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The map label for this gene is 220931381

Identifier: 220931381

GI number: 220931381

Start: 583298

End: 585481

Strand: Reverse

Name: 220931381

Synonym: Hore_05360

Alternate gene names: NA

Gene position: 585481-583298 (Counterclockwise)

Preceding gene: 220931382

Following gene: 220931371

Centisome position: 22.71

GC content: 33.75

Gene sequence:

>2184_bases
ATGGACAATTATGTTAGACTAATAAATAACAATAAAAGAGTCTTTACAATAATTTTTATTATGCTTAATATTCTCTCCCT
TATTGGCCTTTTTAAGTTAAAAATTAATCCAGATTTTGATATTTTTATGCTTAGAGATTCACATTATAAAAAAGTTTTAG
ATGACATGAACCAAACTTTTAATACCACTGAACAAACTATTATTCTTATTGAAACCGAAAACAAAGAAATAAACCCTGAC
ACAATCCACAAATTCAGGTCTTTTCAAAAACATCTGGAAAAAATTAATAGTATTAGCTATATTAACGGACCTGCTCCCAG
ATCTATATCCTTTGGTAATTTTACATTAGACCTTGAAAAACCTATAAATGAATTAGGATTAAAGTTTCTCAAAGAACACT
TTAAGGGTATGGGAAAACTATCTACTGTTACCAGGAAAAATGGGAAACTTTATGGTATATTTACAATATTTCCGGGCGAA
AATTTCAGCAGCAATGACCTCAAAAATATTGAAAGTTATCTTCAAAAAAATGGTTTGAATTATTATTTAACCGGAGACAT
GTACATGCAACACAAAATTATTGACTACATATATATGATACTACTCTTTTTACCACCAACCGCTCTCCTACTAATACTAA
CTGTTTTCAGAACACAGATGGGTACATTAAAAGCTACTTTTTTATCAATACTTCCAGCAGGAATTGCAGCTCTATGGACC
ATGGGAATAATTGGATGGATTGGAAAACCAGTCTCTGTAATTACTGTCCTTGCCCCTATTTTTACAATAGTTATTGGAAG
TGCTGACGGTCTCCACTTCGTTTCCCATGTTCAGGATACCCGTGCTGAAGGTAAAGATAAAATCAAAAGTATTGTTGAAA
CCCTTAAAATGGTTGGTATTCCCATGATAATAACCACCGTAACCTCAATGGCAGGTTTTCTTGCTCTGCTTGTAATGAAT
ACTGATGCGATTCATGACCTTGCTCTTTTCGCATCTCTGGGAATTTTTCTGGCAGGGGTAGCCACCTGGTACATACTCCC
CCTTATTCTAACAGGCAATGTTAGGTTAAAAAAACATAGCCATAAACGAAGCTTCCTGGCTTCTCGTATCAGAAGATTAT
GGGGAGTGCCCAGCATCATAATACTATTCTTCCTCATAACAATATCAATTATAGGAGGTCAGTATTTATCAACAGAGTTC
AACCAGTTATTAATTTATCGGAATTTCACTGATGTTTATAAAAGTTTTGATAAAATAATGGAAGTAAATGAAGGGAGTAT
TCCGGTTTATCTTTATGTAAAAACTGAGAATGATCCGTTAAGCCCAATTAATGGGAAAAGAATGATAGAGCTTGGAAGTA
AATTAACACAGTCTGATTGTGTTACCAAAACTGTCAGTGTTTATGACGCATATTCCTTAATCTATTCAGCCATACAGGGA
TTGAGCAGCCCACAATATCCTGAAAATAAAAACAAGGTTGCTTTTGTTAATAATTTAATAACAGCTGAAAGTAATAACCC
TACATCACATTTAATCAACAGGGACAATAACGCAACCCGGATGTTGGTATTTCCAGCTAATCTAAAAAATAAAATCCTTG
ATAGAATTAACAAAATCGTAACAGATTATGATAAAAAATACCCTGATCTAACAATAGAGGTAACAGGAGTACAATACCTT
ATGAGGGAATTAAGTAATAGTATGATTTCAAATCAAACCCAGTCAATTTTACTGGCCTTTAGTTTAATTTTTATACTACT
TTACATTTCTATTAGAAAAATTAAGCCCTCTGTTATTTCATTGCTTCCTATCGCCTTTACAACCTTAATTATCTTTGGAT
TTATGGGACTGTCAGGCATATCTCTTAACCTATTTACAGCAACTATCTTCAGTATAACCATTGGGGTTGGTATAGATTAT
GCTGTTCATTTCACCTCAGTATGGATGACTTTCCGGAAACGGGGTTATACAGCAAAAGAGGCTACTAATAAATCATACAA
ATATACAGCCAGACCTATCATTGCTAATGCCTTTGGCCTGGCTATCGGGCTCAGCGCCCTGACATTATCTCCTTTAAGAA
TTCATTTATATGTATCTGTTCTGATGTGGGTTGCCATGATATCTGGAGTCTTTTTAAGTCTTTCTTTCCTACCAACCATC
TTAAAAAGTTTAGGAAATAATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AATAAGAACAAATATAACAGTGAAGAACAGGCCCGGGCTATATTAGATATCATCTTTAAAGGAATTAAAAACGATAAGTA
AAATATGGAGGAATGAAAAG

Downstream 100 bases:

>100_bases
CAAAAACCCTTCTAAAATTGGCAGAGTACAAGACAACTTTCAACACGCCGAAAATCTTATTAAAAGGGTATAAAAGAGGG
GGCAAAGTTAATATTGTTGC

Product: putative exporters of the RND superfamily

Products: NA

Alternate protein names: RND Efflux Transporter; RND Superfamily Exporter; Efflux Transporter Hydrophobe/Amphiphile Efflux-3 Family; Patched Family Protein; Exporter Of RND Superfamily Protein; Mfs Transporter; Histidine Kinase; Exporter Of RND Superfamily; Exporter Of RND Superfamily-Like Protein; Integral Membrane Protein; Sterol-Sensing 5tm Box Domain Protein; Exporters Of RND Superfamily; MFS Family Transporter; Transporter RND Superfamily

Number of amino acids: Translated: 727; Mature: 727

Protein sequence:

>727_residues
MDNYVRLINNNKRVFTIIFIMLNILSLIGLFKLKINPDFDIFMLRDSHYKKVLDDMNQTFNTTEQTIILIETENKEINPD
TIHKFRSFQKHLEKINSISYINGPAPRSISFGNFTLDLEKPINELGLKFLKEHFKGMGKLSTVTRKNGKLYGIFTIFPGE
NFSSNDLKNIESYLQKNGLNYYLTGDMYMQHKIIDYIYMILLFLPPTALLLILTVFRTQMGTLKATFLSILPAGIAALWT
MGIIGWIGKPVSVITVLAPIFTIVIGSADGLHFVSHVQDTRAEGKDKIKSIVETLKMVGIPMIITTVTSMAGFLALLVMN
TDAIHDLALFASLGIFLAGVATWYILPLILTGNVRLKKHSHKRSFLASRIRRLWGVPSIIILFFLITISIIGGQYLSTEF
NQLLIYRNFTDVYKSFDKIMEVNEGSIPVYLYVKTENDPLSPINGKRMIELGSKLTQSDCVTKTVSVYDAYSLIYSAIQG
LSSPQYPENKNKVAFVNNLITAESNNPTSHLINRDNNATRMLVFPANLKNKILDRINKIVTDYDKKYPDLTIEVTGVQYL
MRELSNSMISNQTQSILLAFSLIFILLYISIRKIKPSVISLLPIAFTTLIIFGFMGLSGISLNLFTATIFSITIGVGIDY
AVHFTSVWMTFRKRGYTAKEATNKSYKYTARPIIANAFGLAIGLSALTLSPLRIHLYVSVLMWVAMISGVFLSLSFLPTI
LKSLGNN

Sequences:

>Translated_727_residues
MDNYVRLINNNKRVFTIIFIMLNILSLIGLFKLKINPDFDIFMLRDSHYKKVLDDMNQTFNTTEQTIILIETENKEINPD
TIHKFRSFQKHLEKINSISYINGPAPRSISFGNFTLDLEKPINELGLKFLKEHFKGMGKLSTVTRKNGKLYGIFTIFPGE
NFSSNDLKNIESYLQKNGLNYYLTGDMYMQHKIIDYIYMILLFLPPTALLLILTVFRTQMGTLKATFLSILPAGIAALWT
MGIIGWIGKPVSVITVLAPIFTIVIGSADGLHFVSHVQDTRAEGKDKIKSIVETLKMVGIPMIITTVTSMAGFLALLVMN
TDAIHDLALFASLGIFLAGVATWYILPLILTGNVRLKKHSHKRSFLASRIRRLWGVPSIIILFFLITISIIGGQYLSTEF
NQLLIYRNFTDVYKSFDKIMEVNEGSIPVYLYVKTENDPLSPINGKRMIELGSKLTQSDCVTKTVSVYDAYSLIYSAIQG
LSSPQYPENKNKVAFVNNLITAESNNPTSHLINRDNNATRMLVFPANLKNKILDRINKIVTDYDKKYPDLTIEVTGVQYL
MRELSNSMISNQTQSILLAFSLIFILLYISIRKIKPSVISLLPIAFTTLIIFGFMGLSGISLNLFTATIFSITIGVGIDY
AVHFTSVWMTFRKRGYTAKEATNKSYKYTARPIIANAFGLAIGLSALTLSPLRIHLYVSVLMWVAMISGVFLSLSFLPTI
LKSLGNN
>Mature_727_residues
MDNYVRLINNNKRVFTIIFIMLNILSLIGLFKLKINPDFDIFMLRDSHYKKVLDDMNQTFNTTEQTIILIETENKEINPD
TIHKFRSFQKHLEKINSISYINGPAPRSISFGNFTLDLEKPINELGLKFLKEHFKGMGKLSTVTRKNGKLYGIFTIFPGE
NFSSNDLKNIESYLQKNGLNYYLTGDMYMQHKIIDYIYMILLFLPPTALLLILTVFRTQMGTLKATFLSILPAGIAALWT
MGIIGWIGKPVSVITVLAPIFTIVIGSADGLHFVSHVQDTRAEGKDKIKSIVETLKMVGIPMIITTVTSMAGFLALLVMN
TDAIHDLALFASLGIFLAGVATWYILPLILTGNVRLKKHSHKRSFLASRIRRLWGVPSIIILFFLITISIIGGQYLSTEF
NQLLIYRNFTDVYKSFDKIMEVNEGSIPVYLYVKTENDPLSPINGKRMIELGSKLTQSDCVTKTVSVYDAYSLIYSAIQG
LSSPQYPENKNKVAFVNNLITAESNNPTSHLINRDNNATRMLVFPANLKNKILDRINKIVTDYDKKYPDLTIEVTGVQYL
MRELSNSMISNQTQSILLAFSLIFILLYISIRKIKPSVISLLPIAFTTLIIFGFMGLSGISLNLFTATIFSITIGVGIDY
AVHFTSVWMTFRKRGYTAKEATNKSYKYTARPIIANAFGLAIGLSALTLSPLRIHLYVSVLMWVAMISGVFLSLSFLPTI
LKSLGNN

Specific function: Unknown

COG id: COG1033

COG function: function code R; Predicted exporters of the RND superfamily

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 81858; Mature: 81858

Theoretical pI: Translated: 10.05; Mature: 10.05

Prosite motif: PS50156 SSD

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.1 %Cys     (Translated Protein)
3.2 %Met     (Translated Protein)
3.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.1 %Cys     (Mature Protein)
3.2 %Met     (Mature Protein)
3.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MDNYVRLINNNKRVFTIIFIMLNILSLIGLFKLKINPDFDIFMLRDSHYKKVLDDMNQTF
CCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHC
NTTEQTIILIETENKEINPDTIHKFRSFQKHLEKINSISYINGPAPRSISFGNFTLDLEK
CCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEECCCEEEEHHH
PINELGLKFLKEHFKGMGKLSTVTRKNGKLYGIFTIFPGENFSSNDLKNIESYLQKNGLN
CHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHEECCCEEEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCE
YYLTGDMYMQHKIIDYIYMILLFLPPTALLLILTVFRTQMGTLKATFLSILPAGIAALWT
EEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MGIIGWIGKPVSVITVLAPIFTIVIGSADGLHFVSHVQDTRAEGKDKIKSIVETLKMVGI
HHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCC
PMIITTVTSMAGFLALLVMNTDAIHDLALFASLGIFLAGVATWYILPLILTGNVRLKKHS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHH
HKRSFLASRIRRLWGVPSIIILFFLITISIIGGQYLSTEFNQLLIYRNFTDVYKSFDKIM
HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCHHHEEEECCHHHHHHHHHHHH
EVNEGSIPVYLYVKTENDPLSPINGKRMIELGSKLTQSDCVTKTVSVYDAYSLIYSAIQG
HCCCCCEEEEEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
LSSPQYPENKNKVAFVNNLITAESNNPTSHLINRDNNATRMLVFPANLKNKILDRINKIV
CCCCCCCCCCCCEEEEEEEEEECCCCCHHHHCCCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHH
TDYDKKYPDLTIEVTGVQYLMRELSNSMISNQTQSILLAFSLIFILLYISIRKIKPSVIS
HHHHCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH
LLPIAFTTLIIFGFMGLSGISLNLFTATIFSITIGVGIDYAVHFTSVWMTFRKRGYTAKE
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH
ATNKSYKYTARPIIANAFGLAIGLSALTLSPLRIHLYVSVLMWVAMISGVFLSLSFLPTI
HCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LKSLGNN
HHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MDNYVRLINNNKRVFTIIFIMLNILSLIGLFKLKINPDFDIFMLRDSHYKKVLDDMNQTF
CCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHC
NTTEQTIILIETENKEINPDTIHKFRSFQKHLEKINSISYINGPAPRSISFGNFTLDLEK
CCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEECCCEEEEHHH
PINELGLKFLKEHFKGMGKLSTVTRKNGKLYGIFTIFPGENFSSNDLKNIESYLQKNGLN
CHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHEECCCEEEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCE
YYLTGDMYMQHKIIDYIYMILLFLPPTALLLILTVFRTQMGTLKATFLSILPAGIAALWT
EEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MGIIGWIGKPVSVITVLAPIFTIVIGSADGLHFVSHVQDTRAEGKDKIKSIVETLKMVGI
HHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCC
PMIITTVTSMAGFLALLVMNTDAIHDLALFASLGIFLAGVATWYILPLILTGNVRLKKHS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHH
HKRSFLASRIRRLWGVPSIIILFFLITISIIGGQYLSTEFNQLLIYRNFTDVYKSFDKIM
HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCHHHEEEECCHHHHHHHHHHHH
EVNEGSIPVYLYVKTENDPLSPINGKRMIELGSKLTQSDCVTKTVSVYDAYSLIYSAIQG
HCCCCCEEEEEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
LSSPQYPENKNKVAFVNNLITAESNNPTSHLINRDNNATRMLVFPANLKNKILDRINKIV
CCCCCCCCCCCCEEEEEEEEEECCCCCHHHHCCCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHH
TDYDKKYPDLTIEVTGVQYLMRELSNSMISNQTQSILLAFSLIFILLYISIRKIKPSVIS
HHHHCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH
LLPIAFTTLIIFGFMGLSGISLNLFTATIFSITIGVGIDYAVHFTSVWMTFRKRGYTAKE
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH
ATNKSYKYTARPIIANAFGLAIGLSALTLSPLRIHLYVSVLMWVAMISGVFLSLSFLPTI
HCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LKSLGNN
HHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA