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The map label for this gene is 226950780

Identifier: 226950780

GI number: 226950780

Start: 3829899

End: 3831122

Strand: Reverse

Name: 226950780

Synonym: CLM_3791

Alternate gene names: NA

Gene position: 3831122-3829899 (Counterclockwise)

Preceding gene: 226950781

Following gene: 226950779

Centisome position: 92.2

GC content: 25.0

Gene sequence:

>1224_bases
ATGGAGTTGTTAAAACAAGAGTTATATAAGATCTTTTCTAAGAAGCATTTATTTTTAATACTAGCTTTAATGCTTTTATT
TACCTACGGATTTGATTTAATTACAGTGGTTACCAATGTCAAAGATAAACATGGATCAACAAATAACACATATAATTATA
CAAAGCCTTTTGAAGGAAAAATGACTAAAGAGAAAGAAGATAAAATAGCTAGACTTTTTAAAAGCAATAAGGATAAAGAT
AAGGATTCTGAAATTACAAATATATATGAGAGGATGTGGTATAGTTATTCTGAGCAAAAAAGACCAAGATTTGTAGCTAT
ATCTGATGTTCTAAAAGAAACTAATCCTCTTTTTCATAATGAAAAGTTTGATAAGAGACCACATGACTTTAAAGGTTACA
AATTAAATGAGTTAAATAAGGATTTAAAAGAACTTAAAAAAGCAGGAAAAGAAAATACTTATGAATATAAAAATAAAAGT
GCGGCCAATAATATGTATAAAAAGCTTTCAGAACCTAAATTTTTTTATACAGAATCTTGGAATTATATAGATGGTTTTGT
CATTGATTCAAATATTGCAATAGTAGTTATAATGCTTTTATTAGGGGTATCTCCTATTTTTTCAGAGGAATATAAAACTA
AAATATCTACAATAATTTTATCTAGTAAAAAAGGTAGAAAAGAGTGCGTTAGAGCAAAGATATTAGCATCTATTATATAT
ACTATATTTATAGCTTTTATATGTAACTGTATAAGTACTATTTTAATAACTAAAATATATGGTATACAAGGATTTAATGC
ACCTATGCAATGTCTATATGATTTTAGTTGTTCTCCTTACAATTTCACAATATCGCAGTTTTTTGTTACATTATTTTTTA
CCAGTCTAATAGGGGCTATATTATTTGTATTATTGGTATTAATAATATCTAATATTACTAAGTCCTCTATGATGACTTTC
TTTATCTCTGGTTTTATATTTGTATTTCCAATGTTATTGCAAAAAATTGTTGGTGGAGCTAATGTTTGGTGGAAAAAAAC
TTTAATAAGTTTAAGTATTACGGAAATTTTTAATGCTAAGGCGATATATGAAGTATTCAGTACAATTAATATATTTGGAC
AACCTTTAATATATCCTTATTTTATTTTAATTTATTCTCTTTTATTAGGAACATTATTAGTTTATATTTTACACCGAAGA
TTGAAATATGAAGAGATAAGATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTTAAAAGTTTAGAAAGTAAGATTATAAAGTGTTTTTGAAATTTATCTAAAGATATTAAAAAGAAAATTATATAGGAAAT
GAATAATAGGAGGATTAAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAGAAAATTCTTTATAGGATTATATAATAATTATATAAAATAATAGTGTATTAAGCAGTAATTTCGTTATAAATGTAGAA
TATATAAATATAAAATATAT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 407; Mature: 407

Protein sequence:

>407_residues
MELLKQELYKIFSKKHLFLILALMLLFTYGFDLITVVTNVKDKHGSTNNTYNYTKPFEGKMTKEKEDKIARLFKSNKDKD
KDSEITNIYERMWYSYSEQKRPRFVAISDVLKETNPLFHNEKFDKRPHDFKGYKLNELNKDLKELKKAGKENTYEYKNKS
AANNMYKKLSEPKFFYTESWNYIDGFVIDSNIAIVVIMLLLGVSPIFSEEYKTKISTIILSSKKGRKECVRAKILASIIY
TIFIAFICNCISTILITKIYGIQGFNAPMQCLYDFSCSPYNFTISQFFVTLFFTSLIGAILFVLLVLIISNITKSSMMTF
FISGFIFVFPMLLQKIVGGANVWWKKTLISLSITEIFNAKAIYEVFSTINIFGQPLIYPYFILIYSLLLGTLLVYILHRR
LKYEEIR

Sequences:

>Translated_407_residues
MELLKQELYKIFSKKHLFLILALMLLFTYGFDLITVVTNVKDKHGSTNNTYNYTKPFEGKMTKEKEDKIARLFKSNKDKD
KDSEITNIYERMWYSYSEQKRPRFVAISDVLKETNPLFHNEKFDKRPHDFKGYKLNELNKDLKELKKAGKENTYEYKNKS
AANNMYKKLSEPKFFYTESWNYIDGFVIDSNIAIVVIMLLLGVSPIFSEEYKTKISTIILSSKKGRKECVRAKILASIIY
TIFIAFICNCISTILITKIYGIQGFNAPMQCLYDFSCSPYNFTISQFFVTLFFTSLIGAILFVLLVLIISNITKSSMMTF
FISGFIFVFPMLLQKIVGGANVWWKKTLISLSITEIFNAKAIYEVFSTINIFGQPLIYPYFILIYSLLLGTLLVYILHRR
LKYEEIR
>Mature_407_residues
MELLKQELYKIFSKKHLFLILALMLLFTYGFDLITVVTNVKDKHGSTNNTYNYTKPFEGKMTKEKEDKIARLFKSNKDKD
KDSEITNIYERMWYSYSEQKRPRFVAISDVLKETNPLFHNEKFDKRPHDFKGYKLNELNKDLKELKKAGKENTYEYKNKS
AANNMYKKLSEPKFFYTESWNYIDGFVIDSNIAIVVIMLLLGVSPIFSEEYKTKISTIILSSKKGRKECVRAKILASIIY
TIFIAFICNCISTILITKIYGIQGFNAPMQCLYDFSCSPYNFTISQFFVTLFFTSLIGAILFVLLVLIISNITKSSMMTF
FISGFIFVFPMLLQKIVGGANVWWKKTLISLSITEIFNAKAIYEVFSTINIFGQPLIYPYFILIYSLLLGTLLVYILHRR
LKYEEIR

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 47508; Mature: 47508

Theoretical pI: Translated: 9.81; Mature: 9.81

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.2 %Cys     (Translated Protein)
2.5 %Met     (Translated Protein)
3.7 %Cys+Met (Translated Protein)
1.2 %Cys     (Mature Protein)
2.5 %Met     (Mature Protein)
3.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MELLKQELYKIFSKKHLFLILALMLLFTYGFDLITVVTNVKDKHGSTNNTYNYTKPFEGK
CHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCC
MTKEKEDKIARLFKSNKDKDKDSEITNIYERMWYSYSEQKRPRFVAISDVLKETNPLFHN
CCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHCCCCCCC
EKFDKRPHDFKGYKLNELNKDLKELKKAGKENTYEYKNKSAANNMYKKLSEPKFFYTESW
CCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCC
NYIDGFVIDSNIAIVVIMLLLGVSPIFSEEYKTKISTIILSSKKGRKECVRAKILASIIY
CCCCCEEECCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
TIFIAFICNCISTILITKIYGIQGFNAPMQCLYDFSCSPYNFTISQFFVTLFFTSLIGAI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LFVLLVLIISNITKSSMMTFFISGFIFVFPMLLQKIVGGANVWWKKTLISLSITEIFNAK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AIYEVFSTINIFGQPLIYPYFILIYSLLLGTLLVYILHRRLKYEEIR
HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MELLKQELYKIFSKKHLFLILALMLLFTYGFDLITVVTNVKDKHGSTNNTYNYTKPFEGK
CHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCC
MTKEKEDKIARLFKSNKDKDKDSEITNIYERMWYSYSEQKRPRFVAISDVLKETNPLFHN
CCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHCCCCCCC
EKFDKRPHDFKGYKLNELNKDLKELKKAGKENTYEYKNKSAANNMYKKLSEPKFFYTESW
CCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCC
NYIDGFVIDSNIAIVVIMLLLGVSPIFSEEYKTKISTIILSSKKGRKECVRAKILASIIY
CCCCCEEECCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
TIFIAFICNCISTILITKIYGIQGFNAPMQCLYDFSCSPYNFTISQFFVTLFFTSLIGAI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LFVLLVLIISNITKSSMMTFFISGFIFVFPMLLQKIVGGANVWWKKTLISLSITEIFNAK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AIYEVFSTINIFGQPLIYPYFILIYSLLLGTLLVYILHRRLKYEEIR
HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA