Definition Halothermothrix orenii H 168 chromosome, complete genome.
Accession NC_011899
Length 2,578,146

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The map label for this gene is feoB [C]

Identifier: 220931436

GI number: 220931436

Start: 644322

End: 645764

Strand: Direct

Name: feoB [C]

Synonym: Hore_05920

Alternate gene names: 220931436

Gene position: 644322-645764 (Clockwise)

Preceding gene: 220931435

Following gene: 220931437

Centisome position: 24.99

GC content: 37.35

Gene sequence:

>1443_bases
ATGAAAGCCTTTTTAAAATTTGAGGACCCTCTTGAAAGGTCACTTCAAGAACTTTCTTCCCTTTTTAAAAAGAACTACCC
TGTCAGTCATCGGGCCCTGGTACTTATGGTCTTATCAGGGGATAAAGAAATAGAAGACCTAATTTCCAGGTCTGAAAGTG
ATAATCTGGTTGATAGAATAAAAAAACATAAGAATAAGTTAAGGAAGGATTACGGGTATCCTCTGGAGGTAGTTATCTCT
AAACAGAGGAAAGAAAAAGTCAAAAAAGTAGTTGGGGAAGTTTTAAAAAAAGATCAGCAATCAGGTAATGTCCTGAAAGA
GACTATAGATTTTCTGACGATAAATCCCTACAGTGGTCCTGTTATTCTGGCAATAGTTCTTATAGGATTATACTACCTGG
TCGGGGTAGTAGGAGCCCGGTACCTGGTTGATTTTATTGAAAAAAACTTTTTTATAGATTATTTTAATCCTTTGATTACA
GAATTTATTGAAATGATTATTCCATACCGAATTTTGCAGGAACTTTTTGTTGGTGATTATGGTATATTTACTCTGGCTTT
AAGATATGCCATTGCCCTCGTTCTACCGATTGTGGGTTGTTTCTTTCTGGCTTTTTCTATTCTGGAGGATTCAGGTTATT
TCCCCCGGATAGCGGTTTTATCAAATAAAATTCTAAAGGTTATTGGACTGAACGGAAGGGCTGTTATCCCCATATTACTC
GGTTTTGGGTGTGGCACCATGGCTACCATTGCAACCAGGGTCCTGGAGCGTAAAAGAGAACGGATACTCGTAACCTTCCT
CTTAGCCCTGGCAATACCCTGTTCCAGTCAGATGGGGTTAATAAGTGGAATTTTAGCAGGTAATCCAGTAGGTCTTTTAA
TCTGGGTCATTGTTGTGGGTGCAGTCTTTACAGTAACAGGTTATTTACTGGGATTAATTTTACCAGGAAGATCAGGGGCC
TTTTATATGGAATTAACTGAACTTCGTATTCCCCGACCCGTACACATTATTAAGAAGACAGTTAACCGTATGAGGTGGTA
TTTTCTGGAAGTTGTCCCTTTGTTTATATATGCCAGTTTTTTTATCTGGATAGGCAGGTTAACCGGTTTATTTGAAAGGT
TTTTAAACTTGCTACATCCTGTAGTAAGGATGGTTGGTCTTCCCGGGGAATCAGCTGTCATATTTTTATATGGTTTTTTT
AGGAGGGATTATGGGGCAGCCGGCCTTTATGACCTCTATAGAAGTGGAGTATTAAATAACCGTTCTTTAATAGTGGTTTC
AGTAATTTTAACCTTATTTGTTCCCTGTGTTGCTCATTTTTCTATGATAATCAGGGAACGGGGTCTGATTACAGGTCTGG
TAATAACAGGACTTGTATTTATAATTGCCTTTACAACAGGATATATCTTAAATAATATTTTCTTTTTATTAAATATAGTA
TAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAAGATTATTCATAATTGATGTTCTGGTTGCAAAACAGGACGGCGATCTCTATTATGAAATTTGTTGAACATAAATTACT
TTAAATCAGGGAGTTTTTCC

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTGACCAGTGTTTTTGCTTTTAATGTTGTTGAAGATTGGGTTAGTTTCAGGCTATTGAGGCCAATTAAATATCCTGTGAT
TAGATATTATTACGTGTATT

Product: ferrous iron transport protein FeoB

Products: Fe (II) [Cytoplasm] [C]

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 480; Mature: 480

Protein sequence:

>480_residues
MKAFLKFEDPLERSLQELSSLFKKNYPVSHRALVLMVLSGDKEIEDLISRSESDNLVDRIKKHKNKLRKDYGYPLEVVIS
KQRKEKVKKVVGEVLKKDQQSGNVLKETIDFLTINPYSGPVILAIVLIGLYYLVGVVGARYLVDFIEKNFFIDYFNPLIT
EFIEMIIPYRILQELFVGDYGIFTLALRYAIALVLPIVGCFFLAFSILEDSGYFPRIAVLSNKILKVIGLNGRAVIPILL
GFGCGTMATIATRVLERKRERILVTFLLALAIPCSSQMGLISGILAGNPVGLLIWVIVVGAVFTVTGYLLGLILPGRSGA
FYMELTELRIPRPVHIIKKTVNRMRWYFLEVVPLFIYASFFIWIGRLTGLFERFLNLLHPVVRMVGLPGESAVIFLYGFF
RRDYGAAGLYDLYRSGVLNNRSLIVVSVILTLFVPCVAHFSMIIRERGLITGLVITGLVFIIAFTTGYILNNIFFLLNIV

Sequences:

>Translated_480_residues
MKAFLKFEDPLERSLQELSSLFKKNYPVSHRALVLMVLSGDKEIEDLISRSESDNLVDRIKKHKNKLRKDYGYPLEVVIS
KQRKEKVKKVVGEVLKKDQQSGNVLKETIDFLTINPYSGPVILAIVLIGLYYLVGVVGARYLVDFIEKNFFIDYFNPLIT
EFIEMIIPYRILQELFVGDYGIFTLALRYAIALVLPIVGCFFLAFSILEDSGYFPRIAVLSNKILKVIGLNGRAVIPILL
GFGCGTMATIATRVLERKRERILVTFLLALAIPCSSQMGLISGILAGNPVGLLIWVIVVGAVFTVTGYLLGLILPGRSGA
FYMELTELRIPRPVHIIKKTVNRMRWYFLEVVPLFIYASFFIWIGRLTGLFERFLNLLHPVVRMVGLPGESAVIFLYGFF
RRDYGAAGLYDLYRSGVLNNRSLIVVSVILTLFVPCVAHFSMIIRERGLITGLVITGLVFIIAFTTGYILNNIFFLLNIV
>Mature_480_residues
MKAFLKFEDPLERSLQELSSLFKKNYPVSHRALVLMVLSGDKEIEDLISRSESDNLVDRIKKHKNKLRKDYGYPLEVVIS
KQRKEKVKKVVGEVLKKDQQSGNVLKETIDFLTINPYSGPVILAIVLIGLYYLVGVVGARYLVDFIEKNFFIDYFNPLIT
EFIEMIIPYRILQELFVGDYGIFTLALRYAIALVLPIVGCFFLAFSILEDSGYFPRIAVLSNKILKVIGLNGRAVIPILL
GFGCGTMATIATRVLERKRERILVTFLLALAIPCSSQMGLISGILAGNPVGLLIWVIVVGAVFTVTGYLLGLILPGRSGA
FYMELTELRIPRPVHIIKKTVNRMRWYFLEVVPLFIYASFFIWIGRLTGLFERFLNLLHPVVRMVGLPGESAVIFLYGFF
RRDYGAAGLYDLYRSGVLNNRSLIVVSVILTLFVPCVAHFSMIIRERGLITGLVITGLVFIIAFTTGYILNNIFFLLNIV

Specific function: Probable GTP-driven transporter of Fe(2+) ion [H]

COG id: COG0370

COG function: function code P; Fe2+ transport system protein B

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Probable) [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 1 G (guanine nucleotide-binding) domain [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1789813, Length=371, Percent_Identity=23.1805929919137, Blast_Score=80, Evalue=2e-16,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003373
- InterPro:   IPR011640
- InterPro:   IPR011619
- InterPro:   IPR011642
- InterPro:   IPR006073
- InterPro:   IPR002917
- InterPro:   IPR005225 [H]

Pfam domain/function: PF07664 FeoB_C; PF02421 FeoB_N; PF07670 Gate; PF01926 MMR_HSR1 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 54191; Mature: 54191

Theoretical pI: Translated: 9.92; Mature: 9.92

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.8 %Cys     (Translated Protein)
1.9 %Met     (Translated Protein)
2.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.8 %Cys     (Mature Protein)
1.9 %Met     (Mature Protein)
2.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKAFLKFEDPLERSLQELSSLFKKNYPVSHRALVLMVLSGDKEIEDLISRSESDNLVDRI
CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHEEEEEECCCHHHHHHHCCCCCCHHHHHH
KKHKNKLRKDYGYPLEVVISKQRKEKVKKVVGEVLKKDQQSGNVLKETIDFLTINPYSGP
HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHEEECCCCCH
VILAIVLIGLYYLVGVVGARYLVDFIEKNFFIDYFNPLITEFIEMIIPYRILQELFVGDY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCH
GIFTLALRYAIALVLPIVGCFFLAFSILEDSGYFPRIAVLSNKILKVIGLNGRAVIPILL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHH
GFGCGTMATIATRVLERKRERILVTFLLALAIPCSSQMGLISGILAGNPVGLLIWVIVVG
HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH
AVFTVTGYLLGLILPGRSGAFYMELTELRIPRPVHIIKKTVNRMRWYFLEVVPLFIYASF
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FIWIGRLTGLFERFLNLLHPVVRMVGLPGESAVIFLYGFFRRDYGAAGLYDLYRSGVLNN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCCCC
RSLIVVSVILTLFVPCVAHFSMIIRERGLITGLVITGLVFIIAFTTGYILNNIFFLLNIV
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MKAFLKFEDPLERSLQELSSLFKKNYPVSHRALVLMVLSGDKEIEDLISRSESDNLVDRI
CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHEEEEEECCCHHHHHHHCCCCCCHHHHHH
KKHKNKLRKDYGYPLEVVISKQRKEKVKKVVGEVLKKDQQSGNVLKETIDFLTINPYSGP
HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHEEECCCCCH
VILAIVLIGLYYLVGVVGARYLVDFIEKNFFIDYFNPLITEFIEMIIPYRILQELFVGDY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCH
GIFTLALRYAIALVLPIVGCFFLAFSILEDSGYFPRIAVLSNKILKVIGLNGRAVIPILL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHH
GFGCGTMATIATRVLERKRERILVTFLLALAIPCSSQMGLISGILAGNPVGLLIWVIVVG
HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH
AVFTVTGYLLGLILPGRSGAFYMELTELRIPRPVHIIKKTVNRMRWYFLEVVPLFIYASF
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FIWIGRLTGLFERFLNLLHPVVRMVGLPGESAVIFLYGFFRRDYGAAGLYDLYRSGVLNN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCCCC
RSLIVVSVILTLFVPCVAHFSMIIRERGLITGLVITGLVFIIAFTTGYILNNIFFLLNIV
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: Fe (II) [Periplasm] [C]

Specific reaction: Fe (II) [Periplasm] = Fe (II) [Cytoplasm] [C]

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8688087 [H]