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Definition Chloroflexus sp. Y-400-fl chromosome, complete genome.
Accession NC_012032
Length 5,268,950

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The map label for this gene is 222524990

Identifier: 222524990

GI number: 222524990

Start: 2176534

End: 2178801

Strand: Direct

Name: 222524990

Synonym: Chy400_1725

Alternate gene names: NA

Gene position: 2176534-2178801 (Clockwise)

Preceding gene: 222524989

Following gene: 222524992

Centisome position: 41.31

GC content: 57.58

Gene sequence:

>2268_bases
ATGAAACGATTTTCGCTCTCTCGTCCGACGATGGCCACCTTGCCGGTACAGCCGTTGCCGGCGTGGTGGTTGATTACGCG
CCGTGAATTACGCGATACCCTGACCGATTGGCGCTTGCTGACGCCGCTCGCGGCGCTGGCGCTGGTCTTGCCACTGCTGG
TAGCGGCTGCGGCACTGGCGCTCATCCGCTTTACTGAACAGGTTGAGCTTGCCGTTCAAATCATTCCGTTCGCGATCTTG
CTGGTTGGCTTTTTGCCTGCCGGTTTCTCGTTGATCCTGGCGCTCGAATCATTTGCCGGTGAGCGCGAACGCAATACGCT
GGAAACGCTGCTGGCTATGCCGTTAGGGGATCGTGAGCTGTACCTCGCCAAATGGACAGCGGCACTGGCTCTGCCACTGA
TCGGCGCTCTGCTCAGTCAGATGGTGTTTGGTGTCACTCTGCTGGTGTTTGCGCCTGATGTAGCTCTGGTCGCATTTCAA
CCACTCCGCCTGTTGCTGTTACTGGTGCTGGTGGTGACCATGGCGATGGTCATGGTGAGCGGGGCGGTGATCATCTCTGC
CCACGTGACGACGGTGCGGGCGGCAAGTCTGCTCTCCAGTTTGATTCTGGTGCCGCTGGCGTTGGTTGTGCAACTGATCG
CCTTTCTCATCGTTGGTAATCGCTGGGATGGAGTGATCGGTATCTGGTTGGGATTGAGTGTGGTTGTCGTGCTGCTGGTT
CACATCGGTATGCGCTCGTTCAGTCGCGAAGAGCTGCTGGCCCGCGAAGAGATTCGTAAACCCTGGTTTGGCTGGTTGTC
CCGACGACCACGCCGACAGATTGCGTGGTTTGGTGGTCATCCGGTATGGGTAGTTGCCCGGCGCGAGATGGTGGAAATCA
CGCGCGATTGGCGTTCGCTAACGTTGCTCGGGTTTCTGGCATTTCTCATGCCCACCGGTTTGACCGCTGCAATTCATGCA
ATCTCGCCCCAACTTGATAACCCGCTGGCCCTGGCACCGCTGATCCCATTCGCAGGCGTCCTGGCCGGCTTTGTCCCGAT
CAGTTTTGCGCTGGTAGCCGCACTGGAGTCGTTTGTTGGCGAACGGGAGCGTAATACGCTTGAGGCACTCTGCGCATTAC
CGATCTCTGATCGCCAGCTCTTCCTGGGTAAACTGGTTGGTACGCTGTTGATCCCTCTGCTGACAGCTCTGATCACACAG
CATCTCTTCTACGGATTGGTAGCATTCAACTTTCCGACGCTCTACGCTGATGGTATGTCGCTCATCTTACTGGGCCAGAT
GAGTCTGATGACCATTATGGTCGCGGTTGCCCTGGTCTCAGGCGCAGTAAGCTTCTCTATCCATGCCGGTAGCGTGCGGG
AAGCCTCAATGATGGCTTCAGCGATTTTGCTGCCAACCACGGCAATATTGCAGGCTCAGGCACCCTATTTCATTGCCCGT
CGGTTTGACGTAGTCTGGCTGGCAATCGCAGGGTTGCTGGTCGTGGCACTTGCCTTTTTGCGCAGTGGGATGCAGACGTT
TCAGCGGGCTGCCATCTTTTCGCGGAGCCGGGAAGAGATGAGTTTACGACGGATATGGTCGGTCTTCCGGCGTTTCTTCA
ACGAATATCAGCCGGCTGGCACGCCCCTCACTGCCTATCGCGGCTTGCCATTCTCGCCGACACGTTTCTACCGTCACGAA
TTCCCGGCACTGCTGAAAGAATTGCGTCTGCCACTCCTCGTCAGCCTGCTGGCCGCAGTGGGTGGAAGTGTGTTTGGGCT
GACGTTAGCGCGCACGCTGGTGTTGCCCCCGGTTGAGCAGGCGCTCGCCACGCTTGCCTTCGGGCCGACACCGTCGTTAT
TCCTCGTCCTCTTCATCTTTGCCAACAACCTGCGCGTATCGATTCTGTCGAACCTGCTGGCGCCGGTGAGCCTGGGGGTG
TTCCCATTTCTGGTACCGGCCACTGTCTTTGCCCAGATCGGGTATGTCTGTGGACGTTTATTCATCAACAGTGGCGGCTC
ATTGAGTGACCCGCTGATCTTCGTCAGTGCGTATCTGCTGCCGCACGGGATCATCGAGCTACCAACCTTTATGGTTAGCG
CGGCATTGGGACTGCGGATGGGGGCTGCACTGTTGAGTACGCCGGGCGATTTCAGCGTTGGTGAAAATCTGCTTTGGGCA
GCAGCCCAGACCGCGAAGGTCTGGCTCTTGCTGATTACCCCACTGGTCCTGGTTGCGGCTATTGTTGAAGGACTGGTAAC
CCCGCTGGTGATCAGGCTGGTATATTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TGCATAGTCTGGCTGAACAACCACGCCGACTGGAAGACCTCTATTTGCGCATTGTTGCTGAAGACGAAGCCGTTCCGAAT
CCACGATCCCGGTGAAGGTG

Downstream 100 bases:

>100_bases
GATCAAGCACTACTATCGGTATGGTACGCCCGGCCCGTTGCGCATACGCAGCGAAGCCGGGGTAATAGCGGACTGCCCGC
TCCCACAGCTCCAGATACTC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 755; Mature: 755

Protein sequence:

>755_residues
MKRFSLSRPTMATLPVQPLPAWWLITRRELRDTLTDWRLLTPLAALALVLPLLVAAAALALIRFTEQVELAVQIIPFAIL
LVGFLPAGFSLILALESFAGERERNTLETLLAMPLGDRELYLAKWTAALALPLIGALLSQMVFGVTLLVFAPDVALVAFQ
PLRLLLLLVLVVTMAMVMVSGAVIISAHVTTVRAASLLSSLILVPLALVVQLIAFLIVGNRWDGVIGIWLGLSVVVVLLV
HIGMRSFSREELLAREEIRKPWFGWLSRRPRRQIAWFGGHPVWVVARREMVEITRDWRSLTLLGFLAFLMPTGLTAAIHA
ISPQLDNPLALAPLIPFAGVLAGFVPISFALVAALESFVGERERNTLEALCALPISDRQLFLGKLVGTLLIPLLTALITQ
HLFYGLVAFNFPTLYADGMSLILLGQMSLMTIMVAVALVSGAVSFSIHAGSVREASMMASAILLPTTAILQAQAPYFIAR
RFDVVWLAIAGLLVVALAFLRSGMQTFQRAAIFSRSREEMSLRRIWSVFRRFFNEYQPAGTPLTAYRGLPFSPTRFYRHE
FPALLKELRLPLLVSLLAAVGGSVFGLTLARTLVLPPVEQALATLAFGPTPSLFLVLFIFANNLRVSILSNLLAPVSLGV
FPFLVPATVFAQIGYVCGRLFINSGGSLSDPLIFVSAYLLPHGIIELPTFMVSAALGLRMGAALLSTPGDFSVGENLLWA
AAQTAKVWLLLITPLVLVAAIVEGLVTPLVIRLVY

Sequences:

>Translated_755_residues
MKRFSLSRPTMATLPVQPLPAWWLITRRELRDTLTDWRLLTPLAALALVLPLLVAAAALALIRFTEQVELAVQIIPFAIL
LVGFLPAGFSLILALESFAGERERNTLETLLAMPLGDRELYLAKWTAALALPLIGALLSQMVFGVTLLVFAPDVALVAFQ
PLRLLLLLVLVVTMAMVMVSGAVIISAHVTTVRAASLLSSLILVPLALVVQLIAFLIVGNRWDGVIGIWLGLSVVVVLLV
HIGMRSFSREELLAREEIRKPWFGWLSRRPRRQIAWFGGHPVWVVARREMVEITRDWRSLTLLGFLAFLMPTGLTAAIHA
ISPQLDNPLALAPLIPFAGVLAGFVPISFALVAALESFVGERERNTLEALCALPISDRQLFLGKLVGTLLIPLLTALITQ
HLFYGLVAFNFPTLYADGMSLILLGQMSLMTIMVAVALVSGAVSFSIHAGSVREASMMASAILLPTTAILQAQAPYFIAR
RFDVVWLAIAGLLVVALAFLRSGMQTFQRAAIFSRSREEMSLRRIWSVFRRFFNEYQPAGTPLTAYRGLPFSPTRFYRHE
FPALLKELRLPLLVSLLAAVGGSVFGLTLARTLVLPPVEQALATLAFGPTPSLFLVLFIFANNLRVSILSNLLAPVSLGV
FPFLVPATVFAQIGYVCGRLFINSGGSLSDPLIFVSAYLLPHGIIELPTFMVSAALGLRMGAALLSTPGDFSVGENLLWA
AAQTAKVWLLLITPLVLVAAIVEGLVTPLVIRLVY
>Mature_755_residues
MKRFSLSRPTMATLPVQPLPAWWLITRRELRDTLTDWRLLTPLAALALVLPLLVAAAALALIRFTEQVELAVQIIPFAIL
LVGFLPAGFSLILALESFAGERERNTLETLLAMPLGDRELYLAKWTAALALPLIGALLSQMVFGVTLLVFAPDVALVAFQ
PLRLLLLLVLVVTMAMVMVSGAVIISAHVTTVRAASLLSSLILVPLALVVQLIAFLIVGNRWDGVIGIWLGLSVVVVLLV
HIGMRSFSREELLAREEIRKPWFGWLSRRPRRQIAWFGGHPVWVVARREMVEITRDWRSLTLLGFLAFLMPTGLTAAIHA
ISPQLDNPLALAPLIPFAGVLAGFVPISFALVAALESFVGERERNTLEALCALPISDRQLFLGKLVGTLLIPLLTALITQ
HLFYGLVAFNFPTLYADGMSLILLGQMSLMTIMVAVALVSGAVSFSIHAGSVREASMMASAILLPTTAILQAQAPYFIAR
RFDVVWLAIAGLLVVALAFLRSGMQTFQRAAIFSRSREEMSLRRIWSVFRRFFNEYQPAGTPLTAYRGLPFSPTRFYRHE
FPALLKELRLPLLVSLLAAVGGSVFGLTLARTLVLPPVEQALATLAFGPTPSLFLVLFIFANNLRVSILSNLLAPVSLGV
FPFLVPATVFAQIGYVCGRLFINSGGSLSDPLIFVSAYLLPHGIIELPTFMVSAALGLRMGAALLSTPGDFSVGENLLWA
AAQTAKVWLLLITPLVLVAAIVEGLVTPLVIRLVY

Specific function: Unknown

COG id: COG1300

COG function: function code S; Uncharacterized membrane protein

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 82276; Mature: 82276

Theoretical pI: Translated: 10.66; Mature: 10.66

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.3 %Cys     (Translated Protein)
2.6 %Met     (Translated Protein)
2.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.3 %Cys     (Mature Protein)
2.6 %Met     (Mature Protein)
2.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKRFSLSRPTMATLPVQPLPAWWLITRRELRDTLTDWRLLTPLAALALVLPLLVAAAALA
CCCCCCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LIRFTEQVELAVQIIPFAILLVGFLPAGFSLILALESFAGERERNTLETLLAMPLGDREL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHH
YLAKWTAALALPLIGALLSQMVFGVTLLVFAPDVALVAFQPLRLLLLLVLVVTMAMVMVS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
GAVIISAHVTTVRAASLLSSLILVPLALVVQLIAFLIVGNRWDGVIGIWLGLSVVVVLLV
CHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
HIGMRSFSREELLAREEIRKPWFGWLSRRPRRQIAWFGGHPVWVVARREMVEITRDWRSL
HHHHHCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCCCCCEEEECCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHH
TLLGFLAFLMPTGLTAAIHAISPQLDNPLALAPLIPFAGVLAGFVPISFALVAALESFVG
HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
ERERNTLEALCALPISDRQLFLGKLVGTLLIPLLTALITQHLFYGLVAFNFPTLYADGMS
HHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCHH
LILLGQMSLMTIMVAVALVSGAVSFSIHAGSVREASMMASAILLPTTAILQAQAPYFIAR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHH
RFDVVWLAIAGLLVVALAFLRSGMQTFQRAAIFSRSREEMSLRRIWSVFRRFFNEYQPAG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
TPLTAYRGLPFSPTRFYRHEFPALLKELRLPLLVSLLAAVGGSVFGLTLARTLVLPPVEQ
CCCHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCHHH
ALATLAFGPTPSLFLVLFIFANNLRVSILSNLLAPVSLGVFPFLVPATVFAQIGYVCGRL
HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FINSGGSLSDPLIFVSAYLLPHGIIELPTFMVSAALGLRMGAALLSTPGDFSVGENLLWA
HHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHH
AAQTAKVWLLLITPLVLVAAIVEGLVTPLVIRLVY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MKRFSLSRPTMATLPVQPLPAWWLITRRELRDTLTDWRLLTPLAALALVLPLLVAAAALA
CCCCCCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LIRFTEQVELAVQIIPFAILLVGFLPAGFSLILALESFAGERERNTLETLLAMPLGDREL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHH
YLAKWTAALALPLIGALLSQMVFGVTLLVFAPDVALVAFQPLRLLLLLVLVVTMAMVMVS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
GAVIISAHVTTVRAASLLSSLILVPLALVVQLIAFLIVGNRWDGVIGIWLGLSVVVVLLV
CHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
HIGMRSFSREELLAREEIRKPWFGWLSRRPRRQIAWFGGHPVWVVARREMVEITRDWRSL
HHHHHCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCCCCCEEEECCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHH
TLLGFLAFLMPTGLTAAIHAISPQLDNPLALAPLIPFAGVLAGFVPISFALVAALESFVG
HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
ERERNTLEALCALPISDRQLFLGKLVGTLLIPLLTALITQHLFYGLVAFNFPTLYADGMS
HHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCHH
LILLGQMSLMTIMVAVALVSGAVSFSIHAGSVREASMMASAILLPTTAILQAQAPYFIAR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHH
RFDVVWLAIAGLLVVALAFLRSGMQTFQRAAIFSRSREEMSLRRIWSVFRRFFNEYQPAG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
TPLTAYRGLPFSPTRFYRHEFPALLKELRLPLLVSLLAAVGGSVFGLTLARTLVLPPVEQ
CCCHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCHHH
ALATLAFGPTPSLFLVLFIFANNLRVSILSNLLAPVSLGVFPFLVPATVFAQIGYVCGRL
HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FINSGGSLSDPLIFVSAYLLPHGIIELPTFMVSAALGLRMGAALLSTPGDFSVGENLLWA
HHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHH
AAQTAKVWLLLITPLVLVAAIVEGLVTPLVIRLVY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA