| Definition | Halothermothrix orenii H 168 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_011899 |
| Length | 2,578,146 |
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The map label for this gene is 220933113
Identifier: 220933113
GI number: 220933113
Start: 2490392
End: 2491690
Strand: Reverse
Name: 220933113
Synonym: Hore_22810
Alternate gene names: NA
Gene position: 2491690-2490392 (Counterclockwise)
Preceding gene: 220933114
Following gene: 220933112
Centisome position: 96.65
GC content: 23.4
Gene sequence:
>1299_bases ATGAGATTTAAAATGGCAAATATTAGTTTAAAGTTATTATTACTATTTTTTTTGTTAGCTCCATTTCATGGTGTTATAAA AGTTATAAATCATAATACTCTTAATAAACCTATATTAAATGTGTGGAAAGAAGTATTGTTTATTTTTATCTTAGCTCTAT CTATTTTATATTTAATCAAAAAGAAAAAAATACATATTACTAATTTTGGGGGAAAAATTATAATTATAATTTATTTACTT GTATTTAATCTAATCTTAAATCTATATTTTGGAATTGTAAATAAAAATATTGTAATAATACAGTGGTTATGGGGAGTAAA AGTAACTTTTTTTTATGGGTTAATAATATTTATAGTAATTATACATGATATTAATTGGCAAAAATTTATTAATAAAATTA TTAATATTCTTTCATTTTTAGCTCTTTTTATTATTGGTTTTGCTTTATTACAGTTTTTTTTAGGCACAGAATTTATTTCC AGTATAAATTTTGTGGCAGATGGAATGAAAACAAATTTAATCCGTTCTGGTAATATTCGAGCTTCTTCTATTTTCAGACA ACCTGTAACTTTCGGTATGTTTTGCCTTATATTATTAAGTTTTAACATATTAAAAAAAGGTTTTATGCCCAACATAGTTT CTATTATGTCAATTATAGGCATATTAATATCTACTTCTAGAACTAGTATATTGGCTTTAGTAGTTATGTTGTTTTATTGT TTATTACTTAAAAGAAAAAAATATAATATTTTTCTAAAACTTTCTTTAATTATTCCTTTGGTTATTGTATTTGCATTAAA TATAATAGTACCTTATATTGAAAATAATTTACTTAGTAGTAATATTGGAGTGTTAAGAACATATTTGTATACTAATACTT TTTTTGTTAGGATTAATAAGTGGAAGACGCTAATGACATCATGGGTAAAGAGTAAAGGAATTGTTCATATTTTTATTGGG AAAGGATGGGGTTATCTAGGTGGGGGGCAGCACATTTTTAAATTTATTCAAGGAAATCCCAGTGTTCCATATGATCCTGT CGATAATCTTTATTTGTTTCTTTTAATAAATAGTGGAATTGTGGGATTAATATTATTTATTTCAATTATTATAATGTGTA TGAGAAAAGCCCTTATGATGATGCAATTTAGTAGTGAAGTGAATTATGATTTTTTGAATAGTGTGCTACTTTTTTTGTCA ACTTTCCTTATTATTGGAGTGTTTATTACAGGTATAGAGTCATTTATATTTCAAATTTATTTATATTTGATTATAGGAAG TTTGATGAAATATTCTTAG
Upstream 100 bases:
>100_bases AGTGATACTTATAATATTGATAAAGTTATTCAAAATTATTTGAAGTTAATAAAATACAATTCATTATAAAAAGTTGGAAA AAATTTAGGGTGAAAAAAAC
Downstream 100 bases:
>100_bases CCTTAAAGGAACCTCTAAAGTGTAAAATACCTATGATTTTTAAGCAAATTGTAAATTTAATTTATAAAAAAAGGATAAAA CAAAGGATGAAATGAAAATA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 432; Mature: 432
Protein sequence:
>432_residues MRFKMANISLKLLLLFFLLAPFHGVIKVINHNTLNKPILNVWKEVLFIFILALSILYLIKKKKIHITNFGGKIIIIIYLL VFNLILNLYFGIVNKNIVIIQWLWGVKVTFFYGLIIFIVIIHDINWQKFINKIINILSFLALFIIGFALLQFFLGTEFIS SINFVADGMKTNLIRSGNIRASSIFRQPVTFGMFCLILLSFNILKKGFMPNIVSIMSIIGILISTSRTSILALVVMLFYC LLLKRKKYNIFLKLSLIIPLVIVFALNIIVPYIENNLLSSNIGVLRTYLYTNTFFVRINKWKTLMTSWVKSKGIVHIFIG KGWGYLGGGQHIFKFIQGNPSVPYDPVDNLYLFLLINSGIVGLILFISIIIMCMRKALMMMQFSSEVNYDFLNSVLLFLS TFLIIGVFITGIESFIFQIYLYLIIGSLMKYS
Sequences:
>Translated_432_residues MRFKMANISLKLLLLFFLLAPFHGVIKVINHNTLNKPILNVWKEVLFIFILALSILYLIKKKKIHITNFGGKIIIIIYLL VFNLILNLYFGIVNKNIVIIQWLWGVKVTFFYGLIIFIVIIHDINWQKFINKIINILSFLALFIIGFALLQFFLGTEFIS SINFVADGMKTNLIRSGNIRASSIFRQPVTFGMFCLILLSFNILKKGFMPNIVSIMSIIGILISTSRTSILALVVMLFYC LLLKRKKYNIFLKLSLIIPLVIVFALNIIVPYIENNLLSSNIGVLRTYLYTNTFFVRINKWKTLMTSWVKSKGIVHIFIG KGWGYLGGGQHIFKFIQGNPSVPYDPVDNLYLFLLINSGIVGLILFISIIIMCMRKALMMMQFSSEVNYDFLNSVLLFLS TFLIIGVFITGIESFIFQIYLYLIIGSLMKYS >Mature_432_residues MRFKMANISLKLLLLFFLLAPFHGVIKVINHNTLNKPILNVWKEVLFIFILALSILYLIKKKKIHITNFGGKIIIIIYLL VFNLILNLYFGIVNKNIVIIQWLWGVKVTFFYGLIIFIVIIHDINWQKFINKIINILSFLALFIIGFALLQFFLGTEFIS SINFVADGMKTNLIRSGNIRASSIFRQPVTFGMFCLILLSFNILKKGFMPNIVSIMSIIGILISTSRTSILALVVMLFYC LLLKRKKYNIFLKLSLIIPLVIVFALNIIVPYIENNLLSSNIGVLRTYLYTNTFFVRINKWKTLMTSWVKSKGIVHIFIG KGWGYLGGGQHIFKFIQGNPSVPYDPVDNLYLFLLINSGIVGLILFISIIIMCMRKALMMMQFSSEVNYDFLNSVLLFLS TFLIIGVFITGIESFIFQIYLYLIIGSLMKYS
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 49661; Mature: 49661
Theoretical pI: Translated: 10.62; Mature: 10.62
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.7 %Cys (Translated Protein) 3.2 %Met (Translated Protein) 3.9 %Cys+Met (Translated Protein) 0.7 %Cys (Mature Protein) 3.2 %Met (Mature Protein) 3.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MRFKMANISLKLLLLFFLLAPFHGVIKVINHNTLNKPILNVWKEVLFIFILALSILYLIK CCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KKKIHITNFGGKIIIIIYLLVFNLILNLYFGIVNKNIVIIQWLWGVKVTFFYGLIIFIVI HCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHH IHDINWQKFINKIINILSFLALFIIGFALLQFFLGTEFISSINFVADGMKTNLIRSGNIR HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCEECCCCC ASSIFRQPVTFGMFCLILLSFNILKKGFMPNIVSIMSIIGILISTSRTSILALVVMLFYC HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHH LLLKRKKYNIFLKLSLIIPLVIVFALNIIVPYIENNLLSSNIGVLRTYLYTNTFFVRINK HHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHCCHHHHHHHHHHCEEEEEEHH WKTLMTSWVKSKGIVHIFIGKGWGYLGGGQHIFKFIQGNPSVPYDPVDNLYLFLLINSGI HHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHEEEEHHHCCH VGLILFISIIIMCMRKALMMMQFSSEVNYDFLNSVLLFLSTFLIIGVFITGIESFIFQIY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LYLIIGSLMKYS HHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure MRFKMANISLKLLLLFFLLAPFHGVIKVINHNTLNKPILNVWKEVLFIFILALSILYLIK CCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KKKIHITNFGGKIIIIIYLLVFNLILNLYFGIVNKNIVIIQWLWGVKVTFFYGLIIFIVI HCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHH IHDINWQKFINKIINILSFLALFIIGFALLQFFLGTEFISSINFVADGMKTNLIRSGNIR HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCEECCCCC ASSIFRQPVTFGMFCLILLSFNILKKGFMPNIVSIMSIIGILISTSRTSILALVVMLFYC HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHH LLLKRKKYNIFLKLSLIIPLVIVFALNIIVPYIENNLLSSNIGVLRTYLYTNTFFVRINK HHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHCCHHHHHHHHHHCEEEEEEHH WKTLMTSWVKSKGIVHIFIGKGWGYLGGGQHIFKFIQGNPSVPYDPVDNLYLFLLINSGI HHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHEEEEHHHCCH VGLILFISIIIMCMRKALMMMQFSSEVNYDFLNSVLLFLSTFLIIGVFITGIESFIFQIY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LYLIIGSLMKYS HHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA