The gene/protein map for NC_002944 is currently unavailable.
Definition Wolbachia sp. wRi, complete genome.
Accession NC_012416
Length 1,445,873

Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is mviN [H]

Identifier: 225630673

GI number: 225630673

Start: 1033749

End: 1035245

Strand: Direct

Name: mviN [H]

Synonym: WRi_009620

Alternate gene names: 225630673

Gene position: 1033749-1035245 (Clockwise)

Preceding gene: 225630665

Following gene: 225630674

Centisome position: 71.5

GC content: 32.53

Gene sequence:

>1497_bases
ATGTTTAAAAGTATTTTCACATTTAGTTTTTTTACGGCTATTTCAAGGATCTCAGGGTTAATAAGAGATGTATTGATTGC
TACAGTTATTGGTGCAAACTCTCTTGCAGACATATTTTTTTCTTCGTTTCGCTTTGCCAATCTATTTCGAGCATTTTTTG
CAGAAGGAGCGTTCACTACCTCATTCATACCGTTATACTCGACAGAATCATATGATAATAAGAAGGCATTTAATTTTGCA
AGTAGTGTAATATCCATTACGTTTATTATCTTAGTAATTTTTTGCCTTATCATGCAAACTTTCTCCCCTTATATGATTCA
AATTTTTGCTCCTGGATTTGACCAAAGTAAGTTTACCCTTACTGTTACTTTATCAAGAATTATGATGCCCTACATAATCT
TTGTTTCAATTGCATCACTTATTGGTGGAATGCTGCAAGTAAAGCAGCATTTTGCTTCAACAGCTATTGCACCAATCGTT
TTGAATCTCTGTTTAATCATCAGTTTGTTTGTGCCTTACGTAAAAACTCCAGCGCACAACCTTTCTATAGCTGTTCTTAT
AGGAGGAATTTTCCAGCTACTTTTGATACTATTTAGTGCATACAAGTTAAAGGCAGCTTTTTCTTTTAGCCTTGAATTAA
GCAATGAAGTAAGGTTGTTTTTTAAGCGTGTGATACCTGCAATTATCAACAATTGTGTAACTCAAATAAGCTTATGGATT
GATACAATAATGGCAAGTTTTATACCAAATGCGGTGTCTTATATATATTATGCCGATAGACTAAATCAACTACCGCAGGG
AATAATCGGTACTGCAATTGGTACAGTGCTTCTTCCTCTAATTTCAAAACAGGTGAATAATACTGAAAATATAGTCAAAA
TACAGAACAAGGCTCTCAACATAGGATTAATGTTAATTATGCCAACAACTGCTGCCTTTATCATTATTCCCGACATAATT
TTACTTACGCTTTTTTCTTACGGCCGGTTTGATCATTATGCAGTGCAGCAAACTGTTCCCACTTTAATAGCATTTTCTCT
TTCTTTACCTGCATTTATTATAAATAAAGTATTGCTACCTACATTTTTTGCTAAAGGCAATCTGAAAATACCAACCATAT
TTTCGCTAATGTGTCTTGGAATTAATGTAGTGCTAAACCTTTTGTTAATGAACAAGTATCAGCATACGGGGATTGCTATT
GCTACTTCCGTTTCCACTTGGATAAACTCCATTCTATTAATTAGTTATTTAACAATAAATAAGATGTATAAGGTTAGCCA
AGCGTTATTGTTAAATATCATGAAAATTTTTGTAGCAACGGCAGTCATGTCAATAGCCCTTTATATTTTTAATTCTTTGT
TGGCAGGATTATTTTTTGATAAAATGTTGGCTCGTATTGTTTATTTAGCGACTTTAATAGCTTTGAGTGTTATTGTTTAT
TTTGGTACTCTTTACTTAACTTTTAGAGGAAGTTTGAATAATTTGAAATATGTATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AACTCTCCTTTTGCAGAGGGTTTTAAGTTTAGCCAATAAATATTTTCATTGATACTTTTACCATTATAGTTAATTGTATT
GACACTAATGAAGTAGTGGT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ACCAGATCTTTTGCTAAAGGAACAGCAAACGGTGTCATCCCAGTGCTTGACACTGGGATCCAGAAATTTTGTTGATTGTA
TGATCTGGAAAACCTTGTTT

Product: integral membrane protein MviN

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 498; Mature: 498

Protein sequence:

>498_residues
MFKSIFTFSFFTAISRISGLIRDVLIATVIGANSLADIFFSSFRFANLFRAFFAEGAFTTSFIPLYSTESYDNKKAFNFA
SSVISITFIILVIFCLIMQTFSPYMIQIFAPGFDQSKFTLTVTLSRIMMPYIIFVSIASLIGGMLQVKQHFASTAIAPIV
LNLCLIISLFVPYVKTPAHNLSIAVLIGGIFQLLLILFSAYKLKAAFSFSLELSNEVRLFFKRVIPAIINNCVTQISLWI
DTIMASFIPNAVSYIYYADRLNQLPQGIIGTAIGTVLLPLISKQVNNTENIVKIQNKALNIGLMLIMPTTAAFIIIPDII
LLTLFSYGRFDHYAVQQTVPTLIAFSLSLPAFIINKVLLPTFFAKGNLKIPTIFSLMCLGINVVLNLLLMNKYQHTGIAI
ATSVSTWINSILLISYLTINKMYKVSQALLLNIMKIFVATAVMSIALYIFNSLLAGLFFDKMLARIVYLATLIALSVIVY
FGTLYLTFRGSLNNLKYV

Sequences:

>Translated_498_residues
MFKSIFTFSFFTAISRISGLIRDVLIATVIGANSLADIFFSSFRFANLFRAFFAEGAFTTSFIPLYSTESYDNKKAFNFA
SSVISITFIILVIFCLIMQTFSPYMIQIFAPGFDQSKFTLTVTLSRIMMPYIIFVSIASLIGGMLQVKQHFASTAIAPIV
LNLCLIISLFVPYVKTPAHNLSIAVLIGGIFQLLLILFSAYKLKAAFSFSLELSNEVRLFFKRVIPAIINNCVTQISLWI
DTIMASFIPNAVSYIYYADRLNQLPQGIIGTAIGTVLLPLISKQVNNTENIVKIQNKALNIGLMLIMPTTAAFIIIPDII
LLTLFSYGRFDHYAVQQTVPTLIAFSLSLPAFIINKVLLPTFFAKGNLKIPTIFSLMCLGINVVLNLLLMNKYQHTGIAI
ATSVSTWINSILLISYLTINKMYKVSQALLLNIMKIFVATAVMSIALYIFNSLLAGLFFDKMLARIVYLATLIALSVIVY
FGTLYLTFRGSLNNLKYV
>Mature_498_residues
MFKSIFTFSFFTAISRISGLIRDVLIATVIGANSLADIFFSSFRFANLFRAFFAEGAFTTSFIPLYSTESYDNKKAFNFA
SSVISITFIILVIFCLIMQTFSPYMIQIFAPGFDQSKFTLTVTLSRIMMPYIIFVSIASLIGGMLQVKQHFASTAIAPIV
LNLCLIISLFVPYVKTPAHNLSIAVLIGGIFQLLLILFSAYKLKAAFSFSLELSNEVRLFFKRVIPAIINNCVTQISLWI
DTIMASFIPNAVSYIYYADRLNQLPQGIIGTAIGTVLLPLISKQVNNTENIVKIQNKALNIGLMLIMPTTAAFIIIPDII
LLTLFSYGRFDHYAVQQTVPTLIAFSLSLPAFIINKVLLPTFFAKGNLKIPTIFSLMCLGINVVLNLLLMNKYQHTGIAI
ATSVSTWINSILLISYLTINKMYKVSQALLLNIMKIFVATAVMSIALYIFNSLLAGLFFDKMLARIVYLATLIALSVIVY
FGTLYLTFRGSLNNLKYV

Specific function: Unknown

COG id: COG0728

COG function: function code R; Uncharacterized membrane protein, putative virulence factor

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the mviN family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1787309, Length=498, Percent_Identity=31.1244979919679, Blast_Score=231, Evalue=1e-61,

Paralogues:

None

Copy number: 10-20 Molecules/Cell [C]

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR004268 [H]

Pfam domain/function: PF03023 MVIN [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 55461; Mature: 55461

Theoretical pI: Translated: 10.10; Mature: 10.10

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.8 %Cys     (Translated Protein)
3.0 %Met     (Translated Protein)
3.8 %Cys+Met (Translated Protein)
0.8 %Cys     (Mature Protein)
3.0 %Met     (Mature Protein)
3.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MFKSIFTFSFFTAISRISGLIRDVLIATVIGANSLADIFFSSFRFANLFRAFFAEGAFTT
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH
SFIPLYSTESYDNKKAFNFASSVISITFIILVIFCLIMQTFSPYMIQIFAPGFDQSKFTL
CEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCCCEEE
TVTLSRIMMPYIIFVSIASLIGGMLQVKQHFASTAIAPIVLNLCLIISLFVPYVKTPAHN
EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
LSIAVLIGGIFQLLLILFSAYKLKAAFSFSLELSNEVRLFFKRVIPAIINNCVTQISLWI
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DTIMASFIPNAVSYIYYADRLNQLPQGIIGTAIGTVLLPLISKQVNNTENIVKIQNKALN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHEEHHHHHE
IGLMLIMPTTAAFIIIPDIILLTLFSYGRFDHYAVQQTVPTLIAFSLSLPAFIINKVLLP
EEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH
TFFAKGNLKIPTIFSLMCLGINVVLNLLLMNKYQHTGIAIATSVSTWINSILLISYLTIN
HHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KMYKVSQALLLNIMKIFVATAVMSIALYIFNSLLAGLFFDKMLARIVYLATLIALSVIVY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FGTLYLTFRGSLNNLKYV
HHHHHHEEECCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MFKSIFTFSFFTAISRISGLIRDVLIATVIGANSLADIFFSSFRFANLFRAFFAEGAFTT
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH
SFIPLYSTESYDNKKAFNFASSVISITFIILVIFCLIMQTFSPYMIQIFAPGFDQSKFTL
CEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCCCEEE
TVTLSRIMMPYIIFVSIASLIGGMLQVKQHFASTAIAPIVLNLCLIISLFVPYVKTPAHN
EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
LSIAVLIGGIFQLLLILFSAYKLKAAFSFSLELSNEVRLFFKRVIPAIINNCVTQISLWI
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DTIMASFIPNAVSYIYYADRLNQLPQGIIGTAIGTVLLPLISKQVNNTENIVKIQNKALN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHEEHHHHHE
IGLMLIMPTTAAFIIIPDIILLTLFSYGRFDHYAVQQTVPTLIAFSLSLPAFIINKVLLP
EEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH
TFFAKGNLKIPTIFSLMCLGINVVLNLLLMNKYQHTGIAIATSVSTWINSILLISYLTIN
HHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KMYKVSQALLLNIMKIFVATAVMSIALYIFNSLLAGLFFDKMLARIVYLATLIALSVIVY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FGTLYLTFRGSLNNLKYV
HHHHHHEEECCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9823893 [H]