Definition Desulfurococcus kamchatkensis 1221n chromosome, complete genome.
Accession NC_011766
Length 1,365,223

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The map label for this gene is 218884736

Identifier: 218884736

GI number: 218884736

Start: 1320981

End: 1322987

Strand: Reverse

Name: 218884736

Synonym: DKAM_1425

Alternate gene names: NA

Gene position: 1322987-1320981 (Counterclockwise)

Preceding gene: 218884742

Following gene: 218884735

Centisome position: 96.91

GC content: 42.7

Gene sequence:

>2007_bases
ATGGATAGAAGAACCATAACAGGCATCATGTTGCTTGTTACAAGCATTCTAGCCAGCATAGTGTTAACCTATACAATGAA
CACCAAAGTACCTTTCGACAATGTGTCCTGGCTTACAGAGTATTTGTCAAGGAAGCCAGTACTAAGCGATGCATGTACCG
GGATTAATCCGCTCGATAATACATGTAGTTATTTCATAACCTACACATGGTTGTCTGCTAGAATACTCGGGATCCTAGGA
CCCTACGGGGCTCTCTCCATCCAAGTCCTCACGTTAATCCTATTATTCTACATGGTTTACAGGTTCTTTAAAGAGCCCGC
GATAGCTGGGCTCACTACATTAATCTATGGAACCGCCCCGGTCACAGTGTTCTGGCTGACTCCATCTAATGTCGGTCCAC
ATGTTTTCACTGGTATTCTAATAGCATTATTCCTGCTCACCTTATATAAGGCGAGAGAAGTGAGAAGCACTCCTACTGTG
CTTCTCACAGGTTTAACCGGGCTTGTACTCCAATTATTTAACCCCATGGGGTGGTTGATCGTTGAAGCCGCATTGATAGG
TTTATCAGCAGAATACATAGTTGCACCCCTTAAGCGGGTTGATGTTAAGACAGTGTCATCAATTACTTTATCCACTACGC
CACTACTGTTACTCCCATGGCTTAGAAACACTTACTCATTAATACCCTTCTTCACGGGCTCACTGATCTTAGCTACAAGT
AAATTACTTGAGGACAGGAATTCCTCCACAGGTACACGCTTGGTGCTAGTAGCCACCGCTATCTCAGCATCCATAGCTTT
ATCAGCCGCATTAATACAGTTGCTTGGAGGCGGTGATTATACTAGTGTATTTATCAAGCCTTATAACCCGCTAATAGACT
ATGGGGTATTATGCGCCACGGGGTTATTGGGTTTAATAGTGTTCGCTAGGAGTAGAGTGCTCGAGGAGTTTCCCTCAGTA
AGGATCACCATTATATCAGCCACCATAATACTGCTTATAGCATCCCTCTACGATCCAACCCTTGCACTAGCCGAGGTCCT
GTTCTCAGCAGTGTTATCAGGATTGGCCCTATACATGGTTACGGGTTATGTGTGGAGCCATGGGATCAAGGGTTTCGAGA
CAATACTATATAGGGTCATCGCCTTAATCATAGTATTGGGCATAGTATCTAGTAGCATGCTTCTGGCAGTAGCACAGAAT
AAGAGCCAACCATATATATACACCTATGATATCCAGGGGTACAGCAATATAGGTACACCGATAAGAAATGAGAGCGCGTG
GCTTAATGCGTTAACAGCGTTAAAGCAAGCTATATCTAATACCAGCGTAGACAATATATTAGTGATATCATACTGGGGGT
ATACCTACTGGATCCAGGGCTTCCTAGCTGAATCACTACCAGCGCCCAGGGTTTACACGTTAGCCCATATATTAGGAGGA
GATAGGGGTAAATATATTGTTTCATCAATAATGTTAAGCGATGAGGTTGCTGCATCCAAGATAATAAGTAATGTCACATC
AATGATAAACGCTGAGAGGACCTATATAATAATATCATATCTGGCTAGCATTAGAGTAATGATGGGTAATAAAACAAGTA
ACGCCTACCTTGGACTAGCTGTACCGGTTCAATCACAGAACTATTATGAATATATATACTATGCCGCAGCAGGTGATTTA
GCCAGGCTGGTATTATACGCCAGCATCACTAACACTAGCTACGTGGATTACGTGAACATATATAATGCACGTACAGGTTA
TGAGATACCCCTCGCATGGAACAACAAGGGATCCAATACGTTGCTCGCGCAACTAGCAGTAGACTCACTACATAGGCTGG
GTTACACCGTGTATAATGAACTATACAGTTACACACCCTTGTCAAGCAATCTAAATTACTTCAAACCAGTAGCAGTAATT
GGTGTACCAGTTATGAATATAACTGGTTTATATAGCGAATACCAGATAATACATGTAGTAGCGGTTTACGAGTTCACTCA
ACAATAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
CAATAATTATAATTGATTCACAGGAGACTAGAGGGGATTTAAAACTTTATTTACTATTCACTCGTTATCTAGGATACAGC
TAGTTTAAGGGTGCAGCCTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
CCTCGGTGAGAAGAAATGCTAGCTAGGAAGGAATTGCCCGAGATCGGGGAATACGTTATAGCCACGGTTAGGGAAATATA
CGATTATGGCGCCTATGTCA

Product: putative oligosaccharyl transferase STT3 subunit

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 668; Mature: 668

Protein sequence:

>668_residues
MDRRTITGIMLLVTSILASIVLTYTMNTKVPFDNVSWLTEYLSRKPVLSDACTGINPLDNTCSYFITYTWLSARILGILG
PYGALSIQVLTLILLFYMVYRFFKEPAIAGLTTLIYGTAPVTVFWLTPSNVGPHVFTGILIALFLLTLYKAREVRSTPTV
LLTGLTGLVLQLFNPMGWLIVEAALIGLSAEYIVAPLKRVDVKTVSSITLSTTPLLLLPWLRNTYSLIPFFTGSLILATS
KLLEDRNSSTGTRLVLVATAISASIALSAALIQLLGGGDYTSVFIKPYNPLIDYGVLCATGLLGLIVFARSRVLEEFPSV
RITIISATIILLIASLYDPTLALAEVLFSAVLSGLALYMVTGYVWSHGIKGFETILYRVIALIIVLGIVSSSMLLAVAQN
KSQPYIYTYDIQGYSNIGTPIRNESAWLNALTALKQAISNTSVDNILVISYWGYTYWIQGFLAESLPAPRVYTLAHILGG
DRGKYIVSSIMLSDEVAASKIISNVTSMINAERTYIIISYLASIRVMMGNKTSNAYLGLAVPVQSQNYYEYIYYAAAGDL
ARLVLYASITNTSYVDYVNIYNARTGYEIPLAWNNKGSNTLLAQLAVDSLHRLGYTVYNELYSYTPLSSNLNYFKPVAVI
GVPVMNITGLYSEYQIIHVVAVYEFTQQ

Sequences:

>Translated_668_residues
MDRRTITGIMLLVTSILASIVLTYTMNTKVPFDNVSWLTEYLSRKPVLSDACTGINPLDNTCSYFITYTWLSARILGILG
PYGALSIQVLTLILLFYMVYRFFKEPAIAGLTTLIYGTAPVTVFWLTPSNVGPHVFTGILIALFLLTLYKAREVRSTPTV
LLTGLTGLVLQLFNPMGWLIVEAALIGLSAEYIVAPLKRVDVKTVSSITLSTTPLLLLPWLRNTYSLIPFFTGSLILATS
KLLEDRNSSTGTRLVLVATAISASIALSAALIQLLGGGDYTSVFIKPYNPLIDYGVLCATGLLGLIVFARSRVLEEFPSV
RITIISATIILLIASLYDPTLALAEVLFSAVLSGLALYMVTGYVWSHGIKGFETILYRVIALIIVLGIVSSSMLLAVAQN
KSQPYIYTYDIQGYSNIGTPIRNESAWLNALTALKQAISNTSVDNILVISYWGYTYWIQGFLAESLPAPRVYTLAHILGG
DRGKYIVSSIMLSDEVAASKIISNVTSMINAERTYIIISYLASIRVMMGNKTSNAYLGLAVPVQSQNYYEYIYYAAAGDL
ARLVLYASITNTSYVDYVNIYNARTGYEIPLAWNNKGSNTLLAQLAVDSLHRLGYTVYNELYSYTPLSSNLNYFKPVAVI
GVPVMNITGLYSEYQIIHVVAVYEFTQQ
>Mature_668_residues
MDRRTITGIMLLVTSILASIVLTYTMNTKVPFDNVSWLTEYLSRKPVLSDACTGINPLDNTCSYFITYTWLSARILGILG
PYGALSIQVLTLILLFYMVYRFFKEPAIAGLTTLIYGTAPVTVFWLTPSNVGPHVFTGILIALFLLTLYKAREVRSTPTV
LLTGLTGLVLQLFNPMGWLIVEAALIGLSAEYIVAPLKRVDVKTVSSITLSTTPLLLLPWLRNTYSLIPFFTGSLILATS
KLLEDRNSSTGTRLVLVATAISASIALSAALIQLLGGGDYTSVFIKPYNPLIDYGVLCATGLLGLIVFARSRVLEEFPSV
RITIISATIILLIASLYDPTLALAEVLFSAVLSGLALYMVTGYVWSHGIKGFETILYRVIALIIVLGIVSSSMLLAVAQN
KSQPYIYTYDIQGYSNIGTPIRNESAWLNALTALKQAISNTSVDNILVISYWGYTYWIQGFLAESLPAPRVYTLAHILGG
DRGKYIVSSIMLSDEVAASKIISNVTSMINAERTYIIISYLASIRVMMGNKTSNAYLGLAVPVQSQNYYEYIYYAAAGDL
ARLVLYASITNTSYVDYVNIYNARTGYEIPLAWNNKGSNTLLAQLAVDSLHRLGYTVYNELYSYTPLSSNLNYFKPVAVI
GVPVMNITGLYSEYQIIHVVAVYEFTQQ

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 73476; Mature: 73476

Theoretical pI: Translated: 8.65; Mature: 8.65

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
1.8 %Met     (Translated Protein)
2.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
1.8 %Met     (Mature Protein)
2.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MDRRTITGIMLLVTSILASIVLTYTMNTKVPFDNVSWLTEYLSRKPVLSDACTGINPLDN
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCCCCCCC
TCSYFITYTWLSARILGILGPYGALSIQVLTLILLFYMVYRFFKEPAIAGLTTLIYGTAP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCC
VTVFWLTPSNVGPHVFTGILIALFLLTLYKAREVRSTPTVLLTGLTGLVLQLFNPMGWLI
EEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH
VEAALIGLSAEYIVAPLKRVDVKTVSSITLSTTPLLLLPWLRNTYSLIPFFTGSLILATS
HHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCHHHHCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHH
KLLEDRNSSTGTRLVLVATAISASIALSAALIQLLGGGDYTSVFIKPYNPLIDYGVLCAT
HHHHCCCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHH
GLLGLIVFARSRVLEEFPSVRITIISATIILLIASLYDPTLALAEVLFSAVLSGLALYMV
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TGYVWSHGIKGFETILYRVIALIIVLGIVSSSMLLAVAQNKSQPYIYTYDIQGYSNIGTP
HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCEEEEEEECCCCCCCCC
IRNESAWLNALTALKQAISNTSVDNILVISYWGYTYWIQGFLAESLPAPRVYTLAHILGG
CCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCC
DRGKYIVSSIMLSDEVAASKIISNVTSMINAERTYIIISYLASIRVMMGNKTSNAYLGLA
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEE
VPVQSQNYYEYIYYAAAGDLARLVLYASITNTSYVDYVNIYNARTGYEIPLAWNNKGSNT
EEECCCCCEEEEEEECHHHHHHHHHHEEECCCCEEEEEEEEECCCCEEEEEEECCCCCCH
LLAQLAVDSLHRLGYTVYNELYSYTPLSSNLNYFKPVAVIGVPVMNITGLYSEYQIIHVV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCHHHHHCCCCCCEEEEEE
AVYEFTQQ
EEHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MDRRTITGIMLLVTSILASIVLTYTMNTKVPFDNVSWLTEYLSRKPVLSDACTGINPLDN
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCCCCCCC
TCSYFITYTWLSARILGILGPYGALSIQVLTLILLFYMVYRFFKEPAIAGLTTLIYGTAP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCC
VTVFWLTPSNVGPHVFTGILIALFLLTLYKAREVRSTPTVLLTGLTGLVLQLFNPMGWLI
EEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH
VEAALIGLSAEYIVAPLKRVDVKTVSSITLSTTPLLLLPWLRNTYSLIPFFTGSLILATS
HHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCHHHHCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHH
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GLLGLIVFARSRVLEEFPSVRITIISATIILLIASLYDPTLALAEVLFSAVLSGLALYMV
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TGYVWSHGIKGFETILYRVIALIIVLGIVSSSMLLAVAQNKSQPYIYTYDIQGYSNIGTP
HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCEEEEEEECCCCCCCCC
IRNESAWLNALTALKQAISNTSVDNILVISYWGYTYWIQGFLAESLPAPRVYTLAHILGG
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DRGKYIVSSIMLSDEVAASKIISNVTSMINAERTYIIISYLASIRVMMGNKTSNAYLGLA
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEE
VPVQSQNYYEYIYYAAAGDLARLVLYASITNTSYVDYVNIYNARTGYEIPLAWNNKGSNT
EEECCCCCEEEEEEECHHHHHHHHHHEEECCCCEEEEEEEEECCCCEEEEEEECCCCCCH
LLAQLAVDSLHRLGYTVYNELYSYTPLSSNLNYFKPVAVIGVPVMNITGLYSEYQIIHVV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCHHHHHCCCCCCEEEEEE
AVYEFTQQ
EEHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA