| Definition | Halothermothrix orenii H 168 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_011899 |
| Length | 2,578,146 |
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The map label for this gene is spoIIIAE [H]
Identifier: 220931465
GI number: 220931465
Start: 673085
End: 674278
Strand: Direct
Name: spoIIIAE [H]
Synonym: Hore_06210
Alternate gene names: 220931465
Gene position: 673085-674278 (Clockwise)
Preceding gene: 220931464
Following gene: 220931466
Centisome position: 26.11
GC content: 33.84
Gene sequence:
>1194_bases ATGAAAAGGTTAATCTCTATAATTATATTAATAAATATAATTCTAATGATGACAATACCGGTTTTGGCTGAGGAAACACC CCTTAAAGAAGCCCCCCTTAATAAAGAAGATATTATATTAAACCAGATAGAAAAGATTAATTTAAATCAACTACAAAAAG AGGTTGATAAAATAAATAAAAATATGGAGGGTTACATGCCCCACTTAAACATTAAAGAATTGATCCTTGGTTTTATGAAG GGGGATCTTGACGTTAGCTGGGCCCAGATAGGGGGGGCTCTTCTTAAGTATCTGGGGAAGGAAGTGACTGCTAATTTTAA AATACTGGGACAGATCATTATTTTAGCTGTTATGGCAGCAATTTTAAATGTGTTTCATAATTCTTTTACAAGTGAAACCA TCAGTAAGACTGCGAGCATGTTAATATTTATGGTTCTGGCAATATTATCCCTGAATGGATTTAAAATAGCTGTAGAAATC GGTATTACCACTATAGATACGATGGTTTCATTTATGCAGGCCCTTATCCCCGTTCTGTTAACTCTTCTGGTCAGTATCGG GGCCATGACATCTGCAGCTGTTTTTCATCCCATAACCTTTATGGTTATTTCTTTTTTAAGTTCTTTGATCAGGACAATAA TTTTTCCAATGATTTTTATTTCAGCTATTTTAAATATTGTTAATAACATTACCAGTGAATTTAAAATATCTAGACTGTCA GGTTTATTTAAAGAATTTAGTATGGGGATGCTAGGTTTATCCCTTATTTTGTTTACAGGTATTATGGTTATACAGGGTGG AGCAGCTGCAGTGACAGACAGTCTATCTTTACGGACAGCAAAATATCTTACCGGAACTTTTATTCCCATCATCGGGGGTA TTTTTTCAGATGCAGTGGATTTAATTGTTAGCTGTTCATTGATTATAAAAAATGCTATAAATCTATTTGGAATGATAGTA ATCGTTTTTATGATCTCTTATCCATTAATTAAAATAATAGCCCTGATAATAATATATAAAATTGCCGGGGCTATAATTCA GCCCATCAGTGATGGACGGCTGGTAAATATACTCGACAATCTGGGGAATACTCTGGTTCTGATTTTTCTAGCAGTAAGTG GAGTATCATTAATGTTCTTTATTGTACTAACTATCCTCGTCGGTTCTGCCAATTTAACAGTAATGATGAGGTGA
Upstream 100 bases:
>100_bases TGGCAGCTAAAATTATTATAATGATTTTGACAATCCCGGTGATGATTACTTTGATAGAGACTATTATAGATTTAATTCCG TAAGCAGTGAGGGGATATAA
Downstream 100 bases:
>100_bases TTTTGATGGATGAGTTAACCAGGTGGGTAAAGAACCTCATTTTTATTATTCTGTTTACAACCTTTATAGAAATGTTTTTA CCTGAAAATAACATGAGAAA
Product: Sporulation stage III protein AE
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 397; Mature: 397
Protein sequence:
>397_residues MKRLISIIILINIILMMTIPVLAEETPLKEAPLNKEDIILNQIEKINLNQLQKEVDKINKNMEGYMPHLNIKELILGFMK GDLDVSWAQIGGALLKYLGKEVTANFKILGQIIILAVMAAILNVFHNSFTSETISKTASMLIFMVLAILSLNGFKIAVEI GITTIDTMVSFMQALIPVLLTLLVSIGAMTSAAVFHPITFMVISFLSSLIRTIIFPMIFISAILNIVNNITSEFKISRLS GLFKEFSMGMLGLSLILFTGIMVIQGGAAAVTDSLSLRTAKYLTGTFIPIIGGIFSDAVDLIVSCSLIIKNAINLFGMIV IVFMISYPLIKIIALIIIYKIAGAIIQPISDGRLVNILDNLGNTLVLIFLAVSGVSLMFFIVLTILVGSANLTVMMR
Sequences:
>Translated_397_residues MKRLISIIILINIILMMTIPVLAEETPLKEAPLNKEDIILNQIEKINLNQLQKEVDKINKNMEGYMPHLNIKELILGFMK GDLDVSWAQIGGALLKYLGKEVTANFKILGQIIILAVMAAILNVFHNSFTSETISKTASMLIFMVLAILSLNGFKIAVEI GITTIDTMVSFMQALIPVLLTLLVSIGAMTSAAVFHPITFMVISFLSSLIRTIIFPMIFISAILNIVNNITSEFKISRLS GLFKEFSMGMLGLSLILFTGIMVIQGGAAAVTDSLSLRTAKYLTGTFIPIIGGIFSDAVDLIVSCSLIIKNAINLFGMIV IVFMISYPLIKIIALIIIYKIAGAIIQPISDGRLVNILDNLGNTLVLIFLAVSGVSLMFFIVLTILVGSANLTVMMR >Mature_397_residues MKRLISIIILINIILMMTIPVLAEETPLKEAPLNKEDIILNQIEKINLNQLQKEVDKINKNMEGYMPHLNIKELILGFMK GDLDVSWAQIGGALLKYLGKEVTANFKILGQIIILAVMAAILNVFHNSFTSETISKTASMLIFMVLAILSLNGFKIAVEI GITTIDTMVSFMQALIPVLLTLLVSIGAMTSAAVFHPITFMVISFLSSLIRTIIFPMIFISAILNIVNNITSEFKISRLS GLFKEFSMGMLGLSLILFTGIMVIQGGAAAVTDSLSLRTAKYLTGTFIPIIGGIFSDAVDLIVSCSLIIKNAINLFGMIV IVFMISYPLIKIIALIIIYKIAGAIIQPISDGRLVNILDNLGNTLVLIFLAVSGVSLMFFIVLTILVGSANLTVMMR
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR014194 [H]
Pfam domain/function: PF09546 Spore_III_AE [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 43333; Mature: 43333
Theoretical pI: Translated: 9.30; Mature: 9.30
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.3 %Cys (Translated Protein) 5.5 %Met (Translated Protein) 5.8 %Cys+Met (Translated Protein) 0.3 %Cys (Mature Protein) 5.5 %Met (Mature Protein) 5.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKRLISIIILINIILMMTIPVLAEETPLKEAPLNKEDIILNQIEKINLNQLQKEVDKINK CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCC NMEGYMPHLNIKELILGFMKGDLDVSWAQIGGALLKYLGKEVTANFKILGQIIILAVMAA CHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ILNVFHNSFTSETISKTASMLIFMVLAILSLNGFKIAVEIGITTIDTMVSFMQALIPVLL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TLLVSIGAMTSAAVFHPITFMVISFLSSLIRTIIFPMIFISAILNIVNNITSEFKISRLS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GLFKEFSMGMLGLSLILFTGIMVIQGGAAAVTDSLSLRTAKYLTGTFIPIIGGIFSDAVD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LIVSCSLIIKNAINLFGMIVIVFMISYPLIKIIALIIIYKIAGAIIQPISDGRLVNILDN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHH LGNTLVLIFLAVSGVSLMFFIVLTILVGSANLTVMMR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEC >Mature Secondary Structure MKRLISIIILINIILMMTIPVLAEETPLKEAPLNKEDIILNQIEKINLNQLQKEVDKINK CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCC NMEGYMPHLNIKELILGFMKGDLDVSWAQIGGALLKYLGKEVTANFKILGQIIILAVMAA CHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ILNVFHNSFTSETISKTASMLIFMVLAILSLNGFKIAVEIGITTIDTMVSFMQALIPVLL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TLLVSIGAMTSAAVFHPITFMVISFLSSLIRTIIFPMIFISAILNIVNNITSEFKISRLS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GLFKEFSMGMLGLSLILFTGIMVIQGGAAAVTDSLSLRTAKYLTGTFIPIIGGIFSDAVD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LIVSCSLIIKNAINLFGMIVIVFMISYPLIKIIALIIIYKIAGAIIQPISDGRLVNILDN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHH LGNTLVLIFLAVSGVSLMFFIVLTILVGSANLTVMMR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 8969508; 9384377 [H]