| Definition | Chloroflexus sp. Y-400-fl chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_012032 |
| Length | 5,268,950 |
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The map label for this gene is 222524734
Identifier: 222524734
GI number: 222524734
Start: 1849462
End: 1856934
Strand: Reverse
Name: 222524734
Synonym: Chy400_1461
Alternate gene names: NA
Gene position: 1856934-1849462 (Counterclockwise)
Preceding gene: 222524735
Following gene: 222524733
Centisome position: 35.24
GC content: 60.22
Gene sequence:
>7473_bases ATGCTCCGCTATCGAGTCTGGTTCGTCCGCCTTGGGCTGACGGCCATTTTACTGTTAGGGTTCTACCTGCGGACGCTAAA TATCGCTGATTGGGACTCTGGAACCGGTCAGCATCCTGATGAGCGCTTTTTTACGTATGTCGCCTCAACGGTACGACTAC CGGGCGATGTAGCTGAGTTTTACGACTCCAGTCGTTCACCACTTAATCCGCGTAATTACGAACAGTTTCCCCTTTACGTC TACGGGCCGCTCCCTATCATGCTGACGCGGGCCGTCGCGGTGATGCTGACTCCACCAGAAGAGCTGCCGGCGCAGGTGCT CACGATTGCCGGGCCACCACGGGTAGGGGCCGATCCAACAGCGCCAACCGAACGACGTACCGATTACGGGCCGGCAATTG CCAACCCGGAACGAGCCTGGCCACGCCTGACACCTCTGATCTGGTGGCTGAATCCCGACCGCGTTAATCTGACGAGTTAC GGTGAGATTGTTAAGGTTGGACGCATCCTGGCGGCGCTGTTTGATCTCGGTAGCGTCGTCCTTATCTATCTGATTGGCTG CCGTTTGTTTCGGCGACGGGTGGGCCTGATAGCGGCACTGCTGACAGCACTCACGGTCATGCATATTCAGCAGAGCCATT TCTTTGTCGATCCGGCCTTTTCAACCTTCTTCTGCCTACTCGGGTTGTACTGGACGGTGCGGGTTGCCCAGGGGGGTGGC GTTGGTTCGTATCTCGCGCTCGGTCTGAGTATCGGAGCAGCAAGTGCTAATCGGATCACGATGGTGACGATTGGTGGCCT GGCGGTGGTAGCAACACTGATTGCGGCTCAACGGGTATTGCAGGGGCAGCGCTGGTCGACTCTCGTCAATCGCTGGGTGC AGCGCGAACTGTTGCTCTTGATCCTCGCCGGCCTGGTCTCGTTTGTCGCATTCCGCGCCCTCGCTCCCGATGCGTTTATC 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CTGCTTGCCCTCGCGACCGCGGTTGCGCTTCCCTGGTTGTGGGCAGCAACGCAGCGATTGCTTCCTTTCTGGCGTTGGGG ACTACGCAGCCTGTGCGCTCTCTTTCTGGCTGCCGGCCTGGTGTACCCGGTCACCGCTGCTCCGGCCCGGATTGCCGACC GCTGGAACCCTGACGCACCGCGCACGCTTGATGGCGCGGCATTCCTGAACACTATCACCGAGATGCGCAATGGCCCCGGC TACTCACTTGATGAGGATGCGGCAACGATTGACTGGTTGCGGCGGAATGTGCGGGGAACGGCGATCATTCTCGAAGCTCA TCAACCATCGTATCAGTGGGCCGGGCGTATCGCAACCTTTACCGGTCTGCCGACGATCCTCGGTTGGGAGTGGCACCAGA TTCAGCAGCGCAGTGCAGTCAACGCAACGCCGGTCATCAATTATCGTCAACAGGTCATTGCCGCGATCTATAACTCTCCC GATCCGACAACAGCGCTGGCGGCGATCCGTCGCTATGGCGTGGAATATATCTATGTCGGCGGGGTTGAACGACAACTCTA CAGTGCTGAAGGACTGGCAAAATTCGCTGCGTTGGTAGATCAGGGCGAACTGGAACGGGTCTTTCAGGCCGGGCAGAGCG TGCTCTATCGCGTGCGCACACCGGGCCAGCCACAGATGCTGACCAATGATCTGCCGATCCGCGCCCCGTCGCTGCGCACG ACACCGGCGCTGGAGTTGTTGCAGCCGGTGCAGGATTTACCTTCAGTGGGCCGATTGAGCTGGAATACCATGCTGAACGA GCAGCCGTGGCTGGCTATCGTGGCCTGGTTACTCGTCTGGTATCTCATCGCCGGGCTGGGTGTATTGCCTGCCTATGCGG CTCTGGGGGTACACGGTCTGGCCTGGGCACGCCCGATTGGCTTGATCTTGTTGGGGTATGTCATCTGGTTGCCGGCCAGC 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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases GCGAACTGGTCGGCGATGTGCTGATCTGGTGGATCACCGTTCAGGTCTTTACCATTGTTGGCTGGCCGGCTGCGGTGCGG CTGTTTGGTCATCTACCCGG
Product: tetratricopeptide repeat-containing protein
Products: NA
Alternate protein names: TPR Repeat-Containing Protein; Chlor_arch_yyy Domain; Glycosyl Transferase Family; Tetratricopeptide Repeat-Containing Protein
Number of amino acids: Translated: 2490; Mature: 2490
Protein sequence:
>2490_residues MLRYRVWFVRLGLTAILLLGFYLRTLNIADWDSGTGQHPDERFFTYVASTVRLPGDVAEFYDSSRSPLNPRNYEQFPLYV YGPLPIMLTRAVAVMLTPPEELPAQVLTIAGPPRVGADPTAPTERRTDYGPAIANPERAWPRLTPLIWWLNPDRVNLTSY GEIVKVGRILAALFDLGSVVLIYLIGCRLFRRRVGLIAALLTALTVMHIQQSHFFVDPAFSTFFCLLGLYWTVRVAQGGG VGSYLALGLSIGAASANRITMVTIGGLAVVATLIAAQRVLQGQRWSTLVNRWVQRELLLLILAGLVSFVAFRALAPDAFI GSRADSPRIDGPSLLHGAGFFDIRLDPRFRENLTTVRALVTGEYDFPPGQQWVGRPAYIFPWLNMVLWGMGPLLGLAAWG GWLFFAGRYVRRGWQWALHPTSLIGRPWHPAWVLWCWATFYFAWQGNQFAVTLRYLLPIYGALTVLAAWALVTLARWGRR RLHAVVAVRSISWRQRLTGTTQRLLFWTARVALPVVLVATAVWAYAFSRIYTVPHSRVQAARWLAEHAQPGSVVMSERWD DPLPLQATTNAAWNITFFGIDSSPYAEDEPVKYFGNGSEPGLLDQLDQADYITLTSNRVYDSTSRLRMRYPALMRYYHYL FNGELGFELVAEITSYPTILGIRIPDWMAEEAFSVYDHPRVLIFQKTPLYSRERAERLITENVEWGEVYKSPLLIADRNP TALRLTESVWPRYAAGGEWWSWLGTTPFAAMWWLFWLEGLGLAIFAVIGPRLRNLPDRGYSLAKIVGLLLVAYLAWLGGS LHLVPFAPTTLWTIGMVVLGVGGFIGWRERTTLRRIWHERWSALAMAEMVFLAFLLIGLTLRWFNPDLWHPARGGEKPMD FAYLNAVLRSAAFPPLDPWHAGGYINYYYFGFVLVGALIHLSGVAPAVGYNLGVATIFALTALGAFGVVYNLLAARSPQP QRERTALIAAGLAPVLVLLIGNLAQAGWFLNGYAAEQMAKGRYEWAFWDATRITPGTINEFPFFTFLFADLHAHMIVMPL SLAALGLALAWMRKGTAAHWWIIGLLGLVAGAIRATNTWDYPTFVGLAGLMVALATGRRWRQAGRGWPATLLVALVVGAA PALVGNILFAPFIASFATESSGIALWQGPGFTLLETILTAERTTTGQIVQIGGHWLIIWFVFVGLWAWRQRESLLIVIVP LAVWLVALGLNLPAILPLIGVLVTTAWLLWRIRRRSFTIIVPLLWAFGGIGLWAMVEMVVVRGDVGRMNTVFKFGLHTWI LLALATAVALPWLWAATQRLLPFWRWGLRSLCALFLAAGLVYPVTAAPARIADRWNPDAPRTLDGAAFLNTITEMRNGPG YSLDEDAATIDWLRRNVRGTAIILEAHQPSYQWAGRIATFTGLPTILGWEWHQIQQRSAVNATPVINYRQQVIAAIYNSP DPTTALAAIRRYGVEYIYVGGVERQLYSAEGLAKFAALVDQGELERVFQAGQSVLYRVRTPGQPQMLTNDLPIRAPSLRT TPALELLQPVQDLPSVGRLSWNTMLNEQPWLAIVAWLLVWYLIAGLGVLPAYAALGVHGLAWARPIGLILLGYVIWLPAS LGWWRYDSAGLAGGLLVLIGIGLFLWWVGVRPERAAWRSLLPGEAIFLAGFAAMTIIRALNPDLWHPVWGGEKPMEQGFL NAILRSPQMPPYDPFYSNGYINYYYYGLYLMSVPIKLLGIDSAVGFNLALATLYGMLLAGAYELGTRLGGRRRYGIVALS LIGLMGNLTSLIPAGWSLGAQGLRLLLSGQAELLGDWFVGPSRVIPYTINEFPLFSFLYADLHPHLIALPLALLAIVCGW HLILRPQRPLWLLSALTLGTLAVTNSWDFPTYGLLCGLAIIAGAIRRTGWRWQPLTLAVVQAVGLGLGSLLLFAPFFDRY WPMVRGIGLVTTGVTLPLDYLLIYGVPLIIVIPVIAGGLLQRWRSGFAGRRWALIASGIGLLMIIGAAVPELALRLSLFV VLMVTTILLMRRAAGAPAWYALLLCWVAWAVSLGVEIVYIRDHLDGSDWYRMNTVFKFGLHVWVLLGLAAAGLLPRLLRG LQRYGGSSAVMAGLAIIAIPAIIAGSYAPVAIPSRLVTRFDVETGPTLDGMAFMEQATFTYDCQAFGGCAPDTAFVQVDL SGDAAAIRWLNRQIDGTPVVLQSSLWFYRAYAIRVAAATGLPTVISALHADEQRDPVVTGQRVRDVETFFTTTDPDTALR ILARYNVDYVYVGGVERAFYPQGLSKFAVLRDRYLRSVYEQDGVTIYAVTDLPDSYRFLRAERLPVAQPAPPPSPPPNEP VVDLAELEAAVAAQPTNGPLAFGLAEAYRRQGRLTEAAEVLATAAAANPDDVGLHHLWGDILADAGRYEEAEQAYLAAVR ASPTAGNYNKLATALIDWGWLDKAEIALGQALSTDPGLPDPYFQLARLFMQRNQTTLAQDALQRYLQLAPEGRWAGEARQ MLAHLNGGQP
Sequences:
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Specific function: Unknown
COG id: COG5427
COG function: function code S; Uncharacterized membrane protein
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 275746; Mature: 275746
Theoretical pI: Translated: 9.48; Mature: 9.48
Prosite motif: PS50005 TPR L=RR ; PS50293 TPR_REGION
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.4 %Cys (Translated Protein) 1.7 %Met (Translated Protein) 2.1 %Cys+Met (Translated Protein) 0.4 %Cys (Mature Protein) 1.7 %Met (Mature Protein) 2.1 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
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