLSEFEQRVWRQHQRHGDG RNQYATAYRLSGKVNIARLITALSQLPNHFPVLNRRYVLDEASGLTLYSAKPTPLEIHFEHVESMDEAFEHLVRWQNQPM DLAKQATLSFCLLSLGSEERVLGVISHQIISEQWDWRRVFECVTNGYNQIACDIDPVMEGEDLSLGFTPVMPQTPLSQAL LPWLQPASHATWIEQSLPSANSAINTLCSRKYRIALHSSVLAEHGLAQPDKQEVLALIAALFARYLAASAKLGQFELYVP HDVERKTRELNGSMIESQLVHIALKGFERPLSQLSQEILDAMRQPLTGGVASETHASAAALVTWLVDPSVHLQLEGLRCE KLLFAAMHPKFEVALGVGLNCQGALVLELALDATVSPHVGAYLLEQFVAAIGGRTMPSSTTSSSHVSAIELTSNNPPTSN NAHAALAESELELSAVNSSAVEECILAEFRSALGVAEMTAEDDFFDFGGHSLIATRVIGRLLSEQGIELHINDMFSFPNA KQLAQQAVLHRKPTSTSFAVSEVVESSKAPLSLAQASLWKAMSKYAKFGLTHIFNLPFALKFLDEVNEQAFGEAFHWLLL RHAGLRTHFGLEDGQPYQHVIAASNIEHYQWFWTSKDNAAQSVARLLAQEAEHTFDLSQELPLRLNFVRDEQTGTQYLSL LFHHIVLDEWSINILMDELAQVYQHSVQGTRPQWQTEPLPFHEFARKQRSSAFNQTHLNYWLTKFAGVPWAQPLFAADHP LSNSTGVDLGEGGWVEIKLPKSTMVSLYQLAKARHASLFNVMYAAISASVHCLGAPEKLLVGTPASGRLDAEFFDTVGYF TTMGVQLVDFTKVQTVWQLIEQVKNSINQSMPYTDIPIDLIEEGLKGVEHETEGHMFEVFIQLHAKNKLHGELLLTEGHA IRFQQVDPDKSESGLGLQFEILEERIEQKQTLRVMMSYMSKHYSPAQVALLTKVTSGMFERFSDCIAQDIALPTLKKQVR QLEDEACRSPSMG
Sequences:
>Translated_2413_residues MKEMTAMQAAYWLGRQHDCLLDGVAAHLYAEFDGQALNRQALTEAVRALYAKHPMLRLAITKDGQQKILPLSTFHQLKVD DLSQWKPDEVESFVHTKRQRMTHQMLDLTQGNPIEISLTLLPEGKHRLHIDADMIACDAQSFRLLVDDLTSLYLEAIEHR LEIIESDVVTFFQYLDAQQADRALAKRKEVDKKWWQERLATIPAEPSLPYQPVPTDAVSANSQRFAHWFTPVERKGLAEV ARQHHLTLTQLTLALFSQVIANACQERQFRLNVPTFHRGNRSLDIEHTIGDFSNLLIFSADVGTTQTLLSLCQQTANQLH QLLRHESYSGVSVMRDLSRKQGGVQRSPIVFTSGMEMRDEEIFSDHVTQHLGRMNWVISQGAQVTLDAQIAPAYEGILLN WDVRMENFADKDITALFAHYVDLIRCVALHPEMMQQSVQQIDAQLGYARRESIQEMPLTPLQQAYLLGRSTQIALGGVAM HEFREYRGHIDTQSLHSRLLYLVEHIPALRTRIDQEKWIQWVSPCIALNWQAIDLQHLSREQALLAVEPVRQQYQQRMHD LTRSPWQICVVQLPIEEQEEFSSIVLTSFDALIVDGRTHALILAALLGSEEPDITQVVQNARDTQSISPQFASKKAQDEA YWKSKLHPDCPPPALPWKQALETITTSRYARESLQIPKESVGKLNRCGIENGLFLNSLLTATILDVLSYWTTEIGMRVGF PVLIPSSNAIDGNESSFVILEHEKSTLSLLSQASKLQREMLEALEHLAFSGVDLNRLLMNQAPQALVLPVVLTNGLSWKT LNPEDAVTLFDGVTQTPQVALDIRLTYDEQKNLIISFDYALAVLETELIREMLSALHHRLSQITSSASLAAPLEPCIDLS HYRFNSDESASHDCDFLAKLAQQLFVRTEDKTAVICGEQTLSYAQLGEQVQRVMWQLKARGLTTGNVLAICLPRSVEHIV ISLASALSGIIWVPIDAASPKERLNYLLENCHADLVVMDKPCEFGNVIAFDALIEPVLFADGVPDVTPLDQLSRLSQSQQ TAYYLYTSGTTGKPKCVVVNNQATSNVIGQTGQAWHLTSEDVVMSVTPLHHDMSVFDLFATLSFGATLVLPAGHEEKDAL QWNRLIERHQVTIWVSVPAILEMLLSCTQAGQLHSLRLIAQGGDYIKPATIAQLRAGSNPPRLISLGGPTETTIWSIWHE LTADDVSVIPYGRPLAGNRYFIMDEIQRHVPQGVVGRIFTSGVNLAQGYLEDGELKQTDFVTVLDEHGHPVRAFRTGDQG YYRADGNIIFASRINGYVKVRGVRVSLPDIEKQLQTHPALASVVVVDYADTNGDTALAALFSVKPQQSASSQALREFAKQ SLPSSHIPSRFIALEALPLSANGKVDRKQCQAHVQRQSISVEPVGQPNQSQPLSPPTLSSASLSEFEQRVWRQHQRHGDG RNQYATAYRLSGKVNIARLITALSQLPNHFPVLNRRYVLDEASGLTLYSAKPTPLEIHFEHVESMDEAFEHLVRWQNQPM DLAKQATLSFCLLSLGSEERVLGVISHQIISEQWDWRRVFECVTNGYNQIACDIDPVMEGEDLSLGFTPVMPQTPLSQAL LPWLQPASHATWIEQSLPSANSAINTLCSRKYRIALHSSVLAEHGLAQPDKQEVLALIAALFARYLAASAKLGQFELYVP HDVERKTRELNGSMIESQLVHIALKGFERPLSQLSQEILDAMRQPLTGGVASETHASAAALVTWLVDPSVHLQLEGLRCE KLLFAAMHPKFEVALGVGLNCQGALVLELALDATVSPHVGAYLLEQFVAAIGGRTMPSSTTSSSHVSAIELTSNNPPTSN NAHAALAESELELSAVNSSAVEECILAEFRSALGVAEMTAEDDFFDFGGHSLIATRVIGRLLSEQGIELHINDMFSFPNA KQLAQQAVLHRKPTSTSFAVSEVVESSKAPLSLAQASLWKAMSKYAKFGLTHIFNLPFALKFLDEVNEQAFGEAFHWLLL RHAGLRTHFGLEDGQPYQHVIAASNIEHYQWFWTSKDNAAQSVARLLAQEAEHTFDLSQELPLRLNFVRDEQTGTQYLSL LFHHIVLDEWSINILMDELAQVYQHSVQGTRPQWQTEPLPFHEFARKQRSSAFNQTHLNYWLTKFAGVPWAQPLFAADHP LSNSTGVDLGEGGWVEIKLPKSTMVSLYQLAKARHASLFNVMYAAISASVHCLGAPEKLLVGTPASGRLDAEFFDTVGYF TTMGVQLVDFTKVQTVWQLIEQVKNSINQSMPYTDIPIDLIEEGLKGVEHETEGHMFEVFIQLHAKNKLHGELLLTEGHA IRFQQVDPDKSESGLGLQFEILEERIEQKQTLRVMMSYMSKHYSPAQVALLTKVTSGMFERFSDCIAQDIALPTLKKQVR QLEDEACRSPSMG >Mature_2413_residues MKEMTAMQAAYWLGRQHDCLLDGVAAHLYAEFDGQALNRQALTEAVRALYAKHPMLRLAITKDGQQKILPLSTFHQLKVD DLSQWKPDEVESFVHTKRQRMTHQMLDLTQGNPIEISLTLLPEGKHRLHIDADMIACDAQSFRLLVDDLTSLYLEAIEHR LEIIESDVVTFFQYLDAQQADRALAKRKEVDKKWWQERLATIPAEPSLPYQPVPTDAVSANSQRFAHWFTPVERKGLAEV ARQHHLTLTQLTLALFSQVIANACQERQFRLNVPTFHRGNRSLDIEHTIGDFSNLLIFSADVGTTQTLLSLCQQTANQLH QLLRHESYSGVSVMRDLSRKQGGVQRSPIVFTSGMEMRDEEIFSDHVTQHLGRMNWVISQGAQVTLDAQIAPAYEGILLN WDVRMENFADKDITALFAHYVDLIRCVALHPEMMQQSVQQIDAQLGYARRESIQEMPLTPLQQAYLLGRSTQIALGGVAM HEFREYRGHIDTQSLHSRLLYLVEHIPALRTRIDQEKWIQWVSPCIALNWQAIDLQHLSREQALLAVEPVRQQYQQRMHD LTRSPWQICVVQLPIEEQEEFSSIVLTSFDALIVDGRTHALILAALLGSEEPDITQVVQNARDTQSISPQFASKKAQDEA YWKSKLHPDCPPPALPWKQALETITTSRYARESLQIPKESVGKLNRCGIENGLFLNSLLTATILDVLSYWTTEIGMRVGF PVLIPSSNAIDGNESSFVILEHEKSTLSLLSQASKLQREMLEALEHLAFSGVDLNRLLMNQAPQALVLPVVLTNGLSWKT LNPEDAVTLFDGVTQTPQVALDIRLTYDEQKNLIISFDYALAVLETELIREMLSALHHRLSQITSSASLAAPLEPCIDLS HYRFNSDESASHDCDFLAKLAQQLFVRTEDKTAVICGEQTLSYAQLGEQVQRVMWQLKARGLTTGNVLAICLPRSVEHIV ISLASALSGIIWVPIDAASPKERLNYLLENCHADLVVMDKPCEFGNVIAFDALIEPVLFADGVPDVTPLDQLSRLSQSQQ TAYYLYTSGTTGKPKCVVVNNQATSNVIGQTGQAWHLTSEDVVMSVTPLHHDMSVFDLFATLSFGATLVLPAGHEEKDAL QWNRLIERHQVTIWVSVPAILEMLLSCTQAGQLHSLRLIAQGGDYIKPATIAQLRAGSNPPRLISLGGPTETTIWSIWHE LTADDVSVIPYGRPLAGNRYFIMDEIQRHVPQGVVGRIFTSGVNLAQGYLEDGELKQTDFVTVLDEHGHPVRAFRTGDQG YYRADGNIIFASRINGYVKVRGVRVSLPDIEKQLQTHPALASVVVVDYADTNGDTALAALFSVKPQQSASSQALREFAKQ SLPSSHIPSRFIALEALPLSANGKVDRKQCQAHVQRQSISVEPVGQPNQSQPLSPPTLSSASLSEFEQRVWRQHQRHGDG RNQYATAYRLSGKVNIARLITALSQLPNHFPVLNRRYVLDEASGLTLYSAKPTPLEIHFEHVESMDEAFEHLVRWQNQPM DLAKQATLSFCLLSLGSEERVLGVISHQIISEQWDWRRVFECVTNGYNQIACDIDPVMEGEDLSLGFTPVMPQTPLSQAL LPWLQPASHATWIEQSLPSANSAINTLCSRKYRIALHSSVLAEHGLAQPDKQEVLALIAALFARYLAASAKLGQFELYVP HDVERKTRELNGSMIESQLVHIALKGFERPLSQLSQEILDAMRQPLTGGVASETHASAAALVTWLVDPSVHLQLEGLRCE KLLFAAMHPKFEVALGVGLNCQGALVLELALDATVSPHVGAYLLEQFVAAIGGRTMPSSTTSSSHVSAIELTSNNPPTSN NAHAALAESELELSAVNSSAVEECILAEFRSALGVAEMTAEDDFFDFGGHSLIATRVIGRLLSEQGIELHINDMFSFPNA KQLAQQAVLHRKPTSTSFAVSEVVESSKAPLSLAQASLWKAMSKYAKFGLTHIFNLPFALKFLDEVNEQAFGEAFHWLLL RHAGLRTHFGLEDGQPYQHVIAASNIEHYQWFWTSKDNAAQSVARLLAQEAEHTFDLSQELPLRLNFVRDEQTGTQYLSL LFHHIVLDEWSINILMDELAQVYQHSVQGTRPQWQTEPLPFHEFARKQRSSAFNQTHLNYWLTKFAGVPWAQPLFAADHP LSNSTGVDLGEGGWVEIKLPKSTMVSLYQLAKARHASLFNVMYAAISASVHCLGAPEKLLVGTPASGRLDAEFFDTVGYF TTMGVQLVDFTKVQTVWQLIEQVKNSINQSMPYTDIPIDLIEEGLKGVEHETEGHMFEVFIQLHAKNKLHGELLLTEGHA IRFQQVDPDKSESGLGLQFEILEERIEQKQTLRVMMSYMSKHYSPAQVALLTKVTSGMFERFSDCIAQDIALPTLKKQVR QLEDEACRSPSMG
Specific function: Activates five amino acids, incorporates two D-amino acids, releases and cyclizes the mature bacitracin [H]
COG id: COG1020
COG function: function code Q; Non-ribosomal peptide synthetase modules and related proteins
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasm [C]
Metaboloic importance: Non_Essential [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Contains 5 acyl carrier domains [H]
Homologues:
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