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The map label for this gene is yfiS [H]

Identifier: 222095558

GI number: 222095558

Start: 1878608

End: 1879837

Strand: Direct

Name: yfiS [H]

Synonym: BCQ_1898

Alternate gene names: 222095558

Gene position: 1878608-1879837 (Clockwise)

Preceding gene: 222095557

Following gene: 222095560

Centisome position: 36.03

GC content: 31.71

Gene sequence:

>1230_bases
ATGGAGGATGCAGTGAATAATGAAATTGAGGATTTAAAAGAGAATAGCACAAGTATTTGGAGCAATAAAATTTTTTCGTA
TTTTTTCTTAGCAAGTTGCATTTCTTTAATAGGTAATTCTATGGTTACGCTCGTTTTACCGTTATGGGTAATGAAATTAA
CGAACTCTCCATTACTTGTTTCTGGAGTAAACGTTGCAATTGCGACGACGGCGATTTTATTTGCACCTGTAACAGGAACG
TTAGCAGATCGAATGTCGAGAAGAAAGCTTATGATAATTGCGGATGTTATGAGATGTATCGTCATGATTTTAATTGCAGT
TATAGCATTTTATAATAAAATGCTATACATTCCGTTACTAATTTTACTTATAATACGCTCAATTGGGAGTGCTTTATTTA
CTCCGGCTTCAAATGCAGCATTAGTAACATATGTGGAAGAAAAGCATGTTCAACAGGCGATTACGCTGAGGCAAATATCA
ATACAAACCATATCGGTAGCTATTCCTTTAATGGCTAGCTTTTTAATTAGTATTTTTAATTTTCATGGAGTATTTTTGTT
AGATGCAATTACATTTTTTATATCATTTTTAATTTTAATGAAAATTAAATTTCCACGTGAATTAAAAGTAGAAAAGAAAA
AGCCTTTTTACGAAGACTTTAAAGAGGGTTTCTCCATATTTAATAGTAATCAATCATTGAAAACATTGCTTATGAGCGCT
GCGCTTATTAATTTACTTGGAGCGGCGTGTATGCTTTCGCTACAAGTAATAGTTGTTAGAGAAATGGACCTTTCTACGGG
ATGGTATAGTATAGTTTTTGCGGCATCACCGATAGGGATTTTAATAGGAGCATTTATTACGAAAAAGATTCGTACATATA
AAACGATTACGACTGCTTTTATATTTACAGCTATTATGGGGGTTTTTAATGCTGCAATGGGTACGACGTTAAATCCGGTA
TTATTTTCAGTTTATTATTTTCTGTCAGGAATTGCATTTGGGGTAAGTAATATATATTTTGGAGTGTTGTATAGAAAGTT
AATTCCAAATGAAGTGCAAGGAAGATTTTTTGGTTTTTTAAATTCGTTATTATTAGTATCAACCCCGGTTGGAATTGCAA
TAACGGGATATTCCTTAGAGTCAATTTCAGCTTCTATTGTATTTATTATAATTGGTATTATTACGTTTCTAGTTTCGGTT
ATTTCATTTGTAATGATAAATAAGAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TAAGTAAACCTTCTTCTTATTTTGAAGAAGGTTTTTTCTCATTTAAATAGAGGTTTTGAAAGGTGGTGAGGAAGAATTAA
AGAAAATATACAAGAGGAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
GTGTTGTATGAGATTTTTCAAAAATAAAAAACGTCCTGCTATAGGACGTTTTTTATTATATATATTGCCGTCTTTTCTTA
ATAAGTAACAACACCTGTGA

Product: multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 409; Mature: 409

Protein sequence:

>409_residues
MEDAVNNEIEDLKENSTSIWSNKIFSYFFLASCISLIGNSMVTLVLPLWVMKLTNSPLLVSGVNVAIATTAILFAPVTGT
LADRMSRRKLMIIADVMRCIVMILIAVIAFYNKMLYIPLLILLIIRSIGSALFTPASNAALVTYVEEKHVQQAITLRQIS
IQTISVAIPLMASFLISIFNFHGVFLLDAITFFISFLILMKIKFPRELKVEKKKPFYEDFKEGFSIFNSNQSLKTLLMSA
ALINLLGAACMLSLQVIVVREMDLSTGWYSIVFAASPIGILIGAFITKKIRTYKTITTAFIFTAIMGVFNAAMGTTLNPV
LFSVYYFLSGIAFGVSNIYFGVLYRKLIPNEVQGRFFGFLNSLLLVSTPVGIAITGYSLESISASIVFIIIGIITFLVSV
ISFVMINKK

Sequences:

>Translated_409_residues
MEDAVNNEIEDLKENSTSIWSNKIFSYFFLASCISLIGNSMVTLVLPLWVMKLTNSPLLVSGVNVAIATTAILFAPVTGT
LADRMSRRKLMIIADVMRCIVMILIAVIAFYNKMLYIPLLILLIIRSIGSALFTPASNAALVTYVEEKHVQQAITLRQIS
IQTISVAIPLMASFLISIFNFHGVFLLDAITFFISFLILMKIKFPRELKVEKKKPFYEDFKEGFSIFNSNQSLKTLLMSA
ALINLLGAACMLSLQVIVVREMDLSTGWYSIVFAASPIGILIGAFITKKIRTYKTITTAFIFTAIMGVFNAAMGTTLNPV
LFSVYYFLSGIAFGVSNIYFGVLYRKLIPNEVQGRFFGFLNSLLLVSTPVGIAITGYSLESISASIVFIIIGIITFLVSV
ISFVMINKK
>Mature_409_residues
MEDAVNNEIEDLKENSTSIWSNKIFSYFFLASCISLIGNSMVTLVLPLWVMKLTNSPLLVSGVNVAIATTAILFAPVTGT
LADRMSRRKLMIIADVMRCIVMILIAVIAFYNKMLYIPLLILLIIRSIGSALFTPASNAALVTYVEEKHVQQAITLRQIS
IQTISVAIPLMASFLISIFNFHGVFLLDAITFFISFLILMKIKFPRELKVEKKKPFYEDFKEGFSIFNSNQSLKTLLMSA
ALINLLGAACMLSLQVIVVREMDLSTGWYSIVFAASPIGILIGAFITKKIRTYKTITTAFIFTAIMGVFNAAMGTTLNPV
LFSVYYFLSGIAFGVSNIYFGVLYRKLIPNEVQGRFFGFLNSLLLVSTPVGIAITGYSLESISASIVFIIIGIITFLVSV
ISFVMINKK

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the major facilitator superfamily. TCR/tet family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR020846
- InterPro:   IPR011701
- InterPro:   IPR016196 [H]

Pfam domain/function: PF07690 MFS_1 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 45276; Mature: 45276

Theoretical pI: Translated: 9.92; Mature: 9.92

Prosite motif: PS50850 MFS

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
3.9 %Met     (Translated Protein)
4.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
3.9 %Met     (Mature Protein)
4.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MEDAVNNEIEDLKENSTSIWSNKIFSYFFLASCISLIGNSMVTLVLPLWVMKLTNSPLLV
CCCCCCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEE
SGVNVAIATTAILFAPVTGTLADRMSRRKLMIIADVMRCIVMILIAVIAFYNKMLYIPLL
ECCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ILLIIRSIGSALFTPASNAALVTYVEEKHVQQAITLRQISIQTISVAIPLMASFLISIFN
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FHGVFLLDAITFFISFLILMKIKFPRELKVEKKKPFYEDFKEGFSIFNSNQSLKTLLMSA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
ALINLLGAACMLSLQVIVVREMDLSTGWYSIVFAASPIGILIGAFITKKIRTYKTITTAF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IFTAIMGVFNAAMGTTLNPVLFSVYYFLSGIAFGVSNIYFGVLYRKLIPNEVQGRFFGFL
HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH
NSLLLVSTPVGIAITGYSLESISASIVFIIIGIITFLVSVISFVMINKK
HHHHHHCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MEDAVNNEIEDLKENSTSIWSNKIFSYFFLASCISLIGNSMVTLVLPLWVMKLTNSPLLV
CCCCCCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEE
SGVNVAIATTAILFAPVTGTLADRMSRRKLMIIADVMRCIVMILIAVIAFYNKMLYIPLL
ECCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ILLIIRSIGSALFTPASNAALVTYVEEKHVQQAITLRQISIQTISVAIPLMASFLISIFN
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FHGVFLLDAITFFISFLILMKIKFPRELKVEKKKPFYEDFKEGFSIFNSNQSLKTLLMSA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
ALINLLGAACMLSLQVIVVREMDLSTGWYSIVFAASPIGILIGAFITKKIRTYKTITTAF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IFTAIMGVFNAAMGTTLNPVLFSVYYFLSGIAFGVSNIYFGVLYRKLIPNEVQGRFFGFL
HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH
NSLLLVSTPVGIAITGYSLESISASIVFIIIGIITFLVSVISFVMINKK
HHHHHHCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8946165; 9384377 [H]