Definition Macrococcus caseolyticus JCSC5402, complete genome.
Accession NC_011999
Length 2,102,324

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The map label for this gene is 222150922

Identifier: 222150922

GI number: 222150922

Start: 725638

End: 726789

Strand: Direct

Name: 222150922

Synonym: MCCL_0672

Alternate gene names: NA

Gene position: 725638-726789 (Clockwise)

Preceding gene: 222150921

Following gene: 222150923

Centisome position: 34.52

GC content: 22.4

Gene sequence:

>1152_bases
TTGTTTATAGGTATCTTTATTCTATTATATAGTTCGGTGATGTTATTTTTTATTAATACTAAGGAGATAAAATATATTAT
TTTTTCAATAATCAACTTATTAATATATATATTAATTTTGTACTACCACCATAGAATCAAATCATTGCCTACTTCAGGAA
ATGATGATATTAGATTTGAAAGGTTAGCACTTAATTATTATGATGCTTGGATCAATGGATATACTCCCAATGTATTTCAA
AATAGCACATTTTATTCTCAAATGATTGCATCCTTTTACTATTTATTTGGATATAATTCATACATCCCGGGGTTATTAAA
TATACTAATACATTTGATGAGTATCTTGATATTAATTAAAATATGCGAAATATTGTTGGATAATAAAGTCTATACTTTAA
TAATTTTAACTCTATATGCTTATAATCCATTTCATATTTCTTACACAATTATCACTATGAGAGAGATTTCAATAATATTC
TTAATACTATGTTTCATTTACTGCATAATAAAGTATCACATCACCAAAAAAAACAAATATATTTTATTTAGTATATTTTC
ATCTATTTTAGCTAGTTTATTTCATATTGGGTTACTTACGACTCTATTTTTTATTGCTATATATATTTTAATATTTAGTA
AAATAAAAATACTGACAAAAGTTATTTTTTCCTCAACTTTATTTTTAGTATTTGCATCATTATTAATAGTATCAAATGAT
ACAAAATTACAAATATTAGATAAAGGAAGAGAAGATGTAGAGATGTATAGAACAGACTATATCATTTCAAAACCAAGTAA
TATCATTGAATATCCTATATATATTATTAAGAAATCATATTATTTATTAGCAAAACCATTTGTAATGGATATAAAAGGAA
TTCCAGATCTAATAGCTTATGCAGAAAAATTATTATATGTTGTACCTTTAATATTAGCTTTGATTTTTTATAAAAGGTTA
ATAAAAAATAAACCTATAATTATTCTTATATTTTTTTGCTTATTTCTTTCGATAGTATTTGGAATTGGGACTGAAAATTA
TGGTACAGGGATCAGACATAGAGAAAAATTTGTATTTCTATTATATATAATACCTTTTTATATTTTGTCTGAAAAAAGGA
GAGTAAGGATAAAAAGTGAAAAACATGTTTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATAAGGAGATAAAAAATGAGATTAAATAATAAAATAATAATAAATTATTTTAAGTTTACTTACTTTATTTCTTCTATTAT
TTCTTCTGAAATATGAATTA

Downstream 100 bases:

>100_bases
CATACTTAGATTATTTTCAAAAATATTATCAGTTTTCCCAAATTCTTTTTTATATTTTTTATATGAAATAAATAGTTTTT
CTGAAGCAAAAATTTTTATA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 383; Mature: 383

Protein sequence:

>383_residues
MFIGIFILLYSSVMLFFINTKEIKYIIFSIINLLIYILILYYHHRIKSLPTSGNDDIRFERLALNYYDAWINGYTPNVFQ
NSTFYSQMIASFYYLFGYNSYIPGLLNILIHLMSILILIKICEILLDNKVYTLIILTLYAYNPFHISYTIITMREISIIF
LILCFIYCIIKYHITKKNKYILFSIFSSILASLFHIGLLTTLFFIAIYILIFSKIKILTKVIFSSTLFLVFASLLIVSND
TKLQILDKGREDVEMYRTDYIISKPSNIIEYPIYIIKKSYYLLAKPFVMDIKGIPDLIAYAEKLLYVVPLILALIFYKRL
IKNKPIIILIFFCLFLSIVFGIGTENYGTGIRHREKFVFLLYIIPFYILSEKRRVRIKSEKHV

Sequences:

>Translated_383_residues
MFIGIFILLYSSVMLFFINTKEIKYIIFSIINLLIYILILYYHHRIKSLPTSGNDDIRFERLALNYYDAWINGYTPNVFQ
NSTFYSQMIASFYYLFGYNSYIPGLLNILIHLMSILILIKICEILLDNKVYTLIILTLYAYNPFHISYTIITMREISIIF
LILCFIYCIIKYHITKKNKYILFSIFSSILASLFHIGLLTTLFFIAIYILIFSKIKILTKVIFSSTLFLVFASLLIVSND
TKLQILDKGREDVEMYRTDYIISKPSNIIEYPIYIIKKSYYLLAKPFVMDIKGIPDLIAYAEKLLYVVPLILALIFYKRL
IKNKPIIILIFFCLFLSIVFGIGTENYGTGIRHREKFVFLLYIIPFYILSEKRRVRIKSEKHV
>Mature_383_residues
MFIGIFILLYSSVMLFFINTKEIKYIIFSIINLLIYILILYYHHRIKSLPTSGNDDIRFERLALNYYDAWINGYTPNVFQ
NSTFYSQMIASFYYLFGYNSYIPGLLNILIHLMSILILIKICEILLDNKVYTLIILTLYAYNPFHISYTIITMREISIIF
LILCFIYCIIKYHITKKNKYILFSIFSSILASLFHIGLLTTLFFIAIYILIFSKIKILTKVIFSSTLFLVFASLLIVSND
TKLQILDKGREDVEMYRTDYIISKPSNIIEYPIYIIKKSYYLLAKPFVMDIKGIPDLIAYAEKLLYVVPLILALIFYKRL
IKNKPIIILIFFCLFLSIVFGIGTENYGTGIRHREKFVFLLYIIPFYILSEKRRVRIKSEKHV

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 45189; Mature: 45189

Theoretical pI: Translated: 9.74; Mature: 9.74

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.0 %Cys     (Translated Protein)
1.8 %Met     (Translated Protein)
2.9 %Cys+Met (Translated Protein)
1.0 %Cys     (Mature Protein)
1.8 %Met     (Mature Protein)
2.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MFIGIFILLYSSVMLFFINTKEIKYIIFSIINLLIYILILYYHHRIKSLPTSGNDDIRFE
CHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEH
RLALNYYDAWINGYTPNVFQNSTFYSQMIASFYYLFGYNSYIPGLLNILIHLMSILILIK
HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ICEILLDNKVYTLIILTLYAYNPFHISYTIITMREISIIFLILCFIYCIIKYHITKKNKY
HHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCE
ILFSIFSSILASLFHIGLLTTLFFIAIYILIFSKIKILTKVIFSSTLFLVFASLLIVSND
EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
TKLQILDKGREDVEMYRTDYIISKPSNIIEYPIYIIKKSYYLLAKPFVMDIKGIPDLIAY
CEEEEECCCCHHHHHHHHHEEEECCCCHHHCCHHHEECCHHHHCCCHHHHCCCCHHHHHH
AEKLLYVVPLILALIFYKRLIKNKPIIILIFFCLFLSIVFGIGTENYGTGIRHREKFVFL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHH
LYIIPFYILSEKRRVRIKSEKHV
HHHHHHHHHCCCHHEECCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MFIGIFILLYSSVMLFFINTKEIKYIIFSIINLLIYILILYYHHRIKSLPTSGNDDIRFE
CHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEH
RLALNYYDAWINGYTPNVFQNSTFYSQMIASFYYLFGYNSYIPGLLNILIHLMSILILIK
HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ICEILLDNKVYTLIILTLYAYNPFHISYTIITMREISIIFLILCFIYCIIKYHITKKNKY
HHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCE
ILFSIFSSILASLFHIGLLTTLFFIAIYILIFSKIKILTKVIFSSTLFLVFASLLIVSND
EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
TKLQILDKGREDVEMYRTDYIISKPSNIIEYPIYIIKKSYYLLAKPFVMDIKGIPDLIAY
CEEEEECCCCHHHHHHHHHEEEECCCCHHHCCHHHEECCHHHHCCCHHHHCCCCHHHHHH
AEKLLYVVPLILALIFYKRLIKNKPIIILIFFCLFLSIVFGIGTENYGTGIRHREKFVFL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHH
LYIIPFYILSEKRRVRIKSEKHV
HHHHHHHHHCCCHHEECCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA