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The map label for this gene is yfmI [H]

Identifier: 218903220

GI number: 218903220

Start: 1998604

End: 1999821

Strand: Reverse

Name: yfmI [H]

Synonym: BCAH820_2104

Alternate gene names: 218903220

Gene position: 1999821-1998604 (Counterclockwise)

Preceding gene: 218903225

Following gene: 218903214

Centisome position: 37.71

GC content: 34.4

Gene sequence:

>1218_bases
TTGCATAAACGTTCATTAACTTACTATTTAGGATCGAAAATATGCATTACTCTCGCTGACATCTTATACATAATGATTAT
TACAACTCATATGTATATCACAACTAAATCCGCTACATTAACTGCTCTTTTTCCATTATTACAAGTCATAACTAACCTTA
TAGCAAATACATCTGCACCACTTATAATGAATCGCTTTTCATCTTATTCATTACTGTTTACATTACAATGGTCAAAAACT
GCCCTATTATTTTTATTAATGATATTATTCCCGGTCCTTTCTACAAACATTGTAGCACTATTAATTTTCATTTTTTTCAT
TTCATTATGTAGTGGCTGGAGCGCTCCATTACTATACGGTATTCTACCGCGCCTTACACCAAAAGAAAATTTAGTAAAAG
TAAATAGTATTTTTTCCTTTTTCACACAAATTGCCCAAGCCGCTGCTTATACATTTACAAGTGTTATTGTTCTTCTTATC
GGTGCTACTTCTACACTCATGATGAATAATATTTTGATGATTTTCGGATGTGTTGCACTACACTTTTCATTACGTTCCAT
ACATAATGAGCAAGTAATAGAGCCTTCTTCTTCAAAAGCTGCTACTTTATTGGAGGGTTGGAAACTCTTATTTCAAAATC
CTGCTCTCCGCACCGTTACATGTATGGACTTAATTGAAACTTTCGCAGGGACGATATGGATTGGCGCTATTACCATGGCT
TATGTAACAACCGTCCTTCATAAAGGAGAAGAATGGTGGGGATATATTAATACAAGTTATTACGTTGGCACGTTAATTGG
CGGGCTATTAGCGTGGAAAATGAGTACATACATTCAAAACAATTTAATTCGTTCCATGGCGATAGGCTCTCTTATGTTTA
GTATTCTTACATTTTTATATGGTATGACAAGTAGCGGGTTGATTGCCTTATTTCTATGTGTTCTAATGGGGCCATGTTAT
CAAGTTAGAGATATTTCTCAAACGACAGTGTTACAATCTAGTGTCGAGCCTACTCTATTATCCAAAATGTATACAGCTCA
TGGTGCACTCCTCTCGACGGCTTCTGGTCTTTCTATGCTTAGTGTTGGCATTATTACCGATATTTTCGGTGTTCGTACGA
TTTATATCATCGCTTCTCTTCTTATTTTATGTTCTGCTTGTTTATCTTTTAGCCTATTAAAATATCGTAAAACAGATCAA
AAAAATATTTCAATGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAAAAGTGACAAAAAATTAAATTCTTTCGAAAATTTAATTTTCAAATTATAATTATTCTAACTACTGAAATATTACTTTT
TTAGGAAGGTGGTGTGCTTA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TCAATAAAGCAAAAAGGACAGGAATTCCTGTCCTTTTTGTATATTTTACTTATGACAATCCCGGGATTTTTCTATGGTTT
GTCGCTTGTTCAAAAGCGTA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 405; Mature: 405

Protein sequence:

>405_residues
MHKRSLTYYLGSKICITLADILYIMIITTHMYITTKSATLTALFPLLQVITNLIANTSAPLIMNRFSSYSLLFTLQWSKT
ALLFLLMILFPVLSTNIVALLIFIFFISLCSGWSAPLLYGILPRLTPKENLVKVNSIFSFFTQIAQAAAYTFTSVIVLLI
GATSTLMMNNILMIFGCVALHFSLRSIHNEQVIEPSSSKAATLLEGWKLLFQNPALRTVTCMDLIETFAGTIWIGAITMA
YVTTVLHKGEEWWGYINTSYYVGTLIGGLLAWKMSTYIQNNLIRSMAIGSLMFSILTFLYGMTSSGLIALFLCVLMGPCY
QVRDISQTTVLQSSVEPTLLSKMYTAHGALLSTASGLSMLSVGIITDIFGVRTIYIIASLLILCSACLSFSLLKYRKTDQ
KNISM

Sequences:

>Translated_405_residues
MHKRSLTYYLGSKICITLADILYIMIITTHMYITTKSATLTALFPLLQVITNLIANTSAPLIMNRFSSYSLLFTLQWSKT
ALLFLLMILFPVLSTNIVALLIFIFFISLCSGWSAPLLYGILPRLTPKENLVKVNSIFSFFTQIAQAAAYTFTSVIVLLI
GATSTLMMNNILMIFGCVALHFSLRSIHNEQVIEPSSSKAATLLEGWKLLFQNPALRTVTCMDLIETFAGTIWIGAITMA
YVTTVLHKGEEWWGYINTSYYVGTLIGGLLAWKMSTYIQNNLIRSMAIGSLMFSILTFLYGMTSSGLIALFLCVLMGPCY
QVRDISQTTVLQSSVEPTLLSKMYTAHGALLSTASGLSMLSVGIITDIFGVRTIYIIASLLILCSACLSFSLLKYRKTDQ
KNISM
>Mature_405_residues
MHKRSLTYYLGSKICITLADILYIMIITTHMYITTKSATLTALFPLLQVITNLIANTSAPLIMNRFSSYSLLFTLQWSKT
ALLFLLMILFPVLSTNIVALLIFIFFISLCSGWSAPLLYGILPRLTPKENLVKVNSIFSFFTQIAQAAAYTFTSVIVLLI
GATSTLMMNNILMIFGCVALHFSLRSIHNEQVIEPSSSKAATLLEGWKLLFQNPALRTVTCMDLIETFAGTIWIGAITMA
YVTTVLHKGEEWWGYINTSYYVGTLIGGLLAWKMSTYIQNNLIRSMAIGSLMFSILTFLYGMTSSGLIALFLCVLMGPCY
QVRDISQTTVLQSSVEPTLLSKMYTAHGALLSTASGLSMLSVGIITDIFGVRTIYIIASLLILCSACLSFSLLKYRKTDQ
KNISM

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the major facilitator superfamily [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR011701
- InterPro:   IPR016196 [H]

Pfam domain/function: PF07690 MFS_1 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 44890; Mature: 44890

Theoretical pI: Translated: 9.24; Mature: 9.24

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

2.0 %Cys     (Translated Protein)
4.4 %Met     (Translated Protein)
6.4 %Cys+Met (Translated Protein)
2.0 %Cys     (Mature Protein)
4.4 %Met     (Mature Protein)
6.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MHKRSLTYYLGSKICITLADILYIMIITTHMYITTKSATLTALFPLLQVITNLIANTSAP
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
LIMNRFSSYSLLFTLQWSKTALLFLLMILFPVLSTNIVALLIFIFFISLCSGWSAPLLYG
HHHHHCCCEEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHH
ILPRLTPKENLVKVNSIFSFFTQIAQAAAYTFTSVIVLLIGATSTLMMNNILMIFGCVAL
HHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
HFSLRSIHNEQVIEPSSSKAATLLEGWKLLFQNPALRTVTCMDLIETFAGTIWIGAITMA
HHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YVTTVLHKGEEWWGYINTSYYVGTLIGGLLAWKMSTYIQNNLIRSMAIGSLMFSILTFLY
HHHHHHHCCCHHHEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GMTSSGLIALFLCVLMGPCYQVRDISQTTVLQSSVEPTLLSKMYTAHGALLSTASGLSML
CCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHH
SVGIITDIFGVRTIYIIASLLILCSACLSFSLLKYRKTDQKNISM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MHKRSLTYYLGSKICITLADILYIMIITTHMYITTKSATLTALFPLLQVITNLIANTSAP
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
LIMNRFSSYSLLFTLQWSKTALLFLLMILFPVLSTNIVALLIFIFFISLCSGWSAPLLYG
HHHHHCCCEEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHH
ILPRLTPKENLVKVNSIFSFFTQIAQAAAYTFTSVIVLLIGATSTLMMNNILMIFGCVAL
HHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
HFSLRSIHNEQVIEPSSSKAATLLEGWKLLFQNPALRTVTCMDLIETFAGTIWIGAITMA
HHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YVTTVLHKGEEWWGYINTSYYVGTLIGGLLAWKMSTYIQNNLIRSMAIGSLMFSILTFLY
HHHHHHHCCCHHHEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GMTSSGLIALFLCVLMGPCYQVRDISQTTVLQSSVEPTLLSKMYTAHGALLSTASGLSML
CCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHH
SVGIITDIFGVRTIYIIASLLILCSACLSFSLLKYRKTDQKNISM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9272861; 9384377 [H]