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The map label for this gene is yxdM [H]

Identifier: 218906293

GI number: 218906293

Start: 4907032

End: 4908882

Strand: Direct

Name: yxdM [H]

Synonym: BCAH820_5205

Alternate gene names: 218906293

Gene position: 4907032-4908882 (Clockwise)

Preceding gene: 218906292

Following gene: 218906294

Centisome position: 92.54

GC content: 32.36

Gene sequence:

>1851_bases
ATGTTACTCAAACTTTCCATGTCAGGACTAAAAAGTAAAATAAGAGATTACATTGTCTTATTAATTGGACTTGTTATGTC
CATTTCTATCTTTTATATGTTCCAAACACTAGCGATGAATGATTCATTTATTAAAGCAAATGCAATGGTGAGCACTATTG
GAATCATCTTTCAAATAGGTTCGTTTTTATTAGCGACTATCACCTTCTTCTACATCTTATATGCGAATTCATTTTTACTT
TCATTAAGGCAAAAAGAATTCGGCATGTATATGATGTTAGGTGCGAAAAAATATAAAATTACAATGCTCATGTTTATAGA
GACTTTAGCTATCGGTATCAGCTCACTTATTATTGGGATTGGAATCGGTATCGGGCTTTCTAAAGGAATTGGACAACTCC
TCATGAAAGAGTTAGATTTTACTTCCGATGGATACCATGCTCTTTATATTCCATCTATTCGTATAACAGTAATATTTTTC
TTCATTCTGTTTCTCATAGCTGCCATTATGAATACAGCAAAACTATCTCGCATTACAATATTACAACTCGTCCATTCTGA
GATGAAAACAGACAAACCTTCAGTAAAAGGAATCAAAACTTTCTTTGTATCAGTAATTGGTGCTAGTTCATTAGCAATTG
GATATGCAGCATTAATAAACATAGAAACTTTATCATTTGCTGGATTTCCTATCGCTACAGTAGCAACGACATTAGGAACA
TATCTTATTTTTATCTCTTTATTACCGCTAACTATGAAATTACTGAAAAAAATTAAGCCATTAAATGAAAAAGGATTAAA
CTCTTTTACTTTTGCTCAATTAACCTTCCGAGTGAATGATTTAACGAAAGTATTAGCAACTGTAGCGATGTTAATTGCCC
TTGCAGTTGGAGCAATTGCTGGCGGAATGGCTTTTAAAAATAATATTAGCCTCGCTACCGATATTACTAAACTATATGAT
GTAGCAGTTCATAACCCAACAGCAGATGAGAAAAAAATATTAAAAAAGATCAAATTCGAAGAACAAGCAGACTATCGCTA
CAAAGTAGATCAGCAATTTGTTTATTACTTGAAGGAAGACTTAGAAAAGAATCGACCTCTCGTTCAAATTGGATTTGAGA
AAAAGAAAATTGGTAAAGTAGAAAAAACTGCAAGTGAACTTCCAGTTGGAGCAATTGTAAAGAAAGGTCAAAACGATACA
ATTAATGGTCCTACTCTTTCTGAAGAATGGAAGAATGCATTCAAAGAAATACAGCCTGAATACTTATACAAACAACAACA
TATAAAAATTGTAGACCAAAAGATGTACAATCAAATAAAGACAGTAGAACAATATGTTGTAATCGGAAAAACTAATGATT
ATGCAGCGTATAAGAAAGAATGGAAAGAACTTGATCAATTACAATTAGCAAAATATAAAGATATAACTACGGATCAGTTG
AATAGTAAATTTAGCTTTTACGAATTCATGTACAATTTCACAAGTGGTACAGTCTTTATGGGCTTCTTCTTAGGAATTGC
TTTCTTAGCTATGATGGCAAGTTGCTTAATGTTTAAAATTCTATCTGGTGCAACGAAAGATACGAAGCGCTATCAAATGT
TACGTAAAATAGGAGTACGTCGTGAGCTATTAGCAAGATCAATCTATAAGGAGTTATTGTTAGTATTTTTATTCCCAGCT
ACTATTGGTATCTCCCATGTAATTGTTGGTATGAATCTGTTCTCCATCATTGTGGTTGATCCATACTTCCGCATTTGGAT
TCCATTGGCAATTTTCGCAGTGATCTATACAGTTTATTACTTAATTACAGTTCAATTATATAAAGGGATTGTACTTCCGA
AAGAAAGATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GAACTACATCGTACAACAAACCGCGAAATGTTCTATAAGGAAATTTTAAATGTACTTGCTGATTTAGGCACACCAAAAGC
ATAAGAAAGGAATTTACAAC

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAAAAAAAGCTGGTGACATGCTGTCATCAGCTTTTTTATATCCCATATTAATCATTTATACACTATACTAATATATGCAC
TTAATTCTATTTTAAATTTC

Product: ABC transporter permease protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 616; Mature: 616

Protein sequence:

>616_residues
MLLKLSMSGLKSKIRDYIVLLIGLVMSISIFYMFQTLAMNDSFIKANAMVSTIGIIFQIGSFLLATITFFYILYANSFLL
SLRQKEFGMYMMLGAKKYKITMLMFIETLAIGISSLIIGIGIGIGLSKGIGQLLMKELDFTSDGYHALYIPSIRITVIFF
FILFLIAAIMNTAKLSRITILQLVHSEMKTDKPSVKGIKTFFVSVIGASSLAIGYAALINIETLSFAGFPIATVATTLGT
YLIFISLLPLTMKLLKKIKPLNEKGLNSFTFAQLTFRVNDLTKVLATVAMLIALAVGAIAGGMAFKNNISLATDITKLYD
VAVHNPTADEKKILKKIKFEEQADYRYKVDQQFVYYLKEDLEKNRPLVQIGFEKKKIGKVEKTASELPVGAIVKKGQNDT
INGPTLSEEWKNAFKEIQPEYLYKQQHIKIVDQKMYNQIKTVEQYVVIGKTNDYAAYKKEWKELDQLQLAKYKDITTDQL
NSKFSFYEFMYNFTSGTVFMGFFLGIAFLAMMASCLMFKILSGATKDTKRYQMLRKIGVRRELLARSIYKELLLVFLFPA
TIGISHVIVGMNLFSIIVVDPYFRIWIPLAIFAVIYTVYYLITVQLYKGIVLPKER

Sequences:

>Translated_616_residues
MLLKLSMSGLKSKIRDYIVLLIGLVMSISIFYMFQTLAMNDSFIKANAMVSTIGIIFQIGSFLLATITFFYILYANSFLL
SLRQKEFGMYMMLGAKKYKITMLMFIETLAIGISSLIIGIGIGIGLSKGIGQLLMKELDFTSDGYHALYIPSIRITVIFF
FILFLIAAIMNTAKLSRITILQLVHSEMKTDKPSVKGIKTFFVSVIGASSLAIGYAALINIETLSFAGFPIATVATTLGT
YLIFISLLPLTMKLLKKIKPLNEKGLNSFTFAQLTFRVNDLTKVLATVAMLIALAVGAIAGGMAFKNNISLATDITKLYD
VAVHNPTADEKKILKKIKFEEQADYRYKVDQQFVYYLKEDLEKNRPLVQIGFEKKKIGKVEKTASELPVGAIVKKGQNDT
INGPTLSEEWKNAFKEIQPEYLYKQQHIKIVDQKMYNQIKTVEQYVVIGKTNDYAAYKKEWKELDQLQLAKYKDITTDQL
NSKFSFYEFMYNFTSGTVFMGFFLGIAFLAMMASCLMFKILSGATKDTKRYQMLRKIGVRRELLARSIYKELLLVFLFPA
TIGISHVIVGMNLFSIIVVDPYFRIWIPLAIFAVIYTVYYLITVQLYKGIVLPKER
>Mature_616_residues
MLLKLSMSGLKSKIRDYIVLLIGLVMSISIFYMFQTLAMNDSFIKANAMVSTIGIIFQIGSFLLATITFFYILYANSFLL
SLRQKEFGMYMMLGAKKYKITMLMFIETLAIGISSLIIGIGIGIGLSKGIGQLLMKELDFTSDGYHALYIPSIRITVIFF
FILFLIAAIMNTAKLSRITILQLVHSEMKTDKPSVKGIKTFFVSVIGASSLAIGYAALINIETLSFAGFPIATVATTLGT
YLIFISLLPLTMKLLKKIKPLNEKGLNSFTFAQLTFRVNDLTKVLATVAMLIALAVGAIAGGMAFKNNISLATDITKLYD
VAVHNPTADEKKILKKIKFEEQADYRYKVDQQFVYYLKEDLEKNRPLVQIGFEKKKIGKVEKTASELPVGAIVKKGQNDT
INGPTLSEEWKNAFKEIQPEYLYKQQHIKIVDQKMYNQIKTVEQYVVIGKTNDYAAYKKEWKELDQLQLAKYKDITTDQL
NSKFSFYEFMYNFTSGTVFMGFFLGIAFLAMMASCLMFKILSGATKDTKRYQMLRKIGVRRELLARSIYKELLLVFLFPA
TIGISHVIVGMNLFSIIVVDPYFRIWIPLAIFAVIYTVYYLITVQLYKGIVLPKER

Specific function: Part of the ABC transporter complex yxdLM which could be involved in peptide resistance [H]

COG id: COG0577

COG function: function code V; ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the ABC-4 integral membrane protein family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003838 [H]

Pfam domain/function: PF02687 FtsX [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 69703; Mature: 69703

Theoretical pI: Translated: 10.10; Mature: 10.10

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
4.1 %Met     (Translated Protein)
4.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
4.1 %Met     (Mature Protein)
4.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLLKLSMSGLKSKIRDYIVLLIGLVMSISIFYMFQTLAMNDSFIKANAMVSTIGIIFQIG
CEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SFLLATITFFYILYANSFLLSLRQKEFGMYMMLGAKKYKITMLMFIETLAIGISSLIIGI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GIGIGLSKGIGQLLMKELDFTSDGYHALYIPSIRITVIFFFILFLIAAIMNTAKLSRITI
HHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LQLVHSEMKTDKPSVKGIKTFFVSVIGASSLAIGYAALINIETLSFAGFPIATVATTLGT
HHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEHHCCCCCHHHHHHHHHHH
YLIFISLLPLTMKLLKKIKPLNEKGLNSFTFAQLTFRVNDLTKVLATVAMLIALAVGAIA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GGMAFKNNISLATDITKLYDVAVHNPTADEKKILKKIKFEEQADYRYKVDQQFVYYLKED
CCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHH
LEKNRPLVQIGFEKKKIGKVEKTASELPVGAIVKKGQNDTINGPTLSEEWKNAFKEIQPE
HHCCCCEEEECCCHHHHCHHHHHHHHCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCHH
YLYKQQHIKIVDQKMYNQIKTVEQYVVIGKTNDYAAYKKEWKELDQLQLAKYKDITTDQL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH
NSKFSFYEFMYNFTSGTVFMGFFLGIAFLAMMASCLMFKILSGATKDTKRYQMLRKIGVR
CCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
RELLARSIYKELLLVFLFPATIGISHVIVGMNLFSIIVVDPYFRIWIPLAIFAVIYTVYY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LITVQLYKGIVLPKER
HHHHHHHHCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MLLKLSMSGLKSKIRDYIVLLIGLVMSISIFYMFQTLAMNDSFIKANAMVSTIGIIFQIG
CEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SFLLATITFFYILYANSFLLSLRQKEFGMYMMLGAKKYKITMLMFIETLAIGISSLIIGI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GIGIGLSKGIGQLLMKELDFTSDGYHALYIPSIRITVIFFFILFLIAAIMNTAKLSRITI
HHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LQLVHSEMKTDKPSVKGIKTFFVSVIGASSLAIGYAALINIETLSFAGFPIATVATTLGT
HHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEHHCCCCCHHHHHHHHHHH
YLIFISLLPLTMKLLKKIKPLNEKGLNSFTFAQLTFRVNDLTKVLATVAMLIALAVGAIA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GGMAFKNNISLATDITKLYDVAVHNPTADEKKILKKIKFEEQADYRYKVDQQFVYYLKED
CCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHH
LEKNRPLVQIGFEKKKIGKVEKTASELPVGAIVKKGQNDTINGPTLSEEWKNAFKEIQPE
HHCCCCEEEECCCHHHHCHHHHHHHHCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCHH
YLYKQQHIKIVDQKMYNQIKTVEQYVVIGKTNDYAAYKKEWKELDQLQLAKYKDITTDQL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH
NSKFSFYEFMYNFTSGTVFMGFFLGIAFLAMMASCLMFKILSGATKDTKRYQMLRKIGVR
CCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
RELLARSIYKELLLVFLFPATIGISHVIVGMNLFSIIVVDPYFRIWIPLAIFAVIYTVYY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LITVQLYKGIVLPKER
HHHHHHHHCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8867804; 9384377; 7952181 [H]