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The map label for this gene is ybjZ [C]

Identifier: 222096674

GI number: 222096674

Start: 2964103

End: 2966655

Strand: Reverse

Name: ybjZ [C]

Synonym: BCQ_3014

Alternate gene names: 222096674

Gene position: 2966655-2964103 (Counterclockwise)

Preceding gene: 222096675

Following gene: 222096673

Centisome position: 56.9

GC content: 34.39

Gene sequence:

>2553_bases
ATGCTACTAAAATCTGCACTACGTAGTTTAGCACGTAATCGTTTAAGAACTTTTTTTACTGTGTTCAGTATTTTAATAGG
AGTAGCTAGTTTCTTTTCTATGTCTATGTTGGTAGAGCTGGTTCCGCGATCTATTCACGAATCCTCTAAAATTCTTTTAG
GAGGGGATGTGTCAGTTCAATCCTATTTAAAACCGATGGATCGCGAAACTCTTATTTCTTCCATTCCTAAAGAAGAACAG
AAAGCGCTCACAACTTCTTTATTAGGTCAAAGTATGGTCAAATCTGATCGGAAAACAACAAGTTTAATTGTAAAGGGAAT
TGAAACGAACCACTATCCTTTCTTTGGTGATAATCTGTTTCCTAATATTCGTACTTTACATAAAGATGAACTACTACTTT
CCAAAAATACAGCTGACCGTTTGCAAGTCAAAGTAGGAGATAGAGTTGAGATTCCTAACCGTTCTACTGGGGCAATGACC
TCTTATAAAATTAGTGGTTTAGTAGAAGGTGTCCAAGAATCCTATGGCGATGCTTCAATTTTTGGAACTGCCTATTTACA
TTTAGATCAAGCACAGCAGCTTTTAAATGTACCTGCAGGCACAATTAATGAAGCATTAATCTTATTAAATGAAAATGTTA
ATATCTCTTCTTTTAAAAAGAATATTCAAAAACAATTACCACAAAGTAGTGTAATAGATGTTCAGGATAAGGAGCTAGAG
AAACAGAAAGATTTACGGATGTTGTTACCATTTCTTCAGCTTTTCAGTATATTAGCTCTTGGAATTGCCGCTATTACTAC
TTCTAATACAATGAAAGTCATTATTGCTTCACGTACGCATGATATCGCTGTTATGAAGTCCGTAGGAATGAAAACTAAAT
ATATTATTCGATATTTTCTATTAGAAGCATTATGGCTAGCGATTCTCGGAACAGTTGGTGGGATTGTACTCGGCTTATTA
GCTAGTGTTTGGCTGACGTCCTATCTAGCAGACGTGCTTTCACTACCGCTACATTGGGGAATTTCATGGTCCGTAATTTT
TACAACAATTATTGTGGGATTAATTGTAACCTTCTTAGCTTCTTGGATACCAGTAAAAAGTGGAATGTGTGTATCACCAC
TTCAAATGTTACGTGATACTGAGAACACAAGTGTGAATTATGCTTTACCATTTAAAAAGAAATTTCAACTTTTTATATTT
ACTTGTGGCATTCTTTCTATTTATGTTTACAATATAGCTTTCACAACAAATACAAATGGCAACGCAGTCTTTAAGTGGTT
TCTTGCTCTTTTACTTACAACTGCAGTTCTGTTATTTATTTTTACTTTTGTCCGATTTATAGGGTTTATATATTCTTTAT
TATTCAGATTAATTGGCGCCATGAAAAGCATAATGCCACAAAGCCTCTTTCTTGCTTTACACAACATGGCTACTACAAGT
AAACGAAATGGTTTATTGGCAGTTACCTTAACTATTGGTGTTGTTTCTGTTGTCTCTAGTCATGTATTTGCAGACAATTT
AATTGAGTCAGTTCAAGGTCAATTGGAAAGAGAGGCAATGGGAAATATCCTTATTACAAGTTCCATTCATGACGAAGGGA
ACGTTGAAAAGCAGCTACAATCTATTAAGGACATAAAAGGATCGAAAAAAGGTTATCAATTAGATGGAAGACTCCAAAAT
ATTAACGGAGTGGACGCAGCATCTATATTCATGAAAAATATAAAAGATGATAAATTTTTTAGCTCAACTAAAATTTCAAT
AGAAGGGGTAGATACCTCTCTTAACTCTAGATCCTATATGATATCTGAAGGGCGTGATTTAGCTCTATCGGATGCAAAGG
GGAAAAAAGCAATTCTTTTGGACAGCTATAAGAAATTAGGTGTAAAAGTCGGTGATACAGTTGACATTCAAATTGGAAAT
GAATTAGTAAACTGCGAAATTATAGGTTTCTTTAAATCTGGTGTAGTTAAAACCGTTGGCATCCGTATTCCAACTGAAAC
ATTAGCTACATATGGGAAACCAAGCCGAATTACTTATTCCTTAGATAGTGATCCTAAAAAAACAAATACTATATTAACAG
AATTAAATGAAAAACTTCCTGGTTCAGCAATGGCATATTCAATTGCCGCTACAGCAATCGATAGTCTTCAGTATATTATT
CAAATGCAAAGTGCTTTCTTCTCAATTGTAGCGTTGTTCGCATTTTTAACAGCTGTTCTTACAATTGGAAATCAAGTTGT
CATTCGCTTAATGCAACAGACACGAGATGTTGCTATTATGAAAACAGTTGGTATGTCTTCTAGTAATTTGATGAAGTCTA
TCTTATTAGAAAACACGATTATCTCCCTATCGGCTGGATTAGTTGGCGCTGGAATTGCCCTAGCCTTTTCAGGTATCACT
TTACGCTTCTTATTCCAAATGCCGATGAAAATAGATATGACTTGGTCCATTTTAGGCATACTTTTATCTGTTATAACAAC
AATAATTGTTGTATGGATAGCAGCAAAACAATCATTATCGGCTAAACCTATACACCTTTTACAAAATAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AACTTTCAGATCGTGTTTTAAAAATGGAAGATGGCCTCCTCGTTCAAGAAACCTTTAACGACCATACAAAATCTAGTGAG
CAAGAAGGTGGCATAACACC

Downstream 100 bases:

>100_bases
AGAAAGAAAAAAGTGTATTTTGATTATCTAGTCAAAATACGCTTTTTCTATTTTCTTTAAAACAACACATATCCTATGTC
TATCAGGTTAAAATTAAAGA

Product: permease

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 850; Mature: 850

Protein sequence:

>850_residues
MLLKSALRSLARNRLRTFFTVFSILIGVASFFSMSMLVELVPRSIHESSKILLGGDVSVQSYLKPMDRETLISSIPKEEQ
KALTTSLLGQSMVKSDRKTTSLIVKGIETNHYPFFGDNLFPNIRTLHKDELLLSKNTADRLQVKVGDRVEIPNRSTGAMT
SYKISGLVEGVQESYGDASIFGTAYLHLDQAQQLLNVPAGTINEALILLNENVNISSFKKNIQKQLPQSSVIDVQDKELE
KQKDLRMLLPFLQLFSILALGIAAITTSNTMKVIIASRTHDIAVMKSVGMKTKYIIRYFLLEALWLAILGTVGGIVLGLL
ASVWLTSYLADVLSLPLHWGISWSVIFTTIIVGLIVTFLASWIPVKSGMCVSPLQMLRDTENTSVNYALPFKKKFQLFIF
TCGILSIYVYNIAFTTNTNGNAVFKWFLALLLTTAVLLFIFTFVRFIGFIYSLLFRLIGAMKSIMPQSLFLALHNMATTS
KRNGLLAVTLTIGVVSVVSSHVFADNLIESVQGQLEREAMGNILITSSIHDEGNVEKQLQSIKDIKGSKKGYQLDGRLQN
INGVDAASIFMKNIKDDKFFSSTKISIEGVDTSLNSRSYMISEGRDLALSDAKGKKAILLDSYKKLGVKVGDTVDIQIGN
ELVNCEIIGFFKSGVVKTVGIRIPTETLATYGKPSRITYSLDSDPKKTNTILTELNEKLPGSAMAYSIAATAIDSLQYII
QMQSAFFSIVALFAFLTAVLTIGNQVVIRLMQQTRDVAIMKTVGMSSSNLMKSILLENTIISLSAGLVGAGIALAFSGIT
LRFLFQMPMKIDMTWSILGILLSVITTIIVVWIAAKQSLSAKPIHLLQNK

Sequences:

>Translated_850_residues
MLLKSALRSLARNRLRTFFTVFSILIGVASFFSMSMLVELVPRSIHESSKILLGGDVSVQSYLKPMDRETLISSIPKEEQ
KALTTSLLGQSMVKSDRKTTSLIVKGIETNHYPFFGDNLFPNIRTLHKDELLLSKNTADRLQVKVGDRVEIPNRSTGAMT
SYKISGLVEGVQESYGDASIFGTAYLHLDQAQQLLNVPAGTINEALILLNENVNISSFKKNIQKQLPQSSVIDVQDKELE
KQKDLRMLLPFLQLFSILALGIAAITTSNTMKVIIASRTHDIAVMKSVGMKTKYIIRYFLLEALWLAILGTVGGIVLGLL
ASVWLTSYLADVLSLPLHWGISWSVIFTTIIVGLIVTFLASWIPVKSGMCVSPLQMLRDTENTSVNYALPFKKKFQLFIF
TCGILSIYVYNIAFTTNTNGNAVFKWFLALLLTTAVLLFIFTFVRFIGFIYSLLFRLIGAMKSIMPQSLFLALHNMATTS
KRNGLLAVTLTIGVVSVVSSHVFADNLIESVQGQLEREAMGNILITSSIHDEGNVEKQLQSIKDIKGSKKGYQLDGRLQN
INGVDAASIFMKNIKDDKFFSSTKISIEGVDTSLNSRSYMISEGRDLALSDAKGKKAILLDSYKKLGVKVGDTVDIQIGN
ELVNCEIIGFFKSGVVKTVGIRIPTETLATYGKPSRITYSLDSDPKKTNTILTELNEKLPGSAMAYSIAATAIDSLQYII
QMQSAFFSIVALFAFLTAVLTIGNQVVIRLMQQTRDVAIMKTVGMSSSNLMKSILLENTIISLSAGLVGAGIALAFSGIT
LRFLFQMPMKIDMTWSILGILLSVITTIIVVWIAAKQSLSAKPIHLLQNK
>Mature_850_residues
MLLKSALRSLARNRLRTFFTVFSILIGVASFFSMSMLVELVPRSIHESSKILLGGDVSVQSYLKPMDRETLISSIPKEEQ
KALTTSLLGQSMVKSDRKTTSLIVKGIETNHYPFFGDNLFPNIRTLHKDELLLSKNTADRLQVKVGDRVEIPNRSTGAMT
SYKISGLVEGVQESYGDASIFGTAYLHLDQAQQLLNVPAGTINEALILLNENVNISSFKKNIQKQLPQSSVIDVQDKELE
KQKDLRMLLPFLQLFSILALGIAAITTSNTMKVIIASRTHDIAVMKSVGMKTKYIIRYFLLEALWLAILGTVGGIVLGLL
ASVWLTSYLADVLSLPLHWGISWSVIFTTIIVGLIVTFLASWIPVKSGMCVSPLQMLRDTENTSVNYALPFKKKFQLFIF
TCGILSIYVYNIAFTTNTNGNAVFKWFLALLLTTAVLLFIFTFVRFIGFIYSLLFRLIGAMKSIMPQSLFLALHNMATTS
KRNGLLAVTLTIGVVSVVSSHVFADNLIESVQGQLEREAMGNILITSSIHDEGNVEKQLQSIKDIKGSKKGYQLDGRLQN
INGVDAASIFMKNIKDDKFFSSTKISIEGVDTSLNSRSYMISEGRDLALSDAKGKKAILLDSYKKLGVKVGDTVDIQIGN
ELVNCEIIGFFKSGVVKTVGIRIPTETLATYGKPSRITYSLDSDPKKTNTILTELNEKLPGSAMAYSIAATAIDSLQYII
QMQSAFFSIVALFAFLTAVLTIGNQVVIRLMQQTRDVAIMKTVGMSSSNLMKSILLENTIISLSAGLVGAGIALAFSGIT
LRFLFQMPMKIDMTWSILGILLSVITTIIVVWIAAKQSLSAKPIHLLQNK

Specific function: Unknown

COG id: COG4591

COG function: function code M; ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the ABC-4 integral membrane protein family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003838 [H]

Pfam domain/function: PF02687 FtsX [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 93581; Mature: 93581

Theoretical pI: Translated: 10.04; Mature: 10.04

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
3.2 %Met     (Translated Protein)
3.5 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
3.2 %Met     (Mature Protein)
3.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLLKSALRSLARNRLRTFFTVFSILIGVASFFSMSMLVELVPRSIHESSKILLGGDVSVQ
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCHH
SYLKPMDRETLISSIPKEEQKALTTSLLGQSMVKSDRKTTSLIVKGIETNHYPFFGDNLF
HHHCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHEECCCCCCCCCCCCCCC
PNIRTLHKDELLLSKNTADRLQVKVGDRVEIPNRSTGAMTSYKISGLVEGVQESYGDASI
CCHHHHCHHHHHEECCCCHHEEEEECCEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHH
FGTAYLHLDQAQQLLNVPAGTINEALILLNENVNISSFKKNIQKQLPQSSVIDVQDKELE
HHHHEEEHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHH
KQKDLRMLLPFLQLFSILALGIAAITTSNTMKVIIASRTHDIAVMKSVGMKTKYIIRYFL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
LEALWLAILGTVGGIVLGLLASVWLTSYLADVLSLPLHWGISWSVIFTTIIVGLIVTFLA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SWIPVKSGMCVSPLQMLRDTENTSVNYALPFKKKFQLFIFTCGILSIYVYNIAFTTNTNG
HHCCCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCC
NAVFKWFLALLLTTAVLLFIFTFVRFIGFIYSLLFRLIGAMKSIMPQSLFLALHNMATTS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
KRNGLLAVTLTIGVVSVVSSHVFADNLIESVQGQLEREAMGNILITSSIHDEGNVEKQLQ
CCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCCCCHHHHHH
SIKDIKGSKKGYQLDGRLQNINGVDAASIFMKNIKDDKFFSSTKISIEGVDTSLNSRSYM
HHHHHCCCCCCCEECCEECCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCEE
ISEGRDLALSDAKGKKAILLDSYKKLGVKVGDTVDIQIGNELVNCEIIGFFKSGVVKTVG
ECCCCCEEEECCCCCEEEEEHHHHHCCCCCCCEEEEEECCEEEEEEEEEEHHCCCEEEEE
IRIPTETLATYGKPSRITYSLDSDPKKTNTILTELNEKLPGSAMAYSIAATAIDSLQYII
EECCHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QMQSAFFSIVALFAFLTAVLTIGNQVVIRLMQQTRDVAIMKTVGMSSSNLMKSILLENTI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHCEEHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH
ISLSAGLVGAGIALAFSGITLRFLFQMPMKIDMTWSILGILLSVITTIIVVWIAAKQSLS
HHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
AKPIHLLQNK
CCCHHHCCCC
>Mature Secondary Structure
MLLKSALRSLARNRLRTFFTVFSILIGVASFFSMSMLVELVPRSIHESSKILLGGDVSVQ
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCHH
SYLKPMDRETLISSIPKEEQKALTTSLLGQSMVKSDRKTTSLIVKGIETNHYPFFGDNLF
HHHCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHEECCCCCCCCCCCCCCC
PNIRTLHKDELLLSKNTADRLQVKVGDRVEIPNRSTGAMTSYKISGLVEGVQESYGDASI
CCHHHHCHHHHHEECCCCHHEEEEECCEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHH
FGTAYLHLDQAQQLLNVPAGTINEALILLNENVNISSFKKNIQKQLPQSSVIDVQDKELE
HHHHEEEHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHH
KQKDLRMLLPFLQLFSILALGIAAITTSNTMKVIIASRTHDIAVMKSVGMKTKYIIRYFL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
LEALWLAILGTVGGIVLGLLASVWLTSYLADVLSLPLHWGISWSVIFTTIIVGLIVTFLA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SWIPVKSGMCVSPLQMLRDTENTSVNYALPFKKKFQLFIFTCGILSIYVYNIAFTTNTNG
HHCCCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCC
NAVFKWFLALLLTTAVLLFIFTFVRFIGFIYSLLFRLIGAMKSIMPQSLFLALHNMATTS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
KRNGLLAVTLTIGVVSVVSSHVFADNLIESVQGQLEREAMGNILITSSIHDEGNVEKQLQ
CCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCCCCHHHHHH
SIKDIKGSKKGYQLDGRLQNINGVDAASIFMKNIKDDKFFSSTKISIEGVDTSLNSRSYM
HHHHHCCCCCCCEECCEECCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCEE
ISEGRDLALSDAKGKKAILLDSYKKLGVKVGDTVDIQIGNELVNCEIIGFFKSGVVKTVG
ECCCCCEEEECCCCCEEEEEHHHHHCCCCCCCEEEEEECCEEEEEEEEEEHHCCCEEEEE
IRIPTETLATYGKPSRITYSLDSDPKKTNTILTELNEKLPGSAMAYSIAATAIDSLQYII
EECCHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QMQSAFFSIVALFAFLTAVLTIGNQVVIRLMQQTRDVAIMKTVGMSSSNLMKSILLENTI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHCEEHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH
ISLSAGLVGAGIALAFSGITLRFLFQMPMKIDMTWSILGILLSVITTIIVVWIAAKQSLS
HHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
AKPIHLLQNK
CCCHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8688087 [H]