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The map label for this gene is 226948769

Identifier: 226948769

GI number: 226948769

Start: 1712033

End: 1714663

Strand: Direct

Name: 226948769

Synonym: CLM_1670

Alternate gene names: NA

Gene position: 1712033-1714663 (Clockwise)

Preceding gene: 226948768

Following gene: 226948770

Centisome position: 41.2

GC content: 34.89

Gene sequence:

>2631_bases
ATGGCTTCAAAAACCATAGGTGTTGTCCTTTCTCTACGCGACCAAATGAGTAACCCACTACTGAAAATAAACAAAAATGT
ACAAGGGGTTTCTAAAGAAGCAAAGAGAGCTTCACAACAAGTTGCGAATTTTGCTACCAAAGCACAAAAAGGTTTTGAAA
AAGCAGGAGACAAAGTTTTAAAATTTGGTTTAGGATTGGCAACTCTCGCAGGAGGGTTGATAGTAAAAACAGGTGTGCAA
GGATTGGGCGAATTAGACGAAGGTGCTAGAAAAGTTAAATCAATAGCACAAGATAGCTTGCAATTAGATAACATTCAAAA
AGGCCTGCTTAAAACGTCAAATGATACAGGAATTGCCGTAAAAGAATTATCTGATACGCAGTATGATGCTATATCATCTG
GTGTGAAAGCAAATGAAAGTATACAAGCAGCGGTTACATCAGCTAAACTGGCTAAAGCTGGATTTTCAGATTCTAATAGC
TCTCTTAAAATACTAACTTCTACTATGAATGTCTACGGGTTAACAGGTCAAAAAGCAATGCAAAGCATATCGGATAAACT
GTTAGTTACTCAAAATCTAGGTGTGACAACCGTTGGGGAATTGGCGAATTCGATGGGATCATTAACACCTATTGCTAAAT
CTGCTGGTTCTTCTATAGATGAAATGTTAGCAGGAATGGCAAGCTTAACAAAGAATGGATTGAAAACAGAGGAAGCGGTA
ACATCTTTAAAATCTGTGTTTTCAAGTGTAATTAAACCAACCGAAGAAGCTTCTAAAACCGCTCAGCAATTAGGAATAGA
CTTTTCAGCGTCTGCGTTAAAAAGTAAAGGATTTGCCAAATTTCTAGAGGAAATAAAGGTTAAAACTGGTGGGAATACTG
AAACTATGGGTAAGTTGTTCGGAAACGTTAACGCACTATCTGGTGCTTTGGTACTTACAGGAAAGGGGTTCGGAGACTTT
AATACAAGCCTAGACGCTATGAAAAATAGTGTTGGGCTAACTGACCAGGCTTTTGAAACAATGAATAATAGTTTAATAAG
TAAATTTGGGAAAATGAAAAACAGATTAACAAATATGGCTACTGAAATGATGCAGGGAACAGGTGGACAATTAGGAGTTT
TAATAGATGACATAACAGGTAAATTAAAACAATGGCAGGAAGATGGGACTATAGAACAGGTTGCTAATAAAGTGGCGACT
GGATTTATGAAAATGTATGACATTATTAGTAAAGTTATAAGCTTTCTAGTAGAGCATAAAGATGCAATAGCAAATGTAGC
TATTGTATTTGCATCCTTCTATATAGCCATTAAAATTTTCAAGGTACTTAAAGGGGTTATATTCGGAGTACAGATTGCAA
TAGGATTGCTTAATGGTACTTTAATGCTTACACCTTTGGGATGGGTCATGGTGGCGATAACTGCTGTAATAGCAATAGGA
TTATTACTATGGAAAAACTGGGATAAAATAAAGCAAGTTGCCCAAACTTTATGGACAGCAATTAAAACAGTATTTACTAA
TATATGGACAACAATAACAACTGTATTCACTAATATCTGGACCACTATAACAACAGTGGCTAGTAATATATGGACCAGCA
TAACAACTGTATTCACTAATATATGGACAACAATAACTACTATATTTACAGCTATCTGGACCACTATAACAACAATAGCC
ACCAATATATGGTCAAGTATAGTTTCTATTTTTACAACTATATGGAATGTTATTGTAACAATATTTACACCTATTAAGTT
GTTTATAGAAGCGGTATGGAAAGGCATATTAGCTGTAATAATAATTGTAGGAGCGTTTATTTGGAACGCAATTGTAACAA
TGTGGACTAACGTATGGAACGTTATACAACCTATACTAACAGCTATATGGAATGTTATAACAACAGTATGGACAGCTATA
TGGACCACAATAACAACAATAGCAATGGCTATTTGGAACACTATAGTAAACGCATGGAATACTATAGCCGGAGTTGTATC
AGCTGTAATGTCTGCAATTTGGGGTGTTATATCTAGTATATGGAGCAGTATTTATGGAACTGTAAGTGGAATTATGTCAT
CAATTTGGAGTACTATAACAGAGATATGGAACAATATCGTATCTACTGTTAGCGATATTGTTGGTAATATCGCTAGTACA
ATAAGTGATGGGTTTAATTCTTTAATCGGAACATGTTCCGATATATTCAACAATATAAAAAATACTGTAATGGATATTTT
TCAAGGCATATGGCAAGGGATTAAAGATATAATTAACGGTGGAATAGGTATGCTAAATAATTTTATTGGTGGAGTAAATA
AAGTTATTAGTAAAGCCAATAAAGTTCCAGGAGTTAATATAGGCGCTGTATCGGAAATACCTAAATTTGCAAAAGGCACT
CAATATTCACCCGCAGGAATGGCACTAATTAACGAAGAAGGTGGAGAGTTAAGAAAGCTTTCTTCAGGGGAGACAATTAT
ACCAGCCGATAAATCTCGCCAATTAATGAGCGGGAATTCAAGTCCAGAAATTAATATTTATATAACTGGCAATGTAGGAA
CAGAAGAGTTCTTTAATCAAGCAGGGGAACATATAACAAATCAAATTAAATTAGCATTGCAAAATATGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTAAACTTAAAGTTAAATATGATAAATCAAAATTAGATTATATATTTGGGGAAGGTAAAAAATAACCTTCCTTTTTATTT
TGTAAGAAAGGAGGTTATAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AGGTGTAGTTTTATAACTATGCCTTTTTTATTTAAGGGGGTGTAATATGGCAAATATATATTTTAGTACATTAGATAGAA
AACAATTGTACGAACTTCCC

Product: phage tail tape measure protein, TP901 family, core region

Products: NA

Alternate protein names: Phage Protein; Prophage; Bacteriophage Tape Measure Protein; Phage Tail Tape Measure Protein Family Core Region; Phage Tail Tape Measure Protein TP; Bacteriophage Minor Tail Proteins; Phage-Like Protein; TMP Repeat Protein; Tail Tape Meausure Protein; Phage Tail Tape Measure Protein Family; TMP Repeat-Containing Protein; Phage Tail Tape Measure Protein TMP

Number of amino acids: Translated: 876; Mature: 875

Protein sequence:

>876_residues
MASKTIGVVLSLRDQMSNPLLKINKNVQGVSKEAKRASQQVANFATKAQKGFEKAGDKVLKFGLGLATLAGGLIVKTGVQ
GLGELDEGARKVKSIAQDSLQLDNIQKGLLKTSNDTGIAVKELSDTQYDAISSGVKANESIQAAVTSAKLAKAGFSDSNS
SLKILTSTMNVYGLTGQKAMQSISDKLLVTQNLGVTTVGELANSMGSLTPIAKSAGSSIDEMLAGMASLTKNGLKTEEAV
TSLKSVFSSVIKPTEEASKTAQQLGIDFSASALKSKGFAKFLEEIKVKTGGNTETMGKLFGNVNALSGALVLTGKGFGDF
NTSLDAMKNSVGLTDQAFETMNNSLISKFGKMKNRLTNMATEMMQGTGGQLGVLIDDITGKLKQWQEDGTIEQVANKVAT
GFMKMYDIISKVISFLVEHKDAIANVAIVFASFYIAIKIFKVLKGVIFGVQIAIGLLNGTLMLTPLGWVMVAITAVIAIG
LLLWKNWDKIKQVAQTLWTAIKTVFTNIWTTITTVFTNIWTTITTVASNIWTSITTVFTNIWTTITTIFTAIWTTITTIA
TNIWSSIVSIFTTIWNVIVTIFTPIKLFIEAVWKGILAVIIIVGAFIWNAIVTMWTNVWNVIQPILTAIWNVITTVWTAI
WTTITTIAMAIWNTIVNAWNTIAGVVSAVMSAIWGVISSIWSSIYGTVSGIMSSIWSTITEIWNNIVSTVSDIVGNIAST
ISDGFNSLIGTCSDIFNNIKNTVMDIFQGIWQGIKDIINGGIGMLNNFIGGVNKVISKANKVPGVNIGAVSEIPKFAKGT
QYSPAGMALINEEGGELRKLSSGETIIPADKSRQLMSGNSSPEINIYITGNVGTEEFFNQAGEHITNQIKLALQNM

Sequences:

>Translated_876_residues
MASKTIGVVLSLRDQMSNPLLKINKNVQGVSKEAKRASQQVANFATKAQKGFEKAGDKVLKFGLGLATLAGGLIVKTGVQ
GLGELDEGARKVKSIAQDSLQLDNIQKGLLKTSNDTGIAVKELSDTQYDAISSGVKANESIQAAVTSAKLAKAGFSDSNS
SLKILTSTMNVYGLTGQKAMQSISDKLLVTQNLGVTTVGELANSMGSLTPIAKSAGSSIDEMLAGMASLTKNGLKTEEAV
TSLKSVFSSVIKPTEEASKTAQQLGIDFSASALKSKGFAKFLEEIKVKTGGNTETMGKLFGNVNALSGALVLTGKGFGDF
NTSLDAMKNSVGLTDQAFETMNNSLISKFGKMKNRLTNMATEMMQGTGGQLGVLIDDITGKLKQWQEDGTIEQVANKVAT
GFMKMYDIISKVISFLVEHKDAIANVAIVFASFYIAIKIFKVLKGVIFGVQIAIGLLNGTLMLTPLGWVMVAITAVIAIG
LLLWKNWDKIKQVAQTLWTAIKTVFTNIWTTITTVFTNIWTTITTVASNIWTSITTVFTNIWTTITTIFTAIWTTITTIA
TNIWSSIVSIFTTIWNVIVTIFTPIKLFIEAVWKGILAVIIIVGAFIWNAIVTMWTNVWNVIQPILTAIWNVITTVWTAI
WTTITTIAMAIWNTIVNAWNTIAGVVSAVMSAIWGVISSIWSSIYGTVSGIMSSIWSTITEIWNNIVSTVSDIVGNIAST
ISDGFNSLIGTCSDIFNNIKNTVMDIFQGIWQGIKDIINGGIGMLNNFIGGVNKVISKANKVPGVNIGAVSEIPKFAKGT
QYSPAGMALINEEGGELRKLSSGETIIPADKSRQLMSGNSSPEINIYITGNVGTEEFFNQAGEHITNQIKLALQNM
>Mature_875_residues
ASKTIGVVLSLRDQMSNPLLKINKNVQGVSKEAKRASQQVANFATKAQKGFEKAGDKVLKFGLGLATLAGGLIVKTGVQG
LGELDEGARKVKSIAQDSLQLDNIQKGLLKTSNDTGIAVKELSDTQYDAISSGVKANESIQAAVTSAKLAKAGFSDSNSS
LKILTSTMNVYGLTGQKAMQSISDKLLVTQNLGVTTVGELANSMGSLTPIAKSAGSSIDEMLAGMASLTKNGLKTEEAVT
SLKSVFSSVIKPTEEASKTAQQLGIDFSASALKSKGFAKFLEEIKVKTGGNTETMGKLFGNVNALSGALVLTGKGFGDFN
TSLDAMKNSVGLTDQAFETMNNSLISKFGKMKNRLTNMATEMMQGTGGQLGVLIDDITGKLKQWQEDGTIEQVANKVATG
FMKMYDIISKVISFLVEHKDAIANVAIVFASFYIAIKIFKVLKGVIFGVQIAIGLLNGTLMLTPLGWVMVAITAVIAIGL
LLWKNWDKIKQVAQTLWTAIKTVFTNIWTTITTVFTNIWTTITTVASNIWTSITTVFTNIWTTITTIFTAIWTTITTIAT
NIWSSIVSIFTTIWNVIVTIFTPIKLFIEAVWKGILAVIIIVGAFIWNAIVTMWTNVWNVIQPILTAIWNVITTVWTAIW
TTITTIAMAIWNTIVNAWNTIAGVVSAVMSAIWGVISSIWSSIYGTVSGIMSSIWSTITEIWNNIVSTVSDIVGNIASTI
SDGFNSLIGTCSDIFNNIKNTVMDIFQGIWQGIKDIINGGIGMLNNFIGGVNKVISKANKVPGVNIGAVSEIPKFAKGTQ
YSPAGMALINEEGGELRKLSSGETIIPADKSRQLMSGNSSPEINIYITGNVGTEEFFNQAGEHITNQIKLALQNM

Specific function: Unknown

COG id: COG5412

COG function: function code S; Phage-related protein

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 93951; Mature: 93820

Theoretical pI: Translated: 9.91; Mature: 9.91

Prosite motif: PS00678 WD_REPEATS_1

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.1 %Cys     (Translated Protein)
3.1 %Met     (Translated Protein)
3.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.1 %Cys     (Mature Protein)
3.0 %Met     (Mature Protein)
3.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MASKTIGVVLSLRDQMSNPLLKINKNVQGVSKEAKRASQQVANFATKAQKGFEKAGDKVL
CCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KFGLGLATLAGGLIVKTGVQGLGELDEGARKVKSIAQDSLQLDNIQKGLLKTSNDTGIAV
HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCH
KELSDTQYDAISSGVKANESIQAAVTSAKLAKAGFSDSNSSLKILTSTMNVYGLTGQKAM
HHCCCCHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHCCCHHHHH
QSISDKLLVTQNLGVTTVGELANSMGSLTPIAKSAGSSIDEMLAGMASLTKNGLKTEEAV
HHHHHHEEEECCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHH
TSLKSVFSSVIKPTEEASKTAQQLGIDFSASALKSKGFAKFLEEIKVKTGGNTETMGKLF
HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHH
GNVNALSGALVLTGKGFGDFNTSLDAMKNSVGLTDQAFETMNNSLISKFGKMKNRLTNMA
CCHHHHCCEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TEMMQGTGGQLGVLIDDITGKLKQWQEDGTIEQVANKVATGFMKMYDIISKVISFLVEHK
HHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DAIANVAIVFASFYIAIKIFKVLKGVIFGVQIAIGLLNGTLMLTPLGWVMVAITAVIAIG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLLWKNWDKIKQVAQTLWTAIKTVFTNIWTTITTVFTNIWTTITTVASNIWTSITTVFTN
HHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IWTTITTIFTAIWTTITTIATNIWSSIVSIFTTIWNVIVTIFTPIKLFIEAVWKGILAVI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IIVGAFIWNAIVTMWTNVWNVIQPILTAIWNVITTVWTAIWTTITTIAMAIWNTIVNAWN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TIAGVVSAVMSAIWGVISSIWSSIYGTVSGIMSSIWSTITEIWNNIVSTVSDIVGNIAST
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ISDGFNSLIGTCSDIFNNIKNTVMDIFQGIWQGIKDIINGGIGMLNNFIGGVNKVISKAN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
KVPGVNIGAVSEIPKFAKGTQYSPAGMALINEEGGELRKLSSGETIIPADKSRQLMSGNS
CCCCCCCCCHHHCHHHHCCCCCCCCCCEEEECCCCHHHCCCCCCEECCCCCCHHHHCCCC
SPEINIYITGNVGTEEFFNQAGEHITNQIKLALQNM
CCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure 
ASKTIGVVLSLRDQMSNPLLKINKNVQGVSKEAKRASQQVANFATKAQKGFEKAGDKVL
CCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KFGLGLATLAGGLIVKTGVQGLGELDEGARKVKSIAQDSLQLDNIQKGLLKTSNDTGIAV
HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCH
KELSDTQYDAISSGVKANESIQAAVTSAKLAKAGFSDSNSSLKILTSTMNVYGLTGQKAM
HHCCCCHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHCCCHHHHH
QSISDKLLVTQNLGVTTVGELANSMGSLTPIAKSAGSSIDEMLAGMASLTKNGLKTEEAV
HHHHHHEEEECCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHH
TSLKSVFSSVIKPTEEASKTAQQLGIDFSASALKSKGFAKFLEEIKVKTGGNTETMGKLF
HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHH
GNVNALSGALVLTGKGFGDFNTSLDAMKNSVGLTDQAFETMNNSLISKFGKMKNRLTNMA
CCHHHHCCEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TEMMQGTGGQLGVLIDDITGKLKQWQEDGTIEQVANKVATGFMKMYDIISKVISFLVEHK
HHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DAIANVAIVFASFYIAIKIFKVLKGVIFGVQIAIGLLNGTLMLTPLGWVMVAITAVIAIG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLLWKNWDKIKQVAQTLWTAIKTVFTNIWTTITTVFTNIWTTITTVASNIWTSITTVFTN
HHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IWTTITTIFTAIWTTITTIATNIWSSIVSIFTTIWNVIVTIFTPIKLFIEAVWKGILAVI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IIVGAFIWNAIVTMWTNVWNVIQPILTAIWNVITTVWTAIWTTITTIAMAIWNTIVNAWN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TIAGVVSAVMSAIWGVISSIWSSIYGTVSGIMSSIWSTITEIWNNIVSTVSDIVGNIAST
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ISDGFNSLIGTCSDIFNNIKNTVMDIFQGIWQGIKDIINGGIGMLNNFIGGVNKVISKAN
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KVPGVNIGAVSEIPKFAKGTQYSPAGMALINEEGGELRKLSSGETIIPADKSRQLMSGNS
CCCCCCCCCHHHCHHHHCCCCCCCCCCEEEECCCCHHHCCCCCCEECCCCCCHHHHCCCC
SPEINIYITGNVGTEEFFNQAGEHITNQIKLALQNM
CCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA