Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 226949997

Identifier: 226949997

GI number: 226949997

Start: 2954221

End: 2957115

Strand: Reverse

Name: 226949997

Synonym: CLM_2950

Alternate gene names: NA

Gene position: 2957115-2954221 (Counterclockwise)

Preceding gene: 226949998

Following gene: 226949996

Centisome position: 71.17

GC content: 25.32

Gene sequence:

>2895_bases
ATGAGAAATAGAAATATAATGATTTTAAATGTACAAGCTAAAGATGTTATAGATGGAGGATATATAGTAGATAAAAAATC
TAAAAAAGATATACATAAATTATATGAGGAAGAAAAGAGAATATTTAGTAAATATAAAGGTAGTATGGATTATAGTTTAT
TAACTATGTATTTACAAGAAAATTATAAGAAATTTATTAAGGTAAATAAGAAAAAACAGAGATATTATAGTAATGATATG
ATTACAGTTAACTTTGATTATTCTGTAACAGAAGAATATAAAAATAAAAAAGGAAAAACAAAAAAGAAAGTTATTACATC
TACTAAAGGATTAAGAGAAAAATTATATAAAGATGGATTTACCTTGAATGTAAATGGTGTAGATACTAAATATGTAAGAC
TTTATAGATCAAGTGGAAGTGCTAGAAATGGAAAAGTAAATTTTGTGAATGAAAAATACTATGAAGATATATTAAAATAT
TGTATGGCTGGAATTGAATATAAAAATAAGAACGATTTAGATTTACCTTCAATTGAAGCTTATATATCCTTAATAGCTAC
AAGTATTATAGATACGTTTCAAATGAGTCCTAAAAATGTATTATTAATTGATGATATAGAAAGTACATTTCCAGATACGG
TTATGGCTACAGAATTAATTAAGAAAAAATATGATGAAAAAGGAAATGTTAAAAGAGGTGAATTACATACATATGTAGCA
GAAAAAGAAATAACTAATAAATTGACAGATGGTGAAGCTTTGTTATCAAAAGAAATTTTTGAGGAAAATTGTTATGAAGA
CAAAGCTACAATTCAATTAAGAAATAGATTTTATAAAGGTATAGGAATAAACACAGATATACAACAATTTTTTGAGGATA
ATGGTATTACGAATGTAAGTCAGTTGAATGGAAAAACATTAGCTAAGGATATAAAAGATATTAAATTAATAACTACAAAA
TCCTCAATAAAGTATCTAAAAAAAGAATTTAACAAAACTTTTGAAGAGTGGTGTGATATAGCTTTAGATACATGGGGAAT
ATGTAAGACAGATAAAGGGCAACATCATAATTTTAATAATATGGCCTTTACACACTACCAGTTACTTAACACGCTAGGAA
TGTCATATAAAGAAATGGAACAATTTCTCCAACCAACAAAAGAATATATTAAATTATTAAAAAATGATGTATCTGTATTT
AAGCTATATTTAGGATTAATTAAAGATGGAACGCTTAAAGAAATATTAGAAGAGTGTGAAGAAGATACAACAGAATTAGA
AGATTTTACAAGTAATGGCGAATTTGTATTGAATATGTTAAAAATTAATGAAGACTTTATAAATACTAAGATATGTAAAA
AATTTAGAGAAGAAATAATTAATAACTATAAAAAGAATGTTAAGAAAGGTCACGTCTTAATAAATGGTACATATGCAACT
GTTATAAATAATCCATATGAATACTTGTTAGCTAGTATAGGACAATATAATGGGCTTTCTAAAACGTTACATAAGAGAGA
GTGCTATTGTAAGAAATATAATAATGGTGATGATATATTGGCAGTGCGTTCACCACAGCCTACAATGAGCAATGTTACAA
CTATGATAAATAATACAGAATGTAAAGAATTTGATGAATATTTTAACCCTACAGATAATGTAATATTTATTAGTAGTATA
GGTTGGAACATAATGGAGCTTGAAAGTTCTATGGATTTTGATGGAGACTGTTGCTTAATCACAAATGACCGATTACTCAC
AAAAAAATATAGGAAATTGGATGAGGATATAGCAATTGATGGTGAGACTATTAAAAGATTTTTAGTATCTACTGACTTTA
CATCGAAATCACCTATACCACGATCTTATACTCCTAAAGATTTAGCCAACACAGATATAAATTGTGCTGAAGGAAAAATC
GGAGAGGTTATAAACCTTGTACAAATGCTTAATAGTGTATATTGGGATAAAAAATATAAAGGTGAAGAATTAATAAAGAA
GGGTTTATTAACAAGAGGAAAATTAGAGAAAGAATTATTTGAGTTATATAGGGATATAAGTAATTTAAATATATTGTCTT
GTATTGTTATAGATTCGGCAAAAAAATCTAGTCCAGTTGATGTCACAAAAGAATTAGATAGAATTAGAGCTAAAGGTTAT
CTAGGAAGAGATACTATAAGAGTTTATAATAAATATACTAGAAAATGGGAAGATAAAGAGGTTGGTATAAGACCATTTTT
CTTTAAATTTTTGGACGGTGGTAAAGATTATAAATTTAATAAATATAATACTGGGATGGATTATTTAATAAGAATTATGA
ATAAAGGTGACGATAGAAAAGATGCAAACGACACAACGATAAATTTAAAGGATTGTTTAATTAAGCAAAAAATGAATGAA
GCTGACAGAAAGAAAATACAAAAATTCACAAACTTAGTTGCGAGGGAACAGTATGAAATATCTAATGTGTATAAGAATGA
TAAATTAGAAGTTAAGGAAAAATATAGACAAGTACAAGATATTAAAGCGGATTTTAAAGAGAAGTTTGATAAAATTACAT
TAAATAAAGTAACTATTTATACAATTATTAAAAGATTGAGTAAGGCTATTAAGATATTAGATAATAATAGAAAGATATTA
AAAAAACAAAAAAAAGATTTAAGGAAAGTTAAAAGATTTAATGAGATAGAGGAGTTAAAAAAACAATTTAATGAAGATAA
TGAAAGTAATATAAAGTTCGTCAGAATTGGAAGAGGAGTATTAAGACATCTTTATGAACTAGATTCTGTATTATTTTTAA
GTTGTTTTAGGGTAAAAGCTAATACAAGTACGATTTATAGAAGTGATAATGGTGATATACATATATATGAAGTTAAATAT
AAAAAGTTAGGATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTAGAAAAATATGAAATGTATCGAAATTAATATTCACCTTCAAAGGGGATGTTAGTAATTCTAATAAATCATAAAAAATC
AAAAGGGGTGTCTATGTTAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAAATTTTGAAAAAATTGCACGACCCATTTTATATGGACAAGTAATATCAATGAGTACAGAAGTTTTATTTTCACTCTAT
ATGGAAGGGAATAACTCTTC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 964; Mature: 964

Protein sequence:

>964_residues
MRNRNIMILNVQAKDVIDGGYIVDKKSKKDIHKLYEEEKRIFSKYKGSMDYSLLTMYLQENYKKFIKVNKKKQRYYSNDM
ITVNFDYSVTEEYKNKKGKTKKKVITSTKGLREKLYKDGFTLNVNGVDTKYVRLYRSSGSARNGKVNFVNEKYYEDILKY
CMAGIEYKNKNDLDLPSIEAYISLIATSIIDTFQMSPKNVLLIDDIESTFPDTVMATELIKKKYDEKGNVKRGELHTYVA
EKEITNKLTDGEALLSKEIFEENCYEDKATIQLRNRFYKGIGINTDIQQFFEDNGITNVSQLNGKTLAKDIKDIKLITTK
SSIKYLKKEFNKTFEEWCDIALDTWGICKTDKGQHHNFNNMAFTHYQLLNTLGMSYKEMEQFLQPTKEYIKLLKNDVSVF
KLYLGLIKDGTLKEILEECEEDTTELEDFTSNGEFVLNMLKINEDFINTKICKKFREEIINNYKKNVKKGHVLINGTYAT
VINNPYEYLLASIGQYNGLSKTLHKRECYCKKYNNGDDILAVRSPQPTMSNVTTMINNTECKEFDEYFNPTDNVIFISSI
GWNIMELESSMDFDGDCCLITNDRLLTKKYRKLDEDIAIDGETIKRFLVSTDFTSKSPIPRSYTPKDLANTDINCAEGKI
GEVINLVQMLNSVYWDKKYKGEELIKKGLLTRGKLEKELFELYRDISNLNILSCIVIDSAKKSSPVDVTKELDRIRAKGY
LGRDTIRVYNKYTRKWEDKEVGIRPFFFKFLDGGKDYKFNKYNTGMDYLIRIMNKGDDRKDANDTTINLKDCLIKQKMNE
ADRKKIQKFTNLVAREQYEISNVYKNDKLEVKEKYRQVQDIKADFKEKFDKITLNKVTIYTIIKRLSKAIKILDNNRKIL
KKQKKDLRKVKRFNEIEELKKQFNEDNESNIKFVRIGRGVLRHLYELDSVLFLSCFRVKANTSTIYRSDNGDIHIYEVKY
KKLG

Sequences:

>Translated_964_residues
MRNRNIMILNVQAKDVIDGGYIVDKKSKKDIHKLYEEEKRIFSKYKGSMDYSLLTMYLQENYKKFIKVNKKKQRYYSNDM
ITVNFDYSVTEEYKNKKGKTKKKVITSTKGLREKLYKDGFTLNVNGVDTKYVRLYRSSGSARNGKVNFVNEKYYEDILKY
CMAGIEYKNKNDLDLPSIEAYISLIATSIIDTFQMSPKNVLLIDDIESTFPDTVMATELIKKKYDEKGNVKRGELHTYVA
EKEITNKLTDGEALLSKEIFEENCYEDKATIQLRNRFYKGIGINTDIQQFFEDNGITNVSQLNGKTLAKDIKDIKLITTK
SSIKYLKKEFNKTFEEWCDIALDTWGICKTDKGQHHNFNNMAFTHYQLLNTLGMSYKEMEQFLQPTKEYIKLLKNDVSVF
KLYLGLIKDGTLKEILEECEEDTTELEDFTSNGEFVLNMLKINEDFINTKICKKFREEIINNYKKNVKKGHVLINGTYAT
VINNPYEYLLASIGQYNGLSKTLHKRECYCKKYNNGDDILAVRSPQPTMSNVTTMINNTECKEFDEYFNPTDNVIFISSI
GWNIMELESSMDFDGDCCLITNDRLLTKKYRKLDEDIAIDGETIKRFLVSTDFTSKSPIPRSYTPKDLANTDINCAEGKI
GEVINLVQMLNSVYWDKKYKGEELIKKGLLTRGKLEKELFELYRDISNLNILSCIVIDSAKKSSPVDVTKELDRIRAKGY
LGRDTIRVYNKYTRKWEDKEVGIRPFFFKFLDGGKDYKFNKYNTGMDYLIRIMNKGDDRKDANDTTINLKDCLIKQKMNE
ADRKKIQKFTNLVAREQYEISNVYKNDKLEVKEKYRQVQDIKADFKEKFDKITLNKVTIYTIIKRLSKAIKILDNNRKIL
KKQKKDLRKVKRFNEIEELKKQFNEDNESNIKFVRIGRGVLRHLYELDSVLFLSCFRVKANTSTIYRSDNGDIHIYEVKY
KKLG
>Mature_964_residues
MRNRNIMILNVQAKDVIDGGYIVDKKSKKDIHKLYEEEKRIFSKYKGSMDYSLLTMYLQENYKKFIKVNKKKQRYYSNDM
ITVNFDYSVTEEYKNKKGKTKKKVITSTKGLREKLYKDGFTLNVNGVDTKYVRLYRSSGSARNGKVNFVNEKYYEDILKY
CMAGIEYKNKNDLDLPSIEAYISLIATSIIDTFQMSPKNVLLIDDIESTFPDTVMATELIKKKYDEKGNVKRGELHTYVA
EKEITNKLTDGEALLSKEIFEENCYEDKATIQLRNRFYKGIGINTDIQQFFEDNGITNVSQLNGKTLAKDIKDIKLITTK
SSIKYLKKEFNKTFEEWCDIALDTWGICKTDKGQHHNFNNMAFTHYQLLNTLGMSYKEMEQFLQPTKEYIKLLKNDVSVF
KLYLGLIKDGTLKEILEECEEDTTELEDFTSNGEFVLNMLKINEDFINTKICKKFREEIINNYKKNVKKGHVLINGTYAT
VINNPYEYLLASIGQYNGLSKTLHKRECYCKKYNNGDDILAVRSPQPTMSNVTTMINNTECKEFDEYFNPTDNVIFISSI
GWNIMELESSMDFDGDCCLITNDRLLTKKYRKLDEDIAIDGETIKRFLVSTDFTSKSPIPRSYTPKDLANTDINCAEGKI
GEVINLVQMLNSVYWDKKYKGEELIKKGLLTRGKLEKELFELYRDISNLNILSCIVIDSAKKSSPVDVTKELDRIRAKGY
LGRDTIRVYNKYTRKWEDKEVGIRPFFFKFLDGGKDYKFNKYNTGMDYLIRIMNKGDDRKDANDTTINLKDCLIKQKMNE
ADRKKIQKFTNLVAREQYEISNVYKNDKLEVKEKYRQVQDIKADFKEKFDKITLNKVTIYTIIKRLSKAIKILDNNRKIL
KKQKKDLRKVKRFNEIEELKKQFNEDNESNIKFVRIGRGVLRHLYELDSVLFLSCFRVKANTSTIYRSDNGDIHIYEVKY
KKLG

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 112835; Mature: 112835

Theoretical pI: Translated: 9.42; Mature: 9.42

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.6 %Cys     (Translated Protein)
2.1 %Met     (Translated Protein)
3.6 %Cys+Met (Translated Protein)
1.6 %Cys     (Mature Protein)
2.1 %Met     (Mature Protein)
3.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MRNRNIMILNVQAKDVIDGGYIVDKKSKKDIHKLYEEEKRIFSKYKGSMDYSLLTMYLQE
CCCCCEEEEEEEHHHCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHH
NYKKFIKVNKKKQRYYSNDMITVNFDYSVTEEYKNKKGKTKKKVITSTKGLREKLYKDGF
HHHHHHHHCHHHHHHHCCCEEEEEECCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
TLNVNGVDTKYVRLYRSSGSARNGKVNFVNEKYYEDILKYCMAGIEYKNKNDLDLPSIEA
EEEECCCCHHHHHEECCCCCCCCCCEEECHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHH
YISLIATSIIDTFQMSPKNVLLIDDIESTFPDTVMATELIKKKYDEKGNVKRGELHTYVA
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHH
EKEITNKLTDGEALLSKEIFEENCYEDKATIQLRNRFYKGIGINTDIQQFFEDNGITNVS
HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCCCHH
QLNGKTLAKDIKDIKLITTKSSIKYLKKEFNKTFEEWCDIALDTWGICKTDKGQHHNFNN
HCCCHHHHHHHHHEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCC
MAFTHYQLLNTLGMSYKEMEQFLQPTKEYIKLLKNDVSVFKLYLGLIKDGTLKEILEECE
CHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
EDTTELEDFTSNGEFVLNMLKINEDFINTKICKKFREEIINNYKKNVKKGHVLINGTYAT
HHHHHHHHHCCCCCEEEEEEHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEEE
VINNPYEYLLASIGQYNGLSKTLHKRECYCKKYNNGDDILAVRSPQPTMSNVTTMINNTE
EECCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHCCCH
CKEFDEYFNPTDNVIFISSIGWNIMELESSMDFDGDCCLITNDRLLTKKYRKLDEDIAID
HHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCEEEEECCCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHCCCHHCCC
GETIKRFLVSTDFTSKSPIPRSYTPKDLANTDINCAEGKIGEVINLVQMLNSVYWDKKYK
HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
GEELIKKGLLTRGKLEKELFELYRDISNLNILSCIVIDSAKKSSPVDVTKELDRIRAKGY
CHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCC
LGRDTIRVYNKYTRKWEDKEVGIRPFFFKFLDGGKDYKFNKYNTGMDYLIRIMNKGDDRK
CCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCC
DANDTTINLKDCLIKQKMNEADRKKIQKFTNLVAREQYEISNVYKNDKLEVKEKYRQVQD
CCCCCEEEHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHH
IKADFKEKFDKITLNKVTIYTIIKRLSKAIKILDNNRKILKKQKKDLRKVKRFNEIEELK
HHHHHHHHHHCEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KQFNEDNESNIKFVRIGRGVLRHLYELDSVLFLSCFRVKANTSTIYRSDNGDIHIYEVKY
HHCCCCCCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCEEEECCCCCEEEEEEEE
KKLG
ECCC
>Mature Secondary Structure
MRNRNIMILNVQAKDVIDGGYIVDKKSKKDIHKLYEEEKRIFSKYKGSMDYSLLTMYLQE
CCCCCEEEEEEEHHHCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHH
NYKKFIKVNKKKQRYYSNDMITVNFDYSVTEEYKNKKGKTKKKVITSTKGLREKLYKDGF
HHHHHHHHCHHHHHHHCCCEEEEEECCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
TLNVNGVDTKYVRLYRSSGSARNGKVNFVNEKYYEDILKYCMAGIEYKNKNDLDLPSIEA
EEEECCCCHHHHHEECCCCCCCCCCEEECHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHH
YISLIATSIIDTFQMSPKNVLLIDDIESTFPDTVMATELIKKKYDEKGNVKRGELHTYVA
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHH
EKEITNKLTDGEALLSKEIFEENCYEDKATIQLRNRFYKGIGINTDIQQFFEDNGITNVS
HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCCCHH
QLNGKTLAKDIKDIKLITTKSSIKYLKKEFNKTFEEWCDIALDTWGICKTDKGQHHNFNN
HCCCHHHHHHHHHEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCC
MAFTHYQLLNTLGMSYKEMEQFLQPTKEYIKLLKNDVSVFKLYLGLIKDGTLKEILEECE
CHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
EDTTELEDFTSNGEFVLNMLKINEDFINTKICKKFREEIINNYKKNVKKGHVLINGTYAT
HHHHHHHHHCCCCCEEEEEEHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEEE
VINNPYEYLLASIGQYNGLSKTLHKRECYCKKYNNGDDILAVRSPQPTMSNVTTMINNTE
EECCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHCCCH
CKEFDEYFNPTDNVIFISSIGWNIMELESSMDFDGDCCLITNDRLLTKKYRKLDEDIAID
HHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCEEEEECCCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHCCCHHCCC
GETIKRFLVSTDFTSKSPIPRSYTPKDLANTDINCAEGKIGEVINLVQMLNSVYWDKKYK
HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
GEELIKKGLLTRGKLEKELFELYRDISNLNILSCIVIDSAKKSSPVDVTKELDRIRAKGY
CHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCC
LGRDTIRVYNKYTRKWEDKEVGIRPFFFKFLDGGKDYKFNKYNTGMDYLIRIMNKGDDRK
CCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCC
DANDTTINLKDCLIKQKMNEADRKKIQKFTNLVAREQYEISNVYKNDKLEVKEKYRQVQD
CCCCCEEEHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHH
IKADFKEKFDKITLNKVTIYTIIKRLSKAIKILDNNRKILKKQKKDLRKVKRFNEIEELK
HHHHHHHHHHCEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KQFNEDNESNIKFVRIGRGVLRHLYELDSVLFLSCFRVKANTSTIYRSDNGDIHIYEVKY
HHCCCCCCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCEEEECCCCCEEEEEEEE
KKLG
ECCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA