| Definition | Bacillus cereus AH820, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_011773 |
| Length | 5,302,683 |
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The map label for this gene is 218905695
Identifier: 218905695
GI number: 218905695
Start: 4338118
End: 4340745
Strand: Reverse
Name: 218905695
Synonym: BCAH820_4583
Alternate gene names: NA
Gene position: 4340745-4338118 (Counterclockwise)
Preceding gene: 218905696
Following gene: 218905694
Centisome position: 81.86
GC content: 30.4
Gene sequence:
>2628_bases ATGGATAATCCAAGGTTTTTAATTAAAAAAGTGATAATTAATAATTTTCGTGGTTATAGCTATGGAACTTTTGAATTTTT TAAAGATAAAGATGAAAAAAGAGGATTAATTTTATTAGGTGGACCAAATGGCTATGGAAAGACTTCGTTATTAGATGCAG TTGAGTGGTGTTTAAGTGGCACAATACGACGTATTCAAGAAGATTATGAAATTCGTAAAGAGACATCGAACACTTTACAA AGAGGTTTAATTAGACATAATCCGAGTAAGAAAGATGTATCAGTATTTATTGAAGCAGACATACAGGGGAATATCATTAC ATTAGAAAGAATATTTGATAAAAATCAAGAGAGTGCAGCCTTTTCCTTAGATAGTACTACCCTAAAAGTTAATGGGGAAA TATCTCAATTTAGTACTATTGATGGGATTTTAAATAAAGGAATAGCTAGTATATTTTATGATAGATATGTTTGCTCGTAT GATAAAAATATTAAAATATACGAGCAGAGTCGAGATGGAATTTATCAAATGTTTTCAGCCTTTTTTGGAGGTACCCAAGA AATTGAAAATATTATAAACAATTTACAAGGATACCAAACAGGAAGTGGAAAACAAAAAAAGCTTGTCTACGGAGTAATTA AACAATTAGAAGAAGAATTAGGCATTTTAAACGTGAAAAAAGAAGAGGCGAGTCAGAGGCTAGGACAGGAAGAGGAGAAA AGAAGTAGTTATCTGGATGATATAAAAAGTCAGGGAGATTTACAGGAATTCCTTGATATATATTCAGCTAATATGGCAAT AAAACTAAATCTTCATCCACAGAAAATTATGGATCAGTCATTAGATTATGAGCAAAAACTTAAAGCGGTTAGTTTAAATA AACGTGTTTTAGAAAAAATAAAATATCTCGTTGATAAAAGGATAGCTTACATCCAGGGAGAGCTATATATAGAACATTTA CAAAAGGAAGCAGCTCTTCTGGATTTTCGTGAGGAAGTACTCAACCCATATAAACAATATGAAGCGGTTATTGATCAGAT AAAGTCCTTAAATGTTGAAGAACTTAAAGAGCGATTGGATTGGTTTAAGCGGTTTAAAATGCATGTTTCCCAGATTAATG GTACTTCTCAGGGTATAAATGAGGTATTGTTGGGATATGCCAAAAAGCTTTTTGATGATAAACATATTTTAGTGAAACAA AGTGAAGCGTTAGAATCAAAAGCTCAAGAAAAAGTAGAGATTGAGGAAGCTTTGAAAAAGTATGACACTACTAAACCTGT TCTCAAAGCATTGCGTGCTTTGGTTGATAATACAGGTGGATTTGGAGCTCTGCGTAAATCCAAATATCCTAAATGCCCAT TATGCGGGAGTAAAGAAGCTTTTTCTGATGAAGATATAGAACTAGCTCAAGATGCAAAGCGTATCTTAGGAGAAGTAGAT AATAAAAGAAGTGAACTACAAGTTAAAAATAATTTGTTGGAAACAGATTTAAAAGAACAACAAGAGTATATAAAAGAACG TATAATAGAATATATTGATAATGAAATTTCTCAATTACAGAAAAGTATTTTTTATTTTAATCAAACGGAGACCCTTCGAA TAGCTTGTATTAAATTTAATTTGCAGTTTAAAGATTTAGATATTAGTTTTTTAGAAAAAATGGAAAGTGAACTGAAGGAA AAGTTATTAGAAGAATCAACTGTTCTTATTATGGAGGATGCGATAATTAATACTTTATCCAATCAATCTAATAAGCTAGA GGGTATCCCTAGTATTTTGAATGTAAATGAAAATATGGAAATTAAAGAATTCTCAAATCTACCTATTAAAAGAAAACAAA GTGTGTTAAGGGAGTTTGTGAGTCGTTATAAGGTGGAATTGGATGATCAAAAATCTTATTTAGATTCATCGACAATAGAA GAAATAAGTGTAGAGATGCTAGAAATTCAATTAAATACTTGGAAGCATGTTGAACAGTTTCTTATAAGTGATGAAATTAT AAAAGATATGGATAGGAATGTTTTAAATTTAAAAGATGACTTTGAAGAAAAAGAAAGATTATCCAAGAATAAGGATGAAG AAATTAAAAAATTAAAAAGTTTATTGTCCAACTTAAGAACAATTAGAAGTGAGTGGGACAAAAAAGTTGCAGATGAAATC AGAGTGCCGTTCAAAAGGATGTATAAAAGGCTAACAAGACATACTAATATTAATGATATCGATTTAATAAAAGATGGAAG GACAACACAGAAAGCGAAAATAGTAGCTAATGTAAATTCTGAAGAAATTTTTGCGCCTAATATATTAAGTGCGGGTCAAC TGTCGACCATGTCATTGGCGATTTTCTTAACAGTAGCTATGGGGCAGAAAAGCCAAGCGTTTAGGTGTTATTTTATGGAT GAGCCTATTCAAACGATGGATGATTTGAATATTTTATCCTTTGTAGATTTATTACGAACTGAGTTTTTACGTCACAAAAC AGAACAAGATAGTTTTGTTGATCAATTAATTTTAACAACTTGTGATGAGGATTTTGAAAATTTAGTACATCATAAAATGA AGAATTTTGATGTTAATTTTACACATATTCGTTTTACGGGTTACGGTGAATATGAGTTTAAAGTATAA
Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases AAGGGCCTATAAAGGCCCTTTTTAATTAGTGAGATGATTTTCAAAATATGTCAAGGCAGTAATGCAAATTGCCATTGGAA GTGAACTATCCTCGTAAAAT
Product: RecF/RecN/SMC N domain, putative
Products: NA
Alternate protein names: RecF/RecN/SMC Domain-Containing Protein; RecF/RecN/SMC N Domain
Number of amino acids: Translated: 875; Mature: 875
Protein sequence:
>875_residues MDNPRFLIKKVIINNFRGYSYGTFEFFKDKDEKRGLILLGGPNGYGKTSLLDAVEWCLSGTIRRIQEDYEIRKETSNTLQ RGLIRHNPSKKDVSVFIEADIQGNIITLERIFDKNQESAAFSLDSTTLKVNGEISQFSTIDGILNKGIASIFYDRYVCSY DKNIKIYEQSRDGIYQMFSAFFGGTQEIENIINNLQGYQTGSGKQKKLVYGVIKQLEEELGILNVKKEEASQRLGQEEEK RSSYLDDIKSQGDLQEFLDIYSANMAIKLNLHPQKIMDQSLDYEQKLKAVSLNKRVLEKIKYLVDKRIAYIQGELYIEHL QKEAALLDFREEVLNPYKQYEAVIDQIKSLNVEELKERLDWFKRFKMHVSQINGTSQGINEVLLGYAKKLFDDKHILVKQ SEALESKAQEKVEIEEALKKYDTTKPVLKALRALVDNTGGFGALRKSKYPKCPLCGSKEAFSDEDIELAQDAKRILGEVD NKRSELQVKNNLLETDLKEQQEYIKERIIEYIDNEISQLQKSIFYFNQTETLRIACIKFNLQFKDLDISFLEKMESELKE KLLEESTVLIMEDAIINTLSNQSNKLEGIPSILNVNENMEIKEFSNLPIKRKQSVLREFVSRYKVELDDQKSYLDSSTIE EISVEMLEIQLNTWKHVEQFLISDEIIKDMDRNVLNLKDDFEEKERLSKNKDEEIKKLKSLLSNLRTIRSEWDKKVADEI RVPFKRMYKRLTRHTNINDIDLIKDGRTTQKAKIVANVNSEEIFAPNILSAGQLSTMSLAIFLTVAMGQKSQAFRCYFMD EPIQTMDDLNILSFVDLLRTEFLRHKTEQDSFVDQLILTTCDEDFENLVHHKMKNFDVNFTHIRFTGYGEYEFKV
Sequences:
>Translated_875_residues MDNPRFLIKKVIINNFRGYSYGTFEFFKDKDEKRGLILLGGPNGYGKTSLLDAVEWCLSGTIRRIQEDYEIRKETSNTLQ RGLIRHNPSKKDVSVFIEADIQGNIITLERIFDKNQESAAFSLDSTTLKVNGEISQFSTIDGILNKGIASIFYDRYVCSY DKNIKIYEQSRDGIYQMFSAFFGGTQEIENIINNLQGYQTGSGKQKKLVYGVIKQLEEELGILNVKKEEASQRLGQEEEK RSSYLDDIKSQGDLQEFLDIYSANMAIKLNLHPQKIMDQSLDYEQKLKAVSLNKRVLEKIKYLVDKRIAYIQGELYIEHL QKEAALLDFREEVLNPYKQYEAVIDQIKSLNVEELKERLDWFKRFKMHVSQINGTSQGINEVLLGYAKKLFDDKHILVKQ SEALESKAQEKVEIEEALKKYDTTKPVLKALRALVDNTGGFGALRKSKYPKCPLCGSKEAFSDEDIELAQDAKRILGEVD NKRSELQVKNNLLETDLKEQQEYIKERIIEYIDNEISQLQKSIFYFNQTETLRIACIKFNLQFKDLDISFLEKMESELKE KLLEESTVLIMEDAIINTLSNQSNKLEGIPSILNVNENMEIKEFSNLPIKRKQSVLREFVSRYKVELDDQKSYLDSSTIE EISVEMLEIQLNTWKHVEQFLISDEIIKDMDRNVLNLKDDFEEKERLSKNKDEEIKKLKSLLSNLRTIRSEWDKKVADEI RVPFKRMYKRLTRHTNINDIDLIKDGRTTQKAKIVANVNSEEIFAPNILSAGQLSTMSLAIFLTVAMGQKSQAFRCYFMD EPIQTMDDLNILSFVDLLRTEFLRHKTEQDSFVDQLILTTCDEDFENLVHHKMKNFDVNFTHIRFTGYGEYEFKV >Mature_875_residues MDNPRFLIKKVIINNFRGYSYGTFEFFKDKDEKRGLILLGGPNGYGKTSLLDAVEWCLSGTIRRIQEDYEIRKETSNTLQ RGLIRHNPSKKDVSVFIEADIQGNIITLERIFDKNQESAAFSLDSTTLKVNGEISQFSTIDGILNKGIASIFYDRYVCSY DKNIKIYEQSRDGIYQMFSAFFGGTQEIENIINNLQGYQTGSGKQKKLVYGVIKQLEEELGILNVKKEEASQRLGQEEEK RSSYLDDIKSQGDLQEFLDIYSANMAIKLNLHPQKIMDQSLDYEQKLKAVSLNKRVLEKIKYLVDKRIAYIQGELYIEHL QKEAALLDFREEVLNPYKQYEAVIDQIKSLNVEELKERLDWFKRFKMHVSQINGTSQGINEVLLGYAKKLFDDKHILVKQ SEALESKAQEKVEIEEALKKYDTTKPVLKALRALVDNTGGFGALRKSKYPKCPLCGSKEAFSDEDIELAQDAKRILGEVD NKRSELQVKNNLLETDLKEQQEYIKERIIEYIDNEISQLQKSIFYFNQTETLRIACIKFNLQFKDLDISFLEKMESELKE KLLEESTVLIMEDAIINTLSNQSNKLEGIPSILNVNENMEIKEFSNLPIKRKQSVLREFVSRYKVELDDQKSYLDSSTIE EISVEMLEIQLNTWKHVEQFLISDEIIKDMDRNVLNLKDDFEEKERLSKNKDEEIKKLKSLLSNLRTIRSEWDKKVADEI RVPFKRMYKRLTRHTNINDIDLIKDGRTTQKAKIVANVNSEEIFAPNILSAGQLSTMSLAIFLTVAMGQKSQAFRCYFMD EPIQTMDDLNILSFVDLLRTEFLRHKTEQDSFVDQLILTTCDEDFENLVHHKMKNFDVNFTHIRFTGYGEYEFKV
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 101763; Mature: 101763
Theoretical pI: Translated: 5.29; Mature: 5.29
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.8 %Cys (Translated Protein) 1.8 %Met (Translated Protein) 2.6 %Cys+Met (Translated Protein) 0.8 %Cys (Mature Protein) 1.8 %Met (Mature Protein) 2.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MDNPRFLIKKVIINNFRGYSYGTFEFFKDKDEKRGLILLGGPNGYGKTSLLDAVEWCLSG CCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHCCCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHH TIRRIQEDYEIRKETSNTLQRGLIRHNPSKKDVSVFIEADIQGNIITLERIFDKNQESAA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCCCEEEHHHHHCCCCCCCE FSLDSTTLKVNGEISQFSTIDGILNKGIASIFYDRYVCSYDKNIKIYEQSRDGIYQMFSA EEECCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHH FFGGTQEIENIINNLQGYQTGSGKQKKLVYGVIKQLEEELGILNVKKEEASQRLGQEEEK HHCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCCHHHH RSSYLDDIKSQGDLQEFLDIYSANMAIKLNLHPQKIMDQSLDYEQKLKAVSLNKRVLEKI HHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCEEEEEECCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH KYLVDKRIAYIQGELYIEHLQKEAALLDFREEVLNPYKQYEAVIDQIKSLNVEELKERLD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHH WFKRFKMHVSQINGTSQGINEVLLGYAKKLFDDKHILVKQSEALESKAQEKVEIEEALKK HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YDTTKPVLKALRALVDNTGGFGALRKSKYPKCPLCGSKEAFSDEDIELAQDAKRILGEVD CCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHC NKRSELQVKNNLLETDLKEQQEYIKERIIEYIDNEISQLQKSIFYFNQTETLRIACIKFN CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEEE LQFKDLDISFLEKMESELKEKLLEESTVLIMEDAIINTLSNQSNKLEGIPSILNVNENME EEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHCCCCCCC IKEFSNLPIKRKQSVLREFVSRYKVELDDQKSYLDSSTIEEISVEMLEIQLNTWKHVEQF HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCHHHHHHHHHHHHHEEHHHHHHHHHH LISDEIIKDMDRNVLNLKDDFEEKERLSKNKDEEIKKLKSLLSNLRTIRSEWDKKVADEI HHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RVPFKRMYKRLTRHTNINDIDLIKDGRTTQKAKIVANVNSEEIFAPNILSAGQLSTMSLA CCCHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHH IFLTVAMGQKSQAFRCYFMDEPIQTMDDLNILSFVDLLRTEFLRHKTEQDSFVDQLILTT HHHHHHCCCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHH CDEDFENLVHHKMKNFDVNFTHIRFTGYGEYEFKV CCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEECCCEEECC >Mature Secondary Structure MDNPRFLIKKVIINNFRGYSYGTFEFFKDKDEKRGLILLGGPNGYGKTSLLDAVEWCLSG CCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHCCCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHH TIRRIQEDYEIRKETSNTLQRGLIRHNPSKKDVSVFIEADIQGNIITLERIFDKNQESAA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCCCEEEHHHHHCCCCCCCE FSLDSTTLKVNGEISQFSTIDGILNKGIASIFYDRYVCSYDKNIKIYEQSRDGIYQMFSA EEECCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHH FFGGTQEIENIINNLQGYQTGSGKQKKLVYGVIKQLEEELGILNVKKEEASQRLGQEEEK HHCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCCHHHH RSSYLDDIKSQGDLQEFLDIYSANMAIKLNLHPQKIMDQSLDYEQKLKAVSLNKRVLEKI HHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCEEEEEECCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH KYLVDKRIAYIQGELYIEHLQKEAALLDFREEVLNPYKQYEAVIDQIKSLNVEELKERLD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHH WFKRFKMHVSQINGTSQGINEVLLGYAKKLFDDKHILVKQSEALESKAQEKVEIEEALKK HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YDTTKPVLKALRALVDNTGGFGALRKSKYPKCPLCGSKEAFSDEDIELAQDAKRILGEVD CCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHC NKRSELQVKNNLLETDLKEQQEYIKERIIEYIDNEISQLQKSIFYFNQTETLRIACIKFN CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEEE LQFKDLDISFLEKMESELKEKLLEESTVLIMEDAIINTLSNQSNKLEGIPSILNVNENME EEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHCCCCCCC IKEFSNLPIKRKQSVLREFVSRYKVELDDQKSYLDSSTIEEISVEMLEIQLNTWKHVEQF HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCHHHHHHHHHHHHHEEHHHHHHHHHH LISDEIIKDMDRNVLNLKDDFEEKERLSKNKDEEIKKLKSLLSNLRTIRSEWDKKVADEI HHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RVPFKRMYKRLTRHTNINDIDLIKDGRTTQKAKIVANVNSEEIFAPNILSAGQLSTMSLA CCCHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHH IFLTVAMGQKSQAFRCYFMDEPIQTMDDLNILSFVDLLRTEFLRHKTEQDSFVDQLILTT HHHHHHCCCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHH CDEDFENLVHHKMKNFDVNFTHIRFTGYGEYEFKV CCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEECCCEEECC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA