| Definition | Desulfurococcus kamchatkensis 1221n chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_011766 |
| Length | 1,365,223 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is 218884736
Identifier: 218884736
GI number: 218884736
Start: 1320981
End: 1322987
Strand: Reverse
Name: 218884736
Synonym: DKAM_1425
Alternate gene names: NA
Gene position: 1322987-1320981 (Counterclockwise)
Preceding gene: 218884742
Following gene: 218884735
Centisome position: 96.91
GC content: 42.7
Gene sequence:
>2007_bases ATGGATAGAAGAACCATAACAGGCATCATGTTGCTTGTTACAAGCATTCTAGCCAGCATAGTGTTAACCTATACAATGAA CACCAAAGTACCTTTCGACAATGTGTCCTGGCTTACAGAGTATTTGTCAAGGAAGCCAGTACTAAGCGATGCATGTACCG GGATTAATCCGCTCGATAATACATGTAGTTATTTCATAACCTACACATGGTTGTCTGCTAGAATACTCGGGATCCTAGGA CCCTACGGGGCTCTCTCCATCCAAGTCCTCACGTTAATCCTATTATTCTACATGGTTTACAGGTTCTTTAAAGAGCCCGC GATAGCTGGGCTCACTACATTAATCTATGGAACCGCCCCGGTCACAGTGTTCTGGCTGACTCCATCTAATGTCGGTCCAC ATGTTTTCACTGGTATTCTAATAGCATTATTCCTGCTCACCTTATATAAGGCGAGAGAAGTGAGAAGCACTCCTACTGTG CTTCTCACAGGTTTAACCGGGCTTGTACTCCAATTATTTAACCCCATGGGGTGGTTGATCGTTGAAGCCGCATTGATAGG TTTATCAGCAGAATACATAGTTGCACCCCTTAAGCGGGTTGATGTTAAGACAGTGTCATCAATTACTTTATCCACTACGC CACTACTGTTACTCCCATGGCTTAGAAACACTTACTCATTAATACCCTTCTTCACGGGCTCACTGATCTTAGCTACAAGT AAATTACTTGAGGACAGGAATTCCTCCACAGGTACACGCTTGGTGCTAGTAGCCACCGCTATCTCAGCATCCATAGCTTT ATCAGCCGCATTAATACAGTTGCTTGGAGGCGGTGATTATACTAGTGTATTTATCAAGCCTTATAACCCGCTAATAGACT ATGGGGTATTATGCGCCACGGGGTTATTGGGTTTAATAGTGTTCGCTAGGAGTAGAGTGCTCGAGGAGTTTCCCTCAGTA AGGATCACCATTATATCAGCCACCATAATACTGCTTATAGCATCCCTCTACGATCCAACCCTTGCACTAGCCGAGGTCCT GTTCTCAGCAGTGTTATCAGGATTGGCCCTATACATGGTTACGGGTTATGTGTGGAGCCATGGGATCAAGGGTTTCGAGA CAATACTATATAGGGTCATCGCCTTAATCATAGTATTGGGCATAGTATCTAGTAGCATGCTTCTGGCAGTAGCACAGAAT AAGAGCCAACCATATATATACACCTATGATATCCAGGGGTACAGCAATATAGGTACACCGATAAGAAATGAGAGCGCGTG GCTTAATGCGTTAACAGCGTTAAAGCAAGCTATATCTAATACCAGCGTAGACAATATATTAGTGATATCATACTGGGGGT ATACCTACTGGATCCAGGGCTTCCTAGCTGAATCACTACCAGCGCCCAGGGTTTACACGTTAGCCCATATATTAGGAGGA GATAGGGGTAAATATATTGTTTCATCAATAATGTTAAGCGATGAGGTTGCTGCATCCAAGATAATAAGTAATGTCACATC AATGATAAACGCTGAGAGGACCTATATAATAATATCATATCTGGCTAGCATTAGAGTAATGATGGGTAATAAAACAAGTA ACGCCTACCTTGGACTAGCTGTACCGGTTCAATCACAGAACTATTATGAATATATATACTATGCCGCAGCAGGTGATTTA GCCAGGCTGGTATTATACGCCAGCATCACTAACACTAGCTACGTGGATTACGTGAACATATATAATGCACGTACAGGTTA TGAGATACCCCTCGCATGGAACAACAAGGGATCCAATACGTTGCTCGCGCAACTAGCAGTAGACTCACTACATAGGCTGG GTTACACCGTGTATAATGAACTATACAGTTACACACCCTTGTCAAGCAATCTAAATTACTTCAAACCAGTAGCAGTAATT GGTGTACCAGTTATGAATATAACTGGTTTATATAGCGAATACCAGATAATACATGTAGTAGCGGTTTACGAGTTCACTCA ACAATAG
Upstream 100 bases:
>100_bases CAATAATTATAATTGATTCACAGGAGACTAGAGGGGATTTAAAACTTTATTTACTATTCACTCGTTATCTAGGATACAGC TAGTTTAAGGGTGCAGCCTT
Downstream 100 bases:
>100_bases CCTCGGTGAGAAGAAATGCTAGCTAGGAAGGAATTGCCCGAGATCGGGGAATACGTTATAGCCACGGTTAGGGAAATATA CGATTATGGCGCCTATGTCA
Product: putative oligosaccharyl transferase STT3 subunit
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 668; Mature: 668
Protein sequence:
>668_residues MDRRTITGIMLLVTSILASIVLTYTMNTKVPFDNVSWLTEYLSRKPVLSDACTGINPLDNTCSYFITYTWLSARILGILG PYGALSIQVLTLILLFYMVYRFFKEPAIAGLTTLIYGTAPVTVFWLTPSNVGPHVFTGILIALFLLTLYKAREVRSTPTV LLTGLTGLVLQLFNPMGWLIVEAALIGLSAEYIVAPLKRVDVKTVSSITLSTTPLLLLPWLRNTYSLIPFFTGSLILATS KLLEDRNSSTGTRLVLVATAISASIALSAALIQLLGGGDYTSVFIKPYNPLIDYGVLCATGLLGLIVFARSRVLEEFPSV RITIISATIILLIASLYDPTLALAEVLFSAVLSGLALYMVTGYVWSHGIKGFETILYRVIALIIVLGIVSSSMLLAVAQN KSQPYIYTYDIQGYSNIGTPIRNESAWLNALTALKQAISNTSVDNILVISYWGYTYWIQGFLAESLPAPRVYTLAHILGG DRGKYIVSSIMLSDEVAASKIISNVTSMINAERTYIIISYLASIRVMMGNKTSNAYLGLAVPVQSQNYYEYIYYAAAGDL ARLVLYASITNTSYVDYVNIYNARTGYEIPLAWNNKGSNTLLAQLAVDSLHRLGYTVYNELYSYTPLSSNLNYFKPVAVI GVPVMNITGLYSEYQIIHVVAVYEFTQQ
Sequences:
>Translated_668_residues MDRRTITGIMLLVTSILASIVLTYTMNTKVPFDNVSWLTEYLSRKPVLSDACTGINPLDNTCSYFITYTWLSARILGILG PYGALSIQVLTLILLFYMVYRFFKEPAIAGLTTLIYGTAPVTVFWLTPSNVGPHVFTGILIALFLLTLYKAREVRSTPTV LLTGLTGLVLQLFNPMGWLIVEAALIGLSAEYIVAPLKRVDVKTVSSITLSTTPLLLLPWLRNTYSLIPFFTGSLILATS KLLEDRNSSTGTRLVLVATAISASIALSAALIQLLGGGDYTSVFIKPYNPLIDYGVLCATGLLGLIVFARSRVLEEFPSV RITIISATIILLIASLYDPTLALAEVLFSAVLSGLALYMVTGYVWSHGIKGFETILYRVIALIIVLGIVSSSMLLAVAQN KSQPYIYTYDIQGYSNIGTPIRNESAWLNALTALKQAISNTSVDNILVISYWGYTYWIQGFLAESLPAPRVYTLAHILGG DRGKYIVSSIMLSDEVAASKIISNVTSMINAERTYIIISYLASIRVMMGNKTSNAYLGLAVPVQSQNYYEYIYYAAAGDL ARLVLYASITNTSYVDYVNIYNARTGYEIPLAWNNKGSNTLLAQLAVDSLHRLGYTVYNELYSYTPLSSNLNYFKPVAVI GVPVMNITGLYSEYQIIHVVAVYEFTQQ >Mature_668_residues MDRRTITGIMLLVTSILASIVLTYTMNTKVPFDNVSWLTEYLSRKPVLSDACTGINPLDNTCSYFITYTWLSARILGILG PYGALSIQVLTLILLFYMVYRFFKEPAIAGLTTLIYGTAPVTVFWLTPSNVGPHVFTGILIALFLLTLYKAREVRSTPTV LLTGLTGLVLQLFNPMGWLIVEAALIGLSAEYIVAPLKRVDVKTVSSITLSTTPLLLLPWLRNTYSLIPFFTGSLILATS KLLEDRNSSTGTRLVLVATAISASIALSAALIQLLGGGDYTSVFIKPYNPLIDYGVLCATGLLGLIVFARSRVLEEFPSV RITIISATIILLIASLYDPTLALAEVLFSAVLSGLALYMVTGYVWSHGIKGFETILYRVIALIIVLGIVSSSMLLAVAQN KSQPYIYTYDIQGYSNIGTPIRNESAWLNALTALKQAISNTSVDNILVISYWGYTYWIQGFLAESLPAPRVYTLAHILGG DRGKYIVSSIMLSDEVAASKIISNVTSMINAERTYIIISYLASIRVMMGNKTSNAYLGLAVPVQSQNYYEYIYYAAAGDL ARLVLYASITNTSYVDYVNIYNARTGYEIPLAWNNKGSNTLLAQLAVDSLHRLGYTVYNELYSYTPLSSNLNYFKPVAVI GVPVMNITGLYSEYQIIHVVAVYEFTQQ
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 73476; Mature: 73476
Theoretical pI: Translated: 8.65; Mature: 8.65
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.4 %Cys (Translated Protein) 1.8 %Met (Translated Protein) 2.2 %Cys+Met (Translated Protein) 0.4 %Cys (Mature Protein) 1.8 %Met (Mature Protein) 2.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MDRRTITGIMLLVTSILASIVLTYTMNTKVPFDNVSWLTEYLSRKPVLSDACTGINPLDN CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCCCCCCC TCSYFITYTWLSARILGILGPYGALSIQVLTLILLFYMVYRFFKEPAIAGLTTLIYGTAP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCC VTVFWLTPSNVGPHVFTGILIALFLLTLYKAREVRSTPTVLLTGLTGLVLQLFNPMGWLI EEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH VEAALIGLSAEYIVAPLKRVDVKTVSSITLSTTPLLLLPWLRNTYSLIPFFTGSLILATS HHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCHHHHCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHH KLLEDRNSSTGTRLVLVATAISASIALSAALIQLLGGGDYTSVFIKPYNPLIDYGVLCAT HHHHCCCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHH GLLGLIVFARSRVLEEFPSVRITIISATIILLIASLYDPTLALAEVLFSAVLSGLALYMV HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TGYVWSHGIKGFETILYRVIALIIVLGIVSSSMLLAVAQNKSQPYIYTYDIQGYSNIGTP HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCEEEEEEECCCCCCCCC IRNESAWLNALTALKQAISNTSVDNILVISYWGYTYWIQGFLAESLPAPRVYTLAHILGG CCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCC DRGKYIVSSIMLSDEVAASKIISNVTSMINAERTYIIISYLASIRVMMGNKTSNAYLGLA CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEE VPVQSQNYYEYIYYAAAGDLARLVLYASITNTSYVDYVNIYNARTGYEIPLAWNNKGSNT EEECCCCCEEEEEEECHHHHHHHHHHEEECCCCEEEEEEEEECCCCEEEEEEECCCCCCH LLAQLAVDSLHRLGYTVYNELYSYTPLSSNLNYFKPVAVIGVPVMNITGLYSEYQIIHVV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCHHHHHCCCCCCEEEEEE AVYEFTQQ EEHHHHCC >Mature Secondary Structure MDRRTITGIMLLVTSILASIVLTYTMNTKVPFDNVSWLTEYLSRKPVLSDACTGINPLDN CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCCCCCCC TCSYFITYTWLSARILGILGPYGALSIQVLTLILLFYMVYRFFKEPAIAGLTTLIYGTAP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCC VTVFWLTPSNVGPHVFTGILIALFLLTLYKAREVRSTPTVLLTGLTGLVLQLFNPMGWLI EEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH VEAALIGLSAEYIVAPLKRVDVKTVSSITLSTTPLLLLPWLRNTYSLIPFFTGSLILATS HHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCHHHHCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHH KLLEDRNSSTGTRLVLVATAISASIALSAALIQLLGGGDYTSVFIKPYNPLIDYGVLCAT HHHHCCCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHH GLLGLIVFARSRVLEEFPSVRITIISATIILLIASLYDPTLALAEVLFSAVLSGLALYMV HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TGYVWSHGIKGFETILYRVIALIIVLGIVSSSMLLAVAQNKSQPYIYTYDIQGYSNIGTP HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCEEEEEEECCCCCCCCC IRNESAWLNALTALKQAISNTSVDNILVISYWGYTYWIQGFLAESLPAPRVYTLAHILGG CCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCC DRGKYIVSSIMLSDEVAASKIISNVTSMINAERTYIIISYLASIRVMMGNKTSNAYLGLA CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEE VPVQSQNYYEYIYYAAAGDLARLVLYASITNTSYVDYVNIYNARTGYEIPLAWNNKGSNT EEECCCCCEEEEEEECHHHHHHHHHHEEECCCCEEEEEEEEECCCCEEEEEEECCCCCCH LLAQLAVDSLHRLGYTVYNELYSYTPLSSNLNYFKPVAVIGVPVMNITGLYSEYQIIHVV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCHHHHHCCCCCCEEEEEE AVYEFTQQ EEHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA