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The map label for this gene is ydgH [H]

Identifier: 218904065

GI number: 218904065

Start: 2782465

End: 2785131

Strand: Reverse

Name: ydgH [H]

Synonym: BCAH820_2949

Alternate gene names: 218904065

Gene position: 2785131-2782465 (Counterclockwise)

Preceding gene: 218904066

Following gene: 218904064

Centisome position: 52.52

GC content: 34.55

Gene sequence:

>2667_bases
GTGAAAACGAAAGGGGTAAAAACGTACTTAACAGGAAGTGACTTAATCGCGGGTGATTTTCTTACATCTTCTCAAGAGGG
AGTGAAAAAGACTGAAGTTATTTCAATCATTTTCATTCTAGTTATATTAATCATTGTATTTCGTTCACCGATTGTTCCCA
TTGTTTCTCTTCTTACTGTTGGGGTATCATATTTAGTTTCAATGGGGATTATTGCTCATCTTGTAGATCAATTTGATTTT
CCGTTTTCTAACTTTACACAAGTGTTTGTAGTTGTTGTCCTGTTTGGAGTTGGAACAGACTATAACATTTTATTATTTAC
GAGATTTAAAGAAGAATTAAGTAAACAAGAAAACGCATTTTTGGCTACGAAAGAAACATTTAAATCGGCAGGGAAAACTG
TTTTATATAGCGGGATAGCAGTACTAATTGGTTTTGCATCTCTTGCTTTAGCGAGCTTTAAATTATATCAATCTACTTCA
GCGGTAGCAATTGGTGTCGCAGTATTATTACTCGTATTAACTACGTTAAATCCATTTTTCATGGTGCTTCTAGGAAAAGG
GATGTTTTATCCAGTTAAAACATTTAAAGGTCATGAAGATAGTCGCCTATGGGGATTCTTTGCGAAAAATTCAGTTGCAA
GACCGTTTGTCGCTTTAATTATTGTATTCGTGATATCGATTCCTTTCGTATTAAAGTATTCTAATACACTTAATTACAAC
GATTTATTTGAAGTAGACAATAAATATGAGTCGAAAATGGGGATTAACGTAATAGAAGAACATTTTCCACCTGGTTTTTC
TTCACCAAGTACGTTAGTCATTCAATCGAATAATAAGTTAGATGAGGCGAGTTCGCTTCAAACTTTAGATGAACTAACTG
AAAAGATTTTGAAAGTGAAAGGTGTTTCAGAAGTATATGCACCGACACGTCCAACTGGTGAAAGAATTAAAGAACTGTAT
ATAAATAAACAAGCGGGTGAACTAAATACAGGTTTAGGAGATGCCAATGGTGGTATAAAAGAAATTAATGATGGATTAAC
TACTGCGAAAGATAAAATGGGTAGTAAGGATTCAAATAGTCTTGCAAACGTTCAAAAGTTAATTGATGGAACAAATGAAG
CGAAAAATGGTGTGTCGGCATTAGGAACAGCTTTAAATCAACTATCAAATGGCATAAATGACGGAGCAAAAGGTGCGCAG
CAAATTGAGAGTGGGTTAACTTCAGTAAATGAAAATATAAGTGTATTATCTAATGCAACTTCACAACTTCATGCTGGCTA
TACACAGTTAGAGAAAGGTTTAAGTTCTTACGATCAATACTTCGGAAGTATTTCTCAAGCGATTGACGGTGCGAAGAAAG
GTTATGAACAAATTGAAATGTTAATGACCAATTTCATTCAAACGAAACCAGAATTAGCAAATGATCCTAACATTCTGCAG
ACGATAGGAATTGCTAAAGAGGCTCAAAAGCAATTAGGTGGGCTGTCAAATGAATTAAATCAATTAGCAACGCAGCATAA
TGCGGCGATGGGATCATTTAAAGAAGCGAATCAATCGTTATTGAAAGTGGATAACGGCTTAAAAGAAATGAGCAATGGAG
TTACTAAGTTACAAAAAGGAGCAGCTGATCTTAAAAATGGATTAAATGAAGGTGCTTCAGGTTCAAAACAAATTGCGAAC
AAGTCATYTGAGTTACAAACCGGATTAACGAAAATAAACGATGGGCAAGGACAGGTATTAACAGGACTGAAAGACTTGCA
AGAACAGATGGGACAATTACAATCAGGACTATCTAAAAGTACAGAAGGCCTTGAAAAGGTAAGTAATGGCTTAGGGGATG
CTCAGAAATATTTAGGAGAACTAAATGAATCAAAAAGCTCTGAGAAATTTTATATTCCAAAAGAAGTTTTGGAGGGAGAA
GATTTCCAAAAAGCTTTGAATACGTACATGTCACATGATAGAAAGACTGCTAAAATGACAATCATTTTAGACGTAAATCC
GTATTCAAAAGAAGCGATGCCAATTATTCAAGAAATCAATAAAACGATAGATGGTACTTTGAAGGGGACAGAATTAAATA
ATGCAAAAAAAGCAATTGGAGGAACAACAGCTAGAAACGTTGATTTAAAAGAAGTAACAGGGCAAGACTTCTTACGTACA
GCTACAATTATGTTAATTGGAATTGCGATTGTATTAATTGTGATTACACGCTCATTATTAAACACAATCTTTATTATTGG
ATCTTTAATATTAGCTTGTTTTGCATCACTTGGTATAAGTGAACAAATTAGTACACACTTACTAAACGTAGATTCACTAA
GCTGGAATGTTCCATTCTTTAGCTTCATAATGATTGTCGCTTTAGGAGTGGATTATAGTATTTTTGTAATGATGAGATAC
AATGAGTTAGAAGGGGACCCAGCGACGAAAATTGTAACTGCTTCTCGTCATATTGGAGGAGTTGTATTATCAGCGGCACT
TATTTTAGGTGGTACATTTGCTGCATTAATCCCTTCAGGTGTATTAACGCTTATACAAGTAGCATCCGTAGTTGGCGTTG
CGTTGTTCCTATTAGCTATCATTGTGATGCCAATATTGTTACCTGCTTTAATAGGTTTAACGAGTAAAATGAAGGATTAT
GCAAAGAAATTAAGTGTAAGGAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CAATTAGTTTCTAAAGATAATACGACTATTTTAACGCAAATATCGATAGATAAAAAAACAAGGTGAAATATCGAAAGTTT
CAAATAATCTTCATAATAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAGAAGCCCCTTTTAAAAGTAACTGGTTCAGTTATAGGAGATAAAATATAAAATAACATACAAATTAGGGATGCTAAATC
ACATATGATTTAGCATCCTT

Product: putative membrane protein, MmpL family

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 888; Mature: 888

Protein sequence:

>888_residues
MKTKGVKTYLTGSDLIAGDFLTSSQEGVKKTEVISIIFILVILIIVFRSPIVPIVSLLTVGVSYLVSMGIIAHLVDQFDF
PFSNFTQVFVVVVLFGVGTDYNILLFTRFKEELSKQENAFLATKETFKSAGKTVLYSGIAVLIGFASLALASFKLYQSTS
AVAIGVAVLLLVLTTLNPFFMVLLGKGMFYPVKTFKGHEDSRLWGFFAKNSVARPFVALIIVFVISIPFVLKYSNTLNYN
DLFEVDNKYESKMGINVIEEHFPPGFSSPSTLVIQSNNKLDEASSLQTLDELTEKILKVKGVSEVYAPTRPTGERIKELY
INKQAGELNTGLGDANGGIKEINDGLTTAKDKMGSKDSNSLANVQKLIDGTNEAKNGVSALGTALNQLSNGINDGAKGAQ
QIESGLTSVNENISVLSNATSQLHAGYTQLEKGLSSYDQYFGSISQAIDGAKKGYEQIEMLMTNFIQTKPELANDPNILQ
TIGIAKEAQKQLGGLSNELNQLATQHNAAMGSFKEANQSLLKVDNGLKEMSNGVTKLQKGAADLKNGLNEGASGSKQIAN
KSXELQTGLTKINDGQGQVLTGLKDLQEQMGQLQSGLSKSTEGLEKVSNGLGDAQKYLGELNESKSSEKFYIPKEVLEGE
DFQKALNTYMSHDRKTAKMTIILDVNPYSKEAMPIIQEINKTIDGTLKGTELNNAKKAIGGTTARNVDLKEVTGQDFLRT
ATIMLIGIAIVLIVITRSLLNTIFIIGSLILACFASLGISEQISTHLLNVDSLSWNVPFFSFIMIVALGVDYSIFVMMRY
NELEGDPATKIVTASRHIGGVVLSAALILGGTFAALIPSGVLTLIQVASVVGVALFLLAIIVMPILLPALIGLTSKMKDY
AKKLSVRK

Sequences:

>Translated_888_residues
MKTKGVKTYLTGSDLIAGDFLTSSQEGVKKTEVISIIFILVILIIVFRSPIVPIVSLLTVGVSYLVSMGIIAHLVDQFDF
PFSNFTQVFVVVVLFGVGTDYNILLFTRFKEELSKQENAFLATKETFKSAGKTVLYSGIAVLIGFASLALASFKLYQSTS
AVAIGVAVLLLVLTTLNPFFMVLLGKGMFYPVKTFKGHEDSRLWGFFAKNSVARPFVALIIVFVISIPFVLKYSNTLNYN
DLFEVDNKYESKMGINVIEEHFPPGFSSPSTLVIQSNNKLDEASSLQTLDELTEKILKVKGVSEVYAPTRPTGERIKELY
INKQAGELNTGLGDANGGIKEINDGLTTAKDKMGSKDSNSLANVQKLIDGTNEAKNGVSALGTALNQLSNGINDGAKGAQ
QIESGLTSVNENISVLSNATSQLHAGYTQLEKGLSSYDQYFGSISQAIDGAKKGYEQIEMLMTNFIQTKPELANDPNILQ
TIGIAKEAQKQLGGLSNELNQLATQHNAAMGSFKEANQSLLKVDNGLKEMSNGVTKLQKGAADLKNGLNEGASGSKQIAN
KSXELQTGLTKINDGQGQVLTGLKDLQEQMGQLQSGLSKSTEGLEKVSNGLGDAQKYLGELNESKSSEKFYIPKEVLEGE
DFQKALNTYMSHDRKTAKMTIILDVNPYSKEAMPIIQEINKTIDGTLKGTELNNAKKAIGGTTARNVDLKEVTGQDFLRT
ATIMLIGIAIVLIVITRSLLNTIFIIGSLILACFASLGISEQISTHLLNVDSLSWNVPFFSFIMIVALGVDYSIFVMMRY
NELEGDPATKIVTASRHIGGVVLSAALILGGTFAALIPSGVLTLIQVASVVGVALFLLAIIVMPILLPALIGLTSKMKDY
AKKLSVRK
>Mature_888_residues
MKTKGVKTYLTGSDLIAGDFLTSSQEGVKKTEVISIIFILVILIIVFRSPIVPIVSLLTVGVSYLVSMGIIAHLVDQFDF
PFSNFTQVFVVVVLFGVGTDYNILLFTRFKEELSKQENAFLATKETFKSAGKTVLYSGIAVLIGFASLALASFKLYQSTS
AVAIGVAVLLLVLTTLNPFFMVLLGKGMFYPVKTFKGHEDSRLWGFFAKNSVARPFVALIIVFVISIPFVLKYSNTLNYN
DLFEVDNKYESKMGINVIEEHFPPGFSSPSTLVIQSNNKLDEASSLQTLDELTEKILKVKGVSEVYAPTRPTGERIKELY
INKQAGELNTGLGDANGGIKEINDGLTTAKDKMGSKDSNSLANVQKLIDGTNEAKNGVSALGTALNQLSNGINDGAKGAQ
QIESGLTSVNENISVLSNATSQLHAGYTQLEKGLSSYDQYFGSISQAIDGAKKGYEQIEMLMTNFIQTKPELANDPNILQ
TIGIAKEAQKQLGGLSNELNQLATQHNAAMGSFKEANQSLLKVDNGLKEMSNGVTKLQKGAADLKNGLNEGASGSKQIAN
KSXELQTGLTKINDGQGQVLTGLKDLQEQMGQLQSGLSKSTEGLEKVSNGLGDAQKYLGELNESKSSEKFYIPKEVLEGE
DFQKALNTYMSHDRKTAKMTIILDVNPYSKEAMPIIQEINKTIDGTLKGTELNNAKKAIGGTTARNVDLKEVTGQDFLRT
ATIMLIGIAIVLIVITRSLLNTIFIIGSLILACFASLGISEQISTHLLNVDSLSWNVPFFSFIMIVALGVDYSIFVMMRY
NELEGDPATKIVTASRHIGGVVLSAALILGGTFAALIPSGVLTLIQVASVVGVALFLLAIIVMPILLPALIGLTSKMKDY
AKKLSVRK

Specific function: Unknown

COG id: COG2409

COG function: function code R; Predicted drug exporters of the RND superfamily

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the mmpL family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR004869
- InterPro:   IPR000731 [H]

Pfam domain/function: PF03176 MMPL [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 95795; Mature: 95795

Theoretical pI: Translated: 7.29; Mature: 7.29

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.1 %Cys     (Translated Protein)
2.3 %Met     (Translated Protein)
2.4 %Cys+Met (Translated Protein)
0.1 %Cys     (Mature Protein)
2.3 %Met     (Mature Protein)
2.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKTKGVKTYLTGSDLIAGDFLTSSQEGVKKTEVISIIFILVILIIVFRSPIVPIVSLLTV
CCCCCCEEEECCCCHHHHHHHCCCHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
GVSYLVSMGIIAHLVDQFDFPFSNFTQVFVVVVLFGVGTDYNILLFTRFKEELSKQENAF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHCCC
LATKETFKSAGKTVLYSGIAVLIGFASLALASFKLYQSTSAVAIGVAVLLLVLTTLNPFF
HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MVLLGKGMFYPVKTFKGHEDSRLWGFFAKNSVARPFVALIIVFVISIPFVLKYSNTLNYN
HHHHCCCCEEEHHHCCCCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCC
DLFEVDNKYESKMGINVIEEHFPPGFSSPSTLVIQSNNKLDEASSLQTLDELTEKILKVK
HHHHHCCHHHHHCCHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
GVSEVYAPTRPTGERIKELYINKQAGELNTGLGDANGGIKEINDGLTTAKDKMGSKDSNS
CCHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHCCHHHHHHHCCCCCCHH
LANVQKLIDGTNEAKNGVSALGTALNQLSNGINDGAKGAQQIESGLTSVNENISVLSNAT
HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH
SQLHAGYTQLEKGLSSYDQYFGSISQAIDGAKKGYEQIEMLMTNFIQTKPELANDPNILQ
HHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHH
TIGIAKEAQKQLGGLSNELNQLATQHNAAMGSFKEANQSLLKVDNGLKEMSNGVTKLQKG
HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AADLKNGLNEGASGSKQIANKSXELQTGLTKINDGQGQVLTGLKDLQEQMGQLQSGLSKS
HHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCHHHHHHCCHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TEGLEKVSNGLGDAQKYLGELNESKSSEKFYIPKEVLEGEDFQKALNTYMSHDRKTAKMT
HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCEECCHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEE
IILDVNPYSKEAMPIIQEINKTIDGTLKGTELNNAKKAIGGTTARNVDLKEVTGQDFLRT
EEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCHHHHCCHHHHHH
ATIMLIGIAIVLIVITRSLLNTIFIIGSLILACFASLGISEQISTHLLNVDSLSWNVPFF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHH
SFIMIVALGVDYSIFVMMRYNELEGDPATKIVTASRHIGGVVLSAALILGGTFAALIPSG
HHHHHHHHCCCCEEEEEEEECCCCCCCCHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VLTLIQVASVVGVALFLLAIIVMPILLPALIGLTSKMKDYAKKLSVRK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure
MKTKGVKTYLTGSDLIAGDFLTSSQEGVKKTEVISIIFILVILIIVFRSPIVPIVSLLTV
CCCCCCEEEECCCCHHHHHHHCCCHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
GVSYLVSMGIIAHLVDQFDFPFSNFTQVFVVVVLFGVGTDYNILLFTRFKEELSKQENAF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHCCC
LATKETFKSAGKTVLYSGIAVLIGFASLALASFKLYQSTSAVAIGVAVLLLVLTTLNPFF
HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MVLLGKGMFYPVKTFKGHEDSRLWGFFAKNSVARPFVALIIVFVISIPFVLKYSNTLNYN
HHHHCCCCEEEHHHCCCCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCC
DLFEVDNKYESKMGINVIEEHFPPGFSSPSTLVIQSNNKLDEASSLQTLDELTEKILKVK
HHHHHCCHHHHHCCHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
GVSEVYAPTRPTGERIKELYINKQAGELNTGLGDANGGIKEINDGLTTAKDKMGSKDSNS
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LANVQKLIDGTNEAKNGVSALGTALNQLSNGINDGAKGAQQIESGLTSVNENISVLSNAT
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SQLHAGYTQLEKGLSSYDQYFGSISQAIDGAKKGYEQIEMLMTNFIQTKPELANDPNILQ
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TIGIAKEAQKQLGGLSNELNQLATQHNAAMGSFKEANQSLLKVDNGLKEMSNGVTKLQKG
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TEGLEKVSNGLGDAQKYLGELNESKSSEKFYIPKEVLEGEDFQKALNTYMSHDRKTAKMT
HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCEECCHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEE
IILDVNPYSKEAMPIIQEINKTIDGTLKGTELNNAKKAIGGTTARNVDLKEVTGQDFLRT
EEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCHHHHCCHHHHHH
ATIMLIGIAIVLIVITRSLLNTIFIIGSLILACFASLGISEQISTHLLNVDSLSWNVPFF
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SFIMIVALGVDYSIFVMMRYNELEGDPATKIVTASRHIGGVVLSAALILGGTFAALIPSG
HHHHHHHHCCCCEEEEEEEECCCCCCCCHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VLTLIQVASVVGVALFLLAIIVMPILLPALIGLTSKMKDYAKKLSVRK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9384377 [H]