| Definition | Macrococcus caseolyticus JCSC5402, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_011999 |
| Length | 2,102,324 |
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The map label for this gene is 222150922
Identifier: 222150922
GI number: 222150922
Start: 725638
End: 726789
Strand: Direct
Name: 222150922
Synonym: MCCL_0672
Alternate gene names: NA
Gene position: 725638-726789 (Clockwise)
Preceding gene: 222150921
Following gene: 222150923
Centisome position: 34.52
GC content: 22.4
Gene sequence:
>1152_bases TTGTTTATAGGTATCTTTATTCTATTATATAGTTCGGTGATGTTATTTTTTATTAATACTAAGGAGATAAAATATATTAT TTTTTCAATAATCAACTTATTAATATATATATTAATTTTGTACTACCACCATAGAATCAAATCATTGCCTACTTCAGGAA ATGATGATATTAGATTTGAAAGGTTAGCACTTAATTATTATGATGCTTGGATCAATGGATATACTCCCAATGTATTTCAA AATAGCACATTTTATTCTCAAATGATTGCATCCTTTTACTATTTATTTGGATATAATTCATACATCCCGGGGTTATTAAA TATACTAATACATTTGATGAGTATCTTGATATTAATTAAAATATGCGAAATATTGTTGGATAATAAAGTCTATACTTTAA TAATTTTAACTCTATATGCTTATAATCCATTTCATATTTCTTACACAATTATCACTATGAGAGAGATTTCAATAATATTC TTAATACTATGTTTCATTTACTGCATAATAAAGTATCACATCACCAAAAAAAACAAATATATTTTATTTAGTATATTTTC ATCTATTTTAGCTAGTTTATTTCATATTGGGTTACTTACGACTCTATTTTTTATTGCTATATATATTTTAATATTTAGTA AAATAAAAATACTGACAAAAGTTATTTTTTCCTCAACTTTATTTTTAGTATTTGCATCATTATTAATAGTATCAAATGAT ACAAAATTACAAATATTAGATAAAGGAAGAGAAGATGTAGAGATGTATAGAACAGACTATATCATTTCAAAACCAAGTAA TATCATTGAATATCCTATATATATTATTAAGAAATCATATTATTTATTAGCAAAACCATTTGTAATGGATATAAAAGGAA TTCCAGATCTAATAGCTTATGCAGAAAAATTATTATATGTTGTACCTTTAATATTAGCTTTGATTTTTTATAAAAGGTTA ATAAAAAATAAACCTATAATTATTCTTATATTTTTTTGCTTATTTCTTTCGATAGTATTTGGAATTGGGACTGAAAATTA TGGTACAGGGATCAGACATAGAGAAAAATTTGTATTTCTATTATATATAATACCTTTTTATATTTTGTCTGAAAAAAGGA GAGTAAGGATAAAAAGTGAAAAACATGTTTAG
Upstream 100 bases:
>100_bases ATAAGGAGATAAAAAATGAGATTAAATAATAAAATAATAATAAATTATTTTAAGTTTACTTACTTTATTTCTTCTATTAT TTCTTCTGAAATATGAATTA
Downstream 100 bases:
>100_bases CATACTTAGATTATTTTCAAAAATATTATCAGTTTTCCCAAATTCTTTTTTATATTTTTTATATGAAATAAATAGTTTTT CTGAAGCAAAAATTTTTATA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 383; Mature: 383
Protein sequence:
>383_residues MFIGIFILLYSSVMLFFINTKEIKYIIFSIINLLIYILILYYHHRIKSLPTSGNDDIRFERLALNYYDAWINGYTPNVFQ NSTFYSQMIASFYYLFGYNSYIPGLLNILIHLMSILILIKICEILLDNKVYTLIILTLYAYNPFHISYTIITMREISIIF LILCFIYCIIKYHITKKNKYILFSIFSSILASLFHIGLLTTLFFIAIYILIFSKIKILTKVIFSSTLFLVFASLLIVSND TKLQILDKGREDVEMYRTDYIISKPSNIIEYPIYIIKKSYYLLAKPFVMDIKGIPDLIAYAEKLLYVVPLILALIFYKRL IKNKPIIILIFFCLFLSIVFGIGTENYGTGIRHREKFVFLLYIIPFYILSEKRRVRIKSEKHV
Sequences:
>Translated_383_residues MFIGIFILLYSSVMLFFINTKEIKYIIFSIINLLIYILILYYHHRIKSLPTSGNDDIRFERLALNYYDAWINGYTPNVFQ NSTFYSQMIASFYYLFGYNSYIPGLLNILIHLMSILILIKICEILLDNKVYTLIILTLYAYNPFHISYTIITMREISIIF LILCFIYCIIKYHITKKNKYILFSIFSSILASLFHIGLLTTLFFIAIYILIFSKIKILTKVIFSSTLFLVFASLLIVSND TKLQILDKGREDVEMYRTDYIISKPSNIIEYPIYIIKKSYYLLAKPFVMDIKGIPDLIAYAEKLLYVVPLILALIFYKRL IKNKPIIILIFFCLFLSIVFGIGTENYGTGIRHREKFVFLLYIIPFYILSEKRRVRIKSEKHV >Mature_383_residues MFIGIFILLYSSVMLFFINTKEIKYIIFSIINLLIYILILYYHHRIKSLPTSGNDDIRFERLALNYYDAWINGYTPNVFQ NSTFYSQMIASFYYLFGYNSYIPGLLNILIHLMSILILIKICEILLDNKVYTLIILTLYAYNPFHISYTIITMREISIIF LILCFIYCIIKYHITKKNKYILFSIFSSILASLFHIGLLTTLFFIAIYILIFSKIKILTKVIFSSTLFLVFASLLIVSND TKLQILDKGREDVEMYRTDYIISKPSNIIEYPIYIIKKSYYLLAKPFVMDIKGIPDLIAYAEKLLYVVPLILALIFYKRL IKNKPIIILIFFCLFLSIVFGIGTENYGTGIRHREKFVFLLYIIPFYILSEKRRVRIKSEKHV
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 45189; Mature: 45189
Theoretical pI: Translated: 9.74; Mature: 9.74
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
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Cys/Met content:
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Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MFIGIFILLYSSVMLFFINTKEIKYIIFSIINLLIYILILYYHHRIKSLPTSGNDDIRFE CHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEH RLALNYYDAWINGYTPNVFQNSTFYSQMIASFYYLFGYNSYIPGLLNILIHLMSILILIK HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ICEILLDNKVYTLIILTLYAYNPFHISYTIITMREISIIFLILCFIYCIIKYHITKKNKY HHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCE ILFSIFSSILASLFHIGLLTTLFFIAIYILIFSKIKILTKVIFSSTLFLVFASLLIVSND EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC TKLQILDKGREDVEMYRTDYIISKPSNIIEYPIYIIKKSYYLLAKPFVMDIKGIPDLIAY CEEEEECCCCHHHHHHHHHEEEECCCCHHHCCHHHEECCHHHHCCCHHHHCCCCHHHHHH AEKLLYVVPLILALIFYKRLIKNKPIIILIFFCLFLSIVFGIGTENYGTGIRHREKFVFL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHH LYIIPFYILSEKRRVRIKSEKHV HHHHHHHHHCCCHHEECCCCCCC >Mature Secondary Structure MFIGIFILLYSSVMLFFINTKEIKYIIFSIINLLIYILILYYHHRIKSLPTSGNDDIRFE CHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEH RLALNYYDAWINGYTPNVFQNSTFYSQMIASFYYLFGYNSYIPGLLNILIHLMSILILIK HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ICEILLDNKVYTLIILTLYAYNPFHISYTIITMREISIIFLILCFIYCIIKYHITKKNKY HHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCE ILFSIFSSILASLFHIGLLTTLFFIAIYILIFSKIKILTKVIFSSTLFLVFASLLIVSND EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC TKLQILDKGREDVEMYRTDYIISKPSNIIEYPIYIIKKSYYLLAKPFVMDIKGIPDLIAY CEEEEECCCCHHHHHHHHHEEEECCCCHHHCCHHHEECCHHHHCCCHHHHCCCCHHHHHH AEKLLYVVPLILALIFYKRLIKNKPIIILIFFCLFLSIVFGIGTENYGTGIRHREKFVFL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHH LYIIPFYILSEKRRVRIKSEKHV HHHHHHHHHCCCHHEECCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA