| Definition | Chloroflexus sp. Y-400-fl chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_012032 |
| Length | 5,268,950 |
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The map label for this gene is 222524990
Identifier: 222524990
GI number: 222524990
Start: 2176534
End: 2178801
Strand: Direct
Name: 222524990
Synonym: Chy400_1725
Alternate gene names: NA
Gene position: 2176534-2178801 (Clockwise)
Preceding gene: 222524989
Following gene: 222524992
Centisome position: 41.31
GC content: 57.58
Gene sequence:
>2268_bases ATGAAACGATTTTCGCTCTCTCGTCCGACGATGGCCACCTTGCCGGTACAGCCGTTGCCGGCGTGGTGGTTGATTACGCG CCGTGAATTACGCGATACCCTGACCGATTGGCGCTTGCTGACGCCGCTCGCGGCGCTGGCGCTGGTCTTGCCACTGCTGG TAGCGGCTGCGGCACTGGCGCTCATCCGCTTTACTGAACAGGTTGAGCTTGCCGTTCAAATCATTCCGTTCGCGATCTTG CTGGTTGGCTTTTTGCCTGCCGGTTTCTCGTTGATCCTGGCGCTCGAATCATTTGCCGGTGAGCGCGAACGCAATACGCT GGAAACGCTGCTGGCTATGCCGTTAGGGGATCGTGAGCTGTACCTCGCCAAATGGACAGCGGCACTGGCTCTGCCACTGA TCGGCGCTCTGCTCAGTCAGATGGTGTTTGGTGTCACTCTGCTGGTGTTTGCGCCTGATGTAGCTCTGGTCGCATTTCAA CCACTCCGCCTGTTGCTGTTACTGGTGCTGGTGGTGACCATGGCGATGGTCATGGTGAGCGGGGCGGTGATCATCTCTGC CCACGTGACGACGGTGCGGGCGGCAAGTCTGCTCTCCAGTTTGATTCTGGTGCCGCTGGCGTTGGTTGTGCAACTGATCG CCTTTCTCATCGTTGGTAATCGCTGGGATGGAGTGATCGGTATCTGGTTGGGATTGAGTGTGGTTGTCGTGCTGCTGGTT CACATCGGTATGCGCTCGTTCAGTCGCGAAGAGCTGCTGGCCCGCGAAGAGATTCGTAAACCCTGGTTTGGCTGGTTGTC CCGACGACCACGCCGACAGATTGCGTGGTTTGGTGGTCATCCGGTATGGGTAGTTGCCCGGCGCGAGATGGTGGAAATCA CGCGCGATTGGCGTTCGCTAACGTTGCTCGGGTTTCTGGCATTTCTCATGCCCACCGGTTTGACCGCTGCAATTCATGCA ATCTCGCCCCAACTTGATAACCCGCTGGCCCTGGCACCGCTGATCCCATTCGCAGGCGTCCTGGCCGGCTTTGTCCCGAT CAGTTTTGCGCTGGTAGCCGCACTGGAGTCGTTTGTTGGCGAACGGGAGCGTAATACGCTTGAGGCACTCTGCGCATTAC CGATCTCTGATCGCCAGCTCTTCCTGGGTAAACTGGTTGGTACGCTGTTGATCCCTCTGCTGACAGCTCTGATCACACAG CATCTCTTCTACGGATTGGTAGCATTCAACTTTCCGACGCTCTACGCTGATGGTATGTCGCTCATCTTACTGGGCCAGAT GAGTCTGATGACCATTATGGTCGCGGTTGCCCTGGTCTCAGGCGCAGTAAGCTTCTCTATCCATGCCGGTAGCGTGCGGG AAGCCTCAATGATGGCTTCAGCGATTTTGCTGCCAACCACGGCAATATTGCAGGCTCAGGCACCCTATTTCATTGCCCGT CGGTTTGACGTAGTCTGGCTGGCAATCGCAGGGTTGCTGGTCGTGGCACTTGCCTTTTTGCGCAGTGGGATGCAGACGTT TCAGCGGGCTGCCATCTTTTCGCGGAGCCGGGAAGAGATGAGTTTACGACGGATATGGTCGGTCTTCCGGCGTTTCTTCA ACGAATATCAGCCGGCTGGCACGCCCCTCACTGCCTATCGCGGCTTGCCATTCTCGCCGACACGTTTCTACCGTCACGAA TTCCCGGCACTGCTGAAAGAATTGCGTCTGCCACTCCTCGTCAGCCTGCTGGCCGCAGTGGGTGGAAGTGTGTTTGGGCT GACGTTAGCGCGCACGCTGGTGTTGCCCCCGGTTGAGCAGGCGCTCGCCACGCTTGCCTTCGGGCCGACACCGTCGTTAT TCCTCGTCCTCTTCATCTTTGCCAACAACCTGCGCGTATCGATTCTGTCGAACCTGCTGGCGCCGGTGAGCCTGGGGGTG TTCCCATTTCTGGTACCGGCCACTGTCTTTGCCCAGATCGGGTATGTCTGTGGACGTTTATTCATCAACAGTGGCGGCTC ATTGAGTGACCCGCTGATCTTCGTCAGTGCGTATCTGCTGCCGCACGGGATCATCGAGCTACCAACCTTTATGGTTAGCG CGGCATTGGGACTGCGGATGGGGGCTGCACTGTTGAGTACGCCGGGCGATTTCAGCGTTGGTGAAAATCTGCTTTGGGCA GCAGCCCAGACCGCGAAGGTCTGGCTCTTGCTGATTACCCCACTGGTCCTGGTTGCGGCTATTGTTGAAGGACTGGTAAC CCCGCTGGTGATCAGGCTGGTATATTGA
Upstream 100 bases:
>100_bases TGCATAGTCTGGCTGAACAACCACGCCGACTGGAAGACCTCTATTTGCGCATTGTTGCTGAAGACGAAGCCGTTCCGAAT CCACGATCCCGGTGAAGGTG
Downstream 100 bases:
>100_bases GATCAAGCACTACTATCGGTATGGTACGCCCGGCCCGTTGCGCATACGCAGCGAAGCCGGGGTAATAGCGGACTGCCCGC TCCCACAGCTCCAGATACTC
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 755; Mature: 755
Protein sequence:
>755_residues MKRFSLSRPTMATLPVQPLPAWWLITRRELRDTLTDWRLLTPLAALALVLPLLVAAAALALIRFTEQVELAVQIIPFAIL LVGFLPAGFSLILALESFAGERERNTLETLLAMPLGDRELYLAKWTAALALPLIGALLSQMVFGVTLLVFAPDVALVAFQ PLRLLLLLVLVVTMAMVMVSGAVIISAHVTTVRAASLLSSLILVPLALVVQLIAFLIVGNRWDGVIGIWLGLSVVVVLLV HIGMRSFSREELLAREEIRKPWFGWLSRRPRRQIAWFGGHPVWVVARREMVEITRDWRSLTLLGFLAFLMPTGLTAAIHA ISPQLDNPLALAPLIPFAGVLAGFVPISFALVAALESFVGERERNTLEALCALPISDRQLFLGKLVGTLLIPLLTALITQ HLFYGLVAFNFPTLYADGMSLILLGQMSLMTIMVAVALVSGAVSFSIHAGSVREASMMASAILLPTTAILQAQAPYFIAR RFDVVWLAIAGLLVVALAFLRSGMQTFQRAAIFSRSREEMSLRRIWSVFRRFFNEYQPAGTPLTAYRGLPFSPTRFYRHE FPALLKELRLPLLVSLLAAVGGSVFGLTLARTLVLPPVEQALATLAFGPTPSLFLVLFIFANNLRVSILSNLLAPVSLGV FPFLVPATVFAQIGYVCGRLFINSGGSLSDPLIFVSAYLLPHGIIELPTFMVSAALGLRMGAALLSTPGDFSVGENLLWA AAQTAKVWLLLITPLVLVAAIVEGLVTPLVIRLVY
Sequences:
>Translated_755_residues MKRFSLSRPTMATLPVQPLPAWWLITRRELRDTLTDWRLLTPLAALALVLPLLVAAAALALIRFTEQVELAVQIIPFAIL LVGFLPAGFSLILALESFAGERERNTLETLLAMPLGDRELYLAKWTAALALPLIGALLSQMVFGVTLLVFAPDVALVAFQ PLRLLLLLVLVVTMAMVMVSGAVIISAHVTTVRAASLLSSLILVPLALVVQLIAFLIVGNRWDGVIGIWLGLSVVVVLLV HIGMRSFSREELLAREEIRKPWFGWLSRRPRRQIAWFGGHPVWVVARREMVEITRDWRSLTLLGFLAFLMPTGLTAAIHA ISPQLDNPLALAPLIPFAGVLAGFVPISFALVAALESFVGERERNTLEALCALPISDRQLFLGKLVGTLLIPLLTALITQ HLFYGLVAFNFPTLYADGMSLILLGQMSLMTIMVAVALVSGAVSFSIHAGSVREASMMASAILLPTTAILQAQAPYFIAR RFDVVWLAIAGLLVVALAFLRSGMQTFQRAAIFSRSREEMSLRRIWSVFRRFFNEYQPAGTPLTAYRGLPFSPTRFYRHE FPALLKELRLPLLVSLLAAVGGSVFGLTLARTLVLPPVEQALATLAFGPTPSLFLVLFIFANNLRVSILSNLLAPVSLGV FPFLVPATVFAQIGYVCGRLFINSGGSLSDPLIFVSAYLLPHGIIELPTFMVSAALGLRMGAALLSTPGDFSVGENLLWA AAQTAKVWLLLITPLVLVAAIVEGLVTPLVIRLVY >Mature_755_residues MKRFSLSRPTMATLPVQPLPAWWLITRRELRDTLTDWRLLTPLAALALVLPLLVAAAALALIRFTEQVELAVQIIPFAIL LVGFLPAGFSLILALESFAGERERNTLETLLAMPLGDRELYLAKWTAALALPLIGALLSQMVFGVTLLVFAPDVALVAFQ PLRLLLLLVLVVTMAMVMVSGAVIISAHVTTVRAASLLSSLILVPLALVVQLIAFLIVGNRWDGVIGIWLGLSVVVVLLV HIGMRSFSREELLAREEIRKPWFGWLSRRPRRQIAWFGGHPVWVVARREMVEITRDWRSLTLLGFLAFLMPTGLTAAIHA ISPQLDNPLALAPLIPFAGVLAGFVPISFALVAALESFVGERERNTLEALCALPISDRQLFLGKLVGTLLIPLLTALITQ HLFYGLVAFNFPTLYADGMSLILLGQMSLMTIMVAVALVSGAVSFSIHAGSVREASMMASAILLPTTAILQAQAPYFIAR RFDVVWLAIAGLLVVALAFLRSGMQTFQRAAIFSRSREEMSLRRIWSVFRRFFNEYQPAGTPLTAYRGLPFSPTRFYRHE FPALLKELRLPLLVSLLAAVGGSVFGLTLARTLVLPPVEQALATLAFGPTPSLFLVLFIFANNLRVSILSNLLAPVSLGV FPFLVPATVFAQIGYVCGRLFINSGGSLSDPLIFVSAYLLPHGIIELPTFMVSAALGLRMGAALLSTPGDFSVGENLLWA AAQTAKVWLLLITPLVLVAAIVEGLVTPLVIRLVY
Specific function: Unknown
COG id: COG1300
COG function: function code S; Uncharacterized membrane protein
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 82276; Mature: 82276
Theoretical pI: Translated: 10.66; Mature: 10.66
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.3 %Cys (Translated Protein) 2.6 %Met (Translated Protein) 2.9 %Cys+Met (Translated Protein) 0.3 %Cys (Mature Protein) 2.6 %Met (Mature Protein) 2.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKRFSLSRPTMATLPVQPLPAWWLITRRELRDTLTDWRLLTPLAALALVLPLLVAAAALA CCCCCCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LIRFTEQVELAVQIIPFAILLVGFLPAGFSLILALESFAGERERNTLETLLAMPLGDREL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHH YLAKWTAALALPLIGALLSQMVFGVTLLVFAPDVALVAFQPLRLLLLLVLVVTMAMVMVS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC GAVIISAHVTTVRAASLLSSLILVPLALVVQLIAFLIVGNRWDGVIGIWLGLSVVVVLLV CHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH HIGMRSFSREELLAREEIRKPWFGWLSRRPRRQIAWFGGHPVWVVARREMVEITRDWRSL HHHHHCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCCCCCEEEECCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHH TLLGFLAFLMPTGLTAAIHAISPQLDNPLALAPLIPFAGVLAGFVPISFALVAALESFVG HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC ERERNTLEALCALPISDRQLFLGKLVGTLLIPLLTALITQHLFYGLVAFNFPTLYADGMS HHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCHH LILLGQMSLMTIMVAVALVSGAVSFSIHAGSVREASMMASAILLPTTAILQAQAPYFIAR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHH RFDVVWLAIAGLLVVALAFLRSGMQTFQRAAIFSRSREEMSLRRIWSVFRRFFNEYQPAG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC TPLTAYRGLPFSPTRFYRHEFPALLKELRLPLLVSLLAAVGGSVFGLTLARTLVLPPVEQ CCCHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCHHH ALATLAFGPTPSLFLVLFIFANNLRVSILSNLLAPVSLGVFPFLVPATVFAQIGYVCGRL HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FINSGGSLSDPLIFVSAYLLPHGIIELPTFMVSAALGLRMGAALLSTPGDFSVGENLLWA HHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHH AAQTAKVWLLLITPLVLVAAIVEGLVTPLVIRLVY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure MKRFSLSRPTMATLPVQPLPAWWLITRRELRDTLTDWRLLTPLAALALVLPLLVAAAALA CCCCCCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LIRFTEQVELAVQIIPFAILLVGFLPAGFSLILALESFAGERERNTLETLLAMPLGDREL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHH YLAKWTAALALPLIGALLSQMVFGVTLLVFAPDVALVAFQPLRLLLLLVLVVTMAMVMVS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC GAVIISAHVTTVRAASLLSSLILVPLALVVQLIAFLIVGNRWDGVIGIWLGLSVVVVLLV CHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH HIGMRSFSREELLAREEIRKPWFGWLSRRPRRQIAWFGGHPVWVVARREMVEITRDWRSL HHHHHCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCCCCCEEEECCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHH TLLGFLAFLMPTGLTAAIHAISPQLDNPLALAPLIPFAGVLAGFVPISFALVAALESFVG HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC ERERNTLEALCALPISDRQLFLGKLVGTLLIPLLTALITQHLFYGLVAFNFPTLYADGMS HHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCHH LILLGQMSLMTIMVAVALVSGAVSFSIHAGSVREASMMASAILLPTTAILQAQAPYFIAR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHH RFDVVWLAIAGLLVVALAFLRSGMQTFQRAAIFSRSREEMSLRRIWSVFRRFFNEYQPAG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC TPLTAYRGLPFSPTRFYRHEFPALLKELRLPLLVSLLAAVGGSVFGLTLARTLVLPPVEQ CCCHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCHHH ALATLAFGPTPSLFLVLFIFANNLRVSILSNLLAPVSLGVFPFLVPATVFAQIGYVCGRL HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FINSGGSLSDPLIFVSAYLLPHGIIELPTFMVSAALGLRMGAALLSTPGDFSVGENLLWA HHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHH AAQTAKVWLLLITPLVLVAAIVEGLVTPLVIRLVY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA